MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Methanothermobacter thermautotrophicus str. Delta H chromosome

Total Repeats: 22870

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_000916	GGT	2	6	251	256	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15678032
2	NC_000916	GAT	2	6	312	317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678032
3	NC_000916	TTA	2	6	337	342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15678032
4	NC_000916	AGA	2	6	644	649	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15678032
5	NC_000916	TGT	2	6	722	727	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15678032
6	NC_000916	GGC	2	6	806	811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15678032
7	NC_000916	TGA	2	6	959	964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678032
8	NC_000916	CAT	2	6	1006	1011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678033
9	NC_000916	GGC	2	6	1053	1058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15678033
10	NC_000916	CTC	2	6	1108	1113	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678033
11	NC_000916	ATG	2	6	1150	1155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678033
12	NC_000916	CAG	2	6	1266	1271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15678033
13	NC_000916	AGG	2	6	1324	1329	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678033
14	NC_000916	AGC	2	6	1365	1370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15678033
15	NC_000916	GGC	2	6	1489	1494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15678033
16	NC_000916	GAG	2	6	1504	1509	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678033
17	NC_000916	TTG	2	6	1580	1585	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15678033
18	NC_000916	AGG	2	6	1765	1770	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678033
19	NC_000916	ACA	2	6	1778	1783	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15678033
20	NC_000916	TGG	2	6	1836	1841	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15678033
21	NC_000916	CAA	2	6	1904	1909	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15678033
22	NC_000916	GAA	2	6	1957	1962	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15678033
23	NC_000916	GAA	2	6	2092	2097	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15678034
24	NC_000916	GCC	2	6	2257	2262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15678034
25	NC_000916	AGA	2	6	2312	2317	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15678034
26	NC_000916	TGG	2	6	2444	2449	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15678034
27	NC_000916	CGA	3	9	2451	2459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15678034
28	NC_000916	CCG	2	6	2480	2485	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15678034
29	NC_000916	GAC	2	6	2521	2526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15678034
30	NC_000916	ACC	2	6	2657	2662	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15678034
31	NC_000916	TGA	2	6	2769	2774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678034
32	NC_000916	AAG	2	6	2787	2792	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15678034
33	NC_000916	TAT	2	6	2806	2811	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15678035
34	NC_000916	TTA	2	6	2826	2831	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15678035
35	NC_000916	AGA	2	6	2850	2855	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15678035
36	NC_000916	AAG	2	6	2915	2920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15678035
37	NC_000916	GAG	2	6	2926	2931	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678035
38	NC_000916	GAG	2	6	2939	2944	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678035
39	NC_000916	AGA	2	6	2997	3002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15678035
40	NC_000916	GAA	2	6	3336	3341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15678036
41	NC_000916	ACA	2	6	3421	3426	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15678036
42	NC_000916	GGA	2	6	3447	3452	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678036
43	NC_000916	GTT	2	6	3576	3581	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15678036
44	NC_000916	GGA	2	6	3585	3590	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678036
45	NC_000916	AAG	2	6	3624	3629	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15678036
46	NC_000916	AAG	2	6	3654	3659	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15678036
47	NC_000916	GGT	2	6	3708	3713	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15678036
48	NC_000916	CAA	2	6	3739	3744	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15678036
49	NC_000916	CTC	2	6	3760	3765	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678036
50	NC_000916	AGA	2	6	3795	3800	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15678036
51	NC_000916	GAA	2	6	3874	3879	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15678037
52	NC_000916	GTT	2	6	3912	3917	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15678037
53	NC_000916	AGA	2	6	3931	3936	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15678037
54	NC_000916	AGA	2	6	3965	3970	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15678037
55	NC_000916	TCA	2	6	4031	4036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678037
56	NC_000916	GCT	2	6	4145	4150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678037
57	NC_000916	GAA	2	6	4176	4181	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15678037
58	NC_000916	TCA	2	6	4415	4420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678038
59	NC_000916	ACA	2	6	4451	4456	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15678038
60	NC_000916	AGG	2	6	4471	4476	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678038
61	NC_000916	GCA	2	6	4516	4521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15678038
62	NC_000916	CAA	2	6	4682	4687	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15678038
63	NC_000916	AGG	2	6	4967	4972	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678039
64	NC_000916	GAG	2	6	5070	5075	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678039
65	NC_000916	CCT	2	6	5269	5274	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678039
66	NC_000916	TGT	2	6	5277	5282	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15678039
67	NC_000916	GTT	2	6	5359	5364	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15678039
68	NC_000916	GAG	2	6	5374	5379	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678039
69	NC_000916	GAG	2	6	5410	5415	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678039
70	NC_000916	GAG	2	6	5428	5433	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678039
71	NC_000916	AGA	2	6	5462	5467	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15678039
72	NC_000916	GAA	2	6	5482	5487	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15678039
73	NC_000916	ATA	2	6	5496	5501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15678039
74	NC_000916	GGA	2	6	5587	5592	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678040
75	NC_000916	AGA	2	6	5598	5603	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15678040
76	NC_000916	GCT	2	6	5651	5656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678040
77	NC_000916	GAA	2	6	5697	5702	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15678040
78	NC_000916	CAT	2	6	5722	5727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678040
79	NC_000916	GAA	2	6	5783	5788	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15678041
80	NC_000916	TGA	2	6	5865	5870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678041
81	NC_000916	CAT	2	6	5872	5877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678041
82	NC_000916	AAG	3	9	5993	6001	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15678041
83	NC_000916	TCA	2	6	6032	6037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678041
84	NC_000916	TTG	2	6	6275	6280	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15678042
85	NC_000916	TGG	2	6	6299	6304	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15678042
86	NC_000916	GAG	2	6	6313	6318	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678042
87	NC_000916	AGA	2	6	6326	6331	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15678042
88	NC_000916	GTG	2	6	6348	6353	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15678042
89	NC_000916	GTT	2	6	6650	6655	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15678043
90	NC_000916	ACA	2	6	6745	6750	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15678044
91	NC_000916	GAA	2	6	6802	6807	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15678044
92	NC_000916	GCA	3	9	6813	6821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15678044
93	NC_000916	GTT	2	6	6837	6842	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15678044
94	NC_000916	AAG	2	6	6852	6857	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15678044
95	NC_000916	GAG	2	6	6872	6877	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678044
96	NC_000916	GCT	2	6	7029	7034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678044
97	NC_000916	GCA	2	6	7059	7064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15678044
98	NC_000916	ATA	2	6	7068	7073	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15678044
99	NC_000916	TCG	2	6	7146	7151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678045
100	NC_000916	GAT	2	6	7155	7160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678045
101	NC_000916	CAG	2	6	7173	7178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15678045
102	NC_000916	ACA	2	6	7345	7350	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15678045
103	NC_000916	AAT	2	6	7451	7456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15678046
104	NC_000916	ATA	2	6	7638	7643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15678046
105	NC_000916	TGG	2	6	7660	7665	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15678046
106	NC_000916	GAA	2	6	7679	7684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15678046
107	NC_000916	TGA	2	6	7757	7762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678046
108	NC_000916	GAT	2	6	7896	7901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678046
109	NC_000916	AAG	2	6	8031	8036	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15678046
110	NC_000916	AGG	2	6	8162	8167	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678046
111	NC_000916	GGA	2	6	8186	8191	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678047
112	NC_000916	CTT	2	6	8265	8270	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15678047
113	NC_000916	GAG	2	6	8271	8276	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678047
114	NC_000916	GAA	2	6	8339	8344	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15678047
115	NC_000916	TGA	2	6	8447	8452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678047
116	NC_000916	GAC	2	6	9010	9015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15678049
117	NC_000916	AAG	2	6	9094	9099	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15678049
118	NC_000916	ATA	2	6	9151	9156	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15678049
119	NC_000916	AAT	2	6	9177	9182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15678049
120	NC_000916	TGG	2	6	9213	9218	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15678049
121	NC_000916	CTG	2	6	9223	9228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678049
122	NC_000916	CTA	2	6	9237	9242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678049
123	NC_000916	AGC	2	6	9260	9265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15678050
124	NC_000916	TGG	2	6	9317	9322	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15678050
125	NC_000916	GGT	2	6	9404	9409	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15678050
126	NC_000916	AAG	2	6	9432	9437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15678050
127	NC_000916	CAA	2	6	9674	9679	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15678050
128	NC_000916	CCA	2	6	9718	9723	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15678050
129	NC_000916	GGA	2	6	9857	9862	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678051
130	NC_000916	GAG	2	6	9888	9893	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678051
131	NC_000916	TAC	2	6	10243	10248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678052
132	NC_000916	AGA	2	6	10251	10256	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15678052
133	NC_000916	AGC	2	6	10356	10361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15678052
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138	NC_000916	CAG	2	6	10433	10438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15678052
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260	NC_000916	ATG	2	6	19137	19142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678067
261	NC_000916	ACG	2	6	19186	19191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15678067
262	NC_000916	GAG	2	6	19281	19286	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678067
263	NC_000916	GAG	2	6	19296	19301	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678067
264	NC_000916	GAA	2	6	19337	19342	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15678067
265	NC_000916	GTT	2	6	19353	19358	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15678067
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268	NC_000916	TAC	2	6	19527	19532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678067
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280	NC_000916	CGA	2	6	20427	20432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15678069
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282	NC_000916	GAA	2	6	20655	20660	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15678069
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285	NC_000916	TGG	2	6	20972	20977	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15678069
286	NC_000916	AAG	2	6	21001	21006	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15678069
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