MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Methanothermobacter thermautotrophicus str. Delta H chromosome

Total Repeats: 57

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_000916	CTGTAA	2	12	56855	56866	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_000916	CCTCAA	2	12	73087	73098	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_000916	ATAATT	2	12	80922	80933	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_000916	CAGGGG	2	12	85378	85389	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_000916	ATATTT	2	12	164487	164498	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_000916	AACTGG	2	12	166646	166657	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_000916	TTTCAA	2	12	198584	198595	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_000916	GATACA	2	12	235256	235267	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_000916	TGATGT	2	12	337613	337624	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_000916	CATTTT	2	12	407698	407709	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_000916	ACATTA	2	12	458684	458695	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_000916	GCTGCA	2	12	472786	472797	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_000916	GGTTAG	2	12	481928	481939	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_000916	CCCTGA	2	12	517669	517680	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
15	NC_000916	GTTTGA	2	12	549201	549212	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_000916	TCAGAA	2	12	632436	632447	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_000916	AAAAAG	2	12	712249	712260	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_000916	TTAAAA	2	12	714241	714252	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_000916	TATAAT	2	12	784516	784527	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_000916	AGATAT	2	12	809005	809016	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_000916	CAGGTT	2	12	849426	849437	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_000916	ATTTTT	2	12	922466	922477	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_000916	TGGTTG	2	12	983690	983701	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_000916	AACATG	2	12	990786	990797	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_000916	GTTGTA	2	12	1008417	1008428	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_000916	TATATT	2	12	1054495	1054506	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_000916	GCACCA	2	12	1084086	1084097	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
28	NC_000916	AATTTT	2	12	1118689	1118700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_000916	ATAAAT	2	12	1120654	1120665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_000916	ATCTGC	2	12	1152282	1152293	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_000916	GGTTCA	2	12	1155518	1155529	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_000916	GGGGCC	2	12	1160033	1160044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_000916	TCTATC	2	12	1165757	1165768	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_000916	ATTCTA	2	12	1181235	1181246	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_000916	AATTTA	2	12	1195280	1195291	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_000916	AGGTTC	2	12	1283323	1283334	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_000916	CATTTC	2	12	1315954	1315965	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_000916	CCTGAT	2	12	1327402	1327413	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_000916	ATCCTC	2	12	1350423	1350434	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_000916	TTAAAT	2	12	1472103	1472114	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_000916	ATTGAA	2	12	1472595	1472606	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_000916	ATTGAA	2	12	1474513	1474524	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_000916	TTCCTT	2	12	1515930	1515941	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_000916	TAACAC	2	12	1553976	1553987	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_000916	CACAAC	2	12	1581901	1581912	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_000916	TTATTC	2	12	1587222	1587233	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_000916	GAAAAA	2	12	1587305	1587316	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_000916	TCCTAA	2	12	1604487	1604498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_000916	ACCCAT	2	12	1626912	1626923	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_000916	ACCTGA	2	12	1632516	1632527	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_000916	TAACTG	2	12	1659293	1659304	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_000916	AGTGTC	2	12	1690962	1690973	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_000916	TCATTA	2	12	1692839	1692850	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_000916	TAAAAA	2	12	1694871	1694882	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_000916	GGGGGA	2	12	1720762	1720773	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_000916	TCCTAA	2	12	1721069	1721080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_000916	CTCATA	2	12	1723862	1723873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.