MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Archaeoglobus fulgidus DSM 4304

Total Repeats: 62

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_000917	GATTTC	2	12	53308	53319	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_000917	GGCAGA	2	12	80964	80975	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_000917	TTTTGT	2	12	92648	92659	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_000917	GTTGAT	2	12	93751	93762	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_000917	TTTTAA	2	12	104134	104145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_000917	CCTCTC	2	12	110729	110740	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_000917	CTAAGG	2	12	129783	129794	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_000917	TTAAAT	2	12	158060	158071	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_000917	CTAAGG	2	12	167113	167124	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_000917	AAAGTT	2	12	169999	170010	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_000917	TAAATT	2	12	248869	248880	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_000917	CTGCTT	2	12	252565	252576	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_000917	AATTCT	2	12	284742	284753	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_000917	CAAAAA	2	12	289862	289873	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_000917	CTTAAT	2	12	401981	401992	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_000917	ATTTTT	2	12	497150	497161	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_000917	TTGCAA	2	12	509795	509806	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_000917	AAGGTC	2	12	532378	532389	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_000917	GCTCAT	2	12	535823	535834	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_000917	GATATT	2	12	556037	556048	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_000917	ATTTAA	2	12	606848	606859	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_000917	ATTTAT	2	12	672861	672872	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_000917	AAGGAA	2	12	714478	714489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_000917	GTGGAA	2	12	784416	784427	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_000917	CAAGAA	2	12	800124	800135	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_000917	GGGGAA	2	12	803595	803606	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_000917	ATAAAA	2	12	868951	868962	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_000917	AGTTTT	2	12	908988	908999	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_000917	CAAAAA	2	12	972018	972029	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_000917	TAAAAA	2	12	983752	983763	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_000917	CATTAT	2	12	984257	984268	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_000917	AGAGGC	2	12	1050031	1050042	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_000917	TAGCCG	2	12	1091782	1091793	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_000917	ATAGCC	2	12	1091811	1091822	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_000917	GCTATA	2	12	1218186	1218197	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_000917	GAGCTT	2	12	1257688	1257699	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_000917	TAAAAA	2	12	1262751	1262762	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_000917	TAAAAA	2	12	1288393	1288404	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_000917	TGTCCT	2	12	1317364	1317375	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_000917	ACAACC	2	12	1327539	1327550	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_000917	TTTGGC	2	12	1375364	1375375	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_000917	ATTTTT	2	12	1415860	1415871	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_000917	TAAAAA	2	12	1539063	1539074	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_000917	AAAAGC	2	12	1578483	1578494	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_000917	TCCTTT	2	12	1693381	1693392	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_000917	TTCCTT	2	12	1759443	1759454	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_000917	CCCCTG	2	12	1787688	1787699	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_000917	ATTTTT	2	12	1808725	1808736	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_000917	GTGCTG	2	12	1830067	1830078	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_000917	GATTTC	2	12	1874886	1874897	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_000917	TACAGC	2	12	1921985	1921996	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_000917	TAACAT	2	12	1942663	1942674	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_000917	ATTTTT	2	12	1975268	1975279	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_000917	CCCGGA	2	12	1977840	1977851	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
55	NC_000917	TAGCTG	2	12	2003913	2003924	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_000917	TCCTCA	2	12	2024172	2024183	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_000917	AGAAAA	2	12	2059108	2059119	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_000917	TAAAAT	2	12	2062746	2062757	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_000917	TTTAAT	2	12	2111232	2111243	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_000917	ATTTTT	2	12	2121799	2121810	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_000917	TTCTCC	2	12	2134091	2134102	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_000917	TATTTC	2	12	2148015	2148026	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.