MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Coding Repeats of Sinorhizobium fredii NGR234 plasmid pNGR234a

Total Repeats: 148

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_000914	G	6	6	9232	9237	0 %	0 %	100 %	0 %	16519678
2	NC_000914	G	6	6	17389	17394	0 %	0 %	100 %	0 %	16519673
3	NC_000914	T	6	6	22003	22008	0 %	100 %	0 %	0 %	16519948
4	NC_000914	T	6	6	25203	25208	0 %	100 %	0 %	0 %	16519668
5	NC_000914	T	6	6	25287	25292	0 %	100 %	0 %	0 %	16519668
6	NC_000914	A	9	9	34884	34892	100 %	0 %	0 %	0 %	16519661
7	NC_000914	A	8	8	38736	38743	100 %	0 %	0 %	0 %	16519658
8	NC_000914	A	7	7	42785	42791	100 %	0 %	0 %	0 %	16519652
9	NC_000914	A	6	6	43849	43854	100 %	0 %	0 %	0 %	16519651
10	NC_000914	T	6	6	48703	48708	0 %	100 %	0 %	0 %	16519647
11	NC_000914	T	6	6	49928	49933	0 %	100 %	0 %	0 %	16519646
12	NC_000914	G	7	7	51541	51547	0 %	0 %	100 %	0 %	16519645
13	NC_000914	A	6	6	55161	55166	100 %	0 %	0 %	0 %	16519642
14	NC_000914	A	6	6	58245	58250	100 %	0 %	0 %	0 %	16519641
15	NC_000914	G	6	6	66002	66007	0 %	0 %	100 %	0 %	16520053
16	NC_000914	A	6	6	70817	70822	100 %	0 %	0 %	0 %	16520050
17	NC_000914	C	6	6	73444	73449	0 %	0 %	0 %	100 %	255767012
18	NC_000914	C	6	6	83848	83853	0 %	0 %	0 %	100 %	16520037
19	NC_000914	C	7	7	85600	85606	0 %	0 %	0 %	100 %	16520035
20	NC_000914	T	6	6	85880	85885	0 %	100 %	0 %	0 %	16520035
21	NC_000914	T	6	6	88448	88453	0 %	100 %	0 %	0 %	16520033
22	NC_000914	A	6	6	90803	90808	100 %	0 %	0 %	0 %	16520031
23	NC_000914	C	6	6	91052	91057	0 %	0 %	0 %	100 %	16520031
24	NC_000914	A	7	7	98683	98689	100 %	0 %	0 %	0 %	16520025
25	NC_000914	T	6	6	100834	100839	0 %	100 %	0 %	0 %	16520024
26	NC_000914	C	6	6	102927	102932	0 %	0 %	0 %	100 %	16520023
27	NC_000914	T	6	6	104189	104194	0 %	100 %	0 %	0 %	16520020
28	NC_000914	A	6	6	104595	104600	100 %	0 %	0 %	0 %	16520019
29	NC_000914	T	6	6	112774	112779	0 %	100 %	0 %	0 %	16520013
30	NC_000914	A	6	6	115300	115305	100 %	0 %	0 %	0 %	16520012
31	NC_000914	A	6	6	115924	115929	100 %	0 %	0 %	0 %	16520012
32	NC_000914	A	8	8	132510	132517	100 %	0 %	0 %	0 %	16519999
33	NC_000914	T	7	7	133509	133515	0 %	100 %	0 %	0 %	16519998
34	NC_000914	T	6	6	133543	133548	0 %	100 %	0 %	0 %	16519997
35	NC_000914	A	6	6	134364	134369	100 %	0 %	0 %	0 %	16519996
36	NC_000914	T	6	6	142327	142332	0 %	100 %	0 %	0 %	16519991
37	NC_000914	G	6	6	146161	146166	0 %	0 %	100 %	0 %	16519988
38	NC_000914	C	6	6	146561	146566	0 %	0 %	0 %	100 %	16519987
39	NC_000914	A	7	7	149227	149233	100 %	0 %	0 %	0 %	16519985
40	NC_000914	C	7	7	151383	151389	0 %	0 %	0 %	100 %	16519983
41	NC_000914	A	6	6	155752	155757	100 %	0 %	0 %	0 %	16519979
42	NC_000914	A	7	7	156626	156632	100 %	0 %	0 %	0 %	16519979
43	NC_000914	A	6	6	158750	158755	100 %	0 %	0 %	0 %	16519976
44	NC_000914	G	6	6	158925	158930	0 %	0 %	100 %	0 %	16519976
45	NC_000914	T	6	6	160863	160868	0 %	100 %	0 %	0 %	16519974
46	NC_000914	A	6	6	162435	162440	100 %	0 %	0 %	0 %	16519973
47	NC_000914	A	6	6	162936	162941	100 %	0 %	0 %	0 %	16519972
48	NC_000914	G	7	7	165156	165162	0 %	0 %	100 %	0 %	16519970
49	NC_000914	C	7	7	165940	165946	0 %	0 %	0 %	100 %	16519970
50	NC_000914	C	7	7	172047	172053	0 %	0 %	0 %	100 %	16519966
51	NC_000914	T	6	6	176729	176734	0 %	100 %	0 %	0 %	16519961
52	NC_000914	T	7	7	177420	177426	0 %	100 %	0 %	0 %	16519961
53	NC_000914	T	6	6	178244	178249	0 %	100 %	0 %	0 %	16519960
54	NC_000914	A	8	8	178365	178372	100 %	0 %	0 %	0 %	16519960
55	NC_000914	A	6	6	183924	183929	100 %	0 %	0 %	0 %	16519955
56	NC_000914	C	6	6	185115	185120	0 %	0 %	0 %	100 %	16519954
57	NC_000914	T	6	6	185538	185543	0 %	100 %	0 %	0 %	16519954
58	NC_000914	A	6	6	192310	192315	100 %	0 %	0 %	0 %	16519670
59	NC_000914	T	8	8	193627	193634	0 %	100 %	0 %	0 %	16519947
60	NC_000914	C	6	6	196236	196241	0 %	0 %	0 %	100 %	16519946
61	NC_000914	C	6	6	202119	202124	0 %	0 %	0 %	100 %	16519941
62	NC_000914	C	7	7	206316	206322	0 %	0 %	0 %	100 %	16519940
63	NC_000914	T	6	6	217628	217633	0 %	100 %	0 %	0 %	16519933
64	NC_000914	C	6	6	230033	230038	0 %	0 %	0 %	100 %	16519924
65	NC_000914	C	6	6	235694	235699	0 %	0 %	0 %	100 %	16519919
66	NC_000914	A	7	7	242125	242131	100 %	0 %	0 %	0 %	16519915
67	NC_000914	A	6	6	242598	242603	100 %	0 %	0 %	0 %	16519915
68	NC_000914	G	6	6	243970	243975	0 %	0 %	100 %	0 %	16519914
69	NC_000914	A	9	9	266754	266762	100 %	0 %	0 %	0 %	16519903
70	NC_000914	A	6	6	273230	273235	100 %	0 %	0 %	0 %	16519897
71	NC_000914	A	6	6	276489	276494	100 %	0 %	0 %	0 %	16519895
72	NC_000914	T	6	6	276550	276555	0 %	100 %	0 %	0 %	16519895
73	NC_000914	T	6	6	278340	278345	0 %	100 %	0 %	0 %	16519894
74	NC_000914	C	6	6	280826	280831	0 %	0 %	0 %	100 %	16519892
75	NC_000914	A	6	6	280904	280909	100 %	0 %	0 %	0 %	16519892
76	NC_000914	T	6	6	284045	284050	0 %	100 %	0 %	0 %	16519888
77	NC_000914	A	9	9	289904	289912	100 %	0 %	0 %	0 %	16519883
78	NC_000914	C	6	6	295223	295228	0 %	0 %	0 %	100 %	16519880
79	NC_000914	T	6	6	297297	297302	0 %	100 %	0 %	0 %	16519877
80	NC_000914	C	6	6	297328	297333	0 %	0 %	0 %	100 %	16519877
81	NC_000914	A	6	6	300208	300213	100 %	0 %	0 %	0 %	16519876
82	NC_000914	T	6	6	300697	300702	0 %	100 %	0 %	0 %	16519876
83	NC_000914	T	7	7	301717	301723	0 %	100 %	0 %	0 %	16519875
84	NC_000914	T	6	6	302388	302393	0 %	100 %	0 %	0 %	16519874
85	NC_000914	T	6	6	303948	303953	0 %	100 %	0 %	0 %	16519874
86	NC_000914	A	6	6	303982	303987	100 %	0 %	0 %	0 %	16519874
87	NC_000914	G	6	6	305527	305532	0 %	0 %	100 %	0 %	16519873
88	NC_000914	A	7	7	306231	306237	100 %	0 %	0 %	0 %	16519871
89	NC_000914	T	6	6	315737	315742	0 %	100 %	0 %	0 %	16519865
90	NC_000914	T	6	6	315803	315808	0 %	100 %	0 %	0 %	16519865
91	NC_000914	G	6	6	319452	319457	0 %	0 %	100 %	0 %	16519864
92	NC_000914	C	7	7	326731	326737	0 %	0 %	0 %	100 %	16519858
93	NC_000914	C	6	6	330384	330389	0 %	0 %	0 %	100 %	16519855
94	NC_000914	A	7	7	332572	332578	100 %	0 %	0 %	0 %	16519852
95	NC_000914	A	6	6	336277	336282	100 %	0 %	0 %	0 %	16519849
96	NC_000914	G	6	6	341263	341268	0 %	0 %	100 %	0 %	16519846
97	NC_000914	T	6	6	342048	342053	0 %	100 %	0 %	0 %	16519845
98	NC_000914	G	6	6	345631	345636	0 %	0 %	100 %	0 %	16519844
99	NC_000914	C	6	6	350722	350727	0 %	0 %	0 %	100 %	16519842
100	NC_000914	A	7	7	355571	355577	100 %	0 %	0 %	0 %	16519836
101	NC_000914	T	6	6	358709	358714	0 %	100 %	0 %	0 %	16519835
102	NC_000914	C	6	6	360812	360817	0 %	0 %	0 %	100 %	16519834
103	NC_000914	G	6	6	367319	367324	0 %	0 %	100 %	0 %	16519828
104	NC_000914	A	6	6	369717	369722	100 %	0 %	0 %	0 %	16519823
105	NC_000914	T	6	6	370178	370183	0 %	100 %	0 %	0 %	16519822
106	NC_000914	A	6	6	371077	371082	100 %	0 %	0 %	0 %	16519821
107	NC_000914	A	8	8	371152	371159	100 %	0 %	0 %	0 %	16519821
108	NC_000914	C	6	6	371240	371245	0 %	0 %	0 %	100 %	16519821
109	NC_000914	A	6	6	375372	375377	100 %	0 %	0 %	0 %	16519818
110	NC_000914	A	6	6	376417	376422	100 %	0 %	0 %	0 %	16519815
111	NC_000914	G	6	6	377889	377894	0 %	0 %	100 %	0 %	16519814
112	NC_000914	A	6	6	378372	378377	100 %	0 %	0 %	0 %	16519814
113	NC_000914	T	6	6	379650	379655	0 %	100 %	0 %	0 %	16519813
114	NC_000914	A	6	6	382373	382378	100 %	0 %	0 %	0 %	16519811
115	NC_000914	A	7	7	382735	382741	100 %	0 %	0 %	0 %	16519811
116	NC_000914	G	6	6	384118	384123	0 %	0 %	100 %	0 %	16519810
117	NC_000914	T	6	6	386416	386421	0 %	100 %	0 %	0 %	16519807
118	NC_000914	T	6	6	408204	408209	0 %	100 %	0 %	0 %	16519787
119	NC_000914	A	6	6	408930	408935	100 %	0 %	0 %	0 %	16519786
120	NC_000914	C	6	6	409117	409122	0 %	0 %	0 %	100 %	16519786
121	NC_000914	G	6	6	409146	409151	0 %	0 %	100 %	0 %	16519786
122	NC_000914	A	6	6	412910	412915	100 %	0 %	0 %	0 %	16519783
123	NC_000914	A	6	6	418794	418799	100 %	0 %	0 %	0 %	16519779
124	NC_000914	G	6	6	421346	421351	0 %	0 %	100 %	0 %	16519777
125	NC_000914	C	6	6	425805	425810	0 %	0 %	0 %	100 %	16519773
126	NC_000914	C	7	7	429969	429975	0 %	0 %	0 %	100 %	16519769
127	NC_000914	A	6	6	432338	432343	100 %	0 %	0 %	0 %	16519767
128	NC_000914	G	6	6	434783	434788	0 %	0 %	100 %	0 %	16519765
129	NC_000914	A	6	6	446437	446442	100 %	0 %	0 %	0 %	16519756
130	NC_000914	A	7	7	446730	446736	100 %	0 %	0 %	0 %	16519756
131	NC_000914	A	6	6	450595	450600	100 %	0 %	0 %	0 %	16519753
132	NC_000914	T	8	8	450819	450826	0 %	100 %	0 %	0 %	16519753
133	NC_000914	T	6	6	450917	450922	0 %	100 %	0 %	0 %	16519753
134	NC_000914	C	6	6	455137	455142	0 %	0 %	0 %	100 %	16519751
135	NC_000914	G	6	6	467727	467732	0 %	0 %	100 %	0 %	16519742
136	NC_000914	A	6	6	468978	468983	100 %	0 %	0 %	0 %	16519741
137	NC_000914	T	6	6	472271	472276	0 %	100 %	0 %	0 %	16519738
138	NC_000914	A	6	6	474303	474308	100 %	0 %	0 %	0 %	16519737
139	NC_000914	T	6	6	475967	475972	0 %	100 %	0 %	0 %	16519735
140	NC_000914	G	6	6	477962	477967	0 %	0 %	100 %	0 %	16519734
141	NC_000914	C	6	6	495921	495926	0 %	0 %	0 %	100 %	16519720
142	NC_000914	T	6	6	496252	496257	0 %	100 %	0 %	0 %	16519720
143	NC_000914	C	6	6	503885	503890	0 %	0 %	0 %	100 %	16519716
144	NC_000914	T	6	6	520896	520901	0 %	100 %	0 %	0 %	16519702
145	NC_000914	T	6	6	522288	522293	0 %	100 %	0 %	0 %	16519701
146	NC_000914	A	7	7	524745	524751	100 %	0 %	0 %	0 %	16519697
147	NC_000914	C	6	6	528898	528903	0 %	0 %	0 %	100 %	16519692
148	NC_000914	A	6	6	529462	529467	100 %	0 %	0 %	0 %	16519692

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.