MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Chlamydophila pneumoniae CWL029 chromosome

Total Repeats: 2588

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_000922	CA	3	6	168	173	50 %	0 %	0 %	50 %	15617930
2	NC_000922	AG	3	6	248	253	50 %	0 %	50 %	0 %	15617930
3	NC_000922	TC	3	6	377	382	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_000922	AG	3	6	465	470	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_000922	GA	3	6	776	781	50 %	0 %	50 %	0 %	15617931
6	NC_000922	AG	3	6	1609	1614	50 %	0 %	50 %	0 %	15617932
7	NC_000922	TA	3	6	1803	1808	50 %	50 %	0 %	0 %	15617932
8	NC_000922	TC	3	6	1914	1919	0 %	50 %	0 %	50 %	15617932
9	NC_000922	GA	3	6	1987	1992	50 %	0 %	50 %	0 %	15617932
10	NC_000922	TC	3	6	2593	2598	0 %	50 %	0 %	50 %	15617933
11	NC_000922	AG	3	6	3185	3190	50 %	0 %	50 %	0 %	15617933
12	NC_000922	TA	3	6	3252	3257	50 %	50 %	0 %	0 %	15617933
13	NC_000922	CT	3	6	4502	4507	0 %	50 %	0 %	50 %	15617934
14	NC_000922	AT	3	6	5064	5069	50 %	50 %	0 %	0 %	15617934
15	NC_000922	CT	3	6	5726	5731	0 %	50 %	0 %	50 %	15617934
16	NC_000922	TC	3	6	6289	6294	0 %	50 %	0 %	50 %	15617934
17	NC_000922	TG	3	6	6911	6916	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_000922	TG	3	6	6977	6982	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_000922	CT	3	6	7259	7264	0 %	50 %	0 %	50 %	15617935
20	NC_000922	CT	3	6	7562	7567	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_000922	TC	3	6	7575	7580	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_000922	TG	3	6	7752	7757	0 %	50 %	50 %	0 %	15617936
23	NC_000922	TG	3	6	8082	8087	0 %	50 %	50 %	0 %	15617936
24	NC_000922	TG	3	6	8412	8417	0 %	50 %	50 %	0 %	15617936
25	NC_000922	AG	3	6	8519	8524	50 %	0 %	50 %	0 %	15617936
26	NC_000922	AG	3	6	8813	8818	50 %	0 %	50 %	0 %	15617936
27	NC_000922	GA	3	6	9477	9482	50 %	0 %	50 %	0 %	15617936
28	NC_000922	GA	4	8	9531	9538	50 %	0 %	50 %	0 %	15617936
29	NC_000922	AG	3	6	9767	9772	50 %	0 %	50 %	0 %	15617936
30	NC_000922	GC	3	6	10027	10032	0 %	0 %	50 %	50 %	15617936
31	NC_000922	AG	3	6	10205	10210	50 %	0 %	50 %	0 %	15617936
32	NC_000922	AG	3	6	10313	10318	50 %	0 %	50 %	0 %	15617936
33	NC_000922	CT	3	6	10473	10478	0 %	50 %	0 %	50 %	15617936
34	NC_000922	CT	3	6	10824	10829	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_000922	AG	3	6	11184	11189	50 %	0 %	50 %	0 %	15617937
36	NC_000922	GT	3	6	11413	11418	0 %	50 %	50 %	0 %	15617937
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38	NC_000922	GA	3	6	12063	12068	50 %	0 %	50 %	0 %	15617938
39	NC_000922	GA	3	6	12103	12108	50 %	0 %	50 %	0 %	15617938
40	NC_000922	AG	3	6	12114	12119	50 %	0 %	50 %	0 %	15617938
41	NC_000922	TC	3	6	12261	12266	0 %	50 %	0 %	50 %	15617938
42	NC_000922	AG	3	6	12345	12350	50 %	0 %	50 %	0 %	15617938
43	NC_000922	CT	3	6	12537	12542	0 %	50 %	0 %	50 %	15617938
44	NC_000922	GA	3	6	12676	12681	50 %	0 %	50 %	0 %	15617938
45	NC_000922	AG	3	6	12736	12741	50 %	0 %	50 %	0 %	15617938
46	NC_000922	AG	3	6	12934	12939	50 %	0 %	50 %	0 %	15617938
47	NC_000922	TA	3	6	13259	13264	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_000922	CT	3	6	13457	13462	0 %	50 %	0 %	50 %	15617939
49	NC_000922	TC	3	6	13521	13526	0 %	50 %	0 %	50 %	15617939
50	NC_000922	GA	3	6	13580	13585	50 %	0 %	50 %	0 %	15617939
51	NC_000922	GT	3	6	14147	14152	0 %	50 %	50 %	0 %	15617939
52	NC_000922	AG	3	6	14399	14404	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_000922	GA	3	6	14601	14606	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_000922	AG	3	6	14652	14657	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_000922	AG	3	6	14954	14959	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_000922	TG	3	6	15339	15344	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_000922	GA	3	6	15483	15488	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_000922	GA	3	6	15491	15496	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_000922	GA	3	6	15812	15817	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_000922	AT	4	8	17281	17288	50 %	50 %	0 %	0 %	15617942
61	NC_000922	AG	3	6	17826	17831	50 %	0 %	50 %	0 %	15617942
62	NC_000922	TA	3	6	17904	17909	50 %	50 %	0 %	0 %	15617942
63	NC_000922	CT	3	6	18053	18058	0 %	50 %	0 %	50 %	15617942
64	NC_000922	TC	3	6	19374	19379	0 %	50 %	0 %	50 %	15617943
65	NC_000922	GA	3	6	19563	19568	50 %	0 %	50 %	0 %	15617943
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67	NC_000922	CT	3	6	19789	19794	0 %	50 %	0 %	50 %	15617943
68	NC_000922	CT	3	6	21216	21221	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_000922	TA	3	6	21379	21384	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_000922	CT	3	6	21664	21669	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_000922	CT	3	6	23256	23261	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_000922	CT	3	6	23516	23521	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_000922	TC	3	6	23546	23551	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_000922	CT	3	6	24465	24470	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_000922	GA	3	6	25401	25406	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_000922	CT	3	6	25598	25603	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_000922	GA	3	6	25662	25667	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_000922	TC	3	6	26930	26935	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_000922	CT	3	6	27241	27246	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_000922	TC	3	6	27690	27695	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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82	NC_000922	TC	3	6	28470	28475	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_000922	CT	3	6	28501	28506	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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86	NC_000922	GA	3	6	30084	30089	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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88	NC_000922	AG	3	6	30385	30390	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_000922	TC	3	6	30436	30441	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_000922	AG	4	8	30843	30850	50 %	0 %	50 %	0 %	15617944
91	NC_000922	GC	3	6	31494	31499	0 %	0 %	50 %	50 %	15617944
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93	NC_000922	AT	3	6	32275	32280	50 %	50 %	0 %	0 %	15617944
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99	NC_000922	AC	3	6	35343	35348	50 %	0 %	0 %	50 %	15617947
100	NC_000922	TC	3	6	35748	35753	0 %	50 %	0 %	50 %	15617947
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109	NC_000922	CT	3	6	39644	39649	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_000922	TC	3	6	39939	39944	0 %	50 %	0 %	50 %	15617951
111	NC_000922	GA	3	6	40039	40044	50 %	0 %	50 %	0 %	15617951
112	NC_000922	TA	4	8	40267	40274	50 %	50 %	0 %	0 %	15617951
113	NC_000922	AG	3	6	41691	41696	50 %	0 %	50 %	0 %	15617951
114	NC_000922	AT	3	6	41987	41992	50 %	50 %	0 %	0 %	15617951
115	NC_000922	AT	3	6	42367	42372	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_000922	AG	3	6	43058	43063	50 %	0 %	50 %	0 %	15617952
117	NC_000922	GA	3	6	43093	43098	50 %	0 %	50 %	0 %	15617952
118	NC_000922	TC	3	6	43405	43410	0 %	50 %	0 %	50 %	15617953
119	NC_000922	TA	3	6	43720	43725	50 %	50 %	0 %	0 %	15617953
120	NC_000922	TG	3	6	43948	43953	0 %	50 %	50 %	0 %	15617954
121	NC_000922	TC	3	6	44040	44045	0 %	50 %	0 %	50 %	15617954
122	NC_000922	CT	3	6	44308	44313	0 %	50 %	0 %	50 %	15617954
123	NC_000922	TC	3	6	44495	44500	0 %	50 %	0 %	50 %	15617954
124	NC_000922	GA	4	8	46127	46134	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_000922	CT	3	6	46231	46236	0 %	50 %	0 %	50 %	15617957
126	NC_000922	TC	3	6	46386	46391	0 %	50 %	0 %	50 %	15617957
127	NC_000922	AG	3	6	48218	48223	50 %	0 %	50 %	0 %	15617958
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129	NC_000922	GC	3	6	48590	48595	0 %	0 %	50 %	50 %	15617958
130	NC_000922	AG	3	6	48919	48924	50 %	0 %	50 %	0 %	15617958
131	NC_000922	GA	4	8	49976	49983	50 %	0 %	50 %	0 %	15617959
132	NC_000922	GA	3	6	50075	50080	50 %	0 %	50 %	0 %	15617959
133	NC_000922	GA	4	8	50203	50210	50 %	0 %	50 %	0 %	15617959
134	NC_000922	AG	3	6	50297	50302	50 %	0 %	50 %	0 %	15617959
135	NC_000922	CA	3	6	50309	50314	50 %	0 %	0 %	50 %	15617959
136	NC_000922	GA	3	6	50315	50320	50 %	0 %	50 %	0 %	15617959
137	NC_000922	AG	3	6	51676	51681	50 %	0 %	50 %	0 %	15617960
138	NC_000922	AG	3	6	53079	53084	50 %	0 %	50 %	0 %	15617962
139	NC_000922	TC	3	6	53456	53461	0 %	50 %	0 %	50 %	15617962
140	NC_000922	GA	3	6	54885	54890	50 %	0 %	50 %	0 %	15617964
141	NC_000922	GA	5	10	54932	54941	50 %	0 %	50 %	0 %	15617964
142	NC_000922	TA	3	6	55823	55828	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_000922	CT	3	6	56018	56023	0 %	50 %	0 %	50 %	15617965
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145	NC_000922	AT	3	6	56511	56516	50 %	50 %	0 %	0 %	15617965
146	NC_000922	AG	3	6	56536	56541	50 %	0 %	50 %	0 %	15617965
147	NC_000922	TA	3	6	56549	56554	50 %	50 %	0 %	0 %	15617965
148	NC_000922	GT	4	8	56748	56755	0 %	50 %	50 %	0 %	15617965
149	NC_000922	GA	4	8	56766	56773	50 %	0 %	50 %	0 %	15617965
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