MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Chlamydophila pneumoniae CWL029 chromosome

Total Repeats: 751

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_000922	ATTTA	2	10	187	196	40 %	60 %	0 %	0 %	15617930
2	NC_000922	ATAGA	2	10	980	989	60 %	20 %	20 %	0 %	15617932
3	NC_000922	TGTCT	2	10	1974	1983	0 %	60 %	20 %	20 %	15617932
4	NC_000922	GAAAA	2	10	3153	3162	80 %	0 %	20 %	0 %	15617933
5	NC_000922	ATAAA	2	10	5868	5877	80 %	20 %	0 %	0 %	15617934
6	NC_000922	TATAA	2	10	6860	6869	60 %	40 %	0 %	0 %	15617934
7	NC_000922	TCGAA	2	10	12459	12468	40 %	20 %	20 %	20 %	15617938
8	NC_000922	GGGAT	2	10	13872	13881	20 %	20 %	60 %	0 %	15617939
9	NC_000922	GAGGG	2	10	13994	14003	20 %	0 %	80 %	0 %	15617939
10	NC_000922	TGCTT	2	10	34191	34200	0 %	60 %	20 %	20 %	15617945
11	NC_000922	ATCTT	2	10	35069	35078	20 %	60 %	0 %	20 %	15617947
12	NC_000922	TTTTC	2	10	35826	35835	0 %	80 %	0 %	20 %	15617947
13	NC_000922	TCAAA	2	10	37062	37071	60 %	20 %	0 %	20 %	15617948
14	NC_000922	GGCAA	2	10	37968	37977	40 %	0 %	40 %	20 %	15617949
15	NC_000922	GCATA	2	10	39455	39464	40 %	20 %	20 %	20 %	15617950
16	NC_000922	AAGAC	2	10	41975	41984	60 %	0 %	20 %	20 %	15617951
17	NC_000922	TTTAA	2	10	42661	42670	40 %	60 %	0 %	0 %	15617952
18	NC_000922	ATTTG	2	10	43641	43650	20 %	60 %	20 %	0 %	15617953
19	NC_000922	CCGCT	2	10	46914	46923	0 %	20 %	20 %	60 %	15617957
20	NC_000922	GGATA	2	10	49955	49964	40 %	20 %	40 %	0 %	15617959
21	NC_000922	ATAAA	2	10	50102	50111	80 %	20 %	0 %	0 %	15617959
22	NC_000922	AGATC	2	10	51839	51848	40 %	20 %	20 %	20 %	15617961
23	NC_000922	CACAT	2	10	52718	52727	40 %	20 %	0 %	40 %	15617962
24	NC_000922	TCGAG	2	10	57594	57603	20 %	20 %	40 %	20 %	15617966
25	NC_000922	GAGAG	2	10	58154	58163	40 %	0 %	60 %	0 %	15617966
26	NC_000922	AGCAA	2	10	58791	58800	60 %	0 %	20 %	20 %	15617967
27	NC_000922	ATTTA	2	10	59799	59808	40 %	60 %	0 %	0 %	15617967
28	NC_000922	TAAGC	2	10	63728	63737	40 %	20 %	20 %	20 %	15617972
29	NC_000922	CTAAA	2	10	66158	66167	60 %	20 %	0 %	20 %	15617973
30	NC_000922	GCAAA	2	10	66558	66567	60 %	0 %	20 %	20 %	15617974
31	NC_000922	CTATA	2	10	67411	67420	40 %	40 %	0 %	20 %	15617976
32	NC_000922	AAAGT	2	10	68640	68649	60 %	20 %	20 %	0 %	15617977
33	NC_000922	CCGTG	2	10	69787	69796	0 %	20 %	40 %	40 %	15617978
34	NC_000922	TATTT	2	10	70182	70191	20 %	80 %	0 %	0 %	15617979
35	NC_000922	ATTTT	2	10	72709	72718	20 %	80 %	0 %	0 %	15617980
36	NC_000922	CCAAC	2	10	74234	74243	40 %	0 %	0 %	60 %	15617982
37	NC_000922	TGCCC	2	10	75935	75944	0 %	20 %	20 %	60 %	15617985
38	NC_000922	TTCTT	2	10	76048	76057	0 %	80 %	0 %	20 %	15617985
39	NC_000922	TACAT	2	10	76419	76428	40 %	40 %	0 %	20 %	15617986
40	NC_000922	CTAAC	2	10	76684	76693	40 %	20 %	0 %	40 %	15617986
41	NC_000922	TACGA	2	10	77221	77230	40 %	20 %	20 %	20 %	15617986
42	NC_000922	ACAAG	2	10	77339	77348	60 %	0 %	20 %	20 %	15617986
43	NC_000922	AAATC	2	10	79370	79379	60 %	20 %	0 %	20 %	15617989
44	NC_000922	TCTTT	2	10	79597	79606	0 %	80 %	0 %	20 %	15617989
45	NC_000922	AAGAG	2	10	80333	80342	60 %	0 %	40 %	0 %	15617989
46	NC_000922	CAACC	2	10	80363	80372	40 %	0 %	0 %	60 %	15617989
47	NC_000922	TTTTC	2	10	83654	83663	0 %	80 %	0 %	20 %	15617991
48	NC_000922	TGATT	2	10	88058	88067	20 %	60 %	20 %	0 %	15617996
49	NC_000922	TCAAG	2	10	88170	88179	40 %	20 %	20 %	20 %	15617996
50	NC_000922	AGTTT	2	10	88239	88248	20 %	60 %	20 %	0 %	15617996
51	NC_000922	AAGGT	2	10	89387	89396	40 %	20 %	40 %	0 %	15617997
52	NC_000922	AAGAA	2	10	91395	91404	80 %	0 %	20 %	0 %	15618000
53	NC_000922	ATGTA	2	10	92974	92983	40 %	40 %	20 %	0 %	15618002
54	NC_000922	TCAAA	2	10	93013	93022	60 %	20 %	0 %	20 %	15618002
55	NC_000922	ACCAA	2	10	95642	95651	60 %	0 %	0 %	40 %	15618005
56	NC_000922	GTGAT	2	10	96419	96428	20 %	40 %	40 %	0 %	15618005
57	NC_000922	CAAAA	2	10	98669	98678	80 %	0 %	0 %	20 %	15618006
58	NC_000922	ATTAT	2	10	99578	99587	40 %	60 %	0 %	0 %	15618006
59	NC_000922	TCTTG	2	10	100955	100964	0 %	60 %	20 %	20 %	15618006
60	NC_000922	CAAAA	2	10	101432	101441	80 %	0 %	0 %	20 %	15618006
61	NC_000922	TTTCC	2	10	104154	104163	0 %	60 %	0 %	40 %	15618009
62	NC_000922	GCAAG	2	10	112441	112450	40 %	0 %	40 %	20 %	15618016
63	NC_000922	GTTAG	2	10	115813	115822	20 %	40 %	40 %	0 %	15618018
64	NC_000922	TGGTT	2	10	117895	117904	0 %	60 %	40 %	0 %	161353778
65	NC_000922	ATGTT	2	10	121706	121715	20 %	60 %	20 %	0 %	15618020
66	NC_000922	TGAAA	2	10	121975	121984	60 %	20 %	20 %	0 %	15618020
67	NC_000922	TAGCC	2	10	122921	122930	20 %	20 %	20 %	40 %	15618020
68	NC_000922	GAAGA	2	10	123973	123982	60 %	0 %	40 %	0 %	15618020
69	NC_000922	ATTGG	2	10	125638	125647	20 %	40 %	40 %	0 %	15618021
70	NC_000922	TAGAA	2	10	126159	126168	60 %	20 %	20 %	0 %	15618022
71	NC_000922	AGAAA	2	10	126464	126473	80 %	0 %	20 %	0 %	15618022
72	NC_000922	AAAAT	2	10	127056	127065	80 %	20 %	0 %	0 %	15618022
73	NC_000922	CTTAT	2	10	130132	130141	20 %	60 %	0 %	20 %	15618026
74	NC_000922	TTGGG	2	10	130281	130290	0 %	40 %	60 %	0 %	15618026
75	NC_000922	TTTCT	2	10	130497	130506	0 %	80 %	0 %	20 %	15618026
76	NC_000922	ATTTT	2	10	131957	131966	20 %	80 %	0 %	0 %	15618027
77	NC_000922	TCTGG	2	10	134270	134279	0 %	40 %	40 %	20 %	15618029
78	NC_000922	AATCT	2	10	134780	134789	40 %	40 %	0 %	20 %	15618029
79	NC_000922	CTTTT	2	10	135507	135516	0 %	80 %	0 %	20 %	15618030
80	NC_000922	AAGAT	2	10	139904	139913	60 %	20 %	20 %	0 %	15618033
81	NC_000922	AAGAA	2	10	141090	141099	80 %	0 %	20 %	0 %	15618033
82	NC_000922	CGCAT	2	10	141595	141604	20 %	20 %	20 %	40 %	15618033
83	NC_000922	CATAG	2	10	142844	142853	40 %	20 %	20 %	20 %	15618034
84	NC_000922	TTTTC	2	10	144199	144208	0 %	80 %	0 %	20 %	15618035
85	NC_000922	TATGT	2	10	144897	144906	20 %	60 %	20 %	0 %	15618036
86	NC_000922	GGTAG	2	10	144968	144977	20 %	20 %	60 %	0 %	15618036
87	NC_000922	GAAGA	2	10	147544	147553	60 %	0 %	40 %	0 %	15618039
88	NC_000922	AAAGA	2	10	151636	151645	80 %	0 %	20 %	0 %	15618044
89	NC_000922	TTTCT	2	10	152343	152352	0 %	80 %	0 %	20 %	15618046
90	NC_000922	GTAGA	2	10	153718	153727	40 %	20 %	40 %	0 %	15618046
91	NC_000922	AATAT	2	10	154439	154448	60 %	40 %	0 %	0 %	15618047
92	NC_000922	GATCA	2	10	154698	154707	40 %	20 %	20 %	20 %	15618047
93	NC_000922	TGAGG	2	10	155706	155715	20 %	20 %	60 %	0 %	15618047
94	NC_000922	TAGGA	2	10	155865	155874	40 %	20 %	40 %	0 %	15618047
95	NC_000922	GATAT	2	10	158513	158522	40 %	40 %	20 %	0 %	15618049
96	NC_000922	TTATA	2	10	160822	160831	40 %	60 %	0 %	0 %	15618050
97	NC_000922	GTTAG	2	10	161554	161563	20 %	40 %	40 %	0 %	15618051
98	NC_000922	TAGAG	2	10	161648	161657	40 %	20 %	40 %	0 %	15618051
99	NC_000922	ATACG	2	10	162338	162347	40 %	20 %	20 %	20 %	15618052
100	NC_000922	CGGAT	2	10	165627	165636	20 %	20 %	40 %	20 %	15618056
101	NC_000922	TCAGT	2	10	165705	165714	20 %	40 %	20 %	20 %	15618056
102	NC_000922	GAAGT	2	10	166419	166428	40 %	20 %	40 %	0 %	15618056
103	NC_000922	GCAAA	2	10	166507	166516	60 %	0 %	20 %	20 %	15618056
104	NC_000922	TATTT	2	10	169136	169145	20 %	80 %	0 %	0 %	15618059
105	NC_000922	ATGTT	2	10	170581	170590	20 %	60 %	20 %	0 %	15618060
106	NC_000922	TCAGT	2	10	171386	171395	20 %	40 %	20 %	20 %	15618060
107	NC_000922	ATAGG	2	10	172028	172037	40 %	20 %	40 %	0 %	15618061
108	NC_000922	TTTGA	2	10	173998	174007	20 %	60 %	20 %	0 %	15618062
109	NC_000922	GAGAG	2	10	176457	176466	40 %	0 %	60 %	0 %	15618067
110	NC_000922	ATACC	2	10	176695	176704	40 %	20 %	0 %	40 %	15618067
111	NC_000922	TTTGC	2	10	176918	176927	0 %	60 %	20 %	20 %	15618067
112	NC_000922	GAAGA	2	10	179349	179358	60 %	0 %	40 %	0 %	15618068
113	NC_000922	TTTTC	2	10	181455	181464	0 %	80 %	0 %	20 %	15618069
114	NC_000922	TCTCT	2	10	181507	181516	0 %	60 %	0 %	40 %	15618069
115	NC_000922	CATTT	2	10	182083	182092	20 %	60 %	0 %	20 %	15618069
116	NC_000922	TTTAT	2	10	182288	182297	20 %	80 %	0 %	0 %	15618069
117	NC_000922	TAAAA	2	10	184403	184412	80 %	20 %	0 %	0 %	15618072
118	NC_000922	TTATT	2	10	188162	188171	20 %	80 %	0 %	0 %	15618074
119	NC_000922	AGATT	2	10	188428	188437	40 %	40 %	20 %	0 %	15618074
120	NC_000922	AAAGA	2	10	190696	190705	80 %	0 %	20 %	0 %	15618074
121	NC_000922	CAAGA	2	10	193985	193994	60 %	0 %	20 %	20 %	15618075
122	NC_000922	CATTT	2	10	196124	196133	20 %	60 %	0 %	20 %	15618077
123	NC_000922	ATACC	2	10	197510	197519	40 %	20 %	0 %	40 %	15618077
124	NC_000922	AAAGG	2	10	200526	200535	60 %	0 %	40 %	0 %	15618081
125	NC_000922	TTTGG	2	10	206282	206291	0 %	60 %	40 %	0 %	15618087
126	NC_000922	CTTTG	2	10	206375	206384	0 %	60 %	20 %	20 %	15618087
127	NC_000922	GTTTT	2	10	206720	206729	0 %	80 %	20 %	0 %	15618088
128	NC_000922	AAGGA	2	10	207509	207518	60 %	0 %	40 %	0 %	15618089
129	NC_000922	TATAA	2	10	208722	208731	60 %	40 %	0 %	0 %	15618093
130	NC_000922	ATATT	2	10	210674	210683	40 %	60 %	0 %	0 %	15618094
131	NC_000922	GGCTT	2	10	211383	211392	0 %	40 %	40 %	20 %	15618095
132	NC_000922	TGGAG	2	10	211884	211893	20 %	20 %	60 %	0 %	15618095
133	NC_000922	TTGCT	2	10	212355	212364	0 %	60 %	20 %	20 %	15618095
134	NC_000922	ATTCA	2	10	216014	216023	40 %	40 %	0 %	20 %	15618100
135	NC_000922	AGGTT	2	10	218078	218087	20 %	40 %	40 %	0 %	15618103
136	NC_000922	GTTGT	2	10	218263	218272	0 %	60 %	40 %	0 %	15618103
137	NC_000922	TCCCC	2	10	219018	219027	0 %	20 %	0 %	80 %	15618105
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