MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Helicobacter pylori J99 chromosome

Total Repeats: 15035

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_000921	GAT	3	9	162	170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15611072
2	NC_000921	GTT	2	6	345	350	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15611072
3	NC_000921	TTC	2	6	396	401	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15611072
4	NC_000921	ACA	2	6	422	427	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15611072
5	NC_000921	AAT	2	6	497	502	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15611073
6	NC_000921	TTA	2	6	533	538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15611073
7	NC_000921	CTC	2	6	799	804	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15611073
8	NC_000921	CTT	2	6	840	845	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15611073
9	NC_000921	TGA	2	6	858	863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15611073
10	NC_000921	CCG	4	12	1083	1094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15611074
11	NC_000921	CCA	2	6	1227	1232	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15611074
12	NC_000921	GCT	2	6	1252	1257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15611074
13	NC_000921	CTA	2	6	1319	1324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15611074
14	NC_000921	GGC	2	6	1443	1448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15611074
15	NC_000921	GTT	2	6	1663	1668	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15611074
16	NC_000921	CTT	2	6	1697	1702	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15611074
17	NC_000921	TTC	2	6	1802	1807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15611075
18	NC_000921	GTT	2	6	1937	1942	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15611075
19	NC_000921	TTC	2	6	2024	2029	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15611075
20	NC_000921	TGG	2	6	2083	2088	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15611075
21	NC_000921	TCA	2	6	2091	2096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15611075
22	NC_000921	AGC	2	6	2816	2821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15611076
23	NC_000921	GTG	2	6	3005	3010	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15611076
24	NC_000921	AGA	2	6	3103	3108	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15611076
25	NC_000921	GCC	2	6	3171	3176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15611076
26	NC_000921	GTT	2	6	3616	3621	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15611077
27	NC_000921	ATC	2	6	3700	3705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15611077
28	NC_000921	ATT	2	6	3944	3949	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15611077
29	NC_000921	TGT	2	6	3955	3960	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15611077
30	NC_000921	TGG	2	6	4013	4018	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15611077
31	NC_000921	ATT	2	6	5667	5672	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15611078
32	NC_000921	TGG	2	6	5765	5770	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15611078
33	NC_000921	TTG	2	6	5968	5973	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15611078
34	NC_000921	TAA	2	6	6036	6041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15611078
35	NC_000921	TTA	2	6	6094	6099	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15611078
36	NC_000921	GTG	2	6	6163	6168	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15611078
37	NC_000921	GTT	2	6	6183	6188	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15611078
38	NC_000921	CAA	2	6	6231	6236	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15611078
39	NC_000921	TGT	2	6	6284	6289	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15611078
40	NC_000921	GTT	2	6	6339	6344	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15611078
41	NC_000921	CAG	2	6	6515	6520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15611078
42	NC_000921	GCG	2	6	6542	6547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15611078
43	NC_000921	CTT	2	6	6758	6763	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15611078
44	NC_000921	TAG	8	24	6785	6808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15611078
45	NC_000921	TTA	2	6	6817	6822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15611078
46	NC_000921	GTT	2	6	6838	6843	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15611078
47	NC_000921	TTG	2	6	6909	6914	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15611078
48	NC_000921	GTT	2	6	6978	6983	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15611078
49	NC_000921	TGT	2	6	7051	7056	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15611078
50	NC_000921	CCG	2	6	7112	7117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15611078
51	NC_000921	GCT	2	6	7227	7232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15611078
52	NC_000921	GTT	2	6	7257	7262	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15611078
53	NC_000921	CAT	2	6	7761	7766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15611079
54	NC_000921	GCC	2	6	7767	7772	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15611079
55	NC_000921	TCT	2	6	7828	7833	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15611079
56	NC_000921	AAT	2	6	7926	7931	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15611079
57	NC_000921	CTT	2	6	7934	7939	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15611079
58	NC_000921	CCA	2	6	8020	8025	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15611079
59	NC_000921	ATG	2	6	8077	8082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15611079
60	NC_000921	TCA	2	6	8101	8106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15611079
61	NC_000921	CCG	2	6	8155	8160	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15611079
62	NC_000921	CTT	2	6	8174	8179	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15611079
63	NC_000921	CCG	2	6	8183	8188	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15611079
64	NC_000921	GTG	2	6	8410	8415	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15611079
65	NC_000921	TTC	2	6	8490	8495	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15611079
66	NC_000921	TGA	2	6	8498	8503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15611079
67	NC_000921	CCG	2	6	8509	8514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15611079
68	NC_000921	CAC	2	6	8610	8615	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15611079
69	NC_000921	GAT	2	6	8652	8657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15611079
70	NC_000921	TAG	2	6	8691	8696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15611079
71	NC_000921	CTT	2	6	8864	8869	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15611079
72	NC_000921	TCT	2	6	8974	8979	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15611079
73	NC_000921	CTT	2	6	9095	9100	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15611079
74	NC_000921	CTT	2	6	9173	9178	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15611079
75	NC_000921	TCT	2	6	9529	9534	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15611080
76	NC_000921	CTT	2	6	9611	9616	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15611080
77	NC_000921	GAT	3	9	9699	9707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15611080
78	NC_000921	TCT	2	6	9727	9732	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15611080
79	NC_000921	CTA	2	6	9743	9748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15611080
80	NC_000921	TTG	2	6	10171	10176	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15611081
81	NC_000921	GAA	2	6	10187	10192	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15611081
82	NC_000921	TTA	2	6	10366	10371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15611081
83	NC_000921	AGA	2	6	10381	10386	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15611081
84	NC_000921	ACC	2	6	10389	10394	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15611081
85	NC_000921	AAG	2	6	10422	10427	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15611081
86	NC_000921	ATT	2	6	10455	10460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15611081
87	NC_000921	CAT	2	6	10636	10641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15611081
88	NC_000921	GTG	2	6	10670	10675	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15611081
89	NC_000921	ATG	2	6	10950	10955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15611081
90	NC_000921	AAC	2	6	11042	11047	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15611081
91	NC_000921	ATC	2	6	11073	11078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15611081
92	NC_000921	AGA	2	6	11428	11433	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15611081
93	NC_000921	GAC	2	6	11528	11533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15611081
94	NC_000921	TTA	3	9	11549	11557	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15611081
95	NC_000921	TTG	2	6	11606	11611	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15611081
96	NC_000921	TGT	2	6	11792	11797	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15611082
97	NC_000921	TGT	2	6	11960	11965	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15611082
98	NC_000921	AAG	2	6	12119	12124	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15611082
99	NC_000921	TAA	2	6	12429	12434	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15611082
100	NC_000921	TGG	3	9	12530	12538	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15611082
101	NC_000921	GAA	3	9	12547	12555	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15611082
102	NC_000921	TGG	2	6	12629	12634	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15611082
103	NC_000921	AGA	2	6	12651	12656	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15611082
104	NC_000921	TTA	2	6	12961	12966	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15611083
105	NC_000921	GAA	2	6	12978	12983	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15611083
106	NC_000921	GTT	2	6	13001	13006	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15611083
107	NC_000921	GTT	2	6	13045	13050	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15611083
108	NC_000921	TAA	2	6	13055	13060	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15611083
109	NC_000921	ATT	2	6	13068	13073	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15611083
110	NC_000921	ATG	2	6	13141	13146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15611083
111	NC_000921	ACC	2	6	13444	13449	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15611083
112	NC_000921	GGT	2	6	13586	13591	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15611083
113	NC_000921	TTG	2	6	13594	13599	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15611083
114	NC_000921	AGA	2	6	13646	13651	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15611083
115	NC_000921	AGT	2	6	13708	13713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15611083
116	NC_000921	ATG	2	6	13856	13861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15611084
117	NC_000921	GTG	2	6	14072	14077	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15611084
118	NC_000921	GAA	2	6	14163	14168	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15611085
119	NC_000921	ATT	2	6	14350	14355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15611085
120	NC_000921	GAA	2	6	14489	14494	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15611086
121	NC_000921	AAC	2	6	14495	14500	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15611086
122	NC_000921	ATG	2	6	14514	14519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15611086
123	NC_000921	TCC	2	6	14559	14564	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15611086
124	NC_000921	AAG	2	6	14760	14765	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15611086
125	NC_000921	TAG	2	6	15027	15032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15611086
126	NC_000921	ATT	2	6	15084	15089	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15611086
127	NC_000921	GGA	2	6	15394	15399	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15611086
128	NC_000921	ACC	2	6	15522	15527	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15611086
129	NC_000921	ATT	2	6	15645	15650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15611086
130	NC_000921	AAG	2	6	15678	15683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15611086
131	NC_000921	ATA	2	6	15690	15695	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15611086
132	NC_000921	ATG	2	6	15782	15787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15611086
133	NC_000921	AAG	2	6	15993	15998	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15611086
134	NC_000921	AGA	2	6	16003	16008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15611086
135	NC_000921	AGA	2	6	16279	16284	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15611086
136	NC_000921	GTG	3	9	16406	16414	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15611086
137	NC_000921	TAT	2	6	17104	17109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15611087
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139	NC_000921	GAA	2	6	17154	17159	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15611087
140	NC_000921	CTT	2	6	17228	17233	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15611087
141	NC_000921	ATT	2	6	17375	17380	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15611087
142	NC_000921	TAT	2	6	17476	17481	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15611087
143	NC_000921	ACA	2	6	17576	17581	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15611087
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146	NC_000921	ATC	2	6	17788	17793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15611087
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149	NC_000921	TTG	2	6	18092	18097	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15611087
150	NC_000921	ATA	2	6	18359	18364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15611087
151	NC_000921	TTG	2	6	18587	18592	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15611088
152	NC_000921	GTG	2	6	18653	18658	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15611088
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154	NC_000921	CTG	2	6	18957	18962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15611088
155	NC_000921	GTG	2	6	19016	19021	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15611088
156	NC_000921	TGA	2	6	19129	19134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15611088
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158	NC_000921	CAA	2	6	19239	19244	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15611088
159	NC_000921	ATT	2	6	19268	19273	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15611088
160	NC_000921	TTC	2	6	19366	19371	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15611088
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163	NC_000921	GAA	2	6	19702	19707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15611089
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166	NC_000921	CAT	2	6	20158	20163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15611089
167	NC_000921	ATG	2	6	20180	20185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15611089
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255	NC_000921	TAA	2	6	31271	31276	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15611097
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259	NC_000921	AAT	2	6	31644	31649	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15611097
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387	NC_000921	TCA	2	6	46082	46087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15611111
388	NC_000921	CAA	2	6	46092	46097	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15611111
389	NC_000921	GAT	2	6	46203	46208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15611112
390	NC_000921	CTG	2	6	46252	46257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15611112
391	NC_000921	CAA	2	6	46332	46337	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15611112
392	NC_000921	CAC	2	6	46365	46370	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15611112
393	NC_000921	CTA	2	6	46412	46417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15611112
394	NC_000921	CAC	2	6	46503	46508	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15611112
395	NC_000921	CAC	2	6	46608	46613	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15611112
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398	NC_000921	TTG	2	6	46750	46755	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15611112
399	NC_000921	TCT	2	6	46788	46793	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15611112
400	NC_000921	TTC	2	6	46833	46838	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15611112
401	NC_000921	CTT	2	6	46850	46855	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15611112
402	NC_000921	TAA	2	6	46968	46973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15611112
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404	NC_000921	CAA	2	6	47022	47027	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15611112
405	NC_000921	TGG	3	9	47054	47062	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15611112
406	NC_000921	ATC	2	6	47370	47375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15611112
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409	NC_000921	TGC	2	6	47680	47685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15611112
410	NC_000921	GAT	2	6	47820	47825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15611112
411	NC_000921	TCA	2	6	47866	47871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15611112
412	NC_000921	GGT	2	6	48173	48178	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15611112
413	NC_000921	TAA	2	6	48233	48238	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15611112
414	NC_000921	CCA	2	6	48248	48253	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15611112
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416	NC_000921	TTC	2	6	48722	48727	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15611113
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499	NC_000921	GTT	2	6	58856	58861	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15611120
500	NC_000921	TTC	2	6	58905	58910	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15611120

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