MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Aquifex aeolicus VF5

Total Repeats: 132

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_000918	ATTTT	2	10	37585	37594	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_000918	TAATA	2	10	50364	50373	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_000918	CTCAA	2	10	67187	67196	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
4	NC_000918	GAGAG	2	10	87976	87985	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
5	NC_000918	TCGCG	2	10	98183	98192	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
6	NC_000918	AGAGG	2	10	141707	141716	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
7	NC_000918	TTTCC	2	10	149640	149649	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
8	NC_000918	GGCGC	2	10	168898	168907	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
9	NC_000918	GAAAG	2	10	203514	203523	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
10	NC_000918	AATAT	2	10	210992	211001	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_000918	ATAAA	2	10	215822	215831	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_000918	ATAAA	2	10	222052	222061	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_000918	ATTAT	2	10	225162	225171	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_000918	AATTG	2	10	225545	225554	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_000918	CCCTT	2	10	228575	228584	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
16	NC_000918	ATTTC	2	10	244960	244969	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_000918	ACGAA	2	10	263353	263362	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
18	NC_000918	ATTTC	2	10	263460	263469	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
19	NC_000918	TTTAA	2	10	263574	263583	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_000918	GTATA	2	10	276712	276721	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_000918	TTTTA	2	10	279235	279244	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_000918	ATTTC	2	10	279724	279733	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NC_000918	TGAAT	2	10	299038	299047	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_000918	TTTAC	2	10	307685	307694	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_000918	AAAGG	2	10	314458	314467	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
26	NC_000918	CGTCC	2	10	321607	321616	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
27	NC_000918	AGGAG	2	10	321669	321678	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
28	NC_000918	TCAGG	2	10	349356	349365	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
29	NC_000918	AAAGA	2	10	359291	359300	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_000918	TGATA	2	10	359464	359473	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_000918	TTTAA	2	10	392866	392875	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_000918	AAAGT	2	10	397085	397094	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_000918	TGTCA	2	10	410096	410105	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
34	NC_000918	AGGAA	2	10	411020	411029	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
35	NC_000918	ATGAA	2	10	416897	416906	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_000918	GGAAG	2	10	418370	418379	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
37	NC_000918	AGTAA	2	10	418472	418481	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_000918	GTAAA	2	10	418572	418581	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_000918	TCTCT	2	10	419040	419049	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
40	NC_000918	AAAGG	2	10	428319	428328	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
41	NC_000918	TTAAT	2	10	433151	433160	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_000918	TAATT	2	10	450531	450540	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_000918	TTTTA	2	10	533956	533965	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_000918	GACGG	2	10	569291	569300	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
45	NC_000918	CTCAC	2	10	570037	570046	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
46	NC_000918	TTTCC	2	10	570672	570681	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
47	NC_000918	TTCCC	2	10	570713	570722	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
48	NC_000918	CCGGC	2	10	571262	571271	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
49	NC_000918	CTGAC	2	10	571552	571561	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
50	NC_000918	CACGA	2	10	571675	571684	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
51	NC_000918	ACCTT	2	10	578022	578031	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
52	NC_000918	TTCCT	2	10	593273	593282	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
53	NC_000918	AAAGG	2	10	593508	593517	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
54	NC_000918	TTTCC	2	10	614426	614435	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
55	NC_000918	CCTTT	2	10	622217	622226	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
56	NC_000918	GATAA	2	10	631245	631254	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_000918	GGGAA	2	10	665512	665521	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
58	NC_000918	GATAA	2	10	665747	665756	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_000918	TCATC	2	10	692395	692404	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
60	NC_000918	AGAAA	3	15	706211	706225	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_000918	TTTTA	2	10	719205	719214	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_000918	AAGGA	2	10	739352	739361	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
63	NC_000918	AAGAG	2	10	739500	739509	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
64	NC_000918	CTTTC	2	10	755676	755685	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
65	NC_000918	TCAAA	2	10	761129	761138	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
66	NC_000918	TTTCC	2	10	766422	766431	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
67	NC_000918	ATTTA	2	10	770983	770992	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_000918	ACTTA	2	10	798756	798765	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
69	NC_000918	CTAAA	2	10	827405	827414	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
70	NC_000918	CTTTT	2	10	828831	828840	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
71	NC_000918	TCCTT	2	10	844091	844100	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
72	NC_000918	CCCCT	2	10	866389	866398	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
73	NC_000918	AAGGA	2	10	866685	866694	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
74	NC_000918	CCCTC	2	10	923109	923118	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
75	NC_000918	GCCTC	2	10	948293	948302	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
76	NC_000918	CTTCT	2	10	948321	948330	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
77	NC_000918	AAAAG	2	10	986175	986184	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_000918	TTCGT	2	10	988447	988456	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
79	NC_000918	CCTCG	2	10	1003296	1003305	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
80	NC_000918	AAATA	2	10	1019510	1019519	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_000918	CTTTT	2	10	1019948	1019957	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
82	NC_000918	TCTAT	2	10	1034929	1034938	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
83	NC_000918	ACGAA	2	10	1046960	1046969	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
84	NC_000918	TAAAT	2	10	1049024	1049033	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_000918	CAATA	2	10	1050557	1050566	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
86	NC_000918	TAAAT	2	10	1082584	1082593	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_000918	TCACC	2	10	1136019	1136028	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
88	NC_000918	GAAAA	2	10	1144430	1144439	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
89	NC_000918	GCTTA	2	10	1171164	1171173	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
90	NC_000918	TCGTG	2	10	1193170	1193179	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
91	NC_000918	GTCAG	2	10	1193293	1193302	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
92	NC_000918	GGCCG	2	10	1193582	1193591	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
93	NC_000918	AGGAA	2	10	1194172	1194181	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
94	NC_000918	GTGAG	2	10	1194808	1194817	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
95	NC_000918	CCGTC	2	10	1195554	1195563	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
96	NC_000918	TAATT	2	10	1197089	1197098	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_000918	AAATA	2	10	1211180	1211189	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_000918	CCTTC	2	10	1216515	1216524	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
99	NC_000918	GAACA	2	10	1216933	1216942	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
100	NC_000918	TTTCA	2	10	1217118	1217127	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
101	NC_000918	TTTGT	2	10	1231600	1231609	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
102	NC_000918	TTTTC	2	10	1231960	1231969	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
103	NC_000918	AGGGA	2	10	1232184	1232193	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
104	NC_000918	TTTCC	2	10	1241236	1241245	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
105	NC_000918	TTCGT	2	10	1249118	1249127	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
106	NC_000918	CTTCC	2	10	1285567	1285576	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
107	NC_000918	TAAAA	2	10	1289305	1289314	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_000918	GACTT	2	10	1308107	1308116	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
109	NC_000918	TGAAA	2	10	1314980	1314989	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
110	NC_000918	CTTTT	2	10	1316816	1316825	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
111	NC_000918	CTCTT	2	10	1346722	1346731	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
112	NC_000918	AAGAG	2	10	1348381	1348390	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
113	NC_000918	CCCAG	2	10	1348527	1348536	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
114	NC_000918	AGAGG	2	10	1361755	1361764	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
115	NC_000918	GCGGA	2	10	1376004	1376013	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
116	NC_000918	ACGAA	2	10	1379956	1379965	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
117	NC_000918	ATTTC	2	10	1380063	1380072	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
118	NC_000918	AGCGT	2	10	1386441	1386450	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
119	NC_000918	TTTAA	2	10	1386602	1386611	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_000918	GTTTT	2	10	1393074	1393083	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
121	NC_000918	CTTTT	2	10	1407051	1407060	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
122	NC_000918	TTCGT	2	10	1418829	1418838	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
123	NC_000918	TAATA	2	10	1424150	1424159	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_000918	CCTCT	2	10	1428529	1428538	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
125	NC_000918	GGCGG	2	10	1452943	1452952	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
126	NC_000918	TAAGG	2	10	1471356	1471365	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
127	NC_000918	CTTCC	2	10	1472285	1472294	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
128	NC_000918	TTTTA	2	10	1481367	1481376	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_000918	AAGGG	2	10	1487880	1487889	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
130	NC_000918	AAAAC	2	10	1499949	1499958	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
131	NC_000918	TTTTA	2	10	1536269	1536278	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_000918	TACTT	2	10	1540193	1540202	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.