MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Chlamydophila pneumoniae CWL029 chromosome

Total Repeats: 15557

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_000922	ATG	2	6	16	21	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15617930
2	NC_000922	CCT	2	6	32	37	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15617930
3	NC_000922	AGC	2	6	42	47	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15617930
4	NC_000922	CTT	2	6	70	75	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15617930
5	NC_000922	ATA	2	6	128	133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15617930
6	NC_000922	AAT	2	6	181	186	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15617930
7	NC_000922	AAT	2	6	265	270	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15617930
8	NC_000922	TAA	2	6	339	344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_000922	CTT	2	6	363	368	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_000922	GTT	2	6	416	421	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_000922	AAG	2	6	423	428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_000922	AAC	2	6	442	447	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_000922	GAA	2	6	597	602	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15617931
14	NC_000922	CTT	2	6	667	672	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15617931
15	NC_000922	AAG	2	6	697	702	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15617931
16	NC_000922	TGA	2	6	719	724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15617931
17	NC_000922	GTA	2	6	756	761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15617931
18	NC_000922	ATA	2	6	1127	1132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15617932
19	NC_000922	ACA	2	6	1153	1158	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15617932
20	NC_000922	ACC	2	6	1188	1193	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15617932
21	NC_000922	TGT	2	6	1206	1211	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15617932
22	NC_000922	CAA	2	6	1280	1285	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15617932
23	NC_000922	TTC	2	6	1347	1352	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15617932
24	NC_000922	GGA	2	6	1414	1419	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15617932
25	NC_000922	GCA	2	6	1435	1440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15617932
26	NC_000922	AGA	2	6	1548	1553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15617932
27	NC_000922	ATG	2	6	1564	1569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15617932
28	NC_000922	TGA	2	6	1701	1706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15617932
29	NC_000922	TCT	2	6	1721	1726	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15617932
30	NC_000922	CTG	2	6	1823	1828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15617932
31	NC_000922	TAT	2	6	2002	2007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15617932
32	NC_000922	AGG	2	6	2219	2224	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15617932
33	NC_000922	CAA	2	6	2269	2274	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15617932
34	NC_000922	GTT	2	6	2350	2355	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15617932
35	NC_000922	AGG	2	6	2358	2363	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15617932
36	NC_000922	TAT	2	6	2678	2683	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15617933
37	NC_000922	GAG	2	6	2686	2691	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15617933
38	NC_000922	AGA	2	6	2753	2758	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15617933
39	NC_000922	CTT	2	6	2887	2892	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15617933
40	NC_000922	GAA	2	6	2937	2942	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15617933
41	NC_000922	AAC	2	6	3067	3072	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15617933
42	NC_000922	ATG	2	6	3579	3584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15617933
43	NC_000922	GAG	2	6	3606	3611	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15617933
44	NC_000922	GCT	2	6	3632	3637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15617933
45	NC_000922	GGT	2	6	3680	3685	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15617933
46	NC_000922	CAG	2	6	3772	3777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15617933
47	NC_000922	CTC	2	6	3784	3789	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15617933
48	NC_000922	CTT	2	6	4191	4196	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15617934
49	NC_000922	CTA	2	6	4203	4208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15617934
50	NC_000922	AGA	2	6	4225	4230	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15617934
51	NC_000922	ATC	2	6	4392	4397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15617934
52	NC_000922	TAA	2	6	4411	4416	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15617934
53	NC_000922	TTG	2	6	4453	4458	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15617934
54	NC_000922	TAG	2	6	4653	4658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15617934
55	NC_000922	TTC	2	6	4717	4722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15617934
56	NC_000922	ACT	2	6	4871	4876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15617934
57	NC_000922	AGT	2	6	4922	4927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15617934
58	NC_000922	AGG	2	6	5038	5043	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15617934
59	NC_000922	AAT	2	6	5060	5065	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15617934
60	NC_000922	CAG	2	6	5136	5141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15617934
61	NC_000922	TTA	2	6	5442	5447	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15617934
62	NC_000922	CAG	2	6	5598	5603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15617934
63	NC_000922	TTA	2	6	5607	5612	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15617934
64	NC_000922	CTG	2	6	5766	5771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15617934
65	NC_000922	TTC	2	6	5858	5863	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15617934
66	NC_000922	AAG	2	6	5898	5903	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15617934
67	NC_000922	TTC	2	6	6029	6034	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15617934
68	NC_000922	AAT	2	6	6101	6106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15617934
69	NC_000922	TAG	2	6	6154	6159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15617934
70	NC_000922	CAA	2	6	6181	6186	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15617934
71	NC_000922	AAG	2	6	6295	6300	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15617934
72	NC_000922	TTC	2	6	6303	6308	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15617934
73	NC_000922	CCA	2	6	6354	6359	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15617934
74	NC_000922	TTG	2	6	6418	6423	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15617934
75	NC_000922	GAC	2	6	6544	6549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15617934
76	NC_000922	GCT	2	6	6704	6709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15617934
77	NC_000922	GCA	2	6	6743	6748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15617934
78	NC_000922	GCC	2	6	6840	6845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15617934
79	NC_000922	GAG	2	6	7120	7125	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_000922	CTT	2	6	7345	7350	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_000922	TCT	2	6	7435	7440	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_000922	ATG	2	6	7447	7452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_000922	TTA	2	6	7481	7486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_000922	ATT	2	6	7650	7655	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15617936
85	NC_000922	GGT	2	6	7665	7670	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15617936
86	NC_000922	TTC	2	6	7715	7720	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15617936
87	NC_000922	TTC	2	6	7780	7785	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15617936
88	NC_000922	GAA	2	6	7787	7792	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15617936
89	NC_000922	ATT	2	6	7980	7985	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15617936
90	NC_000922	GTG	2	6	7996	8001	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15617936
91	NC_000922	TTC	2	6	8045	8050	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15617936
92	NC_000922	TTC	2	6	8110	8115	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15617936
93	NC_000922	GAA	2	6	8117	8122	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15617936
94	NC_000922	ATT	2	6	8310	8315	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15617936
95	NC_000922	GTG	2	6	8326	8331	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15617936
96	NC_000922	TTC	2	6	8375	8380	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15617936
97	NC_000922	TTC	2	6	8440	8445	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15617936
98	NC_000922	GAA	2	6	8447	8452	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15617936
99	NC_000922	TAG	2	6	8467	8472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15617936
100	NC_000922	GAA	2	6	8490	8495	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15617936
101	NC_000922	GTC	2	6	8496	8501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15617936
102	NC_000922	GAT	2	6	8505	8510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15617936
103	NC_000922	GCA	2	6	8534	8539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15617936
104	NC_000922	GAG	2	6	8571	8576	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15617936
105	NC_000922	ATG	2	6	8644	8649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15617936
106	NC_000922	AGA	2	6	8660	8665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15617936
107	NC_000922	GTC	2	6	8688	8693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15617936
108	NC_000922	TCT	2	6	8697	8702	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15617936
109	NC_000922	AGA	2	6	8736	8741	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15617936
110	NC_000922	GAA	3	9	8748	8756	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15617936
111	NC_000922	CTA	2	6	8800	8805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15617936
112	NC_000922	TAG	2	6	8809	8814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15617936
113	NC_000922	AAT	2	6	8847	8852	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15617936
114	NC_000922	ATT	2	6	8970	8975	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15617936
115	NC_000922	ATA	2	6	9139	9144	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15617936
116	NC_000922	TGA	2	6	9221	9226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15617936
117	NC_000922	TGA	2	6	9311	9316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15617936
118	NC_000922	AGA	2	6	9325	9330	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15617936
119	NC_000922	TCT	2	6	9444	9449	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15617936
120	NC_000922	AGA	3	9	9536	9544	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15617936
121	NC_000922	GAC	2	6	9584	9589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15617936
122	NC_000922	GAA	2	6	9619	9624	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15617936
123	NC_000922	GGA	2	6	9641	9646	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15617936
124	NC_000922	AAG	2	6	9680	9685	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15617936
125	NC_000922	ACT	2	6	9817	9822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15617936
126	NC_000922	AAG	2	6	9958	9963	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15617936
127	NC_000922	AGG	2	6	10120	10125	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15617936
128	NC_000922	GAA	2	6	10140	10145	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15617936
129	NC_000922	CTT	2	6	10197	10202	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15617936
130	NC_000922	ATT	2	6	10348	10353	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15617936
131	NC_000922	GAA	2	6	10449	10454	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15617936
132	NC_000922	ACG	2	6	10625	10630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_000922	CTT	2	6	10639	10644	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_000922	ATG	2	6	10757	10762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_000922	TTG	2	6	10891	10896	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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264	NC_000922	TGA	2	6	20047	20052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15617943
265	NC_000922	CTG	2	6	20097	20102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15617943
266	NC_000922	AGG	2	6	20106	20111	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15617943
267	NC_000922	TCT	2	6	20128	20133	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15617943
268	NC_000922	GTA	2	6	20297	20302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15617943
269	NC_000922	GTG	2	6	20325	20330	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15617943
270	NC_000922	ACT	2	6	20376	20381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15617943
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273	NC_000922	ATC	2	6	20562	20567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15617943
274	NC_000922	CTT	2	6	20622	20627	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15617943
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277	NC_000922	GTA	2	6	20898	20903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15617943
278	NC_000922	GCA	2	6	21020	21025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15617943
279	NC_000922	TCT	2	6	21062	21067	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15617943
280	NC_000922	AGA	2	6	21191	21196	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
281	NC_000922	TAG	2	6	21302	21307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
282	NC_000922	TCT	2	6	21398	21403	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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284	NC_000922	GCT	2	6	21707	21712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
285	NC_000922	CAG	2	6	21718	21723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
286	NC_000922	TTC	2	6	21757	21762	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
287	NC_000922	GCT	2	6	21819	21824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
288	NC_000922	CCT	2	6	21962	21967	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
289	NC_000922	CTT	2	6	22049	22054	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
290	NC_000922	TAA	2	6	22101	22106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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292	NC_000922	AGG	2	6	22173	22178	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
293	NC_000922	CAA	2	6	22251	22256	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
294	NC_000922	ACA	2	6	22264	22269	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
295	NC_000922	GAG	2	6	22274	22279	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
296	NC_000922	GGA	2	6	22312	22317	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
297	NC_000922	CCG	2	6	22409	22414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
298	NC_000922	GTG	2	6	22418	22423	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
299	NC_000922	CTA	2	6	22454	22459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
300	NC_000922	AGT	2	6	22477	22482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
301	NC_000922	CTG	3	9	22523	22531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
302	NC_000922	ATC	2	6	22569	22574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
303	NC_000922	CAT	2	6	22644	22649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
304	NC_000922	CTA	2	6	22711	22716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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323	NC_000922	ATT	2	6	24722	24727	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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399	NC_000922	ATC	2	6	30718	30723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15617944
400	NC_000922	AAT	2	6	30811	30816	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15617944
401	NC_000922	ATA	2	6	31312	31317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15617944
402	NC_000922	GAG	2	6	31396	31401	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15617944
403	NC_000922	GGA	2	6	31446	31451	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15617944
404	NC_000922	TAT	2	6	31598	31603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15617944
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408	NC_000922	GAG	2	6	32020	32025	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15617944
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411	NC_000922	TGT	2	6	32181	32186	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15617944
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453	NC_000922	CTC	2	6	34993	34998	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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