MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Helicobacter pylori 26695 chromosome

Total Repeats: 16816

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_000915	CAT	2	6	185	190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_000915	GAT	3	9	328	336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15644635
3	NC_000915	TTC	2	6	562	567	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15644635
4	NC_000915	ACA	2	6	588	593	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15644635
5	NC_000915	CAA	2	6	662	667	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15644636
6	NC_000915	AAT	2	6	903	908	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15644636
7	NC_000915	CTT	2	6	1006	1011	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15644636
8	NC_000915	TGA	2	6	1024	1029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15644636
9	NC_000915	AAC	2	6	1230	1235	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15644637
10	NC_000915	CCG	3	9	1249	1257	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15644637
11	NC_000915	CCA	2	6	1393	1398	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15644637
12	NC_000915	GCT	2	6	1418	1423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15644637
13	NC_000915	GGC	2	6	1609	1614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15644637
14	NC_000915	GTT	2	6	1829	1834	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15644637
15	NC_000915	CTT	2	6	1863	1868	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15644637
16	NC_000915	ATG	2	6	2029	2034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15644638
17	NC_000915	GTT	2	6	2103	2108	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15644638
18	NC_000915	CTT	2	6	2192	2197	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15644638
19	NC_000915	TGG	2	6	2249	2254	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15644638
20	NC_000915	TCA	2	6	2257	2262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15644638
21	NC_000915	TGA	2	6	2868	2873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15644639
22	NC_000915	AGC	2	6	2983	2988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15644639
23	NC_000915	GTG	2	6	3172	3177	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15644639
24	NC_000915	GTG	2	6	3331	3336	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15644639
25	NC_000915	GCC	2	6	3338	3343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15644639
26	NC_000915	TTG	2	6	3422	3427	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15644640
27	NC_000915	GAA	2	6	3454	3459	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15644640
28	NC_000915	GTT	2	6	3784	3789	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15644640
29	NC_000915	CAG	2	6	4030	4035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15644640
30	NC_000915	ATT	2	6	4112	4117	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15644640
31	NC_000915	TGT	2	6	4123	4128	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15644640
32	NC_000915	TGG	2	6	4181	4186	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15644640
33	NC_000915	GGT	2	6	4291	4296	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_000915	TAT	2	6	4339	4344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_000915	TGG	2	6	4382	4387	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_000915	TGG	2	6	4502	4507	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_000915	GTG	2	6	4618	4623	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_000915	ACC	2	6	4650	4655	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_000915	GGT	2	6	4663	4668	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_000915	AAT	2	6	4823	4828	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_000915	TAT	2	6	4959	4964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_000915	TTA	2	6	5014	5019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_000915	ATT	2	6	5472	5477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15646197
44	NC_000915	TGG	2	6	5570	5575	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15646197
45	NC_000915	ATA	2	6	5691	5696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15646197
46	NC_000915	TCT	2	6	5709	5714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15646197
47	NC_000915	GTT	2	6	5772	5777	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15646197
48	NC_000915	TAA	2	6	5841	5846	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15646197
49	NC_000915	TTA	2	6	5899	5904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15646197
50	NC_000915	GTG	2	6	5968	5973	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15646197
51	NC_000915	GTT	2	6	5988	5993	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15646197
52	NC_000915	CAA	2	6	6036	6041	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15646197
53	NC_000915	AGT	2	6	6200	6205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15646197
54	NC_000915	CAG	2	6	6320	6325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15646197
55	NC_000915	GTT	2	6	6372	6377	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15646197
56	NC_000915	CTT	2	6	6566	6571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15646197
57	NC_000915	TAG	8	24	6593	6616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15646197
58	NC_000915	TTA	2	6	6625	6630	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15646197
59	NC_000915	TGT	2	6	6645	6650	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15646197
60	NC_000915	TTG	2	6	6717	6722	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15646197
61	NC_000915	GTT	2	6	6786	6791	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15646197
62	NC_000915	CCG	2	6	6920	6925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15646197
63	NC_000915	GCT	2	6	7035	7040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15646197
64	NC_000915	GTT	2	6	7065	7070	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15646197
65	NC_000915	GGT	2	6	7408	7413	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_000915	GAT	2	6	7579	7584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_000915	CAT	2	6	7606	7611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15644643
68	NC_000915	TCT	2	6	7673	7678	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15644643
69	NC_000915	AAT	2	6	7771	7776	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15644643
70	NC_000915	CTT	2	6	7779	7784	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15644643
71	NC_000915	CAT	2	6	7869	7874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15644643
72	NC_000915	ATG	2	6	7922	7927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15644643
73	NC_000915	TCA	2	6	7946	7951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15644643
74	NC_000915	CCG	2	6	8000	8005	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15644643
75	NC_000915	CTT	2	6	8019	8024	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15644643
76	NC_000915	CAT	2	6	8052	8057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15644643
77	NC_000915	CAT	2	6	8223	8228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15644643
78	NC_000915	GTG	2	6	8255	8260	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15644643
79	NC_000915	TTC	2	6	8335	8340	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15644643
80	NC_000915	TAA	2	6	8343	8348	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15644643
81	NC_000915	CCG	2	6	8354	8359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15644643
82	NC_000915	CAC	2	6	8455	8460	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15644643
83	NC_000915	GAT	2	6	8497	8502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15644643
84	NC_000915	TAG	2	6	8536	8541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15644643
85	NC_000915	ACA	2	6	8678	8683	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15644643
86	NC_000915	CTT	2	6	8709	8714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15644643
87	NC_000915	TCT	2	6	8819	8824	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15644643
88	NC_000915	TAA	2	6	8862	8867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15644643
89	NC_000915	CTT	2	6	8940	8945	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15644643
90	NC_000915	GCA	2	6	8993	8998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15644643
91	NC_000915	CTT	2	6	9018	9023	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15644643
92	NC_000915	TAA	3	9	9254	9262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_000915	ACA	2	6	9340	9345	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15644644
94	NC_000915	TCT	2	6	9374	9379	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15644644
95	NC_000915	CTT	2	6	9456	9461	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15644644
96	NC_000915	GAT	3	9	9544	9552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15644644
97	NC_000915	TCT	2	6	9572	9577	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15644644
98	NC_000915	CTA	2	6	9588	9593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15644644
99	NC_000915	TTA	2	6	9675	9680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_000915	TAA	2	6	9735	9740	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_000915	ATT	2	6	9754	9759	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_000915	TTA	2	6	9818	9823	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_000915	GAA	2	6	9895	9900	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_000915	TTG	2	6	10015	10020	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15644645
105	NC_000915	GAA	2	6	10031	10036	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15644645
106	NC_000915	TTA	2	6	10210	10215	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15644645
107	NC_000915	AGA	2	6	10225	10230	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15644645
108	NC_000915	ACC	2	6	10233	10238	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15644645
109	NC_000915	AAG	2	6	10266	10271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15644645
110	NC_000915	ATT	2	6	10299	10304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15644645
111	NC_000915	CAT	2	6	10480	10485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15644645
112	NC_000915	GTG	2	6	10514	10519	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15644645
113	NC_000915	ATG	2	6	10794	10799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15644645
114	NC_000915	AGG	2	6	10859	10864	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15644645
115	NC_000915	AAC	2	6	10886	10891	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15644645
116	NC_000915	AGA	2	6	11272	11277	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15644645
117	NC_000915	TTG	2	6	11285	11290	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15644645
118	NC_000915	GAC	2	6	11372	11377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15644645
119	NC_000915	TTA	3	9	11393	11401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15644645
120	NC_000915	TTG	2	6	11450	11455	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15644645
121	NC_000915	TGT	2	6	11636	11641	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15644646
122	NC_000915	TGT	2	6	11804	11809	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15644646
123	NC_000915	AAG	2	6	11963	11968	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15644646
124	NC_000915	GGT	2	6	12049	12054	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15644646
125	NC_000915	GTT	2	6	12078	12083	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15644646
126	NC_000915	TTG	2	6	12140	12145	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15644646
127	NC_000915	TGG	3	9	12374	12382	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15644646
128	NC_000915	GAA	3	9	12391	12399	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15644646
129	NC_000915	TGG	2	6	12473	12478	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15644646
130	NC_000915	AGA	2	6	12495	12500	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15644646
131	NC_000915	AGG	2	6	12717	12722	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
132	NC_000915	TTA	2	6	12804	12809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15644647
133	NC_000915	GAA	2	6	12821	12826	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15644647
134	NC_000915	GTT	2	6	12888	12893	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15644647
135	NC_000915	ATT	2	6	12911	12916	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15644647
136	NC_000915	CGC	2	6	13063	13068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15644647
137	NC_000915	AAT	2	6	13193	13198	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15644647
138	NC_000915	ACC	2	6	13287	13292	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15644647
139	NC_000915	GGT	2	6	13429	13434	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15644647
140	NC_000915	AGA	2	6	13489	13494	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15644647
141	NC_000915	ACC	2	6	13607	13612	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
142	NC_000915	ATA	2	6	13655	13660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_000915	GTG	2	6	13915	13920	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15644648
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145	NC_000915	GAA	2	6	14332	14337	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15644650
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159	NC_000915	AAG	2	6	15836	15841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15644650
160	NC_000915	ATG	2	6	16013	16018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15644650
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163	NC_000915	GTG	3	9	16249	16257	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15644650
164	NC_000915	GAG	2	6	16602	16607	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15644650
165	NC_000915	CTG	2	6	16702	16707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
166	NC_000915	TAT	2	6	16959	16964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15644651
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172	NC_000915	CGG	2	6	17485	17490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15644651
173	NC_000915	GTT	2	6	17507	17512	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15644651
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177	NC_000915	TTG	2	6	17947	17952	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15644651
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179	NC_000915	ATA	2	6	18214	18219	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15644651
180	NC_000915	CCA	2	6	18284	18289	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
181	NC_000915	TTG	2	6	18443	18448	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15644652
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250	NC_000915	TTA	2	6	25471	25476	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
251	NC_000915	GTT	2	6	25684	25689	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
252	NC_000915	TTG	2	6	25741	25746	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
253	NC_000915	GGT	2	6	25852	25857	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
254	NC_000915	TTC	2	6	26297	26302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15644659
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262	NC_000915	AGA	2	6	27215	27220	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15644659
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