MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Helicobacter pylori 26695 chromosome

Total Repeats: 1106

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_000915	TAAAA	2	10	914	923	80 %	20 %	0 %	0 %	15644636
2	NC_000915	TAAAA	2	10	1807	1816	80 %	20 %	0 %	0 %	15644637
3	NC_000915	TTGAT	2	10	6052	6061	20 %	60 %	20 %	0 %	15646197
4	NC_000915	TTTCT	2	10	8385	8394	0 %	80 %	0 %	20 %	15644643
5	NC_000915	TGCCA	2	10	11857	11866	20 %	20 %	20 %	40 %	15644646
6	NC_000915	TTGAA	2	10	11897	11906	40 %	40 %	20 %	0 %	15644646
7	NC_000915	TTTTG	2	10	11913	11922	0 %	80 %	20 %	0 %	15644646
8	NC_000915	TGGTG	2	10	12748	12757	0 %	40 %	60 %	0 %	15644647
9	NC_000915	CAAAA	2	10	18638	18647	80 %	0 %	0 %	20 %	15644652
10	NC_000915	TGAAA	2	10	20982	20991	60 %	20 %	20 %	0 %	15644654
11	NC_000915	TAAAG	2	10	21687	21696	60 %	20 %	20 %	0 %	15644655
12	NC_000915	CCATG	2	10	23437	23446	20 %	20 %	20 %	40 %	15644658
13	NC_000915	CAAGC	2	10	28246	28255	40 %	0 %	20 %	40 %	15644660
14	NC_000915	TGGGT	2	10	28683	28692	0 %	40 %	60 %	0 %	15644660
15	NC_000915	TTTTA	2	10	29177	29186	20 %	80 %	0 %	0 %	15644661
16	NC_000915	GTTTC	2	10	30491	30500	0 %	60 %	20 %	20 %	15644663
17	NC_000915	TCAAA	2	10	31006	31015	60 %	20 %	0 %	20 %	15644663
18	NC_000915	TTTTC	2	10	31176	31185	0 %	80 %	0 %	20 %	15644663
19	NC_000915	TCATA	2	10	31648	31657	40 %	40 %	0 %	20 %	15644663
20	NC_000915	GTGGG	2	10	34133	34142	0 %	20 %	80 %	0 %	15644666
21	NC_000915	AAGCC	2	10	41149	41158	40 %	0 %	20 %	40 %	15644674
22	NC_000915	CAAAC	2	10	41790	41799	60 %	0 %	0 %	40 %	15644674
23	NC_000915	AGAAA	2	10	42476	42485	80 %	0 %	20 %	0 %	15644675
24	NC_000915	TACTC	2	10	43329	43338	20 %	40 %	0 %	40 %	15644676
25	NC_000915	TAAAA	2	10	45758	45767	80 %	20 %	0 %	0 %	15644678
26	NC_000915	TCCCA	2	10	46770	46779	20 %	20 %	0 %	60 %	15644679
27	NC_000915	TGCCT	2	10	49883	49892	0 %	40 %	20 %	40 %	15644681
28	NC_000915	GATTG	2	10	52111	52120	20 %	40 %	40 %	0 %	15644683
29	NC_000915	TGCTT	2	10	52166	52175	0 %	60 %	20 %	20 %	15644683
30	NC_000915	CTTGA	2	10	52582	52591	20 %	40 %	20 %	20 %	15644684
31	NC_000915	CAACA	2	10	52621	52630	60 %	0 %	0 %	40 %	15644684
32	NC_000915	AAATA	2	10	53404	53413	80 %	20 %	0 %	0 %	15644684
33	NC_000915	CCAAA	2	10	53737	53746	60 %	0 %	0 %	40 %	15644685
34	NC_000915	TAAAA	2	10	55788	55797	80 %	20 %	0 %	0 %	15644685
35	NC_000915	ATCAA	2	10	55819	55828	60 %	20 %	0 %	20 %	15644685
36	NC_000915	TGAAA	2	10	56548	56557	60 %	20 %	20 %	0 %	15644686
37	NC_000915	TCAAA	2	10	56802	56811	60 %	20 %	0 %	20 %	15644686
38	NC_000915	CAGCA	2	10	57749	57758	40 %	0 %	20 %	40 %	15644687
39	NC_000915	TAAAA	2	10	59841	59850	80 %	20 %	0 %	0 %	15644687
40	NC_000915	TCAAA	2	10	60557	60566	60 %	20 %	0 %	20 %	15644687
41	NC_000915	TATCC	2	10	65037	65046	20 %	40 %	0 %	40 %	15644690
42	NC_000915	GGTGG	2	10	70511	70520	0 %	20 %	80 %	0 %	15644696
43	NC_000915	ACACC	2	10	71183	71192	40 %	0 %	0 %	60 %	15644696
44	NC_000915	TCAAT	2	10	73688	73697	40 %	40 %	0 %	20 %	15644699
45	NC_000915	TTTCT	2	10	74225	74234	0 %	80 %	0 %	20 %	15644700
46	NC_000915	CTTGG	2	10	74488	74497	0 %	40 %	40 %	20 %	15644700
47	NC_000915	CTTCT	2	10	74542	74551	0 %	60 %	0 %	40 %	15644700
48	NC_000915	TGCCT	2	10	74619	74628	0 %	40 %	20 %	40 %	15644700
49	NC_000915	TCCAA	2	10	75031	75040	40 %	20 %	0 %	40 %	15644701
50	NC_000915	TTTTG	2	10	78313	78322	0 %	80 %	20 %	0 %	15644704
51	NC_000915	ACGCC	2	10	78619	78628	20 %	0 %	20 %	60 %	15644704
52	NC_000915	AAAGC	2	10	79385	79394	60 %	0 %	20 %	20 %	15644705
53	NC_000915	GTATG	2	10	84898	84907	20 %	40 %	40 %	0 %	15644710
54	NC_000915	CCTCA	2	10	86914	86923	20 %	20 %	0 %	60 %	15644712
55	NC_000915	ATCTT	2	10	88013	88022	20 %	60 %	0 %	20 %	15644712
56	NC_000915	TGGCT	2	10	88554	88563	0 %	40 %	40 %	20 %	15644712
57	NC_000915	ATGCC	2	10	88978	88987	20 %	20 %	20 %	40 %	15644713
58	NC_000915	TTGAT	2	10	90024	90033	20 %	60 %	20 %	0 %	15644715
59	NC_000915	GGCGT	2	10	91838	91847	0 %	20 %	60 %	20 %	15644717
60	NC_000915	CTTTC	2	10	95403	95412	0 %	60 %	0 %	40 %	15644719
61	NC_000915	TTTGA	2	10	98197	98206	20 %	60 %	20 %	0 %	15644722
62	NC_000915	TCTTT	2	10	98408	98417	0 %	80 %	0 %	20 %	15644722
63	NC_000915	GAATT	2	10	106321	106330	40 %	40 %	20 %	0 %	15644730
64	NC_000915	TCGTT	2	10	108219	108228	0 %	60 %	20 %	20 %	15644731
65	NC_000915	TCTTT	2	10	111523	111532	0 %	80 %	0 %	20 %	15644734
66	NC_000915	TAGGC	2	10	113125	113134	20 %	20 %	40 %	20 %	161353440
67	NC_000915	AAAGC	2	10	114312	114321	60 %	0 %	20 %	20 %	15644736
68	NC_000915	GAATG	2	10	115543	115552	40 %	20 %	40 %	0 %	15644738
69	NC_000915	CAAAT	2	10	116866	116875	60 %	20 %	0 %	20 %	15644739
70	NC_000915	ACCCT	2	10	118294	118303	20 %	20 %	0 %	60 %	15644740
71	NC_000915	ATGCC	2	10	118426	118435	20 %	20 %	20 %	40 %	15644740
72	NC_000915	TGATT	2	10	120588	120597	20 %	60 %	20 %	0 %	15644742
73	NC_000915	AAGCC	2	10	126991	127000	40 %	0 %	20 %	40 %	15644747
74	NC_000915	TTGAT	2	10	128820	128829	20 %	60 %	20 %	0 %	15644748
75	NC_000915	TTGAT	2	10	131946	131955	20 %	60 %	20 %	0 %	15644750
76	NC_000915	CTGAT	2	10	132121	132130	20 %	40 %	20 %	20 %	15644750
77	NC_000915	TTTGA	2	10	133186	133195	20 %	60 %	20 %	0 %	15644751
78	NC_000915	GACTT	2	10	133720	133729	20 %	40 %	20 %	20 %	15644751
79	NC_000915	ATCTC	2	10	134471	134480	20 %	40 %	0 %	40 %	15644751
80	NC_000915	TTTGT	2	10	134985	134994	0 %	80 %	20 %	0 %	15644752
81	NC_000915	GAAAA	2	10	137178	137187	80 %	0 %	20 %	0 %	15644754
82	NC_000915	GAAAA	2	10	137496	137505	80 %	0 %	20 %	0 %	15644754
83	NC_000915	ATTTT	2	10	140453	140462	20 %	80 %	0 %	0 %	15644760
84	NC_000915	ATGTT	2	10	140535	140544	20 %	60 %	20 %	0 %	15644760
85	NC_000915	AAAAG	2	10	140947	140956	80 %	0 %	20 %	0 %	15644760
86	NC_000915	AAATC	2	10	143246	143255	60 %	20 %	0 %	20 %	15644762
87	NC_000915	AAAAT	2	10	144718	144727	80 %	20 %	0 %	0 %	15644763
88	NC_000915	TTTTC	2	10	147073	147082	0 %	80 %	0 %	20 %	15644766
89	NC_000915	GTAAA	2	10	147625	147634	60 %	20 %	20 %	0 %	15644767
90	NC_000915	TTCTT	2	10	149029	149038	0 %	80 %	0 %	20 %	15644768
91	NC_000915	TCTTT	2	10	149523	149532	0 %	80 %	0 %	20 %	15644769
92	NC_000915	TTTTG	2	10	150696	150705	0 %	80 %	20 %	0 %	15644770
93	NC_000915	GCGAT	2	10	151489	151498	20 %	20 %	40 %	20 %	15644770
94	NC_000915	GCTTG	2	10	151745	151754	0 %	40 %	40 %	20 %	15644770
95	NC_000915	GTCCA	2	10	152357	152366	20 %	20 %	20 %	40 %	15644771
96	NC_000915	TTTTG	2	10	152405	152414	0 %	80 %	20 %	0 %	15644771
97	NC_000915	CCAAA	2	10	154245	154254	60 %	0 %	0 %	40 %	15644772
98	NC_000915	ACGCC	2	10	157769	157778	20 %	0 %	20 %	60 %	15644773
99	NC_000915	TTATT	2	10	159664	159673	20 %	80 %	0 %	0 %	15644777
100	NC_000915	GCGTT	2	10	160022	160031	0 %	40 %	40 %	20 %	15644778
101	NC_000915	ATTTG	2	10	160998	161007	20 %	60 %	20 %	0 %	15644779
102	NC_000915	AGATT	2	10	165516	165525	40 %	40 %	20 %	0 %	15644784
103	NC_000915	AAGCC	2	10	166855	166864	40 %	0 %	20 %	40 %	15644787
104	NC_000915	TGGCG	2	10	167529	167538	0 %	20 %	60 %	20 %	15644787
105	NC_000915	GGCAT	2	10	168670	168679	20 %	20 %	40 %	20 %	15644788
106	NC_000915	ATTTT	2	10	168906	168915	20 %	80 %	0 %	0 %	15644789
107	NC_000915	GGGTG	2	10	169262	169271	0 %	20 %	80 %	0 %	15644789
108	NC_000915	ATTCA	2	10	170782	170791	40 %	40 %	0 %	20 %	15644791
109	NC_000915	ATCTT	2	10	174184	174193	20 %	60 %	0 %	20 %	15644795
110	NC_000915	ATATT	2	10	181585	181594	40 %	60 %	0 %	0 %	551540677
111	NC_000915	TGGGG	2	10	182822	182831	0 %	20 %	80 %	0 %	15644805
112	NC_000915	ATTTG	2	10	183599	183608	20 %	60 %	20 %	0 %	15644805
113	NC_000915	AATTG	2	10	183755	183764	40 %	40 %	20 %	0 %	15644806
114	NC_000915	AAATG	2	10	185130	185139	60 %	20 %	20 %	0 %	15644807
115	NC_000915	TGTAA	2	10	185920	185929	40 %	40 %	20 %	0 %	15644808
116	NC_000915	ATAAA	2	10	187416	187425	80 %	20 %	0 %	0 %	15644809
117	NC_000915	AAAAG	2	10	188566	188575	80 %	0 %	20 %	0 %	15644810
118	NC_000915	ACCCC	2	10	188631	188640	20 %	0 %	0 %	80 %	15644810
119	NC_000915	TGAAT	2	10	188947	188956	40 %	40 %	20 %	0 %	15644811
120	NC_000915	AGAGG	2	10	194283	194292	40 %	0 %	60 %	0 %	15644815
121	NC_000915	TTCAA	2	10	196059	196068	40 %	40 %	0 %	20 %	15644819
122	NC_000915	AATCC	2	10	196735	196744	40 %	20 %	0 %	40 %	15644819
123	NC_000915	TATTG	2	10	201340	201349	20 %	60 %	20 %	0 %	15644823
124	NC_000915	TCATT	2	10	201671	201680	20 %	60 %	0 %	20 %	15644823
125	NC_000915	GCTAC	2	10	202489	202498	20 %	20 %	20 %	40 %	15644824
126	NC_000915	CTATT	2	10	202560	202569	20 %	60 %	0 %	20 %	15644825
127	NC_000915	TTTTC	2	10	203620	203629	0 %	80 %	0 %	20 %	15644826
128	NC_000915	TATTT	2	10	207376	207385	20 %	80 %	0 %	0 %	15644831
129	NC_000915	TTTCA	2	10	208037	208046	20 %	60 %	0 %	20 %	15644832
130	NC_000915	TGAAT	2	10	210939	210948	40 %	40 %	20 %	0 %	15644834
131	NC_000915	CTTCA	2	10	211293	211302	20 %	40 %	0 %	40 %	15644834
132	NC_000915	ATTTA	2	10	212190	212199	40 %	60 %	0 %	0 %	15644836
133	NC_000915	AAACA	2	10	212212	212221	80 %	0 %	0 %	20 %	15644836
134	NC_000915	TGGGG	2	10	214972	214981	0 %	20 %	80 %	0 %	15644837
135	NC_000915	ATTCT	2	10	217406	217415	20 %	60 %	0 %	20 %	15644838
136	NC_000915	GCAAA	2	10	220011	220020	60 %	0 %	20 %	20 %	15644840
137	NC_000915	ATATT	2	10	220479	220488	40 %	60 %	0 %	0 %	15644841
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