MICAS: Microsatellite Analysis Server

Hexa-nucleotide Repeats of Aquifex aeolicus VF5

Total Repeats: 772

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_000918	TTTTCC	2	12	973698	973709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15606563
502	NC_000918	GTTTTT	2	12	973987	973998	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	15606564
503	NC_000918	TTCCAA	2	12	977629	977640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15606568
504	NC_000918	AACATG	2	12	978622	978633	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	15606570
505	NC_000918	TTGCGG	2	12	979000	979011	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	15606571
506	NC_000918	CTCTTC	2	12	980067	980078	0 %	50 %	0 %	50 %	15606573
507	NC_000918	TTCATA	3	18	984929	984946	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	15606576
508	NC_000918	TCCGTA	2	12	987461	987472	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	15606580
509	NC_000918	TTTAAA	2	12	987673	987684	50 %	50 %	0 %	0 %	15606580
510	NC_000918	GTTCCT	2	12	988577	988588	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
511	NC_000918	GGGACA	2	12	989483	989494	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	15606581
512	NC_000918	ATTATG	2	12	993011	993022	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	15606584
513	NC_000918	GAAAAC	2	12	993891	993902	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	15606585
514	NC_000918	GAAAAG	2	12	998352	998363	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15606587
515	NC_000918	GGAAAA	2	12	1000850	1000861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15606590
516	NC_000918	TTCCCT	2	12	1001032	1001043	0 %	50 %	0 %	50 %	15606591
517	NC_000918	ATAAGG	2	12	1002386	1002397	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	15606591
518	NC_000918	ATCCCT	2	12	1005849	1005860	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	15606595
519	NC_000918	TAATAG	2	12	1020371	1020382	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	15606610
520	NC_000918	AGATGA	2	12	1021444	1021455	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	15606612
521	NC_000918	ACTTTT	2	12	1023037	1023048	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	15606613
522	NC_000918	GAAAAA	2	12	1023432	1023443	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	15606613
523	NC_000918	GTGAAA	2	12	1023724	1023735	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	15606613
524	NC_000918	AAGGAT	2	12	1024686	1024697	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	15606614
525	NC_000918	AAGGAA	2	12	1026226	1026237	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15606615
526	NC_000918	CTATTT	2	12	1029321	1029332	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	15606616
527	NC_000918	CCGCAA	2	12	1029983	1029994	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	15606617
528	NC_000918	ACCTAA	2	12	1031514	1031525	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	15606617
529	NC_000918	ACGTTT	2	12	1031653	1031664	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	15606617
530	NC_000918	GACTTT	2	12	1037349	1037360	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	15606623
531	NC_000918	TCGGTA	2	12	1042387	1042398	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	15606627
532	NC_000918	GAAAGA	2	12	1042530	1042541	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15606628
533	NC_000918	AGTAAA	2	12	1043128	1043139	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	15606629
534	NC_000918	TGCACC	2	12	1048241	1048252	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	15606634
535	NC_000918	GGCAAG	2	12	1048397	1048408	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	15606634
536	NC_000918	AAAGGA	2	12	1049951	1049962	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15606635
537	NC_000918	AAGGGA	2	12	1057914	1057925	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
538	NC_000918	CTTTAC	2	12	1058826	1058837	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	15606647
539	NC_000918	ATTATC	2	12	1060042	1060053	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	15606648
540	NC_000918	CTTTCT	2	12	1061350	1061361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15606649
541	NC_000918	CTGGAG	2	12	1061843	1061854	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	15606649
542	NC_000918	TTTCTT	2	12	1062398	1062409	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	15606650
543	NC_000918	CTTTAC	2	12	1063949	1063960	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	15606651
544	NC_000918	ACAAGA	2	12	1066811	1066822	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	15606655
545	NC_000918	TTTCGG	2	12	1075956	1075967	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	15606664
546	NC_000918	AGGAAA	2	12	1076948	1076959	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15606665
547	NC_000918	CAAGGA	2	12	1079868	1079879	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	15606668
548	NC_000918	CTTCCT	2	12	1085140	1085151	0 %	50 %	0 %	50 %	15606673
549	NC_000918	CAACTT	2	12	1090951	1090962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15606680
550	NC_000918	TCCACC	2	12	1091422	1091433	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	15606681
551	NC_000918	TATGCC	2	12	1091490	1091501	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	15606681
552	NC_000918	ATTCTC	2	12	1096844	1096855	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	15606687
553	NC_000918	CCCTGC	2	12	1099831	1099842	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	15606691
554	NC_000918	TTCCTG	2	12	1101124	1101135	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	15606693
555	NC_000918	ACCTGA	2	12	1102820	1102831	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	15606695
556	NC_000918	CCCATA	2	12	1108386	1108397	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	15606697
557	NC_000918	TAAGGG	2	12	1109056	1109067	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	15606697
558	NC_000918	TTTAAC	2	12	1110892	1110903	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	15606698
559	NC_000918	CTTCAC	2	12	1111724	1111735	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	15606700
560	NC_000918	CCTATG	2	12	1112486	1112497	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	15606701
561	NC_000918	TAGAAG	2	12	1113968	1113979	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	15606703
562	NC_000918	CTGAAA	2	12	1114186	1114197	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	15606703
563	NC_000918	CAAAGG	2	12	1117589	1117600	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	15606708
564	NC_000918	CTTGAA	2	12	1118646	1118657	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	15606709
565	NC_000918	GTAAAG	2	12	1118730	1118741	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	15606709
566	NC_000918	CGGAAA	2	12	1119855	1119866	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	15606711
567	NC_000918	AAAGGA	2	12	1120151	1120162	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15606712
568	NC_000918	CTCCTG	2	12	1123320	1123331	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	15606716
569	NC_000918	GGGCGA	2	12	1127285	1127296	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	15606721
570	NC_000918	ATAAAA	2	12	1128593	1128604	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
571	NC_000918	GGATGT	2	12	1129051	1129062	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
572	NC_000918	GGAAAA	2	12	1131367	1131378	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15606725
573	NC_000918	AGTCCG	2	12	1132383	1132394	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	15606727
574	NC_000918	TTGTCC	2	12	1132986	1132997	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	15606727
575	NC_000918	TCTTAC	2	12	1136829	1136840	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	15606730
576	NC_000918	TATCCT	2	12	1143523	1143534	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	15606737
577	NC_000918	GGCTAC	2	12	1146294	1146305	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	15606740
578	NC_000918	AGTACG	2	12	1150875	1150886	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	15606743
579	NC_000918	TGTCCC	2	12	1151668	1151679	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	15606744
580	NC_000918	AGCGAG	2	12	1153740	1153751	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
581	NC_000918	GTTTGA	2	12	1156089	1156100	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	15606751
582	NC_000918	CTCTTC	2	12	1156811	1156822	0 %	50 %	0 %	50 %	15606752
583	NC_000918	TTCCCG	2	12	1159508	1159519	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	15606758
584	NC_000918	TTCAAG	2	12	1160991	1161002	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	15606760
585	NC_000918	CAGAGC	2	12	1161639	1161650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15606761
586	NC_000918	GGGAGC	2	12	1162497	1162508	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	15606762
587	NC_000918	CCTCTG	2	12	1162771	1162782	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	15606763
588	NC_000918	CCATTA	2	12	1163277	1163288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15606763
589	NC_000918	AACTTT	2	12	1163718	1163729	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	15606764
590	NC_000918	TGAAAT	2	12	1165406	1165417	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	15606765
591	NC_000918	CCGAGG	2	12	1168335	1168346	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	15606767
592	NC_000918	TCTTTG	2	12	1168729	1168740	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	15606768
593	NC_000918	TTTAAG	2	12	1172525	1172536	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	15606771
594	NC_000918	GCTCCC	2	12	1176182	1176193	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	15606774
595	NC_000918	TTTCCC	2	12	1176483	1176494	0 %	50 %	0 %	50 %	15606774
596	NC_000918	TAGAAA	2	12	1178053	1178064	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	15606775
597	NC_000918	GAAGAG	2	12	1178880	1178891	50 %	0 %	50 %	0 %	15606775
598	NC_000918	GGAAGA	2	12	1178963	1178974	50 %	0 %	50 %	0 %	15606775
599	NC_000918	AAAGGA	2	12	1179937	1179948	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15606777
600	NC_000918	CCGCGT	2	12	1181135	1181146	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	15606778
601	NC_000918	TGCGGT	2	12	1182355	1182366	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	15606779
602	NC_000918	CTACCC	2	12	1183338	1183349	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	15606779
603	NC_000918	CCCTTT	2	12	1183757	1183768	0 %	50 %	0 %	50 %	15606780
604	NC_000918	TTTAAC	2	12	1183796	1183807	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	15606780
605	NC_000918	AACACC	2	12	1186852	1186863	50 %	0 %	0 %	50 %	15606781
606	NC_000918	ATGAGT	2	12	1200854	1200865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15606791
607	NC_000918	ACCTAT	2	12	1201632	1201643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15606792
608	NC_000918	TCGTGG	2	12	1202408	1202419	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	15606792
609	NC_000918	GGTAGT	2	12	1203368	1203379	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	15606792
610	NC_000918	TTTACT	2	12	1204810	1204821	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	15606794
611	NC_000918	GACAGG	2	12	1208070	1208081	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	15606798
612	NC_000918	TATGAG	2	12	1209333	1209344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
613	NC_000918	CACCTA	2	12	1210366	1210377	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	15606801
614	NC_000918	CTGGAG	2	12	1210748	1210759	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	15606801
615	NC_000918	CGTTGA	2	12	1212689	1212700	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	15606803
616	NC_000918	GAGAGG	2	12	1213602	1213613	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15606804
617	NC_000918	AGAAAG	2	12	1216568	1216579	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
618	NC_000918	AGGTTC	2	12	1217596	1217607	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	15606806
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622	NC_000918	AGGGAA	2	12	1220884	1220895	50 %	0 %	50 %	0 %	15606808
623	NC_000918	CGTACT	2	12	1223882	1223893	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	15606810
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731	NC_000918	TATCTG	2	12	1452566	1452577	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	15607030
732	NC_000918	GGCTAC	2	12	1457944	1457955	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	15607037
733	NC_000918	GTAGCT	3	18	1459485	1459502	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	15607038
734	NC_000918	GGAAAA	2	12	1460063	1460074	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15607038
735	NC_000918	CTTTTC	2	12	1461414	1461425	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15607040
736	NC_000918	TTTACC	2	12	1461958	1461969	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	15607040
737	NC_000918	TTCCTC	2	12	1463469	1463480	0 %	50 %	0 %	50 %	15607041
738	NC_000918	TATGGA	2	12	1465023	1465034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15607043
739	NC_000918	AAAGGT	2	12	1469042	1469053	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	15607048
740	NC_000918	AAAGGC	2	12	1469237	1469248	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	15607048
741	NC_000918	CCATCT	2	12	1473688	1473699	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	15607052
742	NC_000918	TCTTCC	2	12	1474579	1474590	0 %	50 %	0 %	50 %	15607054
743	NC_000918	CCTTTG	2	12	1480614	1480625	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	15607059
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745	NC_000918	GGATAC	2	12	1487417	1487428	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	15607064
746	NC_000918	TAAGAA	2	12	1488306	1488317	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	15607065
747	NC_000918	GCACCT	2	12	1488739	1488750	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	15607065
748	NC_000918	CTTTTT	2	12	1489860	1489871	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	15607066
749	NC_000918	TCCTTT	2	12	1490263	1490274	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15607067
750	NC_000918	TTTCCT	2	12	1493985	1493996	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15607071
751	NC_000918	GAATAT	2	12	1494667	1494678	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	15607071
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753	NC_000918	TAAGGG	2	12	1499465	1499476	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	15607075
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760	NC_000918	ACCTGT	2	12	1522410	1522421	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	15607098
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765	NC_000918	AGCCAT	2	12	1536673	1536684	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	15607118
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