MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori J99 chromosome

Total Repeats: 80

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_000921	ATTATA	2	12	9894	9905	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_000921	AAACAC	2	12	18467	18478	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_000921	CACTAC	2	12	44978	44989	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_000921	ACTTAG	2	12	45114	45125	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_000921	TACAAA	2	12	93348	93359	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_000921	AAAAAT	2	12	93551	93562	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_000921	GATAAC	2	12	111580	111591	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_000921	GTTTTA	2	12	131131	131142	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_000921	TTGTTT	2	12	152860	152871	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_000921	TTTCAC	2	12	163921	163932	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_000921	TAAAAA	2	12	167830	167841	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_000921	AATCAA	2	12	180786	180797	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_000921	GAGATA	2	12	183988	183999	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_000921	TTATAA	2	12	215405	215416	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_000921	AAAAAC	2	12	215782	215793	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_000921	ATTAAA	2	12	229239	229250	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_000921	CAAAAA	2	12	235418	235429	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_000921	ATTTTA	2	12	252421	252432	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_000921	AAATTA	2	12	252456	252467	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_000921	GAAAAA	2	12	316160	316171	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_000921	TAGAAA	2	12	329703	329714	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_000921	AGAATT	2	12	337565	337576	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_000921	CAAAAT	2	12	337665	337676	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_000921	GTTTTT	2	12	362628	362639	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_000921	TTTTAT	2	12	377417	377428	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_000921	TAATCA	2	12	408543	408554	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_000921	AATTTA	2	12	408821	408832	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_000921	TAAAAA	2	12	434758	434769	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_000921	AAATTT	2	12	472167	472178	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_000921	TATTTT	2	12	473914	473925	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_000921	TTTTAA	2	12	500166	500177	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_000921	TTTAAA	2	12	531324	531335	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_000921	TGTTAT	2	12	532180	532191	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_000921	TTTAAA	2	12	550288	550299	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_000921	TTAGGG	2	12	564685	564696	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_000921	ATTTTA	2	12	583807	583818	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_000921	AAGAAA	2	12	691716	691727	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_000921	AAAAAT	2	12	697572	697583	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_000921	TTTTAA	2	12	713286	713297	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_000921	AAATTA	2	12	735545	735556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_000921	ATTTTT	2	12	888666	888677	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_000921	AAAATA	2	12	905128	905139	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_000921	TGCATT	2	12	915083	915094	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_000921	ATTATA	2	12	937063	937074	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_000921	ATTGAA	2	12	944575	944586	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_000921	TATGGG	2	12	994935	994946	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_000921	AAAAAC	2	12	1047987	1047998	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_000921	ATTTTG	2	12	1048352	1048363	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_000921	AGATTT	2	12	1048867	1048878	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_000921	AAACAA	2	12	1057138	1057149	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_000921	CTTTAA	2	12	1057411	1057422	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_000921	TGAAAA	2	12	1064237	1064248	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_000921	AATTAA	2	12	1102584	1102595	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_000921	GATTGC	2	12	1168778	1168789	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_000921	AATCAT	2	12	1189740	1189751	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_000921	AACGCC	2	12	1191750	1191761	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
57	NC_000921	GCATTT	2	12	1213334	1213345	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_000921	TTTTAA	2	12	1219614	1219625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_000921	ATTGGT	2	12	1224293	1224304	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_000921	ATCCTT	2	12	1239245	1239256	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_000921	TTGTAT	2	12	1241666	1241677	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_000921	ACTTAA	2	12	1258589	1258600	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_000921	TTTGAT	2	12	1296029	1296040	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_000921	TTTTTA	2	12	1341535	1341546	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_000921	ATAAAA	2	12	1341714	1341725	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_000921	CAAAGC	2	12	1344994	1345005	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_000921	TGTCCA	2	12	1403544	1403555	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_000921	TAAGAA	2	12	1414766	1414777	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_000921	GTTTTA	2	12	1424931	1424942	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_000921	AAACAA	2	12	1426976	1426987	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_000921	CTTTAA	2	12	1427249	1427260	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_000921	GTTTTA	2	12	1448466	1448477	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_000921	TAAAAA	2	12	1449254	1449265	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_000921	CTAAGT	2	12	1460808	1460819	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_000921	AATCAT	2	12	1464758	1464769	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_000921	AAAATT	2	12	1476274	1476285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_000921	AATCAA	2	12	1612052	1612063	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_000921	TAAATA	2	12	1620001	1620012	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_000921	AACTTT	2	12	1633366	1633377	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_000921	CAGTTT	2	12	1638926	1638937	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.