MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Sinorhizobium fredii NGR234 plasmid pNGR234a

Total Repeats: 247

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_000914	G	6	6	9232	9237	0 %	0 %	100 %	0 %	16519678
2	NC_000914	T	6	6	9257	9262	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_000914	G	6	6	17389	17394	0 %	0 %	100 %	0 %	16519673
4	NC_000914	T	6	6	22003	22008	0 %	100 %	0 %	0 %	16519948
5	NC_000914	T	6	6	25203	25208	0 %	100 %	0 %	0 %	16519668
6	NC_000914	T	6	6	25287	25292	0 %	100 %	0 %	0 %	16519668
7	NC_000914	A	6	6	25433	25438	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_000914	C	6	6	27649	27654	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
9	NC_000914	G	6	6	29672	29677	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
10	NC_000914	A	7	7	29835	29841	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_000914	T	7	7	30101	30107	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_000914	C	6	6	31119	31124	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
13	NC_000914	G	6	6	31349	31354	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
14	NC_000914	A	6	6	31428	31433	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_000914	A	6	6	33062	33067	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_000914	A	9	9	34884	34892	100 %	0 %	0 %	0 %	16519661
17	NC_000914	A	6	6	38165	38170	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_000914	A	8	8	38736	38743	100 %	0 %	0 %	0 %	16519658
19	NC_000914	T	6	6	39188	39193	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_000914	A	6	6	41105	41110	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_000914	A	7	7	42785	42791	100 %	0 %	0 %	0 %	16519652
22	NC_000914	A	6	6	43849	43854	100 %	0 %	0 %	0 %	16519651
23	NC_000914	A	7	7	44905	44911	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_000914	A	7	7	46869	46875	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_000914	T	6	6	48703	48708	0 %	100 %	0 %	0 %	16519647
26	NC_000914	T	6	6	49928	49933	0 %	100 %	0 %	0 %	16519646
27	NC_000914	G	7	7	51541	51547	0 %	0 %	100 %	0 %	16519645
28	NC_000914	G	6	6	51998	52003	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
29	NC_000914	A	6	6	52240	52245	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_000914	A	6	6	52397	52402	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_000914	A	6	6	52602	52607	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_000914	A	6	6	55161	55166	100 %	0 %	0 %	0 %	16519642
33	NC_000914	A	6	6	58245	58250	100 %	0 %	0 %	0 %	16519641
34	NC_000914	A	6	6	60570	60575	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_000914	C	6	6	61577	61582	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
36	NC_000914	C	7	7	65879	65885	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
37	NC_000914	G	6	6	66002	66007	0 %	0 %	100 %	0 %	16520053
38	NC_000914	A	6	6	70817	70822	100 %	0 %	0 %	0 %	16520050
39	NC_000914	C	6	6	73444	73449	0 %	0 %	0 %	100 %	255767012
40	NC_000914	A	7	7	73585	73591	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_000914	A	7	7	73750	73756	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_000914	T	7	7	75039	75045	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_000914	A	6	6	75371	75376	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_000914	C	6	6	83848	83853	0 %	0 %	0 %	100 %	16520037
45	NC_000914	C	7	7	85600	85606	0 %	0 %	0 %	100 %	16520035
46	NC_000914	T	6	6	85880	85885	0 %	100 %	0 %	0 %	16520035
47	NC_000914	T	6	6	88448	88453	0 %	100 %	0 %	0 %	16520033
48	NC_000914	A	6	6	90803	90808	100 %	0 %	0 %	0 %	16520031
49	NC_000914	C	6	6	91052	91057	0 %	0 %	0 %	100 %	16520031
50	NC_000914	A	7	7	98683	98689	100 %	0 %	0 %	0 %	16520025
51	NC_000914	T	6	6	100834	100839	0 %	100 %	0 %	0 %	16520024
52	NC_000914	C	6	6	102927	102932	0 %	0 %	0 %	100 %	16520023
53	NC_000914	T	6	6	104189	104194	0 %	100 %	0 %	0 %	16520020
54	NC_000914	A	6	6	104595	104600	100 %	0 %	0 %	0 %	16520019
55	NC_000914	T	6	6	108253	108258	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_000914	C	6	6	110021	110026	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
57	NC_000914	T	6	6	112774	112779	0 %	100 %	0 %	0 %	16520013
58	NC_000914	T	7	7	114312	114318	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_000914	A	6	6	115300	115305	100 %	0 %	0 %	0 %	16520012
60	NC_000914	A	6	6	115924	115929	100 %	0 %	0 %	0 %	16520012
61	NC_000914	A	6	6	117006	117011	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_000914	T	6	6	117595	117600	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_000914	C	6	6	126938	126943	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
64	NC_000914	G	6	6	130548	130553	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
65	NC_000914	C	6	6	130733	130738	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
66	NC_000914	A	6	6	131916	131921	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_000914	A	8	8	132510	132517	100 %	0 %	0 %	0 %	16519999
68	NC_000914	T	7	7	133509	133515	0 %	100 %	0 %	0 %	16519998
69	NC_000914	T	6	6	133543	133548	0 %	100 %	0 %	0 %	16519997
70	NC_000914	A	6	6	134364	134369	100 %	0 %	0 %	0 %	16519996
71	NC_000914	T	6	6	140131	140136	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_000914	T	6	6	142327	142332	0 %	100 %	0 %	0 %	16519991
73	NC_000914	G	6	6	146161	146166	0 %	0 %	100 %	0 %	16519988
74	NC_000914	C	6	6	146561	146566	0 %	0 %	0 %	100 %	16519987
75	NC_000914	C	6	6	148827	148832	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
76	NC_000914	T	6	6	149196	149201	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_000914	A	7	7	149227	149233	100 %	0 %	0 %	0 %	16519985
78	NC_000914	C	7	7	151383	151389	0 %	0 %	0 %	100 %	16519983
79	NC_000914	A	6	6	155752	155757	100 %	0 %	0 %	0 %	16519979
80	NC_000914	A	7	7	156626	156632	100 %	0 %	0 %	0 %	16519979
81	NC_000914	T	6	6	156823	156828	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_000914	A	6	6	158750	158755	100 %	0 %	0 %	0 %	16519976
83	NC_000914	G	6	6	158925	158930	0 %	0 %	100 %	0 %	16519976
84	NC_000914	T	6	6	160863	160868	0 %	100 %	0 %	0 %	16519974
85	NC_000914	A	6	6	162435	162440	100 %	0 %	0 %	0 %	16519973
86	NC_000914	A	6	6	162936	162941	100 %	0 %	0 %	0 %	16519972
87	NC_000914	C	6	6	163251	163256	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
88	NC_000914	G	7	7	165156	165162	0 %	0 %	100 %	0 %	16519970
89	NC_000914	C	7	7	165940	165946	0 %	0 %	0 %	100 %	16519970
90	NC_000914	C	7	7	166557	166563	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
91	NC_000914	C	7	7	172047	172053	0 %	0 %	0 %	100 %	16519966
92	NC_000914	T	6	6	176729	176734	0 %	100 %	0 %	0 %	16519961
93	NC_000914	T	7	7	177420	177426	0 %	100 %	0 %	0 %	16519961
94	NC_000914	T	6	6	178244	178249	0 %	100 %	0 %	0 %	16519960
95	NC_000914	A	8	8	178365	178372	100 %	0 %	0 %	0 %	16519960
96	NC_000914	A	6	6	183924	183929	100 %	0 %	0 %	0 %	16519955
97	NC_000914	C	6	6	185115	185120	0 %	0 %	0 %	100 %	16519954
98	NC_000914	T	6	6	185538	185543	0 %	100 %	0 %	0 %	16519954
99	NC_000914	A	6	6	192310	192315	100 %	0 %	0 %	0 %	16519670
100	NC_000914	T	8	8	193627	193634	0 %	100 %	0 %	0 %	16519947
101	NC_000914	C	6	6	196236	196241	0 %	0 %	0 %	100 %	16519946
102	NC_000914	C	6	6	202119	202124	0 %	0 %	0 %	100 %	16519941
103	NC_000914	T	6	6	202221	202226	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_000914	C	7	7	206316	206322	0 %	0 %	0 %	100 %	16519940
105	NC_000914	T	6	6	208442	208447	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_000914	A	6	6	215284	215289	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_000914	T	6	6	215450	215455	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_000914	T	6	6	217628	217633	0 %	100 %	0 %	0 %	16519933
109	NC_000914	C	6	6	218236	218241	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
110	NC_000914	T	6	6	219754	219759	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_000914	G	7	7	221664	221670	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
112	NC_000914	T	7	7	221941	221947	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_000914	C	6	6	230033	230038	0 %	0 %	0 %	100 %	16519924
114	NC_000914	C	6	6	235694	235699	0 %	0 %	0 %	100 %	16519919
115	NC_000914	A	7	7	242125	242131	100 %	0 %	0 %	0 %	16519915
116	NC_000914	A	6	6	242598	242603	100 %	0 %	0 %	0 %	16519915
117	NC_000914	G	6	6	243970	243975	0 %	0 %	100 %	0 %	16519914
118	NC_000914	T	6	6	247061	247066	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_000914	T	6	6	250414	250419	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_000914	T	6	6	256070	256075	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_000914	G	6	6	256460	256465	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
122	NC_000914	G	6	6	256818	256823	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
123	NC_000914	C	6	6	258066	258071	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
124	NC_000914	C	6	6	261806	261811	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
125	NC_000914	T	6	6	262856	262861	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_000914	A	9	9	266754	266762	100 %	0 %	0 %	0 %	16519903
127	NC_000914	G	6	6	272591	272596	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
128	NC_000914	A	6	6	273230	273235	100 %	0 %	0 %	0 %	16519897
129	NC_000914	T	6	6	273856	273861	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_000914	A	6	6	276489	276494	100 %	0 %	0 %	0 %	16519895
131	NC_000914	T	6	6	276550	276555	0 %	100 %	0 %	0 %	16519895
132	NC_000914	C	6	6	277362	277367	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
133	NC_000914	T	6	6	278340	278345	0 %	100 %	0 %	0 %	16519894
134	NC_000914	C	6	6	280826	280831	0 %	0 %	0 %	100 %	16519892
135	NC_000914	A	6	6	280904	280909	100 %	0 %	0 %	0 %	16519892
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137	NC_000914	G	7	7	286895	286901	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
138	NC_000914	C	6	6	286922	286927	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
139	NC_000914	A	9	9	289904	289912	100 %	0 %	0 %	0 %	16519883
140	NC_000914	C	6	6	295223	295228	0 %	0 %	0 %	100 %	16519880
141	NC_000914	C	6	6	296781	296786	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
142	NC_000914	T	6	6	297297	297302	0 %	100 %	0 %	0 %	16519877
143	NC_000914	C	6	6	297328	297333	0 %	0 %	0 %	100 %	16519877
144	NC_000914	A	6	6	300208	300213	100 %	0 %	0 %	0 %	16519876
145	NC_000914	T	6	6	300697	300702	0 %	100 %	0 %	0 %	16519876
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.