MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Chlamydophila pneumoniae CWL029 chromosome

Total Repeats: 74

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_000922	TCTTAT	2	12	4070	4081	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_000922	TCGATT	2	12	24249	24260	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_000922	CAAAAA	2	12	26158	26169	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_000922	ATTTTT	2	12	43334	43345	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_000922	ATAAGA	2	12	61853	61864	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_000922	AGGCTT	2	12	89316	89327	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_000922	AATTAA	2	12	93694	93705	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_000922	TGTAGG	2	12	137229	137240	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_000922	TTCTAT	2	12	137921	137932	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_000922	AATTTT	2	12	201959	201970	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_000922	CTATTT	2	12	208333	208344	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_000922	TCCCCC	2	12	244970	244981	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
13	NC_000922	ATACCT	2	12	245012	245023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_000922	ACGAAG	2	12	245303	245314	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_000922	ATAAAA	2	12	245802	245813	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_000922	TAATCC	2	12	245882	245893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_000922	AAACAA	2	12	251292	251303	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_000922	CATCTT	2	12	252216	252227	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_000922	TTTAAG	2	12	266211	266222	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_000922	ATTTTA	2	12	274235	274246	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_000922	AAATTT	2	12	278063	278074	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_000922	TGATAT	2	12	288231	288242	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_000922	AGTAAT	2	12	329862	329873	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_000922	AAAACT	2	12	333056	333067	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_000922	AAAGAG	2	12	333919	333930	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_000922	ATCTTC	2	12	356485	356496	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_000922	TAAAAA	2	12	365867	365878	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_000922	TTATTT	2	12	375033	375044	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_000922	ACAAAA	2	12	379098	379109	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_000922	CCCATG	2	12	412768	412779	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
31	NC_000922	ATTTTT	2	12	426218	426229	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_000922	TTTCCC	2	12	431815	431826	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_000922	TAGAGA	2	12	468210	468221	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_000922	AAATAA	2	12	488539	488550	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_000922	TTATCT	2	12	506150	506161	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_000922	TCCTCA	2	12	519504	519515	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_000922	ATGAAA	2	12	541327	541338	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_000922	AGAAAT	2	12	568049	568060	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_000922	GAAAAA	2	12	603908	603919	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_000922	TATTTT	2	12	606249	606260	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_000922	TAGGAG	2	12	607469	607480	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_000922	CATTAA	2	12	638282	638293	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_000922	TTTTTA	2	12	655657	655668	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_000922	AAAAAC	2	12	662266	662277	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_000922	AATTAT	2	12	679422	679433	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_000922	TAGAAA	2	12	730534	730545	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_000922	GCCTAA	2	12	744256	744267	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_000922	TATTTT	2	12	761331	761342	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_000922	GAATGC	2	12	768401	768412	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_000922	TAAATA	2	12	796744	796755	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_000922	TAAAAA	2	12	799836	799847	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_000922	ATTAAC	2	12	813410	813421	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_000922	TAAATT	2	12	921958	921969	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_000922	TATTTA	2	12	938233	938244	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_000922	TCATGA	2	12	941523	941534	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_000922	TTTTTA	2	12	954698	954709	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_000922	TTATTT	2	12	955220	955231	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_000922	TAAGCA	2	12	981545	981556	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_000922	TTTAAA	2	12	993145	993156	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_000922	AAGCGA	2	12	1003018	1003029	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_000922	GTTATT	2	12	1011390	1011401	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_000922	AAAAGA	2	12	1059852	1059863	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_000922	TAATTT	2	12	1062826	1062837	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_000922	TTTTTA	2	12	1077953	1077964	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_000922	CATAAA	2	12	1088756	1088767	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_000922	ATTTCT	2	12	1089441	1089452	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_000922	GAATAG	2	12	1108486	1108497	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_000922	TTTCAA	2	12	1113020	1113031	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_000922	TTTCAA	2	12	1114669	1114680	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_000922	TACAAG	2	12	1118443	1118454	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_000922	TTATAA	2	12	1120002	1120013	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_000922	TTTGGA	2	12	1178967	1178978	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_000922	ACTTTT	2	12	1211474	1211485	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_000922	TCCTAG	2	12	1223307	1223318	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.