MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Escherichia coli str. K-12 substr. MG1655

Total Repeats: 2448

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_000913	CGCTG	2	10	693	702	0 %	20 %	40 %	40 %	16127996
2	NC_000913	ATTGC	2	10	3396	3405	20 %	40 %	20 %	20 %	16127997
3	NC_000913	CGCAG	2	10	8360	8369	20 %	0 %	40 %	40 %	16128002
4	NC_000913	CGTAC	2	10	9788	9797	20 %	20 %	20 %	40 %	16128003
5	NC_000913	CGCGC	2	10	10775	10784	0 %	0 %	40 %	60 %	16128005
6	NC_000913	CCGAT	2	10	17841	17850	20 %	20 %	20 %	40 %	16128013
7	NC_000913	AGCGA	2	10	18229	18238	40 %	0 %	40 %	20 %	16128013
8	NC_000913	CAGTA	2	10	26673	26682	40 %	20 %	20 %	20 %	16128023
9	NC_000913	GCGCT	2	10	28474	28483	0 %	20 %	40 %	40 %	16128025
10	NC_000913	CGATG	2	10	31527	31536	20 %	20 %	40 %	20 %	16128027
11	NC_000913	GCGAA	2	10	32468	32477	40 %	0 %	40 %	20 %	16128027
12	NC_000913	CCGTT	2	10	33362	33371	0 %	40 %	20 %	40 %	16128027
13	NC_000913	CACGG	2	10	33739	33748	20 %	0 %	40 %	40 %	16128027
14	NC_000913	CGAAT	2	10	36449	36458	40 %	20 %	20 %	20 %	221800780
15	NC_000913	CCATG	2	10	37987	37996	20 %	20 %	20 %	40 %	16128032
16	NC_000913	TTCAG	2	10	38169	38178	20 %	40 %	20 %	20 %	16128032
17	NC_000913	CCGTA	2	10	39633	39642	20 %	20 %	20 %	40 %	16128033
18	NC_000913	TTAAA	2	10	40371	40380	60 %	40 %	0 %	0 %	16128033
19	NC_000913	ACCCA	2	10	41114	41123	40 %	0 %	0 %	60 %	16128034
20	NC_000913	TGATC	2	10	42741	42750	20 %	40 %	20 %	20 %	90111081
21	NC_000913	CGGCG	2	10	42990	42999	0 %	0 %	60 %	40 %	90111081
22	NC_000913	AATCA	2	10	43272	43281	60 %	20 %	0 %	20 %	16128036
23	NC_000913	CGGTT	2	10	44227	44236	0 %	40 %	40 %	20 %	16128037
24	NC_000913	TGGCG	2	10	45917	45926	0 %	20 %	60 %	20 %	16128039
25	NC_000913	TGCAC	2	10	47679	47688	20 %	20 %	20 %	40 %	16128040
26	NC_000913	AGGGC	2	10	48764	48773	20 %	0 %	60 %	20 %	16128041
27	NC_000913	GGCGC	2	10	48798	48807	0 %	0 %	60 %	40 %	16128041
28	NC_000913	GAAAC	2	10	49611	49620	60 %	0 %	20 %	20 %	16128041
29	NC_000913	AACGT	2	10	51523	51532	40 %	20 %	20 %	20 %	16128044
30	NC_000913	GCGTC	2	10	54507	54516	0 %	20 %	40 %	40 %	16128047
31	NC_000913	ATGTT	2	10	55321	55330	20 %	60 %	20 %	0 %	16128048
32	NC_000913	CTTCG	2	10	55754	55763	0 %	40 %	20 %	40 %	16128048
33	NC_000913	TGCGT	2	10	56040	56049	0 %	40 %	40 %	20 %	16128048
34	NC_000913	AAAGT	2	10	63165	63174	60 %	20 %	20 %	0 %	16128053
35	NC_000913	GGTGA	2	10	65413	65422	20 %	20 %	60 %	0 %	16128054
36	NC_000913	CAGCG	2	10	66866	66875	20 %	0 %	40 %	40 %	16128056
37	NC_000913	TCGCG	2	10	68136	68145	0 %	20 %	40 %	40 %	16128056
38	NC_000913	GCTGA	2	10	68515	68524	20 %	20 %	40 %	20 %	16128057
39	NC_000913	GATGG	2	10	76502	76511	20 %	20 %	60 %	0 %	16128063
40	NC_000913	CTGGA	2	10	78402	78411	20 %	20 %	40 %	20 %	49175994
41	NC_000913	CTGGT	2	10	81695	81704	0 %	40 %	40 %	20 %	90111082
42	NC_000913	GACCG	2	10	82243	82252	20 %	0 %	40 %	40 %	16128068
43	NC_000913	ATGTT	2	10	84792	84801	20 %	60 %	20 %	0 %	90111083
44	NC_000913	AAAAC	2	10	85207	85216	80 %	0 %	0 %	20 %	90111083
45	NC_000913	ATTCC	2	10	85904	85913	20 %	40 %	0 %	40 %	90111084
46	NC_000913	AGTTC	2	10	90997	91006	20 %	40 %	20 %	20 %	16128075
47	NC_000913	CGTGG	2	10	92370	92379	0 %	20 %	60 %	20 %	16128077
48	NC_000913	TATCG	2	10	92877	92886	20 %	40 %	20 %	20 %	16128077
49	NC_000913	GCCTG	2	10	97209	97218	0 %	20 %	40 %	40 %	16128081
50	NC_000913	ACCGT	2	10	99122	99131	20 %	20 %	20 %	40 %	16128082
51	NC_000913	ATCAG	2	10	100895	100904	40 %	20 %	20 %	20 %	16128084
52	NC_000913	AGCCG	2	10	102663	102672	20 %	0 %	40 %	40 %	16128085
53	NC_000913	GCGCA	2	10	104991	105000	20 %	0 %	40 %	40 %	16128087
54	NC_000913	TGGCG	2	10	105985	105994	0 %	20 %	60 %	20 %	16128088
55	NC_000913	CCGGC	2	10	108955	108964	0 %	0 %	40 %	60 %	16128091
56	NC_000913	CGCGG	2	10	112280	112289	0 %	0 %	60 %	40 %	16128095
57	NC_000913	ATCCC	2	10	114524	114533	20 %	20 %	0 %	60 %	16128099
58	NC_000913	CATCG	2	10	114537	114546	20 %	20 %	20 %	40 %	16128099
59	NC_000913	TAACG	2	10	115231	115240	40 %	20 %	20 %	20 %	16128099
60	NC_000913	ATGCC	2	10	115690	115699	20 %	20 %	20 %	40 %	16128099
61	NC_000913	AATGC	2	10	116973	116982	40 %	20 %	20 %	20 %	16128100
62	NC_000913	TCTGT	2	10	117919	117928	0 %	60 %	20 %	20 %	16128102
63	NC_000913	GCATG	2	10	119012	119021	20 %	20 %	40 %	20 %	16128103
64	NC_000913	AGCAG	2	10	120350	120359	40 %	0 %	40 %	20 %	16128105
65	NC_000913	TCAGC	2	10	121218	121227	20 %	20 %	20 %	40 %	16128105
66	NC_000913	CGAAG	2	10	122265	122274	40 %	0 %	40 %	20 %	16128106
67	NC_000913	ACACG	2	10	122398	122407	40 %	0 %	20 %	40 %	16128106
68	NC_000913	TCGCG	2	10	122659	122668	0 %	20 %	40 %	40 %	16128106
69	NC_000913	GCATC	2	10	122749	122758	20 %	20 %	20 %	40 %	16128106
70	NC_000913	GACTG	2	10	124067	124076	20 %	20 %	40 %	20 %	16128107
71	NC_000913	AGAGC	2	10	124477	124486	40 %	0 %	40 %	20 %	16128107
72	NC_000913	AGGCG	2	10	129749	129758	20 %	0 %	60 %	20 %	16128110
73	NC_000913	AGGCG	2	10	129845	129854	20 %	0 %	60 %	20 %	16128110
74	NC_000913	GGTTG	2	10	130502	130511	0 %	40 %	60 %	0 %	16128110
75	NC_000913	TCTGG	2	10	133148	133157	0 %	40 %	40 %	20 %	16128111
76	NC_000913	GGGCA	2	10	134560	134569	20 %	0 %	60 %	20 %	90111086
77	NC_000913	CAGCG	2	10	134839	134848	20 %	0 %	40 %	40 %	16128113
78	NC_000913	GCGCG	2	10	141033	141042	0 %	0 %	60 %	40 %	16128117
79	NC_000913	CCGTC	2	10	141824	141833	0 %	20 %	20 %	60 %	90111088
80	NC_000913	GTGAA	2	10	141834	141843	40 %	20 %	40 %	0 %	90111088
81	NC_000913	GTTCA	2	10	142221	142230	20 %	40 %	20 %	20 %	16128119
82	NC_000913	ATCCA	2	10	142547	142556	40 %	20 %	0 %	40 %	16128119
83	NC_000913	CTTTA	2	10	143810	143819	20 %	60 %	0 %	20 %	16128121
84	NC_000913	TGGCG	2	10	144037	144046	0 %	20 %	60 %	20 %	16128121
85	NC_000913	TTTCA	2	10	146350	146359	20 %	60 %	0 %	20 %	16128124
86	NC_000913	GGGAG	2	10	147675	147684	20 %	0 %	80 %	0 %	16128125
87	NC_000913	GAAAA	2	10	150469	150478	80 %	0 %	20 %	0 %	16128128
88	NC_000913	CAGAC	2	10	150545	150554	40 %	0 %	20 %	40 %	16128128
89	NC_000913	TTTGC	2	10	156615	156624	0 %	60 %	20 %	20 %	16128134
90	NC_000913	GCGAG	2	10	158423	158432	20 %	0 %	60 %	20 %	162135892
91	NC_000913	GGCGT	2	10	158861	158870	0 %	20 %	60 %	20 %	162135892
92	NC_000913	ATCAG	2	10	159499	159508	40 %	20 %	20 %	20 %	226524698
93	NC_000913	ACCAC	2	10	161764	161773	40 %	0 %	0 %	60 %	90111091
94	NC_000913	GGCGT	2	10	163467	163476	0 %	20 %	60 %	20 %	162135893
95	NC_000913	CGACG	2	10	164506	164515	20 %	0 %	40 %	40 %	162135893
96	NC_000913	CTGCG	2	10	166642	166651	0 %	20 %	40 %	40 %	16128142
97	NC_000913	AAAAC	2	10	168493	168502	80 %	0 %	0 %	20 %	16128143
98	NC_000913	TGGTT	2	10	168750	168759	0 %	60 %	40 %	0 %	16128143
99	NC_000913	AACCT	2	10	170831	170840	40 %	20 %	0 %	40 %	16128145
100	NC_000913	TGGTC	2	10	170873	170882	0 %	40 %	40 %	20 %	16128145
101	NC_000913	TGGCG	2	10	172118	172127	0 %	20 %	60 %	20 %	16128146
102	NC_000913	CGGCG	2	10	172748	172757	0 %	0 %	60 %	40 %	16128146
103	NC_000913	CGGCG	2	10	172829	172838	0 %	0 %	60 %	40 %	16128146
104	NC_000913	TTCCA	2	10	173359	173368	20 %	40 %	0 %	40 %	16128146
105	NC_000913	GGTCC	2	10	177805	177814	0 %	20 %	40 %	40 %	16128151
106	NC_000913	ACGGG	2	10	179722	179731	20 %	0 %	60 %	20 %	16128153
107	NC_000913	GTGAT	2	10	181881	181890	20 %	40 %	40 %	0 %	16128154
108	NC_000913	GTGAT	2	10	182172	182181	20 %	40 %	40 %	0 %	16128154
109	NC_000913	CCACG	2	10	184319	184328	20 %	0 %	20 %	60 %	90111094
110	NC_000913	GCCAG	2	10	186604	186613	20 %	0 %	40 %	40 %	16128160
111	NC_000913	GTTCT	2	10	188045	188054	0 %	60 %	20 %	20 %	16128160
112	NC_000913	CTGAA	2	10	190037	190046	40 %	20 %	20 %	20 %	16128162
113	NC_000913	AAGCG	2	10	190101	190110	40 %	0 %	40 %	20 %	16128162
114	NC_000913	TGGTG	2	10	192007	192016	0 %	40 %	60 %	0 %	16128164
115	NC_000913	TGCAC	2	10	192133	192142	20 %	20 %	20 %	40 %	16128164
116	NC_000913	TGCGC	2	10	192526	192535	0 %	20 %	40 %	40 %	16128164
117	NC_000913	CATGG	2	10	194369	194378	20 %	20 %	40 %	20 %	16128166
118	NC_000913	CAGAT	2	10	195408	195417	40 %	20 %	20 %	20 %	16128167
119	NC_000913	ACTTT	2	10	195541	195550	20 %	60 %	0 %	20 %	16128167
120	NC_000913	GACGT	2	10	199461	199470	20 %	20 %	40 %	20 %	16128170
121	NC_000913	CGACG	2	10	201288	201297	20 %	0 %	40 %	40 %	16128172
122	NC_000913	ATGCC	2	10	203856	203865	20 %	20 %	20 %	40 %	16128175
123	NC_000913	GGATG	2	10	204118	204127	20 %	20 %	60 %	0 %	16128175
124	NC_000913	TGGCC	2	10	205182	205191	0 %	20 %	40 %	40 %	16128177
125	NC_000913	GTAAC	2	10	205925	205934	40 %	20 %	20 %	20 %	16128177
126	NC_000913	AGCCG	2	10	206553	206562	20 %	0 %	40 %	40 %	16128177
127	NC_000913	GGTGG	2	10	206662	206671	0 %	20 %	80 %	0 %	16128177
128	NC_000913	ACGGT	2	10	217718	217727	20 %	20 %	40 %	20 %	16128187
129	NC_000913	TGATT	2	10	220560	220569	20 %	60 %	20 %	0 %	16128190
130	NC_000913	TAATT	2	10	232354	232363	40 %	60 %	0 %	0 %	16128197
131	NC_000913	CGCGG	2	10	236337	236346	0 %	0 %	60 %	40 %	16128202
132	NC_000913	TTTAA	2	10	238714	238723	40 %	60 %	0 %	0 %	145698220
133	NC_000913	CAAAA	2	10	252312	252321	80 %	0 %	0 %	20 %	16128219
134	NC_000913	GATGC	2	10	257136	257145	20 %	20 %	40 %	20 %	16128225
135	NC_000913	TCGCG	2	10	257321	257330	0 %	20 %	40 %	40 %	16128225
136	NC_000913	GTGAT	2	10	261115	261124	20 %	40 %	40 %	0 %	16128228
137	NC_000913	AGCGA	2	10	261677	261686	40 %	0 %	40 %	20 %	16128229
138	NC_000913	TCGCT	2	10	261888	261897	0 %	40 %	20 %	40 %	16128229
139	NC_000913	CGAGG	2	10	268615	268624	20 %	0 %	60 %	20 %	90111103
140	NC_000913	ATGTA	2	10	269392	269401	40 %	40 %	20 %	0 %	16128239
141	NC_000913	ATGGC	2	10	270058	270067	20 %	20 %	40 %	20 %	16128239
142	NC_000913	TGTGC	2	10	276572	276581	0 %	40 %	40 %	20 %	90111105
143	NC_000913	GTTGC	2	10	277351	277360	0 %	40 %	40 %	20 %	16128246
144	NC_000913	TCCGG	2	10	281374	281383	0 %	20 %	40 %	40 %	16128252
145	NC_000913	AACAA	2	10	281919	281928	80 %	0 %	0 %	20 %	16128252
146	NC_000913	TTTAC	2	10	286195	286204	20 %	60 %	0 %	20 %	16128255
147	NC_000913	GGCGG	2	10	286520	286529	0 %	0 %	80 %	20 %	16128255
148	NC_000913	TTCTG	2	10	286611	286620	0 %	60 %	20 %	20 %	16128255
149	NC_000913	CGAGT	2	10	290133	290142	20 %	20 %	40 %	20 %	16128258
150	NC_000913	GACCA	2	10	292484	292493	40 %	0 %	20 %	40 %	16128262
151	NC_000913	TTCAT	2	10	293602	293611	20 %	60 %	0 %	20 %	16128263
152	NC_000913	AACCC	2	10	296005	296014	40 %	0 %	0 %	60 %	16128266
153	NC_000913	AGCGA	2	10	296154	296163	40 %	0 %	40 %	20 %	16128266
154	NC_000913	GTCGG	2	10	299757	299766	0 %	20 %	60 %	20 %	16128269
155	NC_000913	GGCGG	2	10	300083	300092	0 %	0 %	80 %	20 %	16128269
156	NC_000913	CGTGC	2	10	300828	300837	0 %	20 %	40 %	40 %	16128269
157	NC_000913	TTCGC	2	10	300972	300981	0 %	40 %	20 %	40 %	16128270
158	NC_000913	CGTGA	2	10	302019	302028	20 %	20 %	40 %	20 %	16128271
159	NC_000913	TTCTC	2	10	306817	306826	0 %	60 %	0 %	40 %	16128275
160	NC_000913	GCAGT	2	10	308723	308732	20 %	20 %	40 %	20 %	16128276
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162	NC_000913	AATGC	2	10	324074	324083	40 %	20 %	20 %	20 %	90111113
163	NC_000913	ATAAA	2	10	325314	325323	80 %	20 %	0 %	0 %	16128295
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166	NC_000913	TTATT	2	10	336484	336493	20 %	80 %	0 %	0 %	16128304
167	NC_000913	ATGGC	2	10	336730	336739	20 %	20 %	40 %	20 %	16128304
168	NC_000913	CGGCG	2	10	337308	337317	0 %	0 %	60 %	40 %	16128305
169	NC_000913	GGGCA	2	10	338442	338451	20 %	0 %	60 %	20 %	16128306
170	NC_000913	CCGGC	2	10	339316	339325	0 %	0 %	40 %	60 %	16128306
171	NC_000913	TCGCC	2	10	340658	340667	0 %	20 %	20 %	60 %	16128308
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174	NC_000913	GGCCG	2	10	343396	343405	0 %	0 %	60 %	40 %	16128310
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177	NC_000913	GTGGC	2	10	353381	353390	0 %	20 %	60 %	20 %	16128320
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179	NC_000913	TGCGC	2	10	357331	357340	0 %	20 %	40 %	40 %	16128322
180	NC_000913	AATTC	2	10	363467	363476	40 %	40 %	0 %	20 %	16128329
181	NC_000913	CGCAG	2	10	363485	363494	20 %	0 %	40 %	40 %	16128329
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183	NC_000913	TGACC	2	10	365204	365213	20 %	20 %	20 %	40 %	16128329
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197	NC_000913	GCACA	2	10	389326	389335	40 %	0 %	20 %	40 %	90111123
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201	NC_000913	GATGG	2	10	401963	401972	20 %	20 %	60 %	0 %	49176017
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234	NC_000913	TCCGG	2	10	476076	476085	0 %	20 %	40 %	40 %	16128439
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241	NC_000913	AAATA	2	10	499705	499714	80 %	20 %	0 %	0 %	16128460
242	NC_000913	CTTCT	2	10	502009	502018	0 %	60 %	0 %	40 %	16128462
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249	NC_000913	AGACG	2	10	514404	514413	40 %	0 %	40 %	20 %	145698226
250	NC_000913	CAGCG	2	10	517485	517494	20 %	0 %	40 %	40 %	90111142
251	NC_000913	CAGGC	2	10	519615	519624	20 %	0 %	40 %	40 %	16128478
252	NC_000913	GCTGG	2	10	521675	521684	0 %	20 %	60 %	20 %	16128480
253	NC_000913	TATTT	2	10	522273	522282	20 %	80 %	0 %	0 %	16128480
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255	NC_000913	GCCCG	2	10	523458	523467	0 %	0 %	40 %	60 %	16128481
256	NC_000913	TGACC	2	10	525309	525318	20 %	20 %	20 %	40 %	16128481
257	NC_000913	GAAAA	2	10	527283	527292	80 %	0 %	20 %	0 %	16128481
258	NC_000913	AGGTG	2	10	532705	532714	20 %	20 %	60 %	0 %	16128489
259	NC_000913	ATTCC	2	10	534193	534202	20 %	40 %	0 %	40 %	16128491
260	NC_000913	AACGC	2	10	534708	534717	40 %	0 %	20 %	40 %	16128491
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262	NC_000913	GGTTG	2	10	536412	536421	0 %	40 %	60 %	0 %	16128492
263	NC_000913	TGGTT	2	10	537987	537996	0 %	60 %	40 %	0 %	90111144
264	NC_000913	GTCTG	2	10	539284	539293	0 %	40 %	40 %	20 %	16128496
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