MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Methanothermobacter thermautotrophicus str. Delta H chromosome

Total Repeats: 3689

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_000916	TAAA	2	8	144	151	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_000916	CAGG	2	8	485	492	25 %	0 %	50 %	25 %	15678032
3	NC_000916	AAAG	2	8	512	519	75 %	0 %	25 %	0 %	15678032
4	NC_000916	ATGA	2	8	970	977	50 %	25 %	25 %	0 %	15678032
5	NC_000916	CAGG	2	8	1741	1748	25 %	0 %	50 %	25 %	15678033
6	NC_000916	AGGA	2	8	2338	2345	50 %	0 %	50 %	0 %	15678034
7	NC_000916	AGGA	2	8	2386	2393	50 %	0 %	50 %	0 %	15678034
8	NC_000916	ACAG	2	8	3718	3725	50 %	0 %	25 %	25 %	15678036
9	NC_000916	GGTT	2	8	3776	3783	0 %	50 %	50 %	0 %	15678036
10	NC_000916	ATAA	2	8	3815	3822	75 %	25 %	0 %	0 %	15678036
11	NC_000916	AAAG	2	8	3996	4003	75 %	0 %	25 %	0 %	15678037
12	NC_000916	CCAG	2	8	4128	4135	25 %	0 %	25 %	50 %	15678037
13	NC_000916	TACG	2	8	5254	5261	25 %	25 %	25 %	25 %	15678039
14	NC_000916	ATGG	2	8	5579	5586	25 %	25 %	50 %	0 %	15678040
15	NC_000916	AAAT	2	8	5747	5754	75 %	25 %	0 %	0 %	15678041
16	NC_000916	ATGT	2	8	5766	5773	25 %	50 %	25 %	0 %	15678041
17	NC_000916	GGAA	2	8	6451	6458	50 %	0 %	50 %	0 %	15678043
18	NC_000916	TCAG	2	8	6777	6784	25 %	25 %	25 %	25 %	15678044
19	NC_000916	AAGG	2	8	7218	7225	50 %	0 %	50 %	0 %	15678045
20	NC_000916	GCCA	2	8	8436	8443	25 %	0 %	25 %	50 %	15678047
21	NC_000916	GCAG	2	8	8781	8788	25 %	0 %	50 %	25 %	15678048
22	NC_000916	GAAG	2	8	8976	8983	50 %	0 %	50 %	0 %	15678049
23	NC_000916	TGAA	2	8	10232	10239	50 %	25 %	25 %	0 %	15678052
24	NC_000916	GGTC	2	8	11552	11559	0 %	25 %	50 %	25 %	15678054
25	NC_000916	GACA	2	8	11803	11810	50 %	0 %	25 %	25 %	15678054
26	NC_000916	ATCA	2	8	13113	13120	50 %	25 %	0 %	25 %	15678057
27	NC_000916	CACC	2	8	13445	13452	25 %	0 %	0 %	75 %	15678057
28	NC_000916	TGGG	2	8	13616	13623	0 %	25 %	75 %	0 %	15678057
29	NC_000916	CAGT	2	8	14778	14785	25 %	25 %	25 %	25 %	15678058
30	NC_000916	CATT	2	8	14874	14881	25 %	50 %	0 %	25 %	15678059
31	NC_000916	AGAA	2	8	15497	15504	75 %	0 %	25 %	0 %	15678060
32	NC_000916	ATGT	2	8	15516	15523	25 %	50 %	25 %	0 %	15678060
33	NC_000916	GCTG	2	8	15524	15531	0 %	25 %	50 %	25 %	15678060
34	NC_000916	AATG	2	8	17643	17650	50 %	25 %	25 %	0 %	15678064
35	NC_000916	GAAG	2	8	18081	18088	50 %	0 %	50 %	0 %	15678064
36	NC_000916	GGAA	2	8	18513	18520	50 %	0 %	50 %	0 %	15678065
37	NC_000916	AGGC	2	8	20570	20577	25 %	0 %	50 %	25 %	15678069
38	NC_000916	AGCG	2	8	22402	22409	25 %	0 %	50 %	25 %	15678072
39	NC_000916	CAGG	2	8	22444	22451	25 %	0 %	50 %	25 %	15678072
40	NC_000916	TGGT	2	8	22581	22588	0 %	50 %	50 %	0 %	15678072
41	NC_000916	AGGG	2	8	22643	22650	25 %	0 %	75 %	0 %	15678072
42	NC_000916	ACCT	2	8	22715	22722	25 %	25 %	0 %	50 %	15678072
43	NC_000916	CCCT	2	8	24567	24574	0 %	25 %	0 %	75 %	15678075
44	NC_000916	AGGA	2	8	25392	25399	50 %	0 %	50 %	0 %	15678076
45	NC_000916	TAAT	2	8	26071	26078	50 %	50 %	0 %	0 %	15678076
46	NC_000916	ATCA	2	8	26171	26178	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_000916	AGAT	2	8	26357	26364	50 %	25 %	25 %	0 %	15678077
48	NC_000916	CAGT	2	8	27743	27750	25 %	25 %	25 %	25 %	15678078
49	NC_000916	GGAA	2	8	27863	27870	50 %	0 %	50 %	0 %	15678078
50	NC_000916	GAAG	2	8	29022	29029	50 %	0 %	50 %	0 %	15678079
51	NC_000916	ATCC	2	8	29406	29413	25 %	25 %	0 %	50 %	15678079
52	NC_000916	GTAT	2	8	30171	30178	25 %	50 %	25 %	0 %	15678080
53	NC_000916	CGCC	2	8	31215	31222	0 %	0 %	25 %	75 %	15678080
54	NC_000916	CCCT	2	8	31966	31973	0 %	25 %	0 %	75 %	15678081
55	NC_000916	GTGG	2	8	32058	32065	0 %	25 %	75 %	0 %	15678081
56	NC_000916	ATAA	2	8	32736	32743	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_000916	GCCT	2	8	32939	32946	0 %	25 %	25 %	50 %	15678082
58	NC_000916	GTGG	2	8	33354	33361	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
59	NC_000916	CAGA	2	8	34438	34445	50 %	0 %	25 %	25 %	15678084
60	NC_000916	GTGA	2	8	35737	35744	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_000916	GGAT	2	8	36321	36328	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_000916	TGTT	2	8	37346	37353	0 %	75 %	25 %	0 %	15678089
63	NC_000916	TTAC	2	8	37615	37622	25 %	50 %	0 %	25 %	15678089
64	NC_000916	AATT	2	8	37855	37862	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_000916	TAGA	2	8	39690	39697	50 %	25 %	25 %	0 %	15678092
66	NC_000916	TCTG	2	8	39963	39970	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
67	NC_000916	GCAA	2	8	40151	40158	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
68	NC_000916	TTTC	2	8	40249	40256	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_000916	TCTG	2	8	41224	41231	0 %	50 %	25 %	25 %	15678095
70	NC_000916	TTTA	2	8	42347	42354	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_000916	CAGT	2	8	42524	42531	25 %	25 %	25 %	25 %	15678097
72	NC_000916	TTTC	2	8	42611	42618	0 %	75 %	0 %	25 %	15678097
73	NC_000916	TAGG	2	8	42813	42820	25 %	25 %	50 %	0 %	15678098
74	NC_000916	ATGT	2	8	42961	42968	25 %	50 %	25 %	0 %	15678099
75	NC_000916	CATC	2	8	44626	44633	25 %	25 %	0 %	50 %	15678101
76	NC_000916	TCTG	2	8	45105	45112	0 %	50 %	25 %	25 %	15678101
77	NC_000916	AGTA	2	8	45919	45926	50 %	25 %	25 %	0 %	15678103
78	NC_000916	ATGT	2	8	45950	45957	25 %	50 %	25 %	0 %	15678103
79	NC_000916	TGTT	2	8	46261	46268	0 %	75 %	25 %	0 %	15678103
80	NC_000916	GTAT	2	8	46908	46915	25 %	50 %	25 %	0 %	15678103
81	NC_000916	ATTC	2	8	47100	47107	25 %	50 %	0 %	25 %	15678103
82	NC_000916	CAAG	2	8	49434	49441	50 %	0 %	25 %	25 %	15678106
83	NC_000916	AATT	2	8	49543	49550	50 %	50 %	0 %	0 %	15678106
84	NC_000916	ATGT	2	8	50830	50837	25 %	50 %	25 %	0 %	15678109
85	NC_000916	TCTG	2	8	51133	51140	0 %	50 %	25 %	25 %	15678109
86	NC_000916	ATTT	2	8	52224	52231	25 %	75 %	0 %	0 %	15678111
87	NC_000916	CATC	2	8	52753	52760	25 %	25 %	0 %	50 %	15678112
88	NC_000916	TGTT	2	8	53195	53202	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_000916	TAAT	2	8	53312	53319	50 %	50 %	0 %	0 %	15678113
90	NC_000916	AAAT	2	8	53404	53411	75 %	25 %	0 %	0 %	15678113
91	NC_000916	CAAA	2	8	53513	53520	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
92	NC_000916	GCAA	2	8	53861	53868	50 %	0 %	25 %	25 %	15678114
93	NC_000916	CAAA	2	8	54134	54141	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
94	NC_000916	ATGT	2	8	54445	54452	25 %	50 %	25 %	0 %	15678115
95	NC_000916	TGTT	2	8	54762	54769	0 %	75 %	25 %	0 %	15678115
96	NC_000916	GTAT	2	8	55409	55416	25 %	50 %	25 %	0 %	15678115
97	NC_000916	ATTC	2	8	55601	55608	25 %	50 %	0 %	25 %	15678115
98	NC_000916	AAAC	2	8	57114	57121	75 %	0 %	0 %	25 %	15678117
99	NC_000916	GTAA	2	8	57229	57236	50 %	25 %	25 %	0 %	15678118
100	NC_000916	TAAG	2	8	57632	57639	50 %	25 %	25 %	0 %	15678119
101	NC_000916	TTGG	2	8	59608	59615	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_000916	TCTG	2	8	59891	59898	0 %	50 %	25 %	25 %	15678124
103	NC_000916	TCCA	2	8	61306	61313	25 %	25 %	0 %	50 %	15678127
104	NC_000916	CTGT	2	8	61600	61607	0 %	50 %	25 %	25 %	15678128
105	NC_000916	TAAT	2	8	61821	61828	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_000916	GACA	2	8	62207	62214	50 %	0 %	25 %	25 %	15678129
107	NC_000916	GGAA	2	8	62596	62603	50 %	0 %	50 %	0 %	15678129
108	NC_000916	AGGA	2	8	62712	62719	50 %	0 %	50 %	0 %	15678129
109	NC_000916	TGGA	2	8	63125	63132	25 %	25 %	50 %	0 %	15678129
110	NC_000916	CACC	2	8	63489	63496	25 %	0 %	0 %	75 %	15678130
111	NC_000916	TTCT	2	8	63774	63781	0 %	75 %	0 %	25 %	15678131
112	NC_000916	ATTT	2	8	64479	64486	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_000916	CTTT	2	8	64514	64521	0 %	75 %	0 %	25 %	15678132
114	NC_000916	AACC	2	8	64919	64926	50 %	0 %	0 %	50 %	15678132
115	NC_000916	GCCA	2	8	65417	65424	25 %	0 %	25 %	50 %	15678132
116	NC_000916	GACC	2	8	65634	65641	25 %	0 %	25 %	50 %	15678132
117	NC_000916	CTGC	2	8	66480	66487	0 %	25 %	25 %	50 %	15678133
118	NC_000916	CCCT	2	8	66704	66711	0 %	25 %	0 %	75 %	15678133
119	NC_000916	TATC	2	8	67359	67366	25 %	50 %	0 %	25 %	15678133
120	NC_000916	AGGG	2	8	69039	69046	25 %	0 %	75 %	0 %	15678135
121	NC_000916	AAGG	2	8	69179	69186	50 %	0 %	50 %	0 %	15678135
122	NC_000916	ATAA	2	8	69840	69847	75 %	25 %	0 %	0 %	15678137
123	NC_000916	AAAG	2	8	69853	69860	75 %	0 %	25 %	0 %	15678137
124	NC_000916	AGGA	2	8	70267	70274	50 %	0 %	50 %	0 %	15678138
125	NC_000916	AAAT	2	8	70441	70448	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_000916	ATAG	2	8	70530	70537	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_000916	CAAT	2	8	70564	70571	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
128	NC_000916	ATTG	2	8	71169	71176	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_000916	CACC	2	8	71898	71905	25 %	0 %	0 %	75 %	15678141
130	NC_000916	TACA	2	8	72127	72134	50 %	25 %	0 %	25 %	15678142
131	NC_000916	AGGC	2	8	72582	72589	25 %	0 %	50 %	25 %	15678142
132	NC_000916	ATGG	2	8	72803	72810	25 %	25 %	50 %	0 %	15678142
133	NC_000916	ACTT	2	8	72968	72975	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
134	NC_000916	AGGG	2	8	73072	73079	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
135	NC_000916	AGAT	2	8	73761	73768	50 %	25 %	25 %	0 %	15678143
136	NC_000916	AATG	2	8	73838	73845	50 %	25 %	25 %	0 %	15678144
137	NC_000916	TTCC	2	8	74791	74798	0 %	50 %	0 %	50 %	15678145
138	NC_000916	CTGG	2	8	74906	74913	0 %	25 %	50 %	25 %	15678145
139	NC_000916	ATGG	3	12	75793	75804	25 %	25 %	50 %	0 %	15678146
140	NC_000916	AAAG	2	8	75956	75963	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_000916	GGTT	2	8	76116	76123	0 %	50 %	50 %	0 %	15678147
142	NC_000916	GGCC	2	8	76337	76344	0 %	0 %	50 %	50 %	15678147
143	NC_000916	TTGA	2	8	76991	76998	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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145	NC_000916	AGGC	2	8	77717	77724	25 %	0 %	50 %	25 %	15678149
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