MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Methanothermobacter thermautotrophicus str. Delta H chromosome

Total Repeats: 2216

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_000916	AG	3	6	695	700	50 %	0 %	50 %	0 %	15678032
2	NC_000916	AT	3	6	859	864	50 %	50 %	0 %	0 %	15678032
3	NC_000916	CA	3	6	1426	1431	50 %	0 %	0 %	50 %	15678033
4	NC_000916	AC	3	6	2973	2978	50 %	0 %	0 %	50 %	15678035
5	NC_000916	AC	3	6	4039	4044	50 %	0 %	0 %	50 %	15678037
6	NC_000916	AC	3	6	4676	4681	50 %	0 %	0 %	50 %	15678038
7	NC_000916	TA	3	6	5167	5172	50 %	50 %	0 %	0 %	15678039
8	NC_000916	AG	3	6	6876	6881	50 %	0 %	50 %	0 %	15678044
9	NC_000916	AC	3	6	8301	8306	50 %	0 %	0 %	50 %	15678047
10	NC_000916	AC	3	6	11651	11656	50 %	0 %	0 %	50 %	15678054
11	NC_000916	AC	3	6	12040	12045	50 %	0 %	0 %	50 %	15678055
12	NC_000916	AC	4	8	14499	14506	50 %	0 %	0 %	50 %	15678058
13	NC_000916	CA	3	6	15198	15203	50 %	0 %	0 %	50 %	15678059
14	NC_000916	CT	3	6	15736	15741	0 %	50 %	0 %	50 %	15678061
15	NC_000916	CT	3	6	15925	15930	0 %	50 %	0 %	50 %	15678061
16	NC_000916	AG	3	6	16033	16038	50 %	0 %	50 %	0 %	15678061
17	NC_000916	AT	3	6	16534	16539	50 %	50 %	0 %	0 %	15678063
18	NC_000916	AG	3	6	17827	17832	50 %	0 %	50 %	0 %	15678064
19	NC_000916	AG	3	6	17957	17962	50 %	0 %	50 %	0 %	15678064
20	NC_000916	AC	3	6	18305	18310	50 %	0 %	0 %	50 %	15678065
21	NC_000916	AT	3	6	19984	19989	50 %	50 %	0 %	0 %	15678068
22	NC_000916	GA	3	6	20603	20608	50 %	0 %	50 %	0 %	15678069
23	NC_000916	CA	3	6	20668	20673	50 %	0 %	0 %	50 %	15678069
24	NC_000916	AC	3	6	20762	20767	50 %	0 %	0 %	50 %	15678069
25	NC_000916	TC	3	6	21970	21975	0 %	50 %	0 %	50 %	15678072
26	NC_000916	CA	3	6	22767	22772	50 %	0 %	0 %	50 %	15678072
27	NC_000916	CA	3	6	23826	23831	50 %	0 %	0 %	50 %	15678074
28	NC_000916	GA	3	6	23927	23932	50 %	0 %	50 %	0 %	15678074
29	NC_000916	CA	3	6	24149	24154	50 %	0 %	0 %	50 %	15678074
30	NC_000916	AG	3	6	24593	24598	50 %	0 %	50 %	0 %	15678075
31	NC_000916	TG	3	6	25254	25259	0 %	50 %	50 %	0 %	15678075
32	NC_000916	AG	3	6	27613	27618	50 %	0 %	50 %	0 %	15678078
33	NC_000916	AC	3	6	27654	27659	50 %	0 %	0 %	50 %	15678078
34	NC_000916	CA	3	6	27764	27769	50 %	0 %	0 %	50 %	15678078
35	NC_000916	AT	3	6	28163	28168	50 %	50 %	0 %	0 %	15678078
36	NC_000916	CA	3	6	28855	28860	50 %	0 %	0 %	50 %	15678079
37	NC_000916	AG	3	6	30156	30161	50 %	0 %	50 %	0 %	15678080
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39	NC_000916	AG	3	6	30505	30510	50 %	0 %	50 %	0 %	15678080
40	NC_000916	AC	3	6	32375	32380	50 %	0 %	0 %	50 %	15678081
41	NC_000916	AT	3	6	32777	32782	50 %	50 %	0 %	0 %	15678082
42	NC_000916	GT	3	6	32889	32894	0 %	50 %	50 %	0 %	15678082
43	NC_000916	CA	3	6	32983	32988	50 %	0 %	0 %	50 %	15678082
44	NC_000916	AC	3	6	33318	33323	50 %	0 %	0 %	50 %	15678082
45	NC_000916	TG	3	6	34847	34852	0 %	50 %	50 %	0 %	15678084
46	NC_000916	AT	3	6	35122	35127	50 %	50 %	0 %	0 %	15678084
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50	NC_000916	AT	3	6	37458	37463	50 %	50 %	0 %	0 %	15678089
51	NC_000916	GT	3	6	38615	38620	0 %	50 %	50 %	0 %	15678091
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60	NC_000916	AT	3	6	42769	42774	50 %	50 %	0 %	0 %	15678098
61	NC_000916	AT	3	6	42792	42797	50 %	50 %	0 %	0 %	15678098
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64	NC_000916	AT	3	6	45662	45667	50 %	50 %	0 %	0 %	15678102
65	NC_000916	AT	3	6	45789	45794	50 %	50 %	0 %	0 %	15678103
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125	NC_000916	GA	3	6	90488	90493	50 %	0 %	50 %	0 %	15678166
126	NC_000916	GA	3	6	90865	90870	50 %	0 %	50 %	0 %	15678167
127	NC_000916	AC	4	8	91917	91924	50 %	0 %	0 %	50 %	15678168
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