MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Aquifex aeolicus VF5

Total Repeats: 176

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_000918	TA	4	8	22360	22367	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_000918	AG	3	6	22889	22894	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_000918	TA	4	8	29203	29210	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_000918	GA	3	6	38337	38342	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_000918	AG	3	6	44289	44294	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_000918	TC	3	6	50378	50383	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_000918	CT	3	6	60383	60388	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_000918	CT	3	6	71677	71682	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_000918	TA	3	6	82796	82801	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_000918	TC	3	6	82905	82910	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_000918	GA	4	8	109176	109183	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_000918	TA	3	6	149091	149096	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_000918	GA	3	6	161312	161317	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_000918	CT	3	6	162245	162250	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_000918	TG	3	6	167265	167270	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_000918	TC	3	6	168624	168629	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_000918	GA	3	6	168686	168691	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_000918	AT	3	6	207085	207090	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_000918	AG	3	6	207245	207250	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_000918	TA	3	6	221836	221841	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_000918	TA	3	6	225217	225222	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_000918	CT	3	6	244726	244731	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_000918	TA	3	6	256998	257003	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_000918	TG	3	6	264841	264846	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_000918	AC	3	6	268374	268379	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_000918	TC	4	8	273052	273059	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_000918	CT	3	6	289699	289704	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_000918	AG	3	6	328146	328151	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_000918	TG	3	6	330364	330369	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_000918	AG	3	6	338181	338186	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_000918	AC	3	6	344559	344564	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_000918	AC	3	6	344791	344796	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_000918	TA	3	6	344805	344810	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_000918	TA	3	6	349041	349046	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_000918	GA	3	6	349315	349320	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_000918	TC	3	6	367948	367953	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_000918	TA	3	6	388402	388407	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_000918	AT	3	6	397052	397057	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_000918	AT	3	6	397065	397070	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_000918	AT	3	6	397107	397112	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_000918	TA	3	6	406273	406278	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_000918	AG	3	6	406331	406336	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_000918	AT	3	6	410080	410085	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_000918	GA	3	6	410166	410171	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_000918	TC	3	6	411144	411149	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_000918	TA	3	6	415430	415435	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_000918	TA	3	6	416990	416995	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_000918	CT	3	6	417081	417086	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_000918	TA	3	6	417106	417111	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_000918	GT	3	6	418432	418437	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_000918	AT	3	6	423347	423352	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_000918	TA	3	6	428108	428113	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_000918	GA	3	6	437548	437553	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_000918	AT	3	6	437966	437971	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_000918	AT	3	6	444019	444024	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_000918	AT	3	6	450492	450497	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_000918	TA	3	6	450498	450503	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_000918	TA	3	6	516297	516302	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_000918	CT	3	6	540980	540985	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_000918	GC	3	6	552633	552638	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
61	NC_000918	GC	3	6	569593	569598	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
62	NC_000918	GT	3	6	571355	571360	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_000918	TG	3	6	571525	571530	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_000918	GT	3	6	585931	585936	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_000918	CT	3	6	586000	586005	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_000918	TC	3	6	594610	594615	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_000918	AT	3	6	601813	601818	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_000918	GA	3	6	610217	610222	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_000918	AT	3	6	624226	624231	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_000918	AG	3	6	631343	631348	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_000918	TC	3	6	639606	639611	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_000918	CT	3	6	649702	649707	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_000918	CT	3	6	650110	650115	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_000918	CT	3	6	655661	655666	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_000918	TG	3	6	677823	677828	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_000918	CT	3	6	705195	705200	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_000918	AT	3	6	706131	706136	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_000918	TA	3	6	713168	713173	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_000918	TA	3	6	718629	718634	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_000918	AG	3	6	718735	718740	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_000918	AT	3	6	730684	730689	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_000918	TA	3	6	738014	738019	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_000918	AC	3	6	739214	739219	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_000918	TA	3	6	742964	742969	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_000918	AT	3	6	747249	747254	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_000918	TA	3	6	747332	747337	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_000918	TA	3	6	747424	747429	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_000918	AT	3	6	766445	766450	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_000918	AT	4	8	782192	782199	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_000918	TA	3	6	794846	794851	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_000918	TA	3	6	818924	818929	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_000918	TC	3	6	866507	866512	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_000918	AG	3	6	874179	874184	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_000918	AG	3	6	890566	890571	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_000918	TA	4	8	896439	896446	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_000918	TA	3	6	898390	898395	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_000918	AG	3	6	904534	904539	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_000918	AT	3	6	914799	914804	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_000918	AT	3	6	917922	917927	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_000918	GA	3	6	917987	917992	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_000918	TA	3	6	923140	923145	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_000918	AT	3	6	928099	928104	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_000918	TA	3	6	928224	928229	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_000918	CT	3	6	942960	942965	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_000918	CT	3	6	963762	963767	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_000918	TA	3	6	970360	970365	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_000918	TA	3	6	985775	985780	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_000918	TG	3	6	988332	988337	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_000918	GC	3	6	988509	988514	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
110	NC_000918	CA	3	6	989705	989710	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_000918	GA	4	8	993284	993291	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_000918	TA	3	6	1012341	1012346	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_000918	TA	3	6	1019968	1019973	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_000918	CA	3	6	1038165	1038170	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_000918	CT	3	6	1048835	1048840	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_000918	TC	3	6	1054788	1054793	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_000918	TA	3	6	1054913	1054918	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_000918	AT	3	6	1064724	1064729	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_000918	AC	3	6	1076187	1076192	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_000918	CT	3	6	1096765	1096770	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_000918	TA	3	6	1112810	1112815	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_000918	CT	3	6	1113572	1113577	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_000918	GC	3	6	1128963	1128968	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
124	NC_000918	GA	3	6	1129011	1129016	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_000918	TA	3	6	1147857	1147862	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_000918	CT	3	6	1169063	1169068	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_000918	GC	3	6	1174357	1174362	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
128	NC_000918	CA	3	6	1193324	1193329	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_000918	CA	3	6	1193493	1193498	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_000918	GC	3	6	1195256	1195261	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
131	NC_000918	AG	3	6	1226667	1226672	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_000918	AT	3	6	1231318	1231323	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_000918	GA	3	6	1232272	1232277	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_000918	CT	3	6	1232317	1232322	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_000918	AG	4	8	1232401	1232408	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_000918	GT	3	6	1241115	1241120	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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138	NC_000918	TC	3	6	1241475	1241480	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
139	NC_000918	TA	3	6	1241563	1241568	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_000918	CA	3	6	1249181	1249186	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_000918	AT	3	6	1264227	1264232	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_000918	CT	3	6	1285635	1285640	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
143	NC_000918	TA	3	6	1287972	1287977	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_000918	GA	3	6	1305557	1305562	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_000918	AG	3	6	1321253	1321258	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_000918	TA	3	6	1321554	1321559	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_000918	CT	3	6	1321655	1321660	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
148	NC_000918	CA	3	6	1327125	1327130	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
149	NC_000918	TC	3	6	1346688	1346693	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
150	NC_000918	AG	3	6	1348587	1348592	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
151	NC_000918	AC	4	8	1352118	1352125	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.