MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Chlamydophila pneumoniae CWL029 chromosome

Total Repeats: 911

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_000922	ATTTA	2	10	187	196	40 %	60 %	0 %	0 %	15617930
2	NC_000922	ATAGA	2	10	980	989	60 %	20 %	20 %	0 %	15617932
3	NC_000922	TGTCT	2	10	1974	1983	0 %	60 %	20 %	20 %	15617932
4	NC_000922	GAAAA	2	10	3153	3162	80 %	0 %	20 %	0 %	15617933
5	NC_000922	ATAAA	2	10	5868	5877	80 %	20 %	0 %	0 %	15617934
6	NC_000922	TATAA	2	10	6860	6869	60 %	40 %	0 %	0 %	15617934
7	NC_000922	AATAA	2	10	10705	10714	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_000922	TCGAA	2	10	12459	12468	40 %	20 %	20 %	20 %	15617938
9	NC_000922	GGGAT	2	10	13872	13881	20 %	20 %	60 %	0 %	15617939
10	NC_000922	GAGGG	2	10	13994	14003	20 %	0 %	80 %	0 %	15617939
11	NC_000922	GAGAG	2	10	15583	15592	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
12	NC_000922	TCTCG	2	10	22801	22810	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
13	NC_000922	GCTAT	2	10	27136	27145	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
14	NC_000922	TATTT	2	10	27262	27271	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_000922	TCTAG	2	10	27429	27438	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
16	NC_000922	AATAT	2	10	27514	27523	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_000922	CCACT	2	10	27595	27604	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
18	NC_000922	TGCTT	2	10	34191	34200	0 %	60 %	20 %	20 %	15617945
19	NC_000922	ATCTT	2	10	35069	35078	20 %	60 %	0 %	20 %	15617947
20	NC_000922	TTTTC	2	10	35826	35835	0 %	80 %	0 %	20 %	15617947
21	NC_000922	TCAAA	2	10	37062	37071	60 %	20 %	0 %	20 %	15617948
22	NC_000922	GGCAA	2	10	37968	37977	40 %	0 %	40 %	20 %	15617949
23	NC_000922	GCATA	2	10	39455	39464	40 %	20 %	20 %	20 %	15617950
24	NC_000922	AAGAC	2	10	41975	41984	60 %	0 %	20 %	20 %	15617951
25	NC_000922	TTTAA	2	10	42661	42670	40 %	60 %	0 %	0 %	15617952
26	NC_000922	ATTTG	2	10	43641	43650	20 %	60 %	20 %	0 %	15617953
27	NC_000922	CCGCT	2	10	46914	46923	0 %	20 %	20 %	60 %	15617957
28	NC_000922	GGATA	2	10	49955	49964	40 %	20 %	40 %	0 %	15617959
29	NC_000922	ATAAA	2	10	50102	50111	80 %	20 %	0 %	0 %	15617959
30	NC_000922	AGATC	2	10	51839	51848	40 %	20 %	20 %	20 %	15617961
31	NC_000922	CACAT	2	10	52718	52727	40 %	20 %	0 %	40 %	15617962
32	NC_000922	TCGAG	2	10	57594	57603	20 %	20 %	40 %	20 %	15617966
33	NC_000922	GAGAG	2	10	58154	58163	40 %	0 %	60 %	0 %	15617966
34	NC_000922	GCTAA	2	10	58191	58200	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
35	NC_000922	AGCAA	2	10	58791	58800	60 %	0 %	20 %	20 %	15617967
36	NC_000922	ATTTA	2	10	59799	59808	40 %	60 %	0 %	0 %	15617967
37	NC_000922	TAAGC	2	10	63728	63737	40 %	20 %	20 %	20 %	15617972
38	NC_000922	CTAAA	2	10	66158	66167	60 %	20 %	0 %	20 %	15617973
39	NC_000922	GCAAA	2	10	66558	66567	60 %	0 %	20 %	20 %	15617974
40	NC_000922	CTATA	2	10	67411	67420	40 %	40 %	0 %	20 %	15617976
41	NC_000922	AAAGT	2	10	68640	68649	60 %	20 %	20 %	0 %	15617977
42	NC_000922	CCGTG	2	10	69787	69796	0 %	20 %	40 %	40 %	15617978
43	NC_000922	TATTT	2	10	70182	70191	20 %	80 %	0 %	0 %	15617979
44	NC_000922	ATTTT	2	10	72709	72718	20 %	80 %	0 %	0 %	15617980
45	NC_000922	GAGTA	2	10	72857	72866	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
46	NC_000922	CCAAC	2	10	74234	74243	40 %	0 %	0 %	60 %	15617982
47	NC_000922	TGCCC	2	10	75935	75944	0 %	20 %	20 %	60 %	15617985
48	NC_000922	TTCTT	2	10	76048	76057	0 %	80 %	0 %	20 %	15617985
49	NC_000922	TACAT	2	10	76419	76428	40 %	40 %	0 %	20 %	15617986
50	NC_000922	CTAAC	2	10	76684	76693	40 %	20 %	0 %	40 %	15617986
51	NC_000922	TACGA	2	10	77221	77230	40 %	20 %	20 %	20 %	15617986
52	NC_000922	ACAAG	2	10	77339	77348	60 %	0 %	20 %	20 %	15617986
53	NC_000922	ATCTA	2	10	77955	77964	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
54	NC_000922	AAATC	2	10	79370	79379	60 %	20 %	0 %	20 %	15617989
55	NC_000922	TCTTT	2	10	79597	79606	0 %	80 %	0 %	20 %	15617989
56	NC_000922	AAGAG	2	10	80333	80342	60 %	0 %	40 %	0 %	15617989
57	NC_000922	CAACC	2	10	80363	80372	40 %	0 %	0 %	60 %	15617989
58	NC_000922	TTTTC	2	10	83654	83663	0 %	80 %	0 %	20 %	15617991
59	NC_000922	TGATT	2	10	88058	88067	20 %	60 %	20 %	0 %	15617996
60	NC_000922	TCAAG	2	10	88170	88179	40 %	20 %	20 %	20 %	15617996
61	NC_000922	AGTTT	2	10	88239	88248	20 %	60 %	20 %	0 %	15617996
62	NC_000922	AAGGT	2	10	89387	89396	40 %	20 %	40 %	0 %	15617997
63	NC_000922	AAGAA	2	10	91395	91404	80 %	0 %	20 %	0 %	15618000
64	NC_000922	ATGTA	2	10	92974	92983	40 %	40 %	20 %	0 %	15618002
65	NC_000922	TCAAA	2	10	93013	93022	60 %	20 %	0 %	20 %	15618002
66	NC_000922	AGAAA	2	10	94130	94139	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_000922	TCTTT	2	10	94154	94163	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
68	NC_000922	ACCAA	2	10	95642	95651	60 %	0 %	0 %	40 %	15618005
69	NC_000922	GTGAT	2	10	96419	96428	20 %	40 %	40 %	0 %	15618005
70	NC_000922	CAAAA	2	10	98669	98678	80 %	0 %	0 %	20 %	15618006
71	NC_000922	ATTAT	2	10	99578	99587	40 %	60 %	0 %	0 %	15618006
72	NC_000922	TCTTG	2	10	100955	100964	0 %	60 %	20 %	20 %	15618006
73	NC_000922	CAAAA	2	10	101432	101441	80 %	0 %	0 %	20 %	15618006
74	NC_000922	TTTCC	2	10	104154	104163	0 %	60 %	0 %	40 %	15618009
75	NC_000922	CATAG	2	10	104551	104560	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
76	NC_000922	GCAAG	2	10	112441	112450	40 %	0 %	40 %	20 %	15618016
77	NC_000922	GTTAG	2	10	115813	115822	20 %	40 %	40 %	0 %	15618018
78	NC_000922	TGGTT	2	10	117895	117904	0 %	60 %	40 %	0 %	161353778
79	NC_000922	ATGTT	2	10	121706	121715	20 %	60 %	20 %	0 %	15618020
80	NC_000922	TGAAA	2	10	121975	121984	60 %	20 %	20 %	0 %	15618020
81	NC_000922	TAGCC	2	10	122921	122930	20 %	20 %	20 %	40 %	15618020
82	NC_000922	GAAGA	2	10	123973	123982	60 %	0 %	40 %	0 %	15618020
83	NC_000922	ATTGG	2	10	125638	125647	20 %	40 %	40 %	0 %	15618021
84	NC_000922	TAGAA	2	10	126159	126168	60 %	20 %	20 %	0 %	15618022
85	NC_000922	AGAAA	2	10	126464	126473	80 %	0 %	20 %	0 %	15618022
86	NC_000922	AAAAT	2	10	127056	127065	80 %	20 %	0 %	0 %	15618022
87	NC_000922	CTTAT	2	10	130132	130141	20 %	60 %	0 %	20 %	15618026
88	NC_000922	TTGGG	2	10	130281	130290	0 %	40 %	60 %	0 %	15618026
89	NC_000922	TTTCT	2	10	130497	130506	0 %	80 %	0 %	20 %	15618026
90	NC_000922	ATTTT	2	10	131957	131966	20 %	80 %	0 %	0 %	15618027
91	NC_000922	TCTGG	2	10	134270	134279	0 %	40 %	40 %	20 %	15618029
92	NC_000922	AATCT	2	10	134780	134789	40 %	40 %	0 %	20 %	15618029
93	NC_000922	CTTTT	2	10	135507	135516	0 %	80 %	0 %	20 %	15618030
94	NC_000922	TTGTT	2	10	138408	138417	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_000922	AAGAT	2	10	139904	139913	60 %	20 %	20 %	0 %	15618033
96	NC_000922	AAGAA	2	10	141090	141099	80 %	0 %	20 %	0 %	15618033
97	NC_000922	CGCAT	2	10	141595	141604	20 %	20 %	20 %	40 %	15618033
98	NC_000922	CATAG	2	10	142844	142853	40 %	20 %	20 %	20 %	15618034
99	NC_000922	TTTTC	2	10	144199	144208	0 %	80 %	0 %	20 %	15618035
100	NC_000922	TATGT	2	10	144897	144906	20 %	60 %	20 %	0 %	15618036
101	NC_000922	GGTAG	2	10	144968	144977	20 %	20 %	60 %	0 %	15618036
102	NC_000922	GAAGA	2	10	147544	147553	60 %	0 %	40 %	0 %	15618039
103	NC_000922	AAAGA	2	10	151636	151645	80 %	0 %	20 %	0 %	15618044
104	NC_000922	TTTCT	2	10	152343	152352	0 %	80 %	0 %	20 %	15618046
105	NC_000922	GTAGA	2	10	153718	153727	40 %	20 %	40 %	0 %	15618046
106	NC_000922	TCTTT	2	10	153736	153745	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
107	NC_000922	AATAT	2	10	154439	154448	60 %	40 %	0 %	0 %	15618047
108	NC_000922	GATCA	2	10	154698	154707	40 %	20 %	20 %	20 %	15618047
109	NC_000922	TGAGG	2	10	155706	155715	20 %	20 %	60 %	0 %	15618047
110	NC_000922	TAGGA	2	10	155865	155874	40 %	20 %	40 %	0 %	15618047
111	NC_000922	GATAT	2	10	158513	158522	40 %	40 %	20 %	0 %	15618049
112	NC_000922	GGGGA	2	10	158637	158646	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
113	NC_000922	TTATA	2	10	160822	160831	40 %	60 %	0 %	0 %	15618050
114	NC_000922	GTTAG	2	10	161554	161563	20 %	40 %	40 %	0 %	15618051
115	NC_000922	TAGAG	2	10	161648	161657	40 %	20 %	40 %	0 %	15618051
116	NC_000922	ATACG	2	10	162338	162347	40 %	20 %	20 %	20 %	15618052
117	NC_000922	TATTT	2	10	163901	163910	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_000922	CGGAT	2	10	165627	165636	20 %	20 %	40 %	20 %	15618056
119	NC_000922	TCAGT	2	10	165705	165714	20 %	40 %	20 %	20 %	15618056
120	NC_000922	GAAGT	2	10	166419	166428	40 %	20 %	40 %	0 %	15618056
121	NC_000922	GCAAA	2	10	166507	166516	60 %	0 %	20 %	20 %	15618056
122	NC_000922	TCTTT	2	10	167406	167415	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
123	NC_000922	TATTT	2	10	169136	169145	20 %	80 %	0 %	0 %	15618059
124	NC_000922	ATGTT	2	10	170581	170590	20 %	60 %	20 %	0 %	15618060
125	NC_000922	TCAGT	2	10	171386	171395	20 %	40 %	20 %	20 %	15618060
126	NC_000922	ATAGG	2	10	172028	172037	40 %	20 %	40 %	0 %	15618061
127	NC_000922	TTTGA	2	10	173998	174007	20 %	60 %	20 %	0 %	15618062
128	NC_000922	GAGAG	2	10	176457	176466	40 %	0 %	60 %	0 %	15618067
129	NC_000922	ATACC	2	10	176695	176704	40 %	20 %	0 %	40 %	15618067
130	NC_000922	TTTGC	2	10	176918	176927	0 %	60 %	20 %	20 %	15618067
131	NC_000922	TTTTC	2	10	177584	177593	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
132	NC_000922	GAAGA	2	10	179349	179358	60 %	0 %	40 %	0 %	15618068
133	NC_000922	TTTTC	2	10	181455	181464	0 %	80 %	0 %	20 %	15618069
134	NC_000922	TCTCT	2	10	181507	181516	0 %	60 %	0 %	40 %	15618069
135	NC_000922	CATTT	2	10	182083	182092	20 %	60 %	0 %	20 %	15618069
136	NC_000922	TTTAT	2	10	182288	182297	20 %	80 %	0 %	0 %	15618069
137	NC_000922	TAAAA	2	10	184403	184412	80 %	20 %	0 %	0 %	15618072
138	NC_000922	TTATT	2	10	188162	188171	20 %	80 %	0 %	0 %	15618074
139	NC_000922	AGATT	2	10	188428	188437	40 %	40 %	20 %	0 %	15618074
140	NC_000922	AAAGA	2	10	190696	190705	80 %	0 %	20 %	0 %	15618074
141	NC_000922	CAAGA	2	10	193985	193994	60 %	0 %	20 %	20 %	15618075
142	NC_000922	CATTT	2	10	196124	196133	20 %	60 %	0 %	20 %	15618077
143	NC_000922	ATACC	2	10	197510	197519	40 %	20 %	0 %	40 %	15618077
144	NC_000922	AAAAT	2	10	199721	199730	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_000922	AAAGG	2	10	200526	200535	60 %	0 %	40 %	0 %	15618081
146	NC_000922	TAGAT	2	10	200813	200822	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
147	NC_000922	AAAGA	2	10	205995	206004	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
148	NC_000922	TTTGG	2	10	206282	206291	0 %	60 %	40 %	0 %	15618087
149	NC_000922	CTTTG	2	10	206375	206384	0 %	60 %	20 %	20 %	15618087
150	NC_000922	GTTTT	2	10	206720	206729	0 %	80 %	20 %	0 %	15618088
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152	NC_000922	TATAA	2	10	208722	208731	60 %	40 %	0 %	0 %	15618093
153	NC_000922	TAGAA	2	10	209920	209929	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
154	NC_000922	ATATT	2	10	210674	210683	40 %	60 %	0 %	0 %	15618094
155	NC_000922	ATGAT	2	10	211076	211085	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
156	NC_000922	GGCTT	2	10	211383	211392	0 %	40 %	40 %	20 %	15618095
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161	NC_000922	GTTGT	2	10	218263	218272	0 %	60 %	40 %	0 %	15618103
162	NC_000922	TCCCC	2	10	219018	219027	0 %	20 %	0 %	80 %	15618105
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171	NC_000922	CTTTT	2	10	237075	237084	0 %	80 %	0 %	20 %	15618120
172	NC_000922	CACTC	2	10	239486	239495	20 %	20 %	0 %	60 %	15618122
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174	NC_000922	TTTAA	2	10	240808	240817	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
175	NC_000922	CTCCA	2	10	241246	241255	20 %	20 %	0 %	60 %	15618123
176	NC_000922	ATACT	2	10	241556	241565	40 %	40 %	0 %	20 %	15618123
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178	NC_000922	TATTT	2	10	243064	243073	20 %	80 %	0 %	0 %	15618125
179	NC_000922	ATTAG	2	10	245134	245143	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
180	NC_000922	AATCT	2	10	245501	245510	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
181	NC_000922	CATGC	2	10	250751	250760	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
182	NC_000922	AGTGA	2	10	252299	252308	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
183	NC_000922	AAGCA	2	10	252700	252709	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
184	NC_000922	ATTTT	2	10	252808	252817	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
185	NC_000922	CTTTT	2	10	253225	253234	0 %	80 %	0 %	20 %	15618136
186	NC_000922	TCATT	2	10	254958	254967	20 %	60 %	0 %	20 %	15618138
187	NC_000922	ATCTA	2	10	255007	255016	40 %	40 %	0 %	20 %	15618138
188	NC_000922	AGAAA	2	10	257389	257398	80 %	0 %	20 %	0 %	15618140
189	NC_000922	TTTGA	2	10	257689	257698	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
190	NC_000922	GGCTT	2	10	257988	257997	0 %	40 %	40 %	20 %	15618141
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193	NC_000922	TAAAA	2	10	259098	259107	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
194	NC_000922	TAGCC	2	10	259644	259653	20 %	20 %	20 %	40 %	15618143
195	NC_000922	TCTTA	2	10	260232	260241	20 %	60 %	0 %	20 %	15618143
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198	NC_000922	ATTTT	2	10	261594	261603	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
199	NC_000922	ATTAG	2	10	261611	261620	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
200	NC_000922	TTCTC	2	10	266528	266537	0 %	60 %	0 %	40 %	15618153
201	NC_000922	TTTTC	2	10	267863	267872	0 %	80 %	0 %	20 %	15618154
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203	NC_000922	CTAAG	2	10	269128	269137	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
204	NC_000922	TAAAA	2	10	271304	271313	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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211	NC_000922	CTTTT	2	10	280669	280678	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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221	NC_000922	CAATC	2	10	287827	287836	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
222	NC_000922	GAGAA	2	10	289350	289359	60 %	0 %	40 %	0 %	15618177
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228	NC_000922	TTCTG	2	10	293825	293834	0 %	60 %	20 %	20 %	15618180
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239	NC_000922	CCAGT	2	10	313699	313708	20 %	20 %	20 %	40 %	15618200
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245	NC_000922	TGTTT	2	10	326738	326747	0 %	80 %	20 %	0 %	15618209
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253	NC_000922	ATGGG	2	10	338718	338727	20 %	20 %	60 %	0 %	15618220
254	NC_000922	GAATT	2	10	339335	339344	40 %	40 %	20 %	0 %	15618220
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268	NC_000922	GAAGG	2	10	367203	367212	40 %	0 %	60 %	0 %	15618242
269	NC_000922	TCACT	2	10	367270	367279	20 %	40 %	0 %	40 %	15618242
270	NC_000922	GTCAT	2	10	367653	367662	20 %	40 %	20 %	20 %	15618243
271	NC_000922	GATGC	2	10	367802	367811	20 %	20 %	40 %	20 %	15618243
272	NC_000922	TTTAA	2	10	373210	373219	40 %	60 %	0 %	0 %	15618247
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274	NC_000922	CTCTA	2	10	373986	373995	20 %	40 %	0 %	40 %	15618248
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403	NC_000922	TAAAA	2	10	549645	549654	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
404	NC_000922	AAAAT	2	10	549739	549748	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
405	NC_000922	TCCCT	2	10	551784	551793	0 %	40 %	0 %	60 %	15618386
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