MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Helicobacter pylori 26695 chromosome

Total Repeats: 689

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_000915	AAAGCG	2	12	494	505	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	15644635
2	NC_000915	ATTATA	2	12	2001	2012	50 %	50 %	0 %	0 %	15644638
3	NC_000915	GCTTGC	2	12	6274	6285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15646197
4	NC_000915	GAAACC	2	12	7721	7732	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	15644643
5	NC_000915	AGAAAA	2	12	18673	18684	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	15644652
6	NC_000915	GATAAA	2	12	22229	22240	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	15644655
7	NC_000915	ATAAAC	2	12	22601	22612	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	15644655
8	NC_000915	TTTCTT	2	12	22952	22963	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	15644657
9	NC_000915	ATTTTT	2	12	25052	25063	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	15644658
10	NC_000915	CAATTC	2	12	27035	27046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15644659
11	NC_000915	TATCAA	2	12	30208	30219	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	15644663
12	NC_000915	TCTTAT	2	12	30922	30933	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	15644663
13	NC_000915	CAAAGC	2	12	32626	32637	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	15644665
14	NC_000915	GCGTGG	2	12	32975	32986	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	15644666
15	NC_000915	TTGGAT	2	12	33085	33096	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	15644666
16	NC_000915	TAATGA	2	12	33120	33131	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	15644666
17	NC_000915	TTGAAT	2	12	34171	34182	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	15644666
18	NC_000915	TAAGGA	2	12	34470	34481	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	15644666
19	NC_000915	TAGGGG	2	12	35977	35988	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	15644669
20	NC_000915	AAAGAA	2	12	37489	37500	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	15644670
21	NC_000915	AAAGAA	2	12	39064	39075	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	15646206
22	NC_000915	CAAAAT	2	12	41409	41420	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	15644674
23	NC_000915	CGCAAA	2	12	45823	45834	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	15644678
24	NC_000915	GGCTAG	2	12	50066	50077	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	15644682
25	NC_000915	TGAAAT	2	12	51799	51810	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	15644683
26	NC_000915	CTTTTT	2	12	53909	53920	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	15644685
27	NC_000915	ATTTGC	2	12	56033	56044	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	15644685
28	NC_000915	TAAAAA	2	12	57629	57640	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	15644686
29	NC_000915	CCACGC	2	12	59384	59395	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	15644687
30	NC_000915	AAAAGA	2	12	63516	63527	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	15644689
31	NC_000915	GATGTG	2	12	64325	64336	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	15644690
32	NC_000915	AGCCAA	2	12	64403	64414	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	15644690
33	NC_000915	CCAACA	2	12	66291	66302	50 %	0 %	0 %	50 %	15644690
34	NC_000915	TTTTGT	2	12	66629	66640	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	15644691
35	NC_000915	AAAGAG	2	12	66908	66919	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15644691
36	NC_000915	AGAAAA	2	12	68428	68439	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	15644693
37	NC_000915	AGCGGG	2	12	70590	70601	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	15644696
38	NC_000915	ACGCCC	2	12	78357	78368	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	15644704
39	NC_000915	AAGGGC	2	12	81084	81095	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	15644707
40	NC_000915	CGCCCA	2	12	81620	81631	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	15644707
41	NC_000915	AGGATA	2	12	82465	82476	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	15644709
42	NC_000915	GTGAGC	2	12	83067	83078	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	15644709
43	NC_000915	CAACGA	2	12	83413	83424	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	15644709
44	NC_000915	GGCATG	2	12	84911	84922	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	15644710
45	NC_000915	GGCATG	2	12	84935	84946	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	15644710
46	NC_000915	GCAACG	2	12	85983	85994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15644710
47	NC_000915	AATATT	2	12	86857	86868	50 %	50 %	0 %	0 %	15644712
48	NC_000915	AAAAAT	2	12	97349	97360	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	15644721
49	NC_000915	GATTTT	2	12	100623	100634	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	15644726
50	NC_000915	AAACTC	2	12	100740	100751	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	15644726
51	NC_000915	TCAAAA	2	12	102034	102045	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	15644727
52	NC_000915	TTATCG	2	12	102612	102623	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	15644728
53	NC_000915	CAATAT	2	12	105939	105950	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	15644729
54	NC_000915	TGGAGC	2	12	116845	116856	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	15644739
55	NC_000915	TTTTCT	2	12	118345	118356	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	15644740
56	NC_000915	CGCTCG	2	12	123517	123528	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	15644745
57	NC_000915	TAGGCA	2	12	126054	126065	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	15644746
58	NC_000915	CTTCTA	2	12	128383	128394	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	15644748
59	NC_000915	GTTCTA	2	12	128728	128739	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	15644748
60	NC_000915	CTTCTA	2	12	129842	129853	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	15644749
61	NC_000915	CTTCTA	2	12	131512	131523	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	15644750
62	NC_000915	GTTCTA	2	12	131791	131802	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	15644750
63	NC_000915	GTTCTA	2	12	131854	131865	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	15644750
64	NC_000915	CTAAAG	2	12	133167	133178	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	15644751
65	NC_000915	TGAATT	2	12	133701	133712	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	15644751
66	NC_000915	TTTCAA	2	12	133860	133871	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	15644751
67	NC_000915	AGCAAA	2	12	137206	137217	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	15644754
68	NC_000915	TGGTTT	2	12	138730	138741	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15644757
69	NC_000915	TCATGA	2	12	139982	139993	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	15644759
70	NC_000915	AAAAAT	2	12	146562	146573	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	15644765
71	NC_000915	ATTCAA	2	12	147653	147664	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	15644767
72	NC_000915	TTAGCG	2	12	151611	151622	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	15644770
73	NC_000915	TATCGC	2	12	151823	151834	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	15644770
74	NC_000915	TTTTAG	2	12	152946	152957	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	15644771
75	NC_000915	ATCGCT	2	12	153539	153550	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	15644771
76	NC_000915	CTTGGG	2	12	160573	160584	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	15644779
77	NC_000915	ATTGGA	2	12	161945	161956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15644780
78	NC_000915	TTGGGT	2	12	165347	165358	0 %	50 %	50 %	0 %	15644784
79	NC_000915	GATGGC	2	12	169086	169097	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	15644789
80	NC_000915	CCGCTC	2	12	171474	171485	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	15644792
81	NC_000915	GCTCTC	2	12	173901	173912	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	15644795
82	NC_000915	TAGTGG	2	12	175671	175682	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	15644798
83	NC_000915	TTCTAA	2	12	176224	176235	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	15644798
84	NC_000915	CGTTTT	2	12	178057	178068	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	15644800
85	NC_000915	ATCGTT	2	12	178370	178381	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	15644800
86	NC_000915	AATTTC	2	12	178721	178732	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	15644801
87	NC_000915	TAAAAT	2	12	180245	180256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15644802
88	NC_000915	ATTTTG	2	12	182055	182066	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	15644804
89	NC_000915	CGCTTT	2	12	182533	182544	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	15644804
90	NC_000915	ACTTAT	2	12	182630	182641	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	15644804
91	NC_000915	CCGCTC	2	12	186344	186355	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	15644808
92	NC_000915	AAAGCA	2	12	187540	187551	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	15644809
93	NC_000915	AATAAA	2	12	188513	188524	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	15644810
94	NC_000915	GAAAAA	2	12	189968	189979	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	15644811
95	NC_000915	AGGCAT	2	12	190057	190068	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	15644811
96	NC_000915	GCATTT	2	12	191770	191781	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	15644813
97	NC_000915	TCAAAC	2	12	192337	192348	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	15644814
98	NC_000915	ATAAAG	2	12	192498	192509	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	15644814
99	NC_000915	GGTATT	2	12	196261	196272	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	15644819
100	NC_000915	TCTAAA	2	12	196491	196502	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	15644819
101	NC_000915	TGGGCA	2	12	197560	197571	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	15644820
102	NC_000915	ATTTTC	2	12	199984	199995	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	15644821
103	NC_000915	TGGGGC	2	12	207391	207402	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	15644831
104	NC_000915	CTATGG	2	12	207780	207791	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	15644831
105	NC_000915	AAATCC	2	12	209170	209181	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	15644833
106	NC_000915	CTGTAT	2	12	210916	210927	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	15644834
107	NC_000915	AATTTT	2	12	211636	211647	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15644834
108	NC_000915	GGGAAC	2	12	215693	215704	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	15644837
109	NC_000915	ATTCTA	2	12	219361	219372	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	15644840
110	NC_000915	CATAGC	2	12	221101	221112	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	15644841
111	NC_000915	GTTTTG	2	12	221606	221617	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15644841
112	NC_000915	TAATTA	2	12	226109	226120	50 %	50 %	0 %	0 %	15644845
113	NC_000915	AGGGCC	2	12	236656	236667	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	15644855
114	NC_000915	CACGCC	2	12	239173	239184	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	15644857
115	NC_000915	GCTAGG	2	12	241793	241804	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	15644859
116	NC_000915	TCTTTA	2	12	248413	248424	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	15644866
117	NC_000915	GTTTTT	2	12	254050	254061	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	15644872
118	NC_000915	ATTGTC	2	12	257210	257221	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	15644876
119	NC_000915	TCCCGC	2	12	259412	259423	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	15644878
120	NC_000915	TCCCGC	2	12	260225	260236	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	15644878
121	NC_000915	GAAAAG	2	12	266253	266264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15644884
122	NC_000915	AAAAAG	2	12	266564	266575	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	15644885
123	NC_000915	TGAGCG	2	12	268081	268092	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	15644887
124	NC_000915	CTTTAG	2	12	268387	268398	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	15644887
125	NC_000915	AAATTC	2	12	270609	270620	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	15644889
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127	NC_000915	TGAGCG	2	12	278013	278024	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	15644895
128	NC_000915	AGCTTT	2	12	278161	278172	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	15644895
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230	NC_000915	AAATCA	2	12	550969	550980	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	15645150
231	NC_000915	ATAGTA	2	12	552206	552217	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	15645150
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234	NC_000915	TAGCCA	2	12	555664	555675	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	15645153
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236	NC_000915	AAAACT	2	12	564767	564778	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	15645157
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458	NC_000915	GCGTTT	2	12	1142185	1142196	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	15645697
459	NC_000915	GCTAAC	2	12	1142454	1142465	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	15645697
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461	NC_000915	GATTTT	2	12	1147548	1147559	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	15645702
462	NC_000915	GCTTTT	2	12	1148737	1148748	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	15645703
463	NC_000915	TTTAGC	2	12	1150073	1150084	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	15645703
464	NC_000915	TCTTGA	2	12	1150387	1150398	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	15645703
465	NC_000915	AAAGAA	2	12	1151398	1151409	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	15645704
466	NC_000915	AGCCAA	2	12	1152310	1152321	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	15645704
467	NC_000915	TATGGT	2	12	1154887	1154898	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	15645705
468	NC_000915	TCATGC	2	12	1155439	1155450	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	15645706
469	NC_000915	TTATCT	2	12	1157994	1158005	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	15645709
470	NC_000915	CCATCG	2	12	1159056	1159067	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	15645712
471	NC_000915	TAGCGA	2	12	1161190	1161201	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	15645714
472	NC_000915	TCACCC	2	12	1163189	1163200	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	15645715
473	NC_000915	TTTGAA	2	12	1163477	1163488	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	15645716
474	NC_000915	CAAAAG	2	12	1167591	1167602	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	15645719
475	NC_000915	CTCTGC	2	12	1169753	1169764	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	15645721
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477	NC_000915	TCGCAT	2	12	1183059	1183070	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	15645732
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479	NC_000915	CGATTG	2	12	1188441	1188452	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	551540682
480	NC_000915	CTTGAG	2	12	1189942	1189953	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	15645738
481	NC_000915	TCAAAA	2	12	1190431	1190442	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	15645739
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483	NC_000915	TTTTAG	2	12	1191188	1191199	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	15645740
484	NC_000915	TCAATC	2	12	1194081	1194092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15645745
485	NC_000915	CACGCT	2	12	1196760	1196771	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	15645748
486	NC_000915	ATAACA	2	12	1199566	1199577	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	15645751
487	NC_000915	AAAATC	2	12	1204548	1204559	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	15645756
488	NC_000915	TTCCTT	2	12	1204800	1204811	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15645756
489	NC_000915	TTTTTC	2	12	1214995	1215006	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	15645767
490	NC_000915	TCATTA	2	12	1217469	1217480	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	15645767
491	NC_000915	TAGGGG	2	12	1222022	1222033	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	15645771
492	NC_000915	AAAAAG	2	12	1229435	1229446	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	15645779
493	NC_000915	AGCTTG	2	12	1230757	1230768	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	15645780
494	NC_000915	AGCGCA	2	12	1231893	1231904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15645780
495	NC_000915	TGCCAT	2	12	1245038	1245049	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	15645791
496	NC_000915	AGCATA	2	12	1246036	1246047	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	15645792
497	NC_000915	CCAAAA	2	12	1253915	1253926	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15645798
498	NC_000915	CAAACA	2	12	1254706	1254717	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15645799
499	NC_000915	CTTCTA	2	12	1257181	1257192	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	15645801
500	NC_000915	GTTCTA	2	12	1257484	1257495	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	15645801

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