MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Aquifex aeolicus VF5

Total Repeats: 19155

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_000918	TGC	2	6	138	143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15605613
2	NC_000918	AGA	2	6	465	470	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15605613
3	NC_000918	GGA	2	6	516	521	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15605613
4	NC_000918	GAA	2	6	574	579	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15605613
5	NC_000918	AGT	2	6	600	605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15605613
6	NC_000918	TCC	2	6	612	617	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15605613
7	NC_000918	GAT	2	6	654	659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15605613
8	NC_000918	CGA	3	9	678	686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15605613
9	NC_000918	CAA	2	6	755	760	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15605613
10	NC_000918	CTT	2	6	823	828	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15605613
11	NC_000918	TCC	2	6	867	872	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15605613
12	NC_000918	GAA	2	6	901	906	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15605613
13	NC_000918	GAC	2	6	925	930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15605613
14	NC_000918	CTT	2	6	1075	1080	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15605613
15	NC_000918	CAG	2	6	1111	1116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15605613
16	NC_000918	CGC	2	6	1155	1160	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15605613
17	NC_000918	TGA	2	6	1179	1184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15605613
18	NC_000918	AAG	2	6	1258	1263	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15605613
19	NC_000918	CAA	2	6	1290	1295	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15605613
20	NC_000918	CAA	2	6	1325	1330	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15605613
21	NC_000918	AAT	2	6	1386	1391	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15605613
22	NC_000918	TCA	2	6	1496	1501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15605613
23	NC_000918	TGG	2	6	1509	1514	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15605613
24	NC_000918	GAC	2	6	1585	1590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15605613
25	NC_000918	GGA	2	6	1597	1602	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15605613
26	NC_000918	GTT	2	6	1684	1689	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15605613
27	NC_000918	TTC	2	6	1805	1810	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15605613
28	NC_000918	AGA	2	6	1885	1890	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15605613
29	NC_000918	ACG	2	6	1975	1980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15605613
30	NC_000918	ACG	2	6	2033	2038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15605613
31	NC_000918	GCA	2	6	2046	2051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15605613
32	NC_000918	AGG	2	6	2103	2108	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_000918	GAA	2	6	2270	2275	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15605614
34	NC_000918	AGA	2	6	2290	2295	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15605614
35	NC_000918	GTT	2	6	2441	2446	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15605614
36	NC_000918	GCA	2	6	2450	2455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15605614
37	NC_000918	GAC	2	6	2552	2557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15605614
38	NC_000918	GAA	2	6	2558	2563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15605614
39	NC_000918	AGA	2	6	2788	2793	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15605614
40	NC_000918	TAG	2	6	2877	2882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15605614
41	NC_000918	ACA	2	6	2964	2969	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15605614
42	NC_000918	TGC	2	6	2976	2981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15605614
43	NC_000918	GAC	2	6	2999	3004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15605614
44	NC_000918	AGG	2	6	3087	3092	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15605614
45	NC_000918	AGG	2	6	3094	3099	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15605614
46	NC_000918	GAA	2	6	3257	3262	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15605614
47	NC_000918	GGT	2	6	3287	3292	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15605614
48	NC_000918	AGG	2	6	3899	3904	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15605616
49	NC_000918	GAA	2	6	4217	4222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15605616
50	NC_000918	ACA	2	6	4257	4262	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15605616
51	NC_000918	AGA	2	6	4360	4365	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15605616
52	NC_000918	GAT	2	6	4414	4419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15605617
53	NC_000918	AGT	2	6	4458	4463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15605617
54	NC_000918	AGG	2	6	4483	4488	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15605617
55	NC_000918	TCG	2	6	4601	4606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15605617
56	NC_000918	GGT	2	6	4609	4614	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15605617
57	NC_000918	ATT	2	6	4720	4725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15605617
58	NC_000918	ACG	2	6	4910	4915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15605617
59	NC_000918	AAG	2	6	4969	4974	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15605617
60	NC_000918	AAT	2	6	5013	5018	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15605618
61	NC_000918	GGA	2	6	5058	5063	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15605618
62	NC_000918	ACA	2	6	5066	5071	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15605618
63	NC_000918	GAT	2	6	5166	5171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15605618
64	NC_000918	AGA	3	9	5183	5191	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15605618
65	NC_000918	GAA	2	6	5226	5231	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15605618
66	NC_000918	AGT	2	6	5306	5311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_000918	GAA	2	6	5376	5381	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15605619
68	NC_000918	CTA	2	6	5418	5423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15605619
69	NC_000918	CTC	2	6	5454	5459	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15605619
70	NC_000918	GTG	2	6	5462	5467	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15605619
71	NC_000918	GAG	2	6	5524	5529	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15605619
72	NC_000918	GGA	2	6	5838	5843	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15605619
73	NC_000918	ACC	2	6	6079	6084	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15605619
74	NC_000918	GGT	3	9	6090	6098	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15605619
75	NC_000918	AGA	2	6	6165	6170	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15605619
76	NC_000918	AAG	2	6	6174	6179	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15605619
77	NC_000918	AGG	2	6	6228	6233	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_000918	GAG	2	6	6292	6297	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_000918	CTT	2	6	6415	6420	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15605620
80	NC_000918	GAG	2	6	6421	6426	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15605620
81	NC_000918	AAG	2	6	6464	6469	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15605620
82	NC_000918	ATA	2	6	6571	6576	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15605620
83	NC_000918	GAA	2	6	6598	6603	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15605620
84	NC_000918	ACG	2	6	6727	6732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15605620
85	NC_000918	ATA	2	6	6733	6738	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15605620
86	NC_000918	TGG	2	6	6812	6817	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15605620
87	NC_000918	AAG	3	9	6889	6897	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15605620
88	NC_000918	GAC	2	6	7189	7194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15605621
89	NC_000918	GAA	2	6	7206	7211	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15605621
90	NC_000918	CTA	2	6	7238	7243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15605621
91	NC_000918	AGG	2	6	7301	7306	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15605621
92	NC_000918	TAA	2	6	7357	7362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15605622
93	NC_000918	GAA	2	6	7549	7554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15605622
94	NC_000918	AGG	2	6	7790	7795	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15605622
95	NC_000918	GAA	2	6	7831	7836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15605622
96	NC_000918	AGA	2	6	7956	7961	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_000918	GAA	3	9	7978	7986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_000918	AGG	2	6	8003	8008	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_000918	CAA	2	6	8152	8157	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15605623
100	NC_000918	GAG	2	6	8184	8189	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15605623
101	NC_000918	GTG	2	6	8270	8275	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15605623
102	NC_000918	GGT	2	6	8304	8309	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15605623
103	NC_000918	GGT	2	6	8446	8451	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_000918	AAG	2	6	8475	8480	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15607133
105	NC_000918	AGA	2	6	8486	8491	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15607133
106	NC_000918	CAG	2	6	8693	8698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15605624
107	NC_000918	AAG	2	6	8699	8704	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15605624
108	NC_000918	GTT	2	6	8768	8773	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15605624
109	NC_000918	CAT	2	6	8815	8820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15605624
110	NC_000918	AAG	2	6	8828	8833	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15605624
111	NC_000918	ACG	2	6	8844	8849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15605624
112	NC_000918	GTA	2	6	8927	8932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15605624
113	NC_000918	AGA	2	6	8951	8956	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15605624
114	NC_000918	GAA	2	6	8963	8968	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15605624
115	NC_000918	ACA	2	6	8977	8982	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15605624
116	NC_000918	TGA	2	6	9021	9026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15605625
117	NC_000918	GAA	2	6	9139	9144	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15605625
118	NC_000918	GAG	2	6	9190	9195	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15605625
119	NC_000918	GGA	2	6	9196	9201	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15605625
120	NC_000918	GAA	2	6	9232	9237	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15605625
121	NC_000918	AAG	2	6	9314	9319	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15605625
122	NC_000918	ATA	2	6	9376	9381	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15605625
123	NC_000918	GGA	2	6	9412	9417	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15605625
124	NC_000918	TAA	2	6	9566	9571	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15605625
125	NC_000918	AGA	2	6	9618	9623	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15605625
126	NC_000918	CTC	2	6	9667	9672	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15605626
127	NC_000918	AGA	2	6	9710	9715	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15605626
128	NC_000918	AAG	2	6	9813	9818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15605626
129	NC_000918	TGG	2	6	9854	9859	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15605626
130	NC_000918	TCT	2	6	9919	9924	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15605626
131	NC_000918	CGG	2	6	10255	10260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15605627
132	NC_000918	CTA	2	6	10441	10446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15605627
133	NC_000918	TCC	2	6	10478	10483	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15605627
134	NC_000918	CTT	2	6	10525	10530	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15605627
135	NC_000918	CCT	2	6	10560	10565	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15605627
136	NC_000918	AAT	2	6	10763	10768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15605627
137	NC_000918	GCC	2	6	10992	10997	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15605627
138	NC_000918	TTC	2	6	11075	11080	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15605627
139	NC_000918	GGA	2	6	11113	11118	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15605627
140	NC_000918	TAT	3	9	11371	11379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15605628
141	NC_000918	TCA	2	6	11486	11491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15605628
142	NC_000918	TCC	2	6	11504	11509	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15605628
143	NC_000918	CAA	2	6	11592	11597	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15605628
144	NC_000918	GTC	2	6	11623	11628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15605628
145	NC_000918	TTC	2	6	11776	11781	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15605628
146	NC_000918	TCC	2	6	11824	11829	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15605628
147	NC_000918	TAT	2	6	11989	11994	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15605628
148	NC_000918	CTA	3	9	12096	12104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15605628
149	NC_000918	AAG	2	6	12119	12124	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15605628
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152	NC_000918	CCT	2	6	12393	12398	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15605628
153	NC_000918	CTT	2	6	12488	12493	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15605628
154	NC_000918	CCG	2	6	12584	12589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15605628
155	NC_000918	CTA	2	6	12730	12735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
156	NC_000918	ATT	3	9	12870	12878	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_000918	CTT	2	6	12935	12940	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15605629
158	NC_000918	TGG	2	6	12982	12987	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15605629
159	NC_000918	TCC	2	6	12992	12997	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15605629
160	NC_000918	TCA	2	6	13048	13053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15605629
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164	NC_000918	AAG	2	6	13413	13418	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15605629
165	NC_000918	GTA	2	6	13520	13525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15605629
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168	NC_000918	GAG	4	12	13760	13771	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15605629
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173	NC_000918	CTC	2	6	13988	13993	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15605629
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198	NC_000918	AGG	2	6	17037	17042	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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262	NC_000918	TTA	2	6	21878	21883	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15605636
263	NC_000918	AGA	2	6	21910	21915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15605636
264	NC_000918	TGT	2	6	22082	22087	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15605636
265	NC_000918	TCT	2	6	22165	22170	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15605636
266	NC_000918	TGT	2	6	22241	22246	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15605636
267	NC_000918	AAG	2	6	22319	22324	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15605636
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269	NC_000918	ATA	2	6	22427	22432	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15605637
270	NC_000918	AAG	2	6	22467	22472	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15605637
271	NC_000918	AGA	2	6	22585	22590	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15605637
272	NC_000918	CCT	3	9	22675	22683	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15605637
273	NC_000918	ATT	2	6	22751	22756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15605637
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275	NC_000918	GGT	2	6	23075	23080	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15605638
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281	NC_000918	GAA	2	6	23859	23864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15605639
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284	NC_000918	TAA	2	6	24145	24150	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15605639
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288	NC_000918	TAA	2	6	24280	24285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15605639
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301	NC_000918	CTT	2	6	25315	25320	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15605641
302	NC_000918	CGT	2	6	25326	25331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15605641
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311	NC_000918	TCT	2	6	25751	25756	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15605641
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380	NC_000918	TAA	2	6	30572	30577	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15605648
381	NC_000918	GAA	2	6	30582	30587	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15605648
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385	NC_000918	ACC	2	6	31211	31216	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15605648
386	NC_000918	CTT	2	6	31434	31439	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15605648
387	NC_000918	TAA	2	6	31577	31582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15605648
388	NC_000918	CAA	2	6	31689	31694	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15605648
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500	NC_000918	AGG	2	6	41457	41462	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding

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