MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori 26695 chromosome

Total Repeats: 324

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_000915	GA	11	22	7221	7242	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_000915	CA	3	6	16681	16686	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_000915	GC	3	6	23091	23096	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4	NC_000915	GT	3	6	25516	25521	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_000915	TA	3	6	27502	27507	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_000915	AG	3	6	40546	40551	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_000915	AG	3	6	40629	40634	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_000915	GT	3	6	44299	44304	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_000915	GT	3	6	44343	44348	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_000915	AG	4	8	44457	44464	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_000915	CT	3	6	44924	44929	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_000915	TC	3	6	62122	62127	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_000915	AT	3	6	62966	62971	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_000915	AG	3	6	75480	75485	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_000915	TA	4	8	81806	81813	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_000915	TC	3	6	84143	84148	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_000915	AG	3	6	88749	88754	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_000915	AG	3	6	88777	88782	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_000915	AG	3	6	97173	97178	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_000915	TA	3	6	97221	97226	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_000915	TA	3	6	100507	100512	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_000915	TA	3	6	129147	129152	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_000915	TA	4	8	130814	130821	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_000915	AT	3	6	132280	132285	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_000915	AG	3	6	140381	140386	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_000915	GA	4	8	141696	141703	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_000915	GA	3	6	146750	146755	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_000915	TG	3	6	168838	168843	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_000915	CT	3	6	169845	169850	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_000915	TG	3	6	170068	170073	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_000915	TC	3	6	172457	172462	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_000915	CT	3	6	173267	173272	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_000915	AC	3	6	181849	181854	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_000915	AT	3	6	187931	187936	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_000915	GA	3	6	187937	187942	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_000915	AG	3	6	193161	193166	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_000915	CT	3	6	193179	193184	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_000915	CT	3	6	193195	193200	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_000915	TA	3	6	208471	208476	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_000915	TA	3	6	208489	208494	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_000915	CT	11	22	214466	214487	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_000915	GC	3	6	216143	216148	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43	NC_000915	TG	3	6	230961	230966	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_000915	CT	3	6	233671	233676	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_000915	AG	3	6	234955	234960	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_000915	GT	3	6	238600	238605	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_000915	GA	3	6	244458	244463	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_000915	TG	3	6	244709	244714	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_000915	AT	3	6	270959	270964	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_000915	GA	3	6	297969	297974	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_000915	AG	3	6	331798	331803	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_000915	TG	3	6	334257	334262	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_000915	AG	3	6	340777	340782	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_000915	TC	3	6	349367	349372	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_000915	TC	4	8	351521	351528	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_000915	TC	4	8	351531	351538	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_000915	AC	3	6	377089	377094	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_000915	TG	3	6	377530	377535	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_000915	AT	3	6	377638	377643	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_000915	AC	3	6	377871	377876	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_000915	AT	3	6	380875	380880	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_000915	AC	3	6	380911	380916	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_000915	CT	3	6	395098	395103	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_000915	TA	3	6	397615	397620	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_000915	GA	3	6	399879	399884	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_000915	CT	3	6	426441	426446	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_000915	AG	3	6	445364	445369	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_000915	AG	3	6	445484	445489	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_000915	AT	3	6	446168	446173	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_000915	TG	3	6	446380	446385	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_000915	AT	3	6	446620	446625	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_000915	TG	3	6	447728	447733	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_000915	AC	3	6	448049	448054	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_000915	TG	3	6	448152	448157	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_000915	AG	3	6	448273	448278	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_000915	AG	3	6	450998	451003	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_000915	TG	3	6	451396	451401	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_000915	AG	3	6	451739	451744	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_000915	AT	3	6	452261	452266	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_000915	TG	3	6	452575	452580	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_000915	GA	3	6	453591	453596	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_000915	GA	3	6	453785	453790	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_000915	CA	3	6	466595	466600	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_000915	AG	3	6	468329	468334	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_000915	AG	3	6	468367	468372	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_000915	AC	3	6	474074	474079	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_000915	AT	3	6	474343	474348	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_000915	GA	3	6	474528	474533	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_000915	AG	3	6	474805	474810	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_000915	TG	3	6	479552	479557	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_000915	AT	4	8	494155	494162	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_000915	CT	3	6	504754	504759	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_000915	AG	4	8	506476	506483	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_000915	GA	3	6	506539	506544	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_000915	AG	3	6	506975	506980	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_000915	GT	4	8	507975	507982	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_000915	AG	3	6	507993	507998	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_000915	TA	3	6	509076	509081	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_000915	GA	3	6	530031	530036	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_000915	TA	3	6	530685	530690	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_000915	AT	3	6	530855	530860	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_000915	TG	3	6	537518	537523	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_000915	CT	3	6	538010	538015	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_000915	GA	3	6	547694	547699	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_000915	CA	3	6	547750	547755	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_000915	AT	3	6	554168	554173	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_000915	GA	3	6	564027	564032	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_000915	AG	4	8	564307	564314	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_000915	AG	3	6	565937	565942	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_000915	AC	3	6	567722	567727	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_000915	AC	4	8	579520	579527	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_000915	GT	3	6	579828	579833	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_000915	AG	3	6	583743	583748	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_000915	AG	3	6	583794	583799	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_000915	AG	3	6	583830	583835	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_000915	TC	3	6	584479	584484	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_000915	GA	4	8	591159	591166	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_000915	AG	3	6	591323	591328	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_000915	AC	3	6	591447	591452	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_000915	AC	3	6	596981	596986	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_000915	AT	3	6	600051	600056	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_000915	AG	3	6	605754	605759	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_000915	AG	3	6	616085	616090	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_000915	AT	3	6	629793	629798	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_000915	GC	3	6	648028	648033	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
126	NC_000915	CA	3	6	651070	651075	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_000915	TG	4	8	651144	651151	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_000915	TC	3	6	652805	652810	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_000915	TC	3	6	653261	653266	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_000915	AG	3	6	653685	653690	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_000915	AG	3	6	657261	657266	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_000915	AT	3	6	657371	657376	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_000915	TG	3	6	657404	657409	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_000915	GC	3	6	657552	657557	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
135	NC_000915	AG	4	8	664867	664874	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_000915	GA	3	6	664893	664898	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_000915	CA	3	6	664980	664985	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_000915	GC	3	6	674008	674013	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
139	NC_000915	CT	3	6	684765	684770	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
140	NC_000915	TA	3	6	699474	699479	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_000915	TA	3	6	715029	715034	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_000915	AG	3	6	716219	716224	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_000915	CT	3	6	719440	719445	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
144	NC_000915	TA	3	6	728174	728179	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_000915	TC	3	6	734120	734125	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
146	NC_000915	CT	3	6	734317	734322	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
147	NC_000915	AC	3	6	734465	734470	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
148	NC_000915	TA	3	6	739398	739403	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_000915	TC	3	6	744829	744834	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
150	NC_000915	TC	3	6	756633	756638	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
151	NC_000915	TC	3	6	756802	756807	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
152	NC_000915	CT	3	6	757201	757206	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
153	NC_000915	AG	3	6	761264	761269	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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155	NC_000915	AG	3	6	767604	767609	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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304	NC_000915	GA	3	6	1572673	1572678	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
305	NC_000915	AT	3	6	1572841	1572846	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
306	NC_000915	CA	3	6	1580296	1580301	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
307	NC_000915	TA	3	6	1594901	1594906	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
308	NC_000915	TA	3	6	1595349	1595354	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
309	NC_000915	AT	3	6	1595755	1595760	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
310	NC_000915	TC	3	6	1596009	1596014	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
311	NC_000915	CT	3	6	1596197	1596202	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
312	NC_000915	AT	3	6	1596495	1596500	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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314	NC_000915	CT	3	6	1600711	1600716	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
315	NC_000915	AT	3	6	1601293	1601298	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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320	NC_000915	TC	3	6	1663565	1663570	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
321	NC_000915	CT	3	6	1664383	1664388	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
322	NC_000915	TC	4	8	1665034	1665041	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
323	NC_000915	AC	3	6	1665536	1665541	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
324	NC_000915	TC	3	6	1666941	1666946	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.