MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori 26695 chromosome

Total Repeats: 264

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_000915	TTTTA	2	10	5116	5125	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_000915	AAATT	2	10	7274	7283	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_000915	GCTTT	2	10	13576	13585	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
4	NC_000915	AAAAG	2	10	23259	23268	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_000915	AGCCT	2	10	39552	39561	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
6	NC_000915	CTATT	2	10	44351	44360	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_000915	GATAA	2	10	52411	52420	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_000915	AACGA	2	10	61560	61569	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
9	NC_000915	TTAAA	2	10	61572	61581	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_000915	TTACA	2	10	80167	80176	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_000915	TTTGT	2	10	84181	84190	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_000915	ATAAG	2	10	95018	95027	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_000915	ATTAT	2	10	95075	95084	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_000915	GGCTT	2	10	99528	99537	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
15	NC_000915	CAAAA	2	10	110811	110820	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_000915	ATTTA	2	10	119809	119818	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_000915	GATCT	2	10	119819	119828	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
18	NC_000915	CAATC	2	10	129200	129209	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
19	NC_000915	CAATC	2	10	130870	130879	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
20	NC_000915	GATGT	2	10	141684	141693	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
21	NC_000915	TTTTA	2	10	141863	141872	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_000915	AGATT	2	10	142202	142211	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_000915	TAAGG	2	10	155305	155314	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
24	NC_000915	CAAAT	2	10	162893	162902	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_000915	AACAA	2	10	170404	170413	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
26	NC_000915	AATAA	2	10	170426	170435	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_000915	GAATG	2	10	181722	181731	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
28	NC_000915	AAATC	2	10	184730	184739	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_000915	TTTAA	2	10	187779	187788	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_000915	TTCAA	2	10	200887	200896	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
31	NC_000915	TTTAT	2	10	208655	208664	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_000915	TAAAA	2	10	222202	222211	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_000915	TTTAG	2	10	230893	230902	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_000915	ATTTT	2	10	233750	233759	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_000915	TGTTT	2	10	240170	240179	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_000915	CTAAC	2	10	244865	244874	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
37	NC_000915	CAAAA	2	10	246201	246210	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
38	NC_000915	AAATT	2	10	255550	255559	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_000915	AAATA	2	10	283119	283128	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_000915	GTCAT	2	10	285020	285029	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
41	NC_000915	TTATA	2	10	330125	330134	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_000915	GATTT	2	10	345536	345545	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_000915	TGAAT	2	10	349292	349301	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_000915	TTTTA	2	10	352222	352231	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_000915	TGGCT	2	10	353563	353572	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
46	NC_000915	TTTGG	2	10	353721	353730	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
47	NC_000915	TAAAA	2	10	367048	367057	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_000915	GAATA	2	10	369454	369463	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_000915	AGATA	2	10	376703	376712	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
50	NC_000915	TAATC	2	10	376767	376776	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
51	NC_000915	TTTTA	2	10	384230	384239	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_000915	TTTAT	2	10	395179	395188	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_000915	CAATT	2	10	399261	399270	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
54	NC_000915	AAAAG	2	10	399924	399933	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
55	NC_000915	TATTT	2	10	416623	416632	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_000915	ATTTA	2	10	425643	425652	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_000915	GTTTT	2	10	426001	426010	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_000915	GCATC	2	10	427488	427497	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
59	NC_000915	AAAAG	2	10	438177	438186	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
60	NC_000915	AGTAA	2	10	445199	445208	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_000915	AGTGA	2	10	445497	445506	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
62	NC_000915	AGATG	2	10	446973	446982	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
63	NC_000915	TTGAA	2	10	447205	447214	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_000915	GATAA	2	10	448220	448229	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_000915	TTGTT	2	10	448617	448626	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_000915	TCTCT	2	10	448740	448749	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
67	NC_000915	CTTTT	2	10	451493	451502	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
68	NC_000915	AAGAG	2	10	475008	475017	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
69	NC_000915	TAACA	2	10	492746	492755	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
70	NC_000915	TAAAA	2	10	494230	494239	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_000915	TTTTA	2	10	497460	497469	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_000915	AAAAT	2	10	498902	498911	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_000915	TGCCG	2	10	507058	507067	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
74	NC_000915	TATCC	2	10	509167	509176	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
75	NC_000915	ACACC	2	10	512524	512533	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
76	NC_000915	TTTGT	2	10	516633	516642	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_000915	AGTTT	2	10	518225	518234	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_000915	TAACT	2	10	522550	522559	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
79	NC_000915	TATCT	2	10	530461	530470	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
80	NC_000915	GTTTT	2	10	530632	530641	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
81	NC_000915	TACTA	2	10	537443	537452	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
82	NC_000915	TTCAA	2	10	537564	537573	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
83	NC_000915	ATAAA	2	10	538044	538053	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_000915	ATCAT	2	10	564065	564074	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
85	NC_000915	ATTGA	2	10	583585	583594	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
86	NC_000915	TTATT	2	10	584553	584562	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_000915	ATTTT	2	10	585369	585378	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_000915	TGCTA	2	10	586834	586843	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
89	NC_000915	TTGTA	2	10	591085	591094	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
90	NC_000915	ATTTT	2	10	600156	600165	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_000915	TAAGG	2	10	629924	629933	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
92	NC_000915	CGCTT	2	10	630035	630044	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
93	NC_000915	ATTTT	2	10	630150	630159	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_000915	ATAAG	2	10	647124	647133	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_000915	GCAGA	2	10	649413	649422	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
96	NC_000915	AACCA	2	10	650073	650082	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
97	NC_000915	AATCA	2	10	655315	655324	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
98	NC_000915	TGGGG	2	10	656721	656730	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
99	NC_000915	TTGGA	2	10	656738	656747	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
100	NC_000915	AGTAT	2	10	656959	656968	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
101	NC_000915	AAAAC	2	10	657171	657180	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
102	NC_000915	GATTT	2	10	657575	657584	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
103	NC_000915	TAGCG	2	10	658383	658392	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
104	NC_000915	AATTT	2	10	659041	659050	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_000915	TTGCC	2	10	665473	665482	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
106	NC_000915	TTTAA	2	10	684622	684631	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_000915	CACAA	2	10	688666	688675	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
108	NC_000915	GCTTT	2	10	715761	715770	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
109	NC_000915	TCTAT	2	10	716236	716245	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
110	NC_000915	GAAAA	2	10	716350	716359	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
111	NC_000915	AAAGC	2	10	717621	717630	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
112	NC_000915	TGTTT	2	10	728029	728038	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
113	NC_000915	CCAAA	2	10	728131	728140	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
114	NC_000915	GTTTT	2	10	732575	732584	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
115	NC_000915	CTTAT	2	10	733988	733997	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
116	NC_000915	CAAAA	2	10	740448	740457	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
117	NC_000915	TAAAA	2	10	740460	740469	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_000915	GTTTT	2	10	744550	744559	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
119	NC_000915	GAATT	2	10	745531	745540	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
120	NC_000915	AATAA	2	10	751046	751055	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_000915	GGAAT	2	10	760250	760259	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
122	NC_000915	ATCAA	2	10	766070	766079	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
123	NC_000915	ATTTA	2	10	773584	773593	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_000915	ATTCT	2	10	774171	774180	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
125	NC_000915	TATAG	2	10	777539	777548	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
126	NC_000915	TTTTA	2	10	839470	839479	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_000915	ATTTT	2	10	865822	865831	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_000915	TTTTA	2	10	888038	888047	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_000915	TCTTA	2	10	888050	888059	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
130	NC_000915	TAAAA	2	10	888235	888244	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_000915	TTAAA	2	10	888350	888359	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_000915	ATTTT	2	10	927265	927274	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_000915	ACTTA	2	10	932167	932176	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
134	NC_000915	TCGTA	2	10	952824	952833	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
135	NC_000915	TTTGT	2	10	968775	968784	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
136	NC_000915	TTTAT	2	10	973547	973556	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_000915	TCAAG	2	10	988553	988562	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
138	NC_000915	GCGAT	2	10	993654	993663	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
139	NC_000915	ATTTT	2	10	993950	993959	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_000915	ATTTC	2	10	1026811	1026820	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
141	NC_000915	AGTTT	2	10	1034685	1034694	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
142	NC_000915	TATTT	2	10	1037664	1037673	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_000915	TTGTT	2	10	1045211	1045220	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
144	NC_000915	TCTCT	2	10	1045334	1045343	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
145	NC_000915	TGCTA	2	10	1050603	1050612	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
146	NC_000915	ACTTT	2	10	1053647	1053656	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
147	NC_000915	TTTCA	2	10	1054188	1054197	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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149	NC_000915	ATTTA	2	10	1054577	1054586	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.