MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori J99 chromosome

Total Repeats: 245

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_000921	CA	3	6	16823	16828	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_000921	GT	3	6	25667	25672	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_000921	TA	3	6	27741	27746	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_000921	AG	3	6	40767	40772	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_000921	TA	3	6	44778	44783	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_000921	CT	3	6	45070	45075	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_000921	TC	3	6	45088	45093	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_000921	CT	3	6	59308	59313	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_000921	GC	3	6	61994	61999	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_000921	AG	3	6	72956	72961	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_000921	TA	3	6	78091	78096	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_000921	TA	5	10	79351	79360	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_000921	TC	3	6	80383	80388	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_000921	AG	4	8	80455	80462	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_000921	AG	3	6	84892	84897	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_000921	AG	3	6	84916	84921	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_000921	CT	3	6	85974	85979	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_000921	GA	3	6	93295	93300	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_000921	AG	3	6	93375	93380	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_000921	TA	3	6	93423	93428	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_000921	GA	3	6	93693	93698	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_000921	TA	3	6	96703	96708	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_000921	GT	3	6	98570	98575	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_000921	AT	3	6	103504	103509	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_000921	TC	3	6	165667	165672	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_000921	TA	3	6	174839	174844	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_000921	AC	3	6	175244	175249	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_000921	AG	3	6	177928	177933	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_000921	GA	3	6	184002	184007	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_000921	AG	3	6	189232	189237	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_000921	CT	3	6	189267	189272	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_000921	TA	3	6	204554	204559	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_000921	TA	3	6	204606	204611	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_000921	GC	3	6	212509	212514	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_000921	AT	3	6	215375	215380	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_000921	TG	3	6	227767	227772	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_000921	GA	3	6	227784	227789	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_000921	CT	3	6	230478	230483	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_000921	TC	3	6	230631	230636	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_000921	GT	3	6	235439	235444	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_000921	AG	3	6	258567	258572	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_000921	GA	3	6	295166	295171	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_000921	AG	3	6	305495	305500	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_000921	AG	3	6	315663	315668	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_000921	AG	3	6	336514	336519	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_000921	CT	3	6	338647	338652	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_000921	AG	3	6	345678	345683	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_000921	TA	3	6	377407	377412	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_000921	AT	3	6	379367	379372	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_000921	GC	3	6	379408	379413	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
51	NC_000921	AG	3	6	381060	381065	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_000921	GA	4	8	391015	391022	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_000921	GT	3	6	413655	413660	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_000921	AT	3	6	429501	429506	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_000921	TA	3	6	442291	442296	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_000921	GC	3	6	442383	442388	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
57	NC_000921	GC	3	6	445943	445948	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
58	NC_000921	GT	3	6	447328	447333	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_000921	GT	3	6	470935	470940	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_000921	AG	3	6	470953	470958	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_000921	TA	3	6	472090	472095	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_000921	TG	3	6	479443	479448	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_000921	TG	3	6	500029	500034	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_000921	AT	3	6	513732	513737	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_000921	AC	3	6	513937	513942	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_000921	AT	3	6	518050	518055	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_000921	GA	3	6	527586	527591	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_000921	AG	4	8	527862	527869	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_000921	GA	3	6	529468	529473	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_000921	AG	3	6	529494	529499	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_000921	AC	3	6	531287	531292	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_000921	TG	3	6	531450	531455	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_000921	CT	3	6	541851	541856	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_000921	AC	3	6	543231	543236	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_000921	AC	4	8	543252	543259	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_000921	GT	3	6	543546	543551	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_000921	AG	3	6	547326	547331	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_000921	TC	3	6	547826	547831	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_000921	GA	4	8	554527	554534	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_000921	TA	3	6	558723	558728	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_000921	CA	3	6	563415	563420	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_000921	GC	3	6	563522	563527	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
83	NC_000921	TA	3	6	564735	564740	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_000921	AT	3	6	568600	568605	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_000921	CT	4	8	588732	588739	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_000921	AT	3	6	590495	590500	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_000921	TA	3	6	607923	607928	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_000921	AG	3	6	617770	617775	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_000921	TA	3	6	618112	618117	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_000921	AG	3	6	632465	632470	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_000921	TA	3	6	645034	645039	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_000921	TA	3	6	661939	661944	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_000921	AT	3	6	661945	661950	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_000921	TA	3	6	677475	677480	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_000921	CT	3	6	686825	686830	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_000921	TA	3	6	699626	699631	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_000921	TA	3	6	699673	699678	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_000921	AT	3	6	700556	700561	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_000921	AG	3	6	719018	719023	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_000921	TC	3	6	719085	719090	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_000921	AG	3	6	719323	719328	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_000921	TA	3	6	725254	725259	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_000921	GA	3	6	754592	754597	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_000921	GT	3	6	759024	759029	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_000921	AG	3	6	771165	771170	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_000921	CT	3	6	782683	782688	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_000921	GA	3	6	782723	782728	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_000921	GA	3	6	797077	797082	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_000921	TC	3	6	802007	802012	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_000921	TC	3	6	811414	811419	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_000921	CT	3	6	853800	853805	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_000921	TA	3	6	893115	893120	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_000921	GC	3	6	894326	894331	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
114	NC_000921	GA	3	6	899772	899777	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_000921	GT	3	6	903941	903946	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_000921	TC	3	6	907761	907766	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_000921	AT	3	6	907849	907854	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_000921	AG	3	6	915770	915775	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_000921	AT	3	6	915860	915865	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_000921	AT	3	6	937197	937202	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_000921	AC	3	6	962473	962478	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_000921	AG	3	6	964703	964708	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_000921	AG	3	6	964782	964787	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_000921	TC	3	6	964993	964998	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_000921	CT	3	6	975014	975019	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_000921	CT	3	6	987952	987957	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_000921	AC	4	8	990058	990065	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
128	NC_000921	AG	3	6	991684	991689	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_000921	GC	3	6	994840	994845	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
130	NC_000921	AG	5	10	994980	994989	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_000921	CT	3	6	1007398	1007403	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_000921	TA	3	6	1011802	1011807	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_000921	AG	3	6	1013456	1013461	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_000921	TA	3	6	1014551	1014556	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_000921	GT	3	6	1014832	1014837	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_000921	AG	3	6	1025227	1025232	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_000921	TA	3	6	1038054	1038059	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_000921	AT	3	6	1042221	1042226	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_000921	AT	3	6	1042297	1042302	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_000921	AT	3	6	1043451	1043456	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_000921	GT	3	6	1044774	1044779	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_000921	TC	3	6	1045430	1045435	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
143	NC_000921	CA	3	6	1045573	1045578	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
144	NC_000921	AC	3	6	1048210	1048215	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
145	NC_000921	TA	3	6	1048793	1048798	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_000921	CT	3	6	1057489	1057494	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
147	NC_000921	CA	3	6	1057612	1057617	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
148	NC_000921	GT	3	6	1057715	1057720	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
149	NC_000921	CA	3	6	1058036	1058041	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
150	NC_000921	AT	3	6	1059144	1059149	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_000921	CA	3	6	1059384	1059389	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
152	NC_000921	AT	3	6	1059596	1059601	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_000921	CT	3	6	1060280	1060285	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.