MICAS: Microsatellite Analysis Server

Penta-nucleotide Coding Repeats of Aquifex aeolicus VF5

Total Repeats: 1098

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_000918	TTTGC	2	10	1402649	1402658	0 %	60 %	20 %	20 %	15606986
1002	NC_000918	GCCCG	2	10	1404138	1404147	0 %	0 %	40 %	60 %	15606988
1003	NC_000918	AAAAC	2	10	1405534	1405543	80 %	0 %	0 %	20 %	15606990
1004	NC_000918	CTGAC	2	10	1406277	1406286	20 %	20 %	20 %	40 %	15606990
1005	NC_000918	CAAAT	2	10	1408700	1408709	60 %	20 %	0 %	20 %	15606992
1006	NC_000918	TCGCT	2	10	1411282	1411291	0 %	40 %	20 %	40 %	15606996
1007	NC_000918	TTTTC	2	10	1411931	1411940	0 %	80 %	0 %	20 %	15606997
1008	NC_000918	TTCTC	2	10	1412225	1412234	0 %	60 %	0 %	40 %	15606997
1009	NC_000918	TATCC	2	10	1412892	1412901	20 %	40 %	0 %	40 %	15606998
1010	NC_000918	CTGCT	2	10	1413859	1413868	0 %	40 %	20 %	40 %	15606998
1011	NC_000918	TCCTC	2	10	1416704	1416713	0 %	40 %	0 %	60 %	15607000
1012	NC_000918	AGGAA	2	10	1417176	1417185	60 %	0 %	40 %	0 %	15607000
1013	NC_000918	AACAG	2	10	1419334	1419343	60 %	0 %	20 %	20 %	15607002
1014	NC_000918	CCGCT	2	10	1421714	1421723	0 %	20 %	20 %	60 %	15607004
1015	NC_000918	CTGGA	2	10	1422020	1422029	20 %	20 %	40 %	20 %	15607005
1016	NC_000918	CCCGT	2	10	1426385	1426394	0 %	20 %	20 %	60 %	15607008
1017	NC_000918	TTCCT	2	10	1426621	1426630	0 %	60 %	0 %	40 %	15607008
1018	NC_000918	TCTTT	2	10	1426915	1426924	0 %	80 %	0 %	20 %	15607009
1019	NC_000918	CCCGA	2	10	1428500	1428509	20 %	0 %	20 %	60 %	15607010
1020	NC_000918	ATATA	2	10	1429061	1429070	60 %	40 %	0 %	0 %	15607011
1021	NC_000918	AGAGG	2	10	1429575	1429584	40 %	0 %	60 %	0 %	15607012
1022	NC_000918	CGGTG	2	10	1430997	1431006	0 %	20 %	60 %	20 %	15607012
1023	NC_000918	CAAGG	2	10	1431087	1431096	40 %	0 %	40 %	20 %	15607012
1024	NC_000918	TTAAA	2	10	1431419	1431428	60 %	40 %	0 %	0 %	15607012
1025	NC_000918	TGTGC	2	10	1434027	1434036	0 %	40 %	40 %	20 %	15607015
1026	NC_000918	TGCCT	2	10	1434282	1434291	0 %	40 %	20 %	40 %	15607016
1027	NC_000918	TTGAA	2	10	1434808	1434817	40 %	40 %	20 %	0 %	15607016
1028	NC_000918	AGGAA	2	10	1435324	1435333	60 %	0 %	40 %	0 %	15607017
1029	NC_000918	AAAAG	2	10	1435469	1435478	80 %	0 %	20 %	0 %	15607017
1030	NC_000918	GCTTG	2	10	1436466	1436475	0 %	40 %	40 %	20 %	15607018
1031	NC_000918	GTAAA	2	10	1439147	1439156	60 %	20 %	20 %	0 %	15607021
1032	NC_000918	GAAGG	2	10	1440825	1440834	40 %	0 %	60 %	0 %	15607021
1033	NC_000918	ACTTC	2	10	1444132	1444141	20 %	40 %	0 %	40 %	15607024
1034	NC_000918	AAGTT	2	10	1445978	1445987	40 %	40 %	20 %	0 %	15607025
1035	NC_000918	CTTTT	2	10	1446735	1446744	0 %	80 %	0 %	20 %	15607025
1036	NC_000918	CTAAA	2	10	1446749	1446758	60 %	20 %	0 %	20 %	15607025
1037	NC_000918	TTTTC	2	10	1447546	1447555	0 %	80 %	0 %	20 %	15607025
1038	NC_000918	CCCTG	2	10	1449027	1449036	0 %	20 %	20 %	60 %	15607027
1039	NC_000918	TTTCC	2	10	1449231	1449240	0 %	60 %	0 %	40 %	15607027
1040	NC_000918	AGTCC	2	10	1452628	1452637	20 %	20 %	20 %	40 %	15607030
1041	NC_000918	AGGAA	2	10	1455734	1455743	60 %	0 %	40 %	0 %	15607034
1042	NC_000918	GAAGG	2	10	1455745	1455754	40 %	0 %	60 %	0 %	15607034
1043	NC_000918	AGCGT	2	10	1460861	1460870	20 %	20 %	40 %	20 %	15607039
1044	NC_000918	GCGAC	2	10	1462014	1462023	20 %	0 %	40 %	40 %	15607041
1045	NC_000918	AACGT	2	10	1467801	1467810	40 %	20 %	20 %	20 %	15607045
1046	NC_000918	GAAGA	2	10	1470577	1470586	60 %	0 %	40 %	0 %	15607049
1047	NC_000918	TTTTA	2	10	1471406	1471415	20 %	80 %	0 %	0 %	15607050
1048	NC_000918	CTTCC	2	10	1471857	1471866	0 %	40 %	0 %	60 %	15607050
1049	NC_000918	ATAGG	2	10	1473173	1473182	40 %	20 %	40 %	0 %	15607051
1050	NC_000918	CTTTC	2	10	1475335	1475344	0 %	60 %	0 %	40 %	15607054
1051	NC_000918	TTCCT	2	10	1476664	1476673	0 %	60 %	0 %	40 %	15607055
1052	NC_000918	GAAAG	2	10	1478611	1478620	60 %	0 %	40 %	0 %	15607057
1053	NC_000918	CAACT	2	10	1478819	1478828	40 %	20 %	0 %	40 %	15607057
1054	NC_000918	TCCTA	2	10	1479594	1479603	20 %	40 %	0 %	40 %	15607058
1055	NC_000918	AGTCC	2	10	1480527	1480536	20 %	20 %	20 %	40 %	15607059
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1057	NC_000918	CCTTT	2	10	1495672	1495681	0 %	60 %	0 %	40 %	15607072
1058	NC_000918	CCCTT	2	10	1498449	1498458	0 %	40 %	0 %	60 %	15607074
1059	NC_000918	TTTCC	2	10	1503091	1503100	0 %	60 %	0 %	40 %	15607078
1060	NC_000918	CGGAG	2	10	1503610	1503619	20 %	0 %	60 %	20 %	15607080
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1063	NC_000918	CTTTT	2	10	1506275	1506284	0 %	80 %	0 %	20 %	15607084
1064	NC_000918	AGATA	2	10	1506542	1506551	60 %	20 %	20 %	0 %	15607085
1065	NC_000918	CTTTA	2	10	1506609	1506618	20 %	60 %	0 %	20 %	15607085
1066	NC_000918	TTCCC	2	10	1506868	1506877	0 %	40 %	0 %	60 %	15607085
1067	NC_000918	AGAGG	2	10	1507526	1507535	40 %	0 %	60 %	0 %	15607085
1068	NC_000918	AAAGC	2	10	1508471	1508480	60 %	0 %	20 %	20 %	15607086
1069	NC_000918	AGGAA	2	10	1509548	1509557	60 %	0 %	40 %	0 %	15607086
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1096	NC_000918	TCCCT	2	10	1549233	1549242	0 %	40 %	0 %	60 %	15607131
1097	NC_000918	TCTTT	2	10	1549251	1549260	0 %	80 %	0 %	20 %	15607131
1098	NC_000918	TCCCT	2	10	1550336	1550345	0 %	40 %	0 %	60 %	15607132

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