MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Chlamydophila pneumoniae CWL029 chromosome

Total Repeats: 3145

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_000922	AGCA	2	8	98	105	50 %	0 %	25 %	25 %	15617930
2	NC_000922	TCTT	2	8	512	519	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_000922	AGGT	2	8	1004	1011	25 %	25 %	50 %	0 %	15617932
4	NC_000922	AGAA	2	8	1212	1219	75 %	0 %	25 %	0 %	15617932
5	NC_000922	GTGC	2	8	2023	2030	0 %	25 %	50 %	25 %	15617932
6	NC_000922	CTAC	2	8	3133	3140	25 %	25 %	0 %	50 %	15617933
7	NC_000922	GAAC	2	8	3800	3807	50 %	0 %	25 %	25 %	15617933
8	NC_000922	GTCT	2	8	3851	3858	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_000922	CTAC	2	8	3965	3972	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_000922	GCTT	2	8	4062	4069	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_000922	TAAA	2	8	4341	4348	75 %	25 %	0 %	0 %	15617934
12	NC_000922	AAGG	2	8	4436	4443	50 %	0 %	50 %	0 %	15617934
13	NC_000922	AGGG	2	8	4887	4894	25 %	0 %	75 %	0 %	15617934
14	NC_000922	CTGT	2	8	4896	4903	0 %	50 %	25 %	25 %	15617934
15	NC_000922	GAAA	2	8	4976	4983	75 %	0 %	25 %	0 %	15617934
16	NC_000922	CATC	2	8	5197	5204	25 %	25 %	0 %	50 %	15617934
17	NC_000922	GATA	2	8	5566	5573	50 %	25 %	25 %	0 %	15617934
18	NC_000922	ACAG	2	8	5989	5996	50 %	0 %	25 %	25 %	15617934
19	NC_000922	GGAG	2	8	6437	6444	25 %	0 %	75 %	0 %	15617934
20	NC_000922	TGCT	2	8	7759	7766	0 %	50 %	25 %	25 %	15617936
21	NC_000922	TGCT	2	8	8089	8096	0 %	50 %	25 %	25 %	15617936
22	NC_000922	TGCT	2	8	8419	8426	0 %	50 %	25 %	25 %	15617936
23	NC_000922	GCCT	2	8	8635	8642	0 %	25 %	25 %	50 %	15617936
24	NC_000922	TTAT	2	8	8870	8877	25 %	75 %	0 %	0 %	15617936
25	NC_000922	AAGA	2	8	9858	9865	75 %	0 %	25 %	0 %	15617936
26	NC_000922	AGCA	2	8	10034	10041	50 %	0 %	25 %	25 %	15617936
27	NC_000922	TCGC	2	8	10528	10535	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
28	NC_000922	CGTA	2	8	11799	11806	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
29	NC_000922	ATTT	2	8	11841	11848	25 %	75 %	0 %	0 %	15617938
30	NC_000922	GTAC	2	8	12712	12719	25 %	25 %	25 %	25 %	15617938
31	NC_000922	ATGG	2	8	12909	12916	25 %	25 %	50 %	0 %	15617938
32	NC_000922	GGCA	2	8	12944	12951	25 %	0 %	50 %	25 %	15617938
33	NC_000922	TTTA	2	8	13182	13189	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_000922	GCAG	2	8	14522	14529	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
35	NC_000922	TTCT	2	8	14803	14810	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_000922	AGAA	2	8	14908	14915	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_000922	AAGA	2	8	15390	15397	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_000922	GATG	2	8	15466	15473	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_000922	AGGC	2	8	15526	15533	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
40	NC_000922	TGGT	2	8	15613	15620	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_000922	TTTA	2	8	15722	15729	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_000922	TTGT	2	8	16073	16080	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_000922	ATTT	2	8	16442	16449	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_000922	ATCT	2	8	16847	16854	25 %	50 %	0 %	25 %	15617942
45	NC_000922	CCTA	2	8	17626	17633	25 %	25 %	0 %	50 %	15617942
46	NC_000922	GAAA	2	8	17764	17771	75 %	0 %	25 %	0 %	15617942
47	NC_000922	CTCA	2	8	17832	17839	25 %	25 %	0 %	50 %	15617942
48	NC_000922	AAGA	2	8	18096	18103	75 %	0 %	25 %	0 %	15617942
49	NC_000922	AGAT	2	8	18137	18144	50 %	25 %	25 %	0 %	15617942
50	NC_000922	CTTT	2	8	18525	18532	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_000922	ATCT	2	8	18533	18540	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_000922	GAAA	2	8	18550	18557	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_000922	TTTC	2	8	18873	18880	0 %	75 %	0 %	25 %	15617943
54	NC_000922	CTTT	2	8	18974	18981	0 %	75 %	0 %	25 %	15617943
55	NC_000922	AATT	2	8	19108	19115	50 %	50 %	0 %	0 %	15617943
56	NC_000922	CTTT	2	8	19151	19158	0 %	75 %	0 %	25 %	15617943
57	NC_000922	GTTC	2	8	20153	20160	0 %	50 %	25 %	25 %	15617943
58	NC_000922	GAGG	2	8	20474	20481	25 %	0 %	75 %	0 %	15617943
59	NC_000922	CCAA	2	8	20931	20938	50 %	0 %	0 %	50 %	15617943
60	NC_000922	CTAC	2	8	21546	21553	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_000922	AAAG	2	8	21969	21976	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_000922	GAGC	2	8	22142	22149	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
63	NC_000922	CTAT	2	8	22280	22287	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_000922	AAAC	2	8	24632	24639	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_000922	ATTG	2	8	25184	25191	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_000922	ATGG	2	8	25817	25824	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_000922	TCAG	2	8	27097	27104	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
68	NC_000922	CTAC	2	8	27682	27689	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_000922	CTAT	2	8	28720	28727	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_000922	GGGA	2	8	29219	29226	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
71	NC_000922	GCCA	2	8	30758	30765	25 %	0 %	25 %	50 %	15617944
72	NC_000922	TTTC	2	8	31053	31060	0 %	75 %	0 %	25 %	15617944
73	NC_000922	AACG	2	8	31299	31306	50 %	0 %	25 %	25 %	15617944
74	NC_000922	TTGG	2	8	31647	31654	0 %	50 %	50 %	0 %	15617944
75	NC_000922	AGAA	2	8	32196	32203	75 %	0 %	25 %	0 %	15617944
76	NC_000922	TACA	2	8	32490	32497	50 %	25 %	0 %	25 %	15617944
77	NC_000922	TAGG	2	8	33177	33184	25 %	25 %	50 %	0 %	15617945
78	NC_000922	TGCT	2	8	33535	33542	0 %	50 %	25 %	25 %	15617945
79	NC_000922	ATGA	2	8	33907	33914	50 %	25 %	25 %	0 %	15617945
80	NC_000922	AAGG	2	8	34970	34977	50 %	0 %	50 %	0 %	15617946
81	NC_000922	AAGA	2	8	35172	35179	75 %	0 %	25 %	0 %	15617947
82	NC_000922	GGAT	2	8	35600	35607	25 %	25 %	50 %	0 %	15617947
83	NC_000922	CTCG	2	8	35774	35781	0 %	25 %	25 %	50 %	15617947
84	NC_000922	TGAC	2	8	35981	35988	25 %	25 %	25 %	25 %	15617947
85	NC_000922	TAGA	2	8	36295	36302	50 %	25 %	25 %	0 %	15617947
86	NC_000922	CTTT	2	8	37019	37026	0 %	75 %	0 %	25 %	15617948
87	NC_000922	ATAG	2	8	37579	37586	50 %	25 %	25 %	0 %	15617948
88	NC_000922	TATT	2	8	37682	37689	25 %	75 %	0 %	0 %	15617949
89	NC_000922	AGGT	2	8	37910	37917	25 %	25 %	50 %	0 %	15617949
90	NC_000922	TTCC	2	8	38232	38239	0 %	50 %	0 %	50 %	15617949
91	NC_000922	TAGG	2	8	38527	38534	25 %	25 %	50 %	0 %	15617949
92	NC_000922	TTGC	2	8	38774	38781	0 %	50 %	25 %	25 %	15617950
93	NC_000922	AGGG	2	8	38876	38883	25 %	0 %	75 %	0 %	15617950
94	NC_000922	TATG	2	8	38953	38960	25 %	50 %	25 %	0 %	15617950
95	NC_000922	GCTT	2	8	39127	39134	0 %	50 %	25 %	25 %	15617950
96	NC_000922	TTTG	2	8	39191	39198	0 %	75 %	25 %	0 %	15617950
97	NC_000922	AGGT	2	8	40169	40176	25 %	25 %	50 %	0 %	15617951
98	NC_000922	TGAG	2	8	40242	40249	25 %	25 %	50 %	0 %	15617951
99	NC_000922	GTAC	2	8	40493	40500	25 %	25 %	25 %	25 %	15617951
100	NC_000922	ACGT	2	8	40744	40751	25 %	25 %	25 %	25 %	15617951
101	NC_000922	CTTT	2	8	41178	41185	0 %	75 %	0 %	25 %	15617951
102	NC_000922	CATG	2	8	41556	41563	25 %	25 %	25 %	25 %	15617951
103	NC_000922	TTTA	2	8	42085	42092	25 %	75 %	0 %	0 %	15617951
104	NC_000922	ATAA	2	8	42101	42108	75 %	25 %	0 %	0 %	15617951
105	NC_000922	TGTC	2	8	42260	42267	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
106	NC_000922	GAAA	2	8	42840	42847	75 %	0 %	25 %	0 %	15617952
107	NC_000922	TTTC	2	8	43820	43827	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
108	NC_000922	TTTC	2	8	44105	44112	0 %	75 %	0 %	25 %	15617954
109	NC_000922	TGAA	2	8	44270	44277	50 %	25 %	25 %	0 %	15617954
110	NC_000922	TTAT	2	8	44682	44689	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_000922	ATGC	2	8	44707	44714	25 %	25 %	25 %	25 %	15617955
112	NC_000922	CTCC	2	8	45689	45696	0 %	25 %	0 %	75 %	15617956
113	NC_000922	GTCT	2	8	46994	47001	0 %	50 %	25 %	25 %	15617957
114	NC_000922	ATCA	2	8	47455	47462	50 %	25 %	0 %	25 %	15617957
115	NC_000922	TGCC	2	8	47733	47740	0 %	25 %	25 %	50 %	15617957
116	NC_000922	TTTC	2	8	49313	49320	0 %	75 %	0 %	25 %	15617958
117	NC_000922	AGCA	2	8	50528	50535	50 %	0 %	25 %	25 %	15617959
118	NC_000922	AGGA	2	8	50823	50830	50 %	0 %	50 %	0 %	15617959
119	NC_000922	GAAA	2	8	50990	50997	75 %	0 %	25 %	0 %	15617959
120	NC_000922	CTTT	2	8	51042	51049	0 %	75 %	0 %	25 %	15617960
121	NC_000922	CCTT	2	8	51646	51653	0 %	50 %	0 %	50 %	15617960
122	NC_000922	AATG	2	8	51791	51798	50 %	25 %	25 %	0 %	15617960
123	NC_000922	GCAG	2	8	52968	52975	25 %	0 %	50 %	25 %	15617962
124	NC_000922	CCTA	2	8	53066	53073	25 %	25 %	0 %	50 %	15617962
125	NC_000922	AAGA	2	8	53190	53197	75 %	0 %	25 %	0 %	15617962
126	NC_000922	TCCT	2	8	53437	53444	0 %	50 %	0 %	50 %	15617962
127	NC_000922	TTTA	2	8	53651	53658	25 %	75 %	0 %	0 %	15617962
128	NC_000922	TATC	2	8	54254	54261	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_000922	ATGA	2	8	54609	54616	50 %	25 %	25 %	0 %	15617964
130	NC_000922	CTTG	2	8	54729	54736	0 %	50 %	25 %	25 %	15617964
131	NC_000922	ATAG	2	8	55508	55515	50 %	25 %	25 %	0 %	15617964
132	NC_000922	AATC	2	8	56496	56503	50 %	25 %	0 %	25 %	15617965
133	NC_000922	GAAA	2	8	57135	57142	75 %	0 %	25 %	0 %	15617965
134	NC_000922	TCAT	2	8	57954	57961	25 %	50 %	0 %	25 %	15617966
135	NC_000922	GATG	2	8	58037	58044	25 %	25 %	50 %	0 %	15617966
136	NC_000922	GAAG	2	8	58095	58102	50 %	0 %	50 %	0 %	15617966
137	NC_000922	TTTA	2	8	58301	58308	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_000922	AGTT	2	8	58399	58406	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_000922	TGTC	2	8	58513	58520	0 %	50 %	25 %	25 %	15617967
140	NC_000922	TTTG	2	8	58945	58952	0 %	75 %	25 %	0 %	15617967
141	NC_000922	GGTG	2	8	59482	59489	0 %	25 %	75 %	0 %	15617967
142	NC_000922	GGAT	2	8	59625	59632	25 %	25 %	50 %	0 %	15617967
143	NC_000922	AGCA	2	8	60182	60189	50 %	0 %	25 %	25 %	15617967
144	NC_000922	AAGT	2	8	60783	60790	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
145	NC_000922	TTTA	2	8	60811	60818	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_000922	CACC	2	8	60976	60983	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
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