MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Helicobacter pylori J99 chromosome

Total Repeats: 1307

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_000921	TAAAA	2	10	1641	1650	80 %	20 %	0 %	0 %	15611074
2	NC_000921	AAGCA	2	10	3530	3539	60 %	0 %	20 %	20 %	15611077
3	NC_000921	CAAAA	2	10	5286	5295	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_000921	CAAAA	2	10	5348	5357	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
5	NC_000921	AAATT	2	10	7456	7465	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_000921	TTTCT	2	10	8540	8549	0 %	80 %	0 %	20 %	15611079
7	NC_000921	AAAGG	2	10	11013	11022	60 %	0 %	40 %	0 %	15611081
8	NC_000921	TTTTG	2	10	12069	12078	0 %	80 %	20 %	0 %	15611082
9	NC_000921	GGGTT	2	10	12291	12300	0 %	40 %	60 %	0 %	15611082
10	NC_000921	TGGTG	2	10	12905	12914	0 %	40 %	60 %	0 %	15611083
11	NC_000921	GCTTT	2	10	13732	13741	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
12	NC_000921	CTTTA	2	10	25619	25628	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_000921	GTTTG	2	10	25884	25893	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
14	NC_000921	GTTTG	2	10	25990	25999	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
15	NC_000921	AGCCT	2	10	26301	26310	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
16	NC_000921	CAAGC	2	10	28485	28494	40 %	0 %	20 %	40 %	15611094
17	NC_000921	TTTTA	2	10	29408	29417	20 %	80 %	0 %	0 %	15611095
18	NC_000921	TGATT	2	10	32374	32383	20 %	60 %	20 %	0 %	15611098
19	NC_000921	CAAGC	2	10	35315	35324	40 %	0 %	20 %	40 %	15611101
20	NC_000921	ATCAA	2	10	36386	36395	60 %	20 %	0 %	20 %	15611103
21	NC_000921	ATTTT	2	10	37050	37059	20 %	80 %	0 %	0 %	15611104
22	NC_000921	TTTTG	2	10	38882	38891	0 %	80 %	20 %	0 %	15611106
23	NC_000921	AGCCT	2	10	39695	39704	20 %	20 %	20 %	40 %	15611107
24	NC_000921	TGAGT	2	10	40902	40911	20 %	40 %	40 %	0 %	15611108
25	NC_000921	AAGCC	2	10	41287	41296	40 %	0 %	20 %	40 %	15611108
26	NC_000921	CAAAC	2	10	41928	41937	60 %	0 %	0 %	40 %	15611108
27	NC_000921	AGAAA	2	10	42613	42622	80 %	0 %	20 %	0 %	15611109
28	NC_000921	GCTGG	2	10	43258	43267	0 %	20 %	60 %	20 %	15611109
29	NC_000921	TAAAA	2	10	45907	45916	80 %	20 %	0 %	0 %	15611111
30	NC_000921	GCTCC	2	10	47240	47249	0 %	20 %	20 %	60 %	15611112
31	NC_000921	AAAAT	2	10	47419	47428	80 %	20 %	0 %	0 %	15611112
32	NC_000921	TCGCA	2	10	47777	47786	20 %	20 %	20 %	40 %	15611112
33	NC_000921	CAATA	2	10	49345	49354	60 %	20 %	0 %	20 %	15611113
34	NC_000921	GATTG	2	10	50517	50526	20 %	40 %	40 %	0 %	15611115
35	NC_000921	GCTTT	2	10	50573	50582	0 %	60 %	20 %	20 %	15611115
36	NC_000921	TAAAA	2	10	51747	51756	80 %	20 %	0 %	0 %	15611116
37	NC_000921	ATTTC	2	10	51822	51831	20 %	60 %	0 %	20 %	15611116
38	NC_000921	TGAAA	2	10	53727	53736	60 %	20 %	20 %	0 %	15611118
39	NC_000921	CAGCA	2	10	54928	54937	40 %	0 %	20 %	40 %	15611119
40	NC_000921	TAAAA	2	10	57020	57029	80 %	20 %	0 %	0 %	15611119
41	NC_000921	TCAAA	2	10	57736	57745	60 %	20 %	0 %	20 %	15611119
42	NC_000921	AACGA	2	10	58739	58748	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
43	NC_000921	TTAAA	2	10	58751	58760	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_000921	ACAAA	2	10	58779	58788	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
45	NC_000921	ATATA	2	10	59097	59106	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_000921	GATAC	2	10	63709	63718	40 %	20 %	20 %	20 %	15611126
47	NC_000921	GGTGG	2	10	67967	67976	0 %	20 %	80 %	0 %	15611132
48	NC_000921	TTTCT	2	10	71698	71707	0 %	80 %	0 %	20 %	15611136
49	NC_000921	CTTGG	2	10	71961	71970	0 %	40 %	40 %	20 %	15611136
50	NC_000921	CTTCT	2	10	72015	72024	0 %	60 %	0 %	40 %	15611136
51	NC_000921	TGCCT	2	10	72092	72101	0 %	40 %	20 %	40 %	15611136
52	NC_000921	TCCAA	2	10	72504	72513	40 %	20 %	0 %	40 %	15611137
53	NC_000921	CAAAA	2	10	72821	72830	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
54	NC_000921	TTTTG	2	10	75843	75852	0 %	80 %	20 %	0 %	15611140
55	NC_000921	ACGCC	2	10	76149	76158	20 %	0 %	20 %	60 %	15611140
56	NC_000921	AAAGC	2	10	76915	76924	60 %	0 %	20 %	20 %	15611141
57	NC_000921	TTACA	2	10	77697	77706	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
58	NC_000921	TAAAA	2	10	79373	79382	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_000921	ATCTT	2	10	84157	84166	20 %	60 %	0 %	20 %	15611146
60	NC_000921	TGGCT	2	10	84698	84707	0 %	40 %	40 %	20 %	15611146
61	NC_000921	ATGCC	2	10	85116	85125	20 %	20 %	20 %	40 %	15611147
62	NC_000921	TTGAT	2	10	86201	86210	20 %	60 %	20 %	0 %	15611149
63	NC_000921	GGCGT	2	10	88015	88024	0 %	20 %	60 %	20 %	15611151
64	NC_000921	TTCTT	2	10	88456	88465	0 %	80 %	0 %	20 %	15611151
65	NC_000921	ACTTT	2	10	91010	91019	20 %	60 %	0 %	20 %	15611152
66	NC_000921	ATAAG	2	10	91224	91233	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_000921	ATTAT	2	10	91281	91290	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_000921	TTCCA	2	10	91367	91376	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
69	NC_000921	CTTTC	2	10	91608	91617	0 %	60 %	0 %	40 %	15611153
70	NC_000921	TGATT	2	10	94402	94411	20 %	60 %	20 %	0 %	15611155
71	NC_000921	GGCTT	2	10	95727	95736	0 %	40 %	40 %	20 %	15611156
72	NC_000921	ACGAT	2	10	100632	100641	40 %	20 %	20 %	20 %	15611161
73	NC_000921	TTTTC	2	10	100827	100836	0 %	80 %	0 %	20 %	15611161
74	NC_000921	GAATT	2	10	102473	102482	40 %	40 %	20 %	0 %	15611162
75	NC_000921	TCGTT	2	10	104375	104384	0 %	60 %	20 %	20 %	15611163
76	NC_000921	AAAGC	2	10	110456	110465	60 %	0 %	20 %	20 %	15611168
77	NC_000921	GAATG	2	10	111692	111701	40 %	20 %	40 %	0 %	15611170
78	NC_000921	CAAAT	2	10	113016	113025	60 %	20 %	0 %	20 %	15611171
79	NC_000921	CGTTT	2	10	113649	113658	0 %	60 %	20 %	20 %	15611171
80	NC_000921	ACCCT	2	10	114444	114453	20 %	20 %	0 %	60 %	15611172
81	NC_000921	ATGCC	2	10	114576	114585	20 %	20 %	20 %	40 %	15611172
82	NC_000921	GATTT	2	10	115957	115966	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
83	NC_000921	TGATT	2	10	116569	116578	20 %	60 %	20 %	0 %	15611174
84	NC_000921	AGCAG	2	10	116786	116795	40 %	0 %	40 %	20 %	15611175
85	NC_000921	CTAAA	2	10	117056	117065	60 %	20 %	0 %	20 %	15611176
86	NC_000921	AGCTC	2	10	121086	121095	20 %	20 %	20 %	40 %	15611178
87	NC_000921	AAGCC	2	10	122974	122983	40 %	0 %	20 %	40 %	15611179
88	NC_000921	TTTTC	2	10	123953	123962	0 %	80 %	0 %	20 %	15611180
89	NC_000921	TTGAT	2	10	124855	124864	20 %	60 %	20 %	0 %	15611180
90	NC_000921	TTTGA	2	10	126101	126110	20 %	60 %	20 %	0 %	15611181
91	NC_000921	ATCTC	2	10	127386	127395	20 %	40 %	0 %	40 %	15611181
92	NC_000921	TTTGT	2	10	127899	127908	0 %	80 %	20 %	0 %	15611182
93	NC_000921	TGCGT	2	10	129931	129940	0 %	40 %	40 %	20 %	15611184
94	NC_000921	GAAAA	2	10	130092	130101	80 %	0 %	20 %	0 %	15611184
95	NC_000921	GAAAA	2	10	130410	130419	80 %	0 %	20 %	0 %	15611184
96	NC_000921	GCAAC	2	10	132265	132274	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
97	NC_000921	ATTTT	2	10	132626	132635	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_000921	ATTTT	2	10	133505	133514	20 %	80 %	0 %	0 %	15611189
99	NC_000921	ATGTT	2	10	133587	133596	20 %	60 %	20 %	0 %	15611189
100	NC_000921	AAAAG	2	10	133999	134008	80 %	0 %	20 %	0 %	15611189
101	NC_000921	AAATC	2	10	136013	136022	60 %	20 %	0 %	20 %	15611190
102	NC_000921	AAAAT	2	10	137485	137494	80 %	20 %	0 %	0 %	15611191
103	NC_000921	ATAAA	2	10	139261	139270	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_000921	TTTTC	2	10	140040	140049	0 %	80 %	0 %	20 %	15611194
105	NC_000921	TTCTT	2	10	141996	142005	0 %	80 %	0 %	20 %	15611196
106	NC_000921	TCTTT	2	10	142490	142499	0 %	80 %	0 %	20 %	15611197
107	NC_000921	GTTTT	2	10	143653	143662	0 %	80 %	20 %	0 %	15611198
108	NC_000921	AATTC	2	10	144288	144297	40 %	40 %	0 %	20 %	15611198
109	NC_000921	GCGAT	2	10	144447	144456	20 %	20 %	40 %	20 %	15611198
110	NC_000921	TTTTG	2	10	145355	145364	0 %	80 %	20 %	0 %	15611199
111	NC_000921	CCAAA	2	10	147195	147204	60 %	0 %	0 %	40 %	15611200
112	NC_000921	ACGCC	2	10	150717	150726	20 %	0 %	20 %	60 %	15611202
113	NC_000921	GCGTT	2	10	152980	152989	0 %	40 %	40 %	20 %	15611207
114	NC_000921	CCCAG	2	10	153901	153910	20 %	0 %	20 %	60 %	15611208
115	NC_000921	ATTTG	2	10	153956	153965	20 %	60 %	20 %	0 %	15611208
116	NC_000921	CAAAT	2	10	156376	156385	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
117	NC_000921	AAAAC	2	10	157100	157109	80 %	0 %	0 %	20 %	15611211
118	NC_000921	AGATT	2	10	158999	159008	40 %	40 %	20 %	0 %	15611213
119	NC_000921	AAGCC	2	10	160337	160346	40 %	0 %	20 %	40 %	15611216
120	NC_000921	ATTTT	2	10	162405	162414	20 %	80 %	0 %	0 %	15611218
121	NC_000921	TTGAA	2	10	163697	163706	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
122	NC_000921	ATTCA	2	10	164057	164066	40 %	40 %	0 %	20 %	15611219
123	NC_000921	CACTT	2	10	164261	164270	20 %	40 %	0 %	40 %	15611219
124	NC_000921	ATCTT	2	10	167455	167464	20 %	60 %	0 %	20 %	15611222
125	NC_000921	TAAAA	2	10	168070	168079	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_000921	CAAAA	2	10	168100	168109	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
127	NC_000921	ATATT	2	10	174984	174993	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_000921	TTTCC	2	10	175035	175044	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
129	NC_000921	TGGGG	2	10	176214	176223	0 %	20 %	80 %	0 %	15611232
130	NC_000921	AGCGG	2	10	176640	176649	20 %	0 %	60 %	20 %	15611232
131	NC_000921	ATTTG	2	10	176991	177000	20 %	60 %	20 %	0 %	15611232
132	NC_000921	AATTG	2	10	177147	177156	40 %	40 %	20 %	0 %	15611233
133	NC_000921	AGTGA	2	10	177663	177672	40 %	20 %	40 %	0 %	15611233
134	NC_000921	ATAAA	2	10	178439	178448	80 %	20 %	0 %	0 %	15611234
135	NC_000921	TTTAA	2	10	179561	179570	40 %	60 %	0 %	0 %	15611234
136	NC_000921	TAAAA	2	10	181189	181198	80 %	20 %	0 %	0 %	15611236
137	NC_000921	TGTAA	2	10	181980	181989	40 %	40 %	20 %	0 %	15611237
138	NC_000921	ATAAA	2	10	183476	183485	80 %	20 %	0 %	0 %	15611238
139	NC_000921	TTTAA	2	10	183839	183848	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_000921	AAAAG	2	10	184631	184640	80 %	0 %	20 %	0 %	15611239
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