MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori 26695 chromosome

Total Repeats: 103

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_000915	ACTTAG	2	12	44968	44979	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_000915	AGAAAA	2	12	62309	62320	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_000915	AAAAGA	2	12	62432	62443	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_000915	AGAAAA	2	12	62540	62551	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_000915	AGAAAA	2	12	62645	62656	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_000915	TACAAA	2	12	97145	97156	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_000915	CAAGAT	2	12	99193	99204	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_000915	GTTTTA	2	12	138216	138227	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_000915	CCTAAA	2	12	155764	155775	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_000915	TTGTTT	2	12	159911	159922	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_000915	TAAAAA	2	12	174559	174570	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_000915	CAAAAC	2	12	230926	230937	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_000915	ATTAAA	2	12	232432	232443	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_000915	TCAATA	2	12	238693	238704	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_000915	ATTTTA	2	12	255510	255521	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_000915	AAATTT	2	12	270999	271010	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_000915	TGCATT	2	12	334141	334152	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_000915	ATCCAT	2	12	352248	352259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_000915	AAAAGC	2	12	352810	352821	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_000915	TTAATT	2	12	399225	399236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_000915	AAAGAA	2	12	423707	423718	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_000915	TTAAAG	2	12	448345	448356	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_000915	CTAAGT	2	12	448921	448932	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_000915	TTTAAG	2	12	451196	451207	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_000915	AAAGAA	2	12	452318	452329	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_000915	GTTTGT	2	12	452760	452771	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_000915	AAGATA	2	12	454793	454804	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_000915	TTTCTT	2	12	479951	479962	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_000915	TAAAAA	2	12	485965	485976	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_000915	ACTTTA	2	12	504863	504874	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_000915	TTTAAT	2	12	522690	522701	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_000915	TAAAGA	2	12	531209	531220	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_000915	TTGTAA	2	12	561581	561592	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_000915	TTTTAT	2	12	567640	567651	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_000915	TTTAAA	2	12	567759	567770	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_000915	TTTAAA	2	12	586925	586936	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_000915	ATTTTA	2	12	620078	620089	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_000915	AAATCA	2	12	630217	630228	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_000915	ACTTTC	2	12	649605	649616	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_000915	TTTAAT	2	12	651586	651597	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_000915	CCAAAC	2	12	651897	651908	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_000915	ATTTGA	2	12	651995	652006	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_000915	GCGAAT	2	12	654877	654888	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_000915	ATGTGG	2	12	656159	656170	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_000915	CGCTAA	2	12	673994	674005	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_000915	TGATTT	2	12	675075	675086	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_000915	CTCAAT	2	12	677847	677858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_000915	ACACCA	2	12	684092	684103	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_000915	CACCGG	2	12	717759	717770	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
50	NC_000915	AAGAAA	2	12	731464	731475	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_000915	TTTTAG	2	12	734191	734202	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_000915	CCCTAA	2	12	734511	734522	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_000915	ATGGTA	2	12	767844	767855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_000915	AATAAG	2	12	768041	768052	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_000915	GTTCCA	2	12	900821	900832	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_000915	CTTTTT	2	12	925555	925566	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_000915	ATTTTT	2	12	927351	927362	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_000915	ATTATA	2	12	970806	970817	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_000915	TTTGGG	2	12	972318	972329	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_000915	ATTGAA	2	12	978297	978308	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_000915	ACATAT	2	12	1020393	1020404	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_000915	TTAAAA	2	12	1020416	1020427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_000915	TATGGG	2	12	1026289	1026300	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_000915	TGATTG	2	12	1046469	1046480	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_000915	CAAGAG	2	12	1048069	1048080	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_000915	AAGATA	2	12	1051503	1051514	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_000915	AGTGGC	2	12	1052837	1052848	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_000915	AAACCA	2	12	1054731	1054742	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_000915	TAAATC	2	12	1057333	1057344	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_000915	CAAAAT	2	12	1057841	1057852	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_000915	GTTTTT	2	12	1058166	1058177	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_000915	TTTTTC	2	12	1065940	1065951	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_000915	CATGCG	2	12	1066310	1066321	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_000915	AAACCC	2	12	1071657	1071668	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_000915	AAAGAA	3	18	1071816	1071833	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_000915	AAAAAC	2	12	1153529	1153540	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_000915	GCATTA	2	12	1206861	1206872	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_000915	AAATTA	2	12	1210483	1210494	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_000915	AACGCT	2	12	1211001	1211012	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_000915	ACAGAA	2	12	1241812	1241823	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_000915	AAATCA	2	12	1249236	1249247	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_000915	CTTCTA	2	12	1258592	1258603	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_000915	ATCCTT	2	12	1259533	1259544	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_000915	TGTTAT	2	12	1312086	1312097	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_000915	TGCATT	2	12	1320068	1320079	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_000915	AAAATC	2	12	1407159	1407170	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_000915	CAAATG	2	12	1413369	1413380	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_000915	TGGCTT	2	12	1413648	1413659	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_000915	TTTTTA	2	12	1455881	1455892	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_000915	CTTTAA	2	12	1473743	1473754	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_000915	GTTTTA	2	12	1494981	1494992	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_000915	TAGCTT	2	12	1496506	1496517	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_000915	TAAAAA	2	12	1496621	1496632	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_000915	TAAAAA	2	12	1496819	1496830	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_000915	CAGCAA	2	12	1502703	1502714	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_000915	CTAAGT	6	36	1508309	1508344	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_000915	TGTTTA	2	12	1516915	1516926	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_000915	TACGAT	2	12	1595156	1595167	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_000915	TTGAAT	2	12	1595295	1595306	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_000915	TTTTGA	2	12	1595885	1595896	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_000915	TTCTAA	2	12	1596673	1596684	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_000915	TTTTAC	2	12	1596828	1596839	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_000915	AAATTG	2	12	1597113	1597124	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.