MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Helicobacter pylori J99 chromosome

Total Repeats: 2274

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_000921	TG	3	6	178	183	0 %	50 %	50 %	0 %	15611072
2	NC_000921	CT	3	6	731	736	0 %	50 %	0 %	50 %	15611073
3	NC_000921	CA	3	6	1266	1271	50 %	0 %	0 %	50 %	15611074
4	NC_000921	GC	3	6	1952	1957	0 %	0 %	50 %	50 %	15611075
5	NC_000921	GC	3	6	2829	2834	0 %	0 %	50 %	50 %	15611076
6	NC_000921	AG	3	6	2986	2991	50 %	0 %	50 %	0 %	15611076
7	NC_000921	TG	3	6	3467	3472	0 %	50 %	50 %	0 %	15611077
8	NC_000921	TG	3	6	3798	3803	0 %	50 %	50 %	0 %	15611077
9	NC_000921	GC	3	6	6225	6230	0 %	0 %	50 %	50 %	15611078
10	NC_000921	AC	3	6	6651	6656	50 %	0 %	0 %	50 %	15611078
11	NC_000921	GC	3	6	6683	6688	0 %	0 %	50 %	50 %	15611078
12	NC_000921	GA	6	12	7413	7424	50 %	0 %	50 %	0 %	15611078
13	NC_000921	GC	3	6	8071	8076	0 %	0 %	50 %	50 %	15611079
14	NC_000921	CG	3	6	8136	8141	0 %	0 %	50 %	50 %	15611079
15	NC_000921	AG	3	6	8283	8288	50 %	0 %	50 %	0 %	15611079
16	NC_000921	AG	3	6	11300	11305	50 %	0 %	50 %	0 %	15611081
17	NC_000921	AG	3	6	11878	11883	50 %	0 %	50 %	0 %	15611082
18	NC_000921	AG	3	6	11938	11943	50 %	0 %	50 %	0 %	15611082
19	NC_000921	GA	3	6	12946	12951	50 %	0 %	50 %	0 %	15611083
20	NC_000921	TG	3	6	14020	14025	0 %	50 %	50 %	0 %	15611084
21	NC_000921	TC	3	6	14878	14883	0 %	50 %	0 %	50 %	15611086
22	NC_000921	AT	3	6	14992	14997	50 %	50 %	0 %	0 %	15611086
23	NC_000921	AG	3	6	15265	15270	50 %	0 %	50 %	0 %	15611086
24	NC_000921	CA	3	6	16823	16828	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_000921	CG	3	6	17440	17445	0 %	0 %	50 %	50 %	15611087
26	NC_000921	AG	3	6	18728	18733	50 %	0 %	50 %	0 %	15611088
27	NC_000921	AG	3	6	19527	19532	50 %	0 %	50 %	0 %	15611089
28	NC_000921	GA	3	6	19718	19723	50 %	0 %	50 %	0 %	15611089
29	NC_000921	GC	3	6	21163	21168	0 %	0 %	50 %	50 %	15611090
30	NC_000921	AG	3	6	22279	22284	50 %	0 %	50 %	0 %	15611091
31	NC_000921	GC	3	6	24342	24347	0 %	0 %	50 %	50 %	15611092
32	NC_000921	TC	3	6	24410	24415	0 %	50 %	0 %	50 %	15611092
33	NC_000921	AT	3	6	24798	24803	50 %	50 %	0 %	0 %	15611092
34	NC_000921	GT	3	6	25667	25672	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_000921	GC	3	6	26625	26630	0 %	0 %	50 %	50 %	15611093
36	NC_000921	CG	4	8	26698	26705	0 %	0 %	50 %	50 %	15611093
37	NC_000921	GC	3	6	27020	27025	0 %	0 %	50 %	50 %	15611093
38	NC_000921	AG	3	6	27188	27193	50 %	0 %	50 %	0 %	15611093
39	NC_000921	CA	3	6	27339	27344	50 %	0 %	0 %	50 %	15611093
40	NC_000921	TA	3	6	27741	27746	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_000921	TG	3	6	28200	28205	0 %	50 %	50 %	0 %	15611094
42	NC_000921	AG	3	6	28440	28445	50 %	0 %	50 %	0 %	15611094
43	NC_000921	AG	3	6	29548	29553	50 %	0 %	50 %	0 %	15611095
44	NC_000921	CT	3	6	31526	31531	0 %	50 %	0 %	50 %	15611097
45	NC_000921	AT	3	6	32721	32726	50 %	50 %	0 %	0 %	15611099
46	NC_000921	AT	3	6	33684	33689	50 %	50 %	0 %	0 %	15611100
47	NC_000921	GA	3	6	34858	34863	50 %	0 %	50 %	0 %	15611100
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49	NC_000921	TA	3	6	35079	35084	50 %	50 %	0 %	0 %	15611101
50	NC_000921	AG	3	6	35130	35135	50 %	0 %	50 %	0 %	15611101
51	NC_000921	GC	3	6	35906	35911	0 %	0 %	50 %	50 %	15611103
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53	NC_000921	TG	3	6	37201	37206	0 %	50 %	50 %	0 %	15611104
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59	NC_000921	AG	3	6	40767	40772	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_000921	CG	3	6	41472	41477	0 %	0 %	50 %	50 %	15611108
61	NC_000921	AG	3	6	41673	41678	50 %	0 %	50 %	0 %	15611108
62	NC_000921	AC	3	6	41821	41826	50 %	0 %	0 %	50 %	15611108
63	NC_000921	AG	3	6	42761	42766	50 %	0 %	50 %	0 %	15611109
64	NC_000921	AG	3	6	43739	43744	50 %	0 %	50 %	0 %	15611110
65	NC_000921	CT	3	6	43800	43805	0 %	50 %	0 %	50 %	15611110
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67	NC_000921	CT	3	6	45070	45075	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_000921	TC	3	6	45088	45093	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_000921	CT	3	6	47755	47760	0 %	50 %	0 %	50 %	15611112
70	NC_000921	AG	3	6	47789	47794	50 %	0 %	50 %	0 %	15611112
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116	NC_000921	CA	3	6	78845	78850	50 %	0 %	0 %	50 %	15611143
117	NC_000921	TA	5	10	79351	79360	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_000921	GT	3	6	79623	79628	0 %	50 %	50 %	0 %	15611144
119	NC_000921	GA	3	6	80094	80099	50 %	0 %	50 %	0 %	15611144
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121	NC_000921	AG	4	8	80455	80462	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_000921	GA	3	6	83201	83206	50 %	0 %	50 %	0 %	15611146
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126	NC_000921	AG	3	6	84892	84897	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_000921	AG	3	6	84916	84921	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_000921	CT	3	6	85974	85979	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_000921	CT	3	6	88930	88935	0 %	50 %	0 %	50 %	15611151
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131	NC_000921	CT	3	6	91082	91087	0 %	50 %	0 %	50 %	15611152
132	NC_000921	TG	3	6	91103	91108	0 %	50 %	50 %	0 %	15611152
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138	NC_000921	TA	3	6	93423	93428	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_000921	GA	3	6	93693	93698	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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