MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Borrelia burgdorferi B31 plasmid cp32-1

Total Repeats: 61

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_000948	GT	3	6	66	71	0 %	50 %	50 %	0 %	11497090
2	NC_000948	AT	3	6	504	509	50 %	50 %	0 %	0 %	11497090
3	NC_000948	CT	3	6	675	680	0 %	50 %	0 %	50 %	11497090
4	NC_000948	GA	3	6	1739	1744	50 %	0 %	50 %	0 %	11497091
5	NC_000948	GT	3	6	2299	2304	0 %	50 %	50 %	0 %	11497092
6	NC_000948	CA	3	6	2498	2503	50 %	0 %	0 %	50 %	11497092
7	NC_000948	TA	3	6	2964	2969	50 %	50 %	0 %	0 %	11497093
8	NC_000948	AT	3	6	3178	3183	50 %	50 %	0 %	0 %	11497093
9	NC_000948	AT	3	6	4271	4276	50 %	50 %	0 %	0 %	364556427
10	NC_000948	TG	3	6	5380	5385	0 %	50 %	50 %	0 %	364556428
11	NC_000948	AG	3	6	5521	5526	50 %	0 %	50 %	0 %	364556429
12	NC_000948	AT	3	6	5914	5919	50 %	50 %	0 %	0 %	11497067
13	NC_000948	TA	3	6	5930	5935	50 %	50 %	0 %	0 %	11497067
14	NC_000948	AT	4	8	6406	6413	50 %	50 %	0 %	0 %	11497068
15	NC_000948	AC	3	6	7048	7053	50 %	0 %	0 %	50 %	11497095
16	NC_000948	TA	3	6	7496	7501	50 %	50 %	0 %	0 %	11497095
17	NC_000948	AG	3	6	9169	9174	50 %	0 %	50 %	0 %	11497099
18	NC_000948	AT	3	6	9813	9818	50 %	50 %	0 %	0 %	11497099
19	NC_000948	AC	3	6	10069	10074	50 %	0 %	0 %	50 %	11497099
20	NC_000948	AT	3	6	10504	10509	50 %	50 %	0 %	0 %	11497100
21	NC_000948	AT	3	6	10650	10655	50 %	50 %	0 %	0 %	11497100
22	NC_000948	TA	3	6	10683	10688	50 %	50 %	0 %	0 %	11497100
23	NC_000948	TA	4	8	10804	10811	50 %	50 %	0 %	0 %	11497100
24	NC_000948	AT	3	6	11207	11212	50 %	50 %	0 %	0 %	11497101
25	NC_000948	TA	3	6	11606	11611	50 %	50 %	0 %	0 %	11497101
26	NC_000948	CA	3	6	11740	11745	50 %	0 %	0 %	50 %	11497101
27	NC_000948	CA	3	6	12106	12111	50 %	0 %	0 %	50 %	11497102
28	NC_000948	TA	3	6	12229	12234	50 %	50 %	0 %	0 %	11497102
29	NC_000948	AT	3	6	12775	12780	50 %	50 %	0 %	0 %	11497069
30	NC_000948	AT	3	6	13169	13174	50 %	50 %	0 %	0 %	11497070
31	NC_000948	AT	3	6	13855	13860	50 %	50 %	0 %	0 %	11497071
32	NC_000948	AT	3	6	15480	15485	50 %	50 %	0 %	0 %	11497074
33	NC_000948	AT	3	6	15890	15895	50 %	50 %	0 %	0 %	11497075
34	NC_000948	AT	3	6	16363	16368	50 %	50 %	0 %	0 %	364556430
35	NC_000948	AC	3	6	17433	17438	50 %	0 %	0 %	50 %	11497078
36	NC_000948	AT	3	6	19177	19182	50 %	50 %	0 %	0 %	11497080
37	NC_000948	AC	3	6	19226	19231	50 %	0 %	0 %	50 %	11497080
38	NC_000948	TA	3	6	20130	20135	50 %	50 %	0 %	0 %	11497080
39	NC_000948	TA	3	6	20717	20722	50 %	50 %	0 %	0 %	11497081
40	NC_000948	TA	3	6	20966	20971	50 %	50 %	0 %	0 %	11497082
41	NC_000948	TA	3	6	21456	21461	50 %	50 %	0 %	0 %	11497082
42	NC_000948	AG	3	6	21710	21715	50 %	0 %	50 %	0 %	364556431
43	NC_000948	AT	3	6	22300	22305	50 %	50 %	0 %	0 %	11497084
44	NC_000948	AT	3	6	22354	22359	50 %	50 %	0 %	0 %	11497084
45	NC_000948	AT	3	6	22408	22413	50 %	50 %	0 %	0 %	11497084
46	NC_000948	AT	3	6	22462	22467	50 %	50 %	0 %	0 %	11497084
47	NC_000948	AT	3	6	22751	22756	50 %	50 %	0 %	0 %	11497084
48	NC_000948	TA	3	6	23891	23896	50 %	50 %	0 %	0 %	11497085
49	NC_000948	AG	3	6	24080	24085	50 %	0 %	50 %	0 %	11497085
50	NC_000948	AG	3	6	25094	25099	50 %	0 %	50 %	0 %	11497087
51	NC_000948	GA	3	6	25214	25219	50 %	0 %	50 %	0 %	11497087
52	NC_000948	AT	3	6	26666	26671	50 %	50 %	0 %	0 %	364556426
53	NC_000948	TA	3	6	27620	27625	50 %	50 %	0 %	0 %	11497062
54	NC_000948	AT	3	6	27740	27745	50 %	50 %	0 %	0 %	11497062
55	NC_000948	TA	3	6	28153	28158	50 %	50 %	0 %	0 %	364556432
56	NC_000948	TG	3	6	28939	28944	0 %	50 %	50 %	0 %	11497089
57	NC_000948	AT	3	6	29281	29286	50 %	50 %	0 %	0 %	11497089
58	NC_000948	AT	3	6	29465	29470	50 %	50 %	0 %	0 %	11497063
59	NC_000948	AT	3	6	29805	29810	50 %	50 %	0 %	0 %	11497063
60	NC_000948	TA	3	6	30122	30127	50 %	50 %	0 %	0 %	11497063
61	NC_000948	AG	3	6	30709	30714	50 %	0 %	50 %	0 %	11497063

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.