MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori J99 chromosome

Total Repeats: 547

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_000921	TTTA	2	8	4962	4969	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_000921	AAAG	2	8	5321	5328	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_000921	TAAG	2	8	7488	7495	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_000921	TTTG	2	8	7582	7589	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_000921	TTTG	2	8	7660	7667	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_000921	ATAA	2	8	9800	9807	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_000921	TATT	2	8	10000	10007	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_000921	TTAA	2	8	13831	13838	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_000921	ATCA	2	8	22936	22943	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_000921	AAAG	2	8	23114	23121	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_000921	TTTA	2	8	23324	23331	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_000921	TAAG	2	8	25676	25683	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_000921	TTTG	2	8	25905	25912	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_000921	GGTT	2	8	32100	32107	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_000921	CAAA	2	8	44406	44413	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_000921	GCTT	2	8	44559	44566	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_000921	CTGT	2	8	44675	44682	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_000921	GATT	2	8	44861	44868	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_000921	TTGA	2	8	53069	53076	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_000921	TTTA	2	8	58488	58495	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_000921	TAAT	2	8	58588	58595	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_000921	AAAT	2	8	58697	58704	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_000921	AAAG	2	8	61931	61938	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_000921	TAGA	2	8	77676	77683	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_000921	CCAC	2	8	79231	79238	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
26	NC_000921	ATTT	2	8	80418	80425	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_000921	TTTG	2	8	85886	85893	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_000921	TTAT	2	8	86042	86049	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_000921	TATT	2	8	86066	86073	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_000921	TCAA	2	8	91205	91212	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_000921	AAAC	2	8	91388	91395	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_000921	TTTA	2	8	93119	93126	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_000921	GGTG	2	8	93166	93173	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
34	NC_000921	TCCC	2	8	93236	93243	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
35	NC_000921	ATTT	2	8	94163	94170	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_000921	TTCA	2	8	98530	98537	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_000921	TTTA	2	8	98557	98564	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_000921	GATC	2	8	100164	100171	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
39	NC_000921	ATCA	2	8	106892	106899	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_000921	TAAA	2	8	106973	106980	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_000921	AAGC	2	8	112451	112458	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
42	NC_000921	GCTT	2	8	112476	112483	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_000921	CTTT	2	8	114383	114390	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_000921	AAAT	2	8	114393	114400	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_000921	ATTT	2	8	115922	115929	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_000921	TCAT	2	8	120600	120607	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_000921	GTTA	2	8	127842	127849	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_000921	AAAG	2	8	130747	130754	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_000921	AAAG	2	8	131242	131249	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_000921	GAAG	2	8	131299	131306	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_000921	CTAT	2	8	133219	133226	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_000921	CAAT	2	8	134653	134660	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_000921	AAAC	2	8	134811	134818	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_000921	ATCT	2	8	139348	139355	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_000921	TAAG	2	8	143248	143255	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_000921	ACAA	2	8	154299	154306	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_000921	ATTT	2	8	162274	162281	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_000921	CCCT	2	8	163563	163570	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
59	NC_000921	TCAT	2	8	163713	163720	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_000921	AAGC	2	8	167950	167957	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_000921	ATAC	2	8	174962	174969	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_000921	GAAT	2	8	175125	175132	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_000921	GATT	2	8	177865	177872	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_000921	TTGT	2	8	177981	177988	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_000921	GACT	2	8	178090	178097	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
66	NC_000921	AAAC	2	8	180842	180849	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_000921	GATT	2	8	183857	183864	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_000921	GTTT	2	8	183955	183962	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_000921	CATT	2	8	189078	189085	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_000921	TTTG	2	8	189097	189104	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_000921	TTGC	2	8	189145	189152	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
72	NC_000921	TGCA	2	8	190992	190999	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
73	NC_000921	TTAA	2	8	201342	201349	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_000921	CAAC	2	8	204718	204725	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_000921	AAAC	2	8	204920	204927	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_000921	GTTT	2	8	211050	211057	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_000921	GTTT	2	8	215568	215575	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_000921	TTGA	2	8	215583	215590	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_000921	TTTG	2	8	222536	222543	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_000921	ATCA	2	8	223734	223741	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_000921	ACAA	2	8	223789	223796	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_000921	TATT	2	8	224464	224471	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_000921	GAGC	2	8	227328	227335	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
84	NC_000921	ATTT	2	8	230447	230454	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_000921	ATTT	2	8	230732	230739	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_000921	AAAC	2	8	231770	231777	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_000921	AAGA	2	8	234130	234137	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_000921	TTTA	2	8	237046	237053	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_000921	AACA	2	8	241794	241801	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
90	NC_000921	GATT	2	8	241972	241979	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_000921	TCCC	2	8	244457	244464	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
92	NC_000921	ATTT	2	8	252315	252322	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_000921	TAAT	2	8	258316	258323	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_000921	TACC	2	8	258601	258608	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_000921	GCCA	2	8	267904	267911	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
96	NC_000921	ATTT	2	8	275378	275385	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_000921	AAAT	2	8	285836	285843	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_000921	CATT	2	8	308120	308127	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
99	NC_000921	ATTT	2	8	309510	309517	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_000921	AACA	2	8	312065	312072	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
101	NC_000921	TTAA	2	8	312893	312900	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_000921	TCAC	2	8	316079	316086	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_000921	TCAG	2	8	320576	320583	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
104	NC_000921	TTTA	2	8	329397	329404	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_000921	TAAA	2	8	329507	329514	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_000921	AAGA	2	8	329542	329549	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_000921	GAGC	2	8	329678	329685	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
108	NC_000921	AAGT	2	8	329728	329735	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_000921	GCTT	2	8	329767	329774	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
110	NC_000921	TTGG	2	8	332826	332833	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_000921	TTTG	2	8	332836	332843	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_000921	TTGG	2	8	335088	335095	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_000921	AAGT	2	8	336440	336447	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_000921	TGAT	2	8	337357	337364	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_000921	CGCA	2	8	337779	337786	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
116	NC_000921	CTTT	2	8	338048	338055	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
117	NC_000921	TTTA	2	8	338085	338092	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_000921	CAAG	2	8	338095	338102	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
119	NC_000921	ACAG	2	8	338153	338160	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
120	NC_000921	CAAA	2	8	338716	338723	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
121	NC_000921	AAAT	2	8	341248	341255	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_000921	TTTA	2	8	346685	346692	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_000921	TGAA	2	8	351092	351099	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_000921	GCGG	2	8	362717	362724	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
125	NC_000921	TAAA	2	8	362831	362838	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_000921	TTAA	2	8	372913	372920	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_000921	TAAA	2	8	372924	372931	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_000921	TCAA	2	8	374520	374527	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_000921	CAAG	2	8	377393	377400	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
130	NC_000921	TTAT	2	8	377435	377442	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_000921	TTTG	2	8	377501	377508	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_000921	ACAA	2	8	378846	378853	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
133	NC_000921	CAAA	2	8	383323	383330	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
134	NC_000921	GTTT	2	8	390281	390288	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_000921	TTTC	2	8	394631	394638	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
136	NC_000921	GGGT	2	8	396522	396529	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
137	NC_000921	GAAA	2	8	396581	396588	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_000921	AACA	2	8	396594	396601	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
139	NC_000921	CAAA	2	8	408531	408538	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
140	NC_000921	CCAA	2	8	408647	408654	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_000921	CAAC	2	8	408755	408762	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NC_000921	GATT	2	8	409575	409582	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
143	NC_000921	AAAT	2	8	409721	409728	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_000921	AAAT	2	8	415481	415488	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_000921	AAGG	2	8	422821	422828	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_000921	TCAA	2	8	424442	424449	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
147	NC_000921	TCAA	2	8	426975	426982	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
148	NC_000921	CAAT	2	8	428355	428362	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
149	NC_000921	GTTT	2	8	442275	442282	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
150	NC_000921	CACC	2	8	442367	442374	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
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152	NC_000921	TCTT	2	8	442832	442839	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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