MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Helicobacter pylori 26695 chromosome

Total Repeats: 14680

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_000915	GAT	3	9	328	336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15644635
2	NC_000915	TTC	2	6	562	567	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15644635
3	NC_000915	ACA	2	6	588	593	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15644635
4	NC_000915	CAA	2	6	662	667	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15644636
5	NC_000915	AAT	2	6	903	908	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15644636
6	NC_000915	CTT	2	6	1006	1011	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15644636
7	NC_000915	TGA	2	6	1024	1029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15644636
8	NC_000915	AAC	2	6	1230	1235	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15644637
9	NC_000915	CCG	3	9	1249	1257	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15644637
10	NC_000915	CCA	2	6	1393	1398	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15644637
11	NC_000915	GCT	2	6	1418	1423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15644637
12	NC_000915	GGC	2	6	1609	1614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15644637
13	NC_000915	GTT	2	6	1829	1834	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15644637
14	NC_000915	CTT	2	6	1863	1868	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15644637
15	NC_000915	ATG	2	6	2029	2034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15644638
16	NC_000915	GTT	2	6	2103	2108	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15644638
17	NC_000915	CTT	2	6	2192	2197	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15644638
18	NC_000915	TGG	2	6	2249	2254	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15644638
19	NC_000915	TCA	2	6	2257	2262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15644638
20	NC_000915	TGA	2	6	2868	2873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15644639
21	NC_000915	AGC	2	6	2983	2988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15644639
22	NC_000915	GTG	2	6	3172	3177	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15644639
23	NC_000915	GTG	2	6	3331	3336	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15644639
24	NC_000915	GCC	2	6	3338	3343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15644639
25	NC_000915	TTG	2	6	3422	3427	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15644640
26	NC_000915	GAA	2	6	3454	3459	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15644640
27	NC_000915	GTT	2	6	3784	3789	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15644640
28	NC_000915	CAG	2	6	4030	4035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15644640
29	NC_000915	ATT	2	6	4112	4117	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15644640
30	NC_000915	TGT	2	6	4123	4128	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15644640
31	NC_000915	TGG	2	6	4181	4186	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15644640
32	NC_000915	ATT	2	6	5472	5477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15646197
33	NC_000915	TGG	2	6	5570	5575	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15646197
34	NC_000915	ATA	2	6	5691	5696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15646197
35	NC_000915	TCT	2	6	5709	5714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15646197
36	NC_000915	GTT	2	6	5772	5777	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15646197
37	NC_000915	TAA	2	6	5841	5846	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15646197
38	NC_000915	TTA	2	6	5899	5904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15646197
39	NC_000915	GTG	2	6	5968	5973	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15646197
40	NC_000915	GTT	2	6	5988	5993	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15646197
41	NC_000915	CAA	2	6	6036	6041	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15646197
42	NC_000915	AGT	2	6	6200	6205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15646197
43	NC_000915	CAG	2	6	6320	6325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15646197
44	NC_000915	GTT	2	6	6372	6377	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15646197
45	NC_000915	CTT	2	6	6566	6571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15646197
46	NC_000915	TAG	8	24	6593	6616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15646197
47	NC_000915	TTA	2	6	6625	6630	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15646197
48	NC_000915	TGT	2	6	6645	6650	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15646197
49	NC_000915	TTG	2	6	6717	6722	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15646197
50	NC_000915	GTT	2	6	6786	6791	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15646197
51	NC_000915	CCG	2	6	6920	6925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15646197
52	NC_000915	GCT	2	6	7035	7040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15646197
53	NC_000915	GTT	2	6	7065	7070	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15646197
54	NC_000915	CAT	2	6	7606	7611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15644643
55	NC_000915	TCT	2	6	7673	7678	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15644643
56	NC_000915	AAT	2	6	7771	7776	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15644643
57	NC_000915	CTT	2	6	7779	7784	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15644643
58	NC_000915	CAT	2	6	7869	7874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15644643
59	NC_000915	ATG	2	6	7922	7927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15644643
60	NC_000915	TCA	2	6	7946	7951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15644643
61	NC_000915	CCG	2	6	8000	8005	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15644643
62	NC_000915	CTT	2	6	8019	8024	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15644643
63	NC_000915	CAT	2	6	8052	8057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15644643
64	NC_000915	CAT	2	6	8223	8228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15644643
65	NC_000915	GTG	2	6	8255	8260	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15644643
66	NC_000915	TTC	2	6	8335	8340	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15644643
67	NC_000915	TAA	2	6	8343	8348	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15644643
68	NC_000915	CCG	2	6	8354	8359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15644643
69	NC_000915	CAC	2	6	8455	8460	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15644643
70	NC_000915	GAT	2	6	8497	8502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15644643
71	NC_000915	TAG	2	6	8536	8541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15644643
72	NC_000915	ACA	2	6	8678	8683	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15644643
73	NC_000915	CTT	2	6	8709	8714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15644643
74	NC_000915	TCT	2	6	8819	8824	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15644643
75	NC_000915	TAA	2	6	8862	8867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15644643
76	NC_000915	CTT	2	6	8940	8945	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15644643
77	NC_000915	GCA	2	6	8993	8998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15644643
78	NC_000915	CTT	2	6	9018	9023	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15644643
79	NC_000915	ACA	2	6	9340	9345	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15644644
80	NC_000915	TCT	2	6	9374	9379	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15644644
81	NC_000915	CTT	2	6	9456	9461	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15644644
82	NC_000915	GAT	3	9	9544	9552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15644644
83	NC_000915	TCT	2	6	9572	9577	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15644644
84	NC_000915	CTA	2	6	9588	9593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15644644
85	NC_000915	TTG	2	6	10015	10020	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15644645
86	NC_000915	GAA	2	6	10031	10036	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15644645
87	NC_000915	TTA	2	6	10210	10215	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15644645
88	NC_000915	AGA	2	6	10225	10230	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15644645
89	NC_000915	ACC	2	6	10233	10238	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15644645
90	NC_000915	AAG	2	6	10266	10271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15644645
91	NC_000915	ATT	2	6	10299	10304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15644645
92	NC_000915	CAT	2	6	10480	10485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15644645
93	NC_000915	GTG	2	6	10514	10519	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15644645
94	NC_000915	ATG	2	6	10794	10799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15644645
95	NC_000915	AGG	2	6	10859	10864	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15644645
96	NC_000915	AAC	2	6	10886	10891	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15644645
97	NC_000915	AGA	2	6	11272	11277	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15644645
98	NC_000915	TTG	2	6	11285	11290	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15644645
99	NC_000915	GAC	2	6	11372	11377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15644645
100	NC_000915	TTA	3	9	11393	11401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15644645
101	NC_000915	TTG	2	6	11450	11455	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15644645
102	NC_000915	TGT	2	6	11636	11641	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15644646
103	NC_000915	TGT	2	6	11804	11809	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15644646
104	NC_000915	AAG	2	6	11963	11968	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15644646
105	NC_000915	GGT	2	6	12049	12054	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15644646
106	NC_000915	GTT	2	6	12078	12083	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15644646
107	NC_000915	TTG	2	6	12140	12145	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15644646
108	NC_000915	TGG	3	9	12374	12382	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15644646
109	NC_000915	GAA	3	9	12391	12399	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15644646
110	NC_000915	TGG	2	6	12473	12478	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15644646
111	NC_000915	AGA	2	6	12495	12500	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15644646
112	NC_000915	TTA	2	6	12804	12809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15644647
113	NC_000915	GAA	2	6	12821	12826	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15644647
114	NC_000915	GTT	2	6	12888	12893	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15644647
115	NC_000915	ATT	2	6	12911	12916	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15644647
116	NC_000915	CGC	2	6	13063	13068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15644647
117	NC_000915	AAT	2	6	13193	13198	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15644647
118	NC_000915	ACC	2	6	13287	13292	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15644647
119	NC_000915	GGT	2	6	13429	13434	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15644647
120	NC_000915	AGA	2	6	13489	13494	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15644647
121	NC_000915	GTG	2	6	13915	13920	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15644648
122	NC_000915	GAA	2	6	14006	14011	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15644649
123	NC_000915	GAA	2	6	14332	14337	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15644650
124	NC_000915	AAC	2	6	14338	14343	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15644650
125	NC_000915	ATG	2	6	14357	14362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15644650
126	NC_000915	TCC	2	6	14402	14407	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15644650
127	NC_000915	CAA	2	6	14542	14547	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15644650
128	NC_000915	AAG	2	6	14603	14608	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15644650
129	NC_000915	TAG	2	6	14870	14875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15644650
130	NC_000915	ATT	2	6	14927	14932	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15644650
131	NC_000915	TCT	2	6	15059	15064	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15644650
132	NC_000915	ACC	2	6	15365	15370	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15644650
133	NC_000915	ATT	2	6	15488	15493	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15644650
134	NC_000915	AAG	2	6	15521	15526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15644650
135	NC_000915	ATG	2	6	15625	15630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15644650
136	NC_000915	CTT	2	6	15795	15800	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15644650
137	NC_000915	AAG	2	6	15836	15841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15644650
138	NC_000915	ATG	2	6	16013	16018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15644650
139	NC_000915	TAT	2	6	16099	16104	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15644650
140	NC_000915	AGA	2	6	16122	16127	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15644650
141	NC_000915	GTG	3	9	16249	16257	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15644650
142	NC_000915	GAG	2	6	16602	16607	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15644650
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145	NC_000915	CTT	2	6	17083	17088	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15644651
146	NC_000915	ATT	2	6	17230	17235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15644651
147	NC_000915	TAT	2	6	17331	17336	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15644651
148	NC_000915	ACA	2	6	17431	17436	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15644651
149	NC_000915	CGG	2	6	17485	17490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15644651
150	NC_000915	GTT	2	6	17507	17512	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15644651
151	NC_000915	ATC	2	6	17643	17648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15644651
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153	NC_000915	TAT	2	6	17934	17939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15644651
154	NC_000915	TTG	2	6	17947	17952	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15644651
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158	NC_000915	GTG	2	6	18509	18514	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15644652
159	NC_000915	CAT	2	6	18535	18540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15644652
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161	NC_000915	GAT	2	6	18692	18697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15644652
162	NC_000915	GTG	2	6	18872	18877	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15644652
163	NC_000915	ATT	2	6	19124	19129	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15644652
164	NC_000915	TTC	2	6	19222	19227	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15644652
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167	NC_000915	GAA	2	6	19558	19563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15644653
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172	NC_000915	ATA	2	6	20087	20092	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15644653
173	NC_000915	CTT	2	6	20201	20206	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15644653
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257	NC_000915	TCT	3	9	29802	29810	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15644662
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259	NC_000915	TTA	2	6	30750	30755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15644663
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