MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Sinorhizobium fredii NGR234 plasmid pNGR234a

Total Repeats: 5496

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_000914	CGC	2	6	114	119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16519683
2	NC_000914	GCA	2	6	208	213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16519683
3	NC_000914	GAA	2	6	298	303	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16519683
4	NC_000914	TCG	3	9	341	349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16519683
5	NC_000914	GAC	3	9	505	513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16519683
6	NC_000914	GCC	2	6	515	520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16519683
7	NC_000914	TCG	2	6	593	598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16519683
8	NC_000914	ATC	2	6	686	691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16519683
9	NC_000914	CTT	2	6	805	810	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16519683
10	NC_000914	GTC	2	6	860	865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16519683
11	NC_000914	TGC	2	6	1024	1029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16519683
12	NC_000914	TGG	2	6	1098	1103	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16519683
13	NC_000914	CCA	2	6	1123	1128	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16519683
14	NC_000914	GAA	2	6	1138	1143	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16519683
15	NC_000914	TCG	2	6	1278	1283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16519683
16	NC_000914	GGA	2	6	1305	1310	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16519683
17	NC_000914	GTC	2	6	1540	1545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16519682
18	NC_000914	CCG	2	6	1716	1721	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16519682
19	NC_000914	GTC	2	6	1762	1767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16519682
20	NC_000914	TGC	2	6	1911	1916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16519682
21	NC_000914	CGG	2	6	1997	2002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16519682
22	NC_000914	GCG	2	6	2149	2154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16519682
23	NC_000914	GAC	2	6	2169	2174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16519682
24	NC_000914	CGG	2	6	2201	2206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16519682
25	NC_000914	AGA	2	6	2511	2516	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16519681
26	NC_000914	GAC	2	6	2533	2538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16519681
27	NC_000914	GCG	2	6	2548	2553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16519681
28	NC_000914	GAC	2	6	2725	2730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16519681
29	NC_000914	TCG	2	6	2835	2840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16519681
30	NC_000914	GAG	2	6	3077	3082	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16519681
31	NC_000914	TAG	2	6	3129	3134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16519681
32	NC_000914	GTC	2	6	3491	3496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16519681
33	NC_000914	CGG	2	6	3616	3621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16519681
34	NC_000914	CTG	2	6	3689	3694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16519681
35	NC_000914	CCT	2	6	3723	3728	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16519681
36	NC_000914	ATG	2	6	6296	6301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16519680
37	NC_000914	CGA	2	6	6330	6335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16519680
38	NC_000914	GAC	2	6	6359	6364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16519680
39	NC_000914	AGA	2	6	6435	6440	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16519680
40	NC_000914	GGC	2	6	6505	6510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16519680
41	NC_000914	AGT	2	6	6691	6696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16519679
42	NC_000914	GCC	2	6	6726	6731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16519679
43	NC_000914	GGC	2	6	6765	6770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16519679
44	NC_000914	GAT	2	6	6830	6835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16519679
45	NC_000914	GGC	2	6	7140	7145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16519679
46	NC_000914	GCG	2	6	7232	7237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16519679
47	NC_000914	CGC	2	6	7277	7282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16519679
48	NC_000914	ACG	3	9	7348	7356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16519679
49	NC_000914	AAG	2	6	7383	7388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16519679
50	NC_000914	TGG	2	6	7435	7440	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16519679
51	NC_000914	GCC	2	6	7456	7461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16519679
52	NC_000914	TCG	2	6	7468	7473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16519679
53	NC_000914	CGT	2	6	7481	7486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16519679
54	NC_000914	TGC	2	6	7531	7536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16519679
55	NC_000914	CGA	2	6	8183	8188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16519678
56	NC_000914	TCC	2	6	8299	8304	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16519678
57	NC_000914	ACG	2	6	8305	8310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16519678
58	NC_000914	CCG	2	6	8372	8377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16519678
59	NC_000914	ACG	2	6	8542	8547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16519678
60	NC_000914	GCC	2	6	8574	8579	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16519678
61	NC_000914	TGG	2	6	8713	8718	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16519678
62	NC_000914	TGC	2	6	8731	8736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16519678
63	NC_000914	CGG	2	6	8755	8760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16519678
64	NC_000914	TGC	2	6	8761	8766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16519678
65	NC_000914	TCG	2	6	8773	8778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16519678
66	NC_000914	GCA	2	6	8810	8815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16519678
67	NC_000914	CAC	2	6	8870	8875	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16519678
68	NC_000914	GCC	2	6	8889	8894	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16519678
69	NC_000914	GCC	2	6	8932	8937	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16519678
70	NC_000914	GCT	2	6	8957	8962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16519678
71	NC_000914	GGC	2	6	8984	8989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16519678
72	NC_000914	GAT	2	6	9038	9043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16519678
73	NC_000914	GGC	2	6	9164	9169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16519678
74	NC_000914	GCG	2	6	9170	9175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16519678
75	NC_000914	TGT	2	6	9333	9338	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16519677
76	NC_000914	GTT	2	6	9462	9467	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16519677
77	NC_000914	CGG	2	6	9665	9670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16519677
78	NC_000914	CCG	2	6	9689	9694	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16519677
79	NC_000914	TTG	2	6	9781	9786	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16519677
80	NC_000914	CGT	2	6	9801	9806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16519677
81	NC_000914	TGC	2	6	9962	9967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16519677
82	NC_000914	AGC	2	6	9976	9981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16519677
83	NC_000914	ATC	2	6	10022	10027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16519677
84	NC_000914	GTC	2	6	10051	10056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16519677
85	NC_000914	TGG	2	6	10113	10118	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16519677
86	NC_000914	CGG	2	6	10211	10216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16519677
87	NC_000914	ATC	2	6	10237	10242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16519677
88	NC_000914	GAA	2	6	10246	10251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16519677
89	NC_000914	TGG	2	6	10260	10265	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16519677
90	NC_000914	CGC	2	6	10409	10414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16519677
91	NC_000914	ATC	2	6	11054	11059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16519676
92	NC_000914	GAA	2	6	11117	11122	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16519676
93	NC_000914	CGA	2	6	11134	11139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16519676
94	NC_000914	GAC	2	6	11164	11169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16519676
95	NC_000914	GAC	2	6	11258	11263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16519676
96	NC_000914	GTC	2	6	11348	11353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16519676
97	NC_000914	CGG	2	6	11382	11387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16519676
98	NC_000914	GCC	2	6	11416	11421	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16519676
99	NC_000914	CGA	3	9	11494	11502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16519676
100	NC_000914	AGC	2	6	11669	11674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16519676
101	NC_000914	GAC	2	6	11681	11686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16519676
102	NC_000914	GCA	2	6	11868	11873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16519676
103	NC_000914	GAT	2	6	11881	11886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16519676
104	NC_000914	ATC	2	6	11930	11935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16519676
105	NC_000914	GGT	2	6	12104	12109	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16519676
106	NC_000914	GGC	2	6	12191	12196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16519676
107	NC_000914	AAG	2	6	12254	12259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16519676
108	NC_000914	ACT	2	6	12270	12275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16519676
109	NC_000914	GAA	2	6	12385	12390	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16519676
110	NC_000914	TGC	2	6	12402	12407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16519676
111	NC_000914	TTG	2	6	12534	12539	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16519676
112	NC_000914	CGA	2	6	12541	12546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16519676
113	NC_000914	AAG	2	6	12551	12556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16519676
114	NC_000914	CAA	2	6	12595	12600	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16519676
115	NC_000914	GGC	2	6	12612	12617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16519676
116	NC_000914	TTC	2	6	12738	12743	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16519676
117	NC_000914	GGC	2	6	12792	12797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16519676
118	NC_000914	TGA	2	6	12805	12810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16519676
119	NC_000914	GCG	2	6	12816	12821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16519676
120	NC_000914	AGA	2	6	12893	12898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16519675
121	NC_000914	GAG	2	6	13267	13272	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16519675
122	NC_000914	AAG	2	6	13378	13383	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16519675
123	NC_000914	AGA	2	6	13385	13390	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16519675
124	NC_000914	TAT	2	6	13419	13424	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16519675
125	NC_000914	GTG	2	6	13433	13438	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16519675
126	NC_000914	GAC	2	6	13450	13455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16519675
127	NC_000914	CGA	2	6	13661	13666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16519675
128	NC_000914	TGC	2	6	13735	13740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16519675
129	NC_000914	GCG	2	6	13741	13746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16519675
130	NC_000914	GTG	2	6	13784	13789	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16519675
131	NC_000914	CCT	2	6	13851	13856	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16519675
132	NC_000914	GCG	2	6	13966	13971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16519675
133	NC_000914	GAC	2	6	14103	14108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16519675
134	NC_000914	CAT	2	6	14223	14228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16519675
135	NC_000914	GAA	2	6	14346	14351	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16519675
136	NC_000914	TTA	2	6	14422	14427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16519674
137	NC_000914	GCT	2	6	14458	14463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16519674
138	NC_000914	TGG	2	6	14470	14475	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16519674
139	NC_000914	CGC	2	6	14592	14597	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16519674
140	NC_000914	GCC	2	6	14626	14631	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16519674
141	NC_000914	TCA	2	6	14771	14776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16519673
142	NC_000914	TCG	2	6	14803	14808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16519673
143	NC_000914	GAA	2	6	14964	14969	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16519673
144	NC_000914	ACG	2	6	15070	15075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16519673
145	NC_000914	CAC	2	6	15122	15127	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16519673
146	NC_000914	CGA	2	6	15272	15277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16519673
147	NC_000914	TGG	2	6	15400	15405	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16519673
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149	NC_000914	GGC	2	6	15582	15587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16519673
150	NC_000914	TCG	3	9	15653	15661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16519673
151	NC_000914	GAT	2	6	15665	15670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16519673
152	NC_000914	CGC	2	6	15671	15676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16519673
153	NC_000914	TGC	2	6	15788	15793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16519673
154	NC_000914	GTG	2	6	15813	15818	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16519673
155	NC_000914	CGG	2	6	16030	16035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16519673
156	NC_000914	CCG	2	6	16264	16269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16519673
157	NC_000914	GCT	2	6	16292	16297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16519673
158	NC_000914	ATC	2	6	16405	16410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16519673
159	NC_000914	CGC	2	6	16425	16430	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16519673
160	NC_000914	CGG	2	6	16514	16519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16519673
161	NC_000914	ACC	2	6	16545	16550	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16519673
162	NC_000914	CCG	2	6	16591	16596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16519673
163	NC_000914	GGC	2	6	16631	16636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16519673
164	NC_000914	TCG	2	6	16660	16665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16519673
165	NC_000914	CCT	2	6	16727	16732	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16519673
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171	NC_000914	TGG	2	6	17340	17345	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16519673
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189	NC_000914	CGC	2	6	18263	18268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16519673
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249	NC_000914	GCA	2	6	24147	24152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16519669
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253	NC_000914	CAT	2	6	24827	24832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16519668
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257	NC_000914	GCC	2	6	25125	25130	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16519668
258	NC_000914	GCC	2	6	25195	25200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16519668
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500	NC_000914	CCA	2	6	50697	50702	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16519646

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