MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Methanothermobacter thermautotrophicus str. Delta H chromosome

Total Repeats: 497

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_000916	TA	3	6	5500	5505	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_000916	GA	3	6	15402	15407	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_000916	GA	3	6	18637	18642	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_000916	TA	3	6	21070	21075	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_000916	TA	3	6	37875	37880	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_000916	AT	3	6	37911	37916	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_000916	TA	3	6	38541	38546	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_000916	TA	3	6	39353	39358	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_000916	AC	3	6	39827	39832	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_000916	TA	3	6	40126	40131	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_000916	CT	3	6	42234	42239	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_000916	TG	3	6	43122	43127	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_000916	TA	3	6	57188	57193	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_000916	CT	3	6	57812	57817	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_000916	AT	5	10	60574	60583	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_000916	AT	3	6	61124	61129	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_000916	AT	3	6	61771	61776	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_000916	TA	3	6	68706	68711	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_000916	TA	3	6	69611	69616	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_000916	AT	3	6	73174	73179	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_000916	TA	3	6	75684	75689	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_000916	AG	3	6	78391	78396	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_000916	AT	3	6	81955	81960	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_000916	AT	3	6	84322	84327	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_000916	TA	3	6	84395	84400	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_000916	GA	3	6	90640	90645	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_000916	CT	3	6	95622	95627	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_000916	TA	3	6	95637	95642	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_000916	TA	3	6	100079	100084	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_000916	TC	3	6	103268	103273	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_000916	CT	3	6	106696	106701	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_000916	TA	3	6	114383	114388	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_000916	TA	3	6	114426	114431	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_000916	GA	3	6	125534	125539	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_000916	AT	3	6	144771	144776	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_000916	TC	3	6	151074	151079	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_000916	TC	3	6	159824	159829	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_000916	TA	3	6	159834	159839	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_000916	GT	3	6	167022	167027	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_000916	TG	3	6	173338	173343	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_000916	TG	3	6	173351	173356	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_000916	TA	3	6	173436	173441	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_000916	AT	3	6	173492	173497	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_000916	CT	3	6	173521	173526	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_000916	TG	3	6	182939	182944	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_000916	AT	3	6	197641	197646	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_000916	TA	3	6	197648	197653	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_000916	TA	3	6	198067	198072	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_000916	TA	3	6	207081	207086	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_000916	AT	3	6	208320	208325	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_000916	TC	3	6	209217	209222	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_000916	TC	3	6	211314	211319	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_000916	CT	3	6	214214	214219	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_000916	CA	3	6	216676	216681	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_000916	TA	3	6	216683	216688	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_000916	GT	3	6	222396	222401	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_000916	TA	3	6	226757	226762	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_000916	TC	3	6	226897	226902	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_000916	AT	3	6	230155	230160	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_000916	GA	3	6	232362	232367	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_000916	TA	3	6	248239	248244	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_000916	CT	3	6	251015	251020	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_000916	TA	3	6	251028	251033	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_000916	TG	3	6	251434	251439	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_000916	TA	3	6	255766	255771	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_000916	TA	3	6	256980	256985	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_000916	TA	3	6	259221	259226	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_000916	AG	3	6	266652	266657	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_000916	TG	3	6	266713	266718	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_000916	AG	3	6	267480	267485	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_000916	TA	3	6	276889	276894	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_000916	TC	3	6	288262	288267	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_000916	CA	3	6	296748	296753	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_000916	AT	3	6	297123	297128	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_000916	TA	3	6	303409	303414	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_000916	TC	3	6	303421	303426	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_000916	TG	3	6	305233	305238	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_000916	GT	3	6	307449	307454	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_000916	TC	3	6	318276	318281	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_000916	AT	3	6	324372	324377	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_000916	AT	3	6	328792	328797	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_000916	GT	3	6	329460	329465	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_000916	AT	3	6	331359	331364	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_000916	AG	3	6	345197	345202	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_000916	AG	3	6	345382	345387	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_000916	AT	3	6	349653	349658	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_000916	AT	3	6	349691	349696	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_000916	AG	3	6	349724	349729	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_000916	AC	3	6	349817	349822	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_000916	CA	3	6	352060	352065	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_000916	CT	3	6	352107	352112	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_000916	AT	3	6	355212	355217	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_000916	GT	3	6	359176	359181	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_000916	AT	3	6	362418	362423	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_000916	AT	3	6	362434	362439	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_000916	AT	3	6	372549	372554	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_000916	CT	3	6	372706	372711	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_000916	CA	3	6	374861	374866	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_000916	TA	4	8	376842	376849	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_000916	TA	3	6	388676	388681	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_000916	CA	3	6	397075	397080	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_000916	AT	4	8	402010	402017	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_000916	GT	3	6	402259	402264	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_000916	TG	3	6	402355	402360	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_000916	TA	3	6	407662	407667	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_000916	AG	3	6	407797	407802	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_000916	GA	3	6	407860	407865	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_000916	AT	3	6	410636	410641	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_000916	AT	3	6	414461	414466	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_000916	AT	3	6	415712	415717	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_000916	AT	3	6	420740	420745	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_000916	AT	3	6	421118	421123	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_000916	CT	3	6	421124	421129	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_000916	AT	3	6	424062	424067	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_000916	AT	3	6	453785	453790	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_000916	GA	3	6	454058	454063	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_000916	TA	4	8	466089	466096	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_000916	AG	3	6	468938	468943	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_000916	AG	3	6	468971	468976	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_000916	TA	3	6	476044	476049	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_000916	TA	3	6	477646	477651	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_000916	AT	4	8	477664	477671	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_000916	CT	3	6	482618	482623	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_000916	AG	3	6	491362	491367	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_000916	CT	3	6	499283	499288	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_000916	AG	3	6	505789	505794	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_000916	TA	4	8	515412	515419	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_000916	TA	3	6	515713	515718	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_000916	TA	3	6	515774	515779	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_000916	TC	3	6	516598	516603	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NC_000916	AT	3	6	517817	517822	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_000916	GT	3	6	520327	520332	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_000916	TA	3	6	525852	525857	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_000916	TA	3	6	540222	540227	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_000916	AT	3	6	545461	545466	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_000916	AT	3	6	550386	550391	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_000916	AT	3	6	561292	561297	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_000916	TG	3	6	561407	561412	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_000916	GA	3	6	564334	564339	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_000916	AT	3	6	575411	575416	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_000916	GA	3	6	575485	575490	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_000916	GA	3	6	581047	581052	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_000916	CT	3	6	588824	588829	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
144	NC_000916	TA	3	6	590680	590685	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_000916	GA	3	6	590752	590757	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_000916	TA	3	6	597680	597685	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_000916	AT	3	6	606094	606099	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_000916	AT	3	6	607232	607237	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_000916	CT	3	6	614035	614040	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
150	NC_000916	AG	3	6	622326	622331	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
151	NC_000916	CA	3	6	624837	624842	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
152	NC_000916	CT	3	6	635441	635446	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
153	NC_000916	AG	3	6	635559	635564	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
154	NC_000916	AC	3	6	635582	635587	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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