MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycoplasma pneumoniae M129 chromosome

Total Repeats: 121

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_000912	TTATT	2	10	600	609	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_000912	AAACA	2	10	656	665	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_000912	CTTTA	2	10	14798	14807	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_000912	ATTAG	2	10	29788	29797	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_000912	AAATA	2	10	46907	46916	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_000912	CAGCG	2	10	47411	47420	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
7	NC_000912	AATTA	2	10	47547	47556	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_000912	CAAGG	2	10	47557	47566	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
9	NC_000912	TTTAC	2	10	61571	61580	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_000912	TAATT	2	10	67090	67099	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_000912	ATGGC	2	10	69027	69036	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
12	NC_000912	TACTT	2	10	69381	69390	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_000912	TCAGT	2	10	69391	69400	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
14	NC_000912	CTTTA	2	10	89288	89297	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_000912	ATAAA	2	10	109287	109296	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_000912	AAGTG	2	10	109875	109884	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
17	NC_000912	TTCTT	2	10	110137	110146	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_000912	ATACA	2	10	110589	110598	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
19	NC_000912	ATTCA	2	10	111434	111443	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
20	NC_000912	TATGA	2	10	115230	115239	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_000912	ACCAC	2	10	117615	117624	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
22	NC_000912	ACCAA	2	10	117990	117999	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
23	NC_000912	TCGTG	2	10	119373	119382	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
24	NC_000912	TTTTC	2	10	119848	119857	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_000912	AAACA	2	10	119880	119889	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
26	NC_000912	CAATA	2	10	120052	120061	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_000912	GAAAA	2	10	120273	120282	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_000912	CTCAT	2	10	122572	122581	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
29	NC_000912	CTAAT	2	10	126963	126972	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NC_000912	CGGGG	2	10	127742	127751	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
31	NC_000912	ACCAA	2	10	128176	128185	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
32	NC_000912	GGTGA	2	10	128205	128214	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
33	NC_000912	TCCCC	2	10	130423	130432	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
34	NC_000912	TATGA	2	10	133267	133276	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_000912	AGTTT	2	10	144901	144910	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_000912	AAAGT	2	10	146613	146622	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_000912	AATTG	2	10	146852	146861	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_000912	GTTTT	2	10	146868	146877	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_000912	ATTTT	2	10	161798	161807	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_000912	TTTGA	2	10	166276	166285	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_000912	AAATT	2	10	166970	166979	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_000912	ACCAC	2	10	168467	168476	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
43	NC_000912	GGTGA	2	10	170769	170778	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
44	NC_000912	ACCAC	2	10	190592	190601	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
45	NC_000912	ATCAA	2	10	192965	192974	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
46	NC_000912	GATCT	2	10	193261	193270	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
47	NC_000912	GATTC	2	10	194493	194502	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
48	NC_000912	AAGCA	2	10	194628	194637	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
49	NC_000912	TTTTC	2	10	195346	195355	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
50	NC_000912	CAGTC	2	10	202310	202319	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
51	NC_000912	AAAGG	2	10	207687	207696	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
52	NC_000912	TTAAG	2	10	239328	239337	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
53	NC_000912	ACCAC	2	10	246020	246029	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
54	NC_000912	CAAAT	2	10	249977	249986	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
55	NC_000912	TTTAA	2	10	262107	262116	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_000912	TCTTT	2	10	287304	287313	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
57	NC_000912	GCAAA	2	10	287371	287380	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
58	NC_000912	GTCTT	2	10	323825	323834	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
59	NC_000912	TGGAA	2	10	333624	333633	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
60	NC_000912	GGAAA	2	10	334727	334736	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
61	NC_000912	AAAAC	2	10	340194	340203	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
62	NC_000912	TCTTT	2	10	343448	343457	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
63	NC_000912	AAAAC	2	10	347119	347128	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
64	NC_000912	CTTAC	2	10	358996	359005	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
65	NC_000912	CTTTA	2	10	359642	359651	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
66	NC_000912	TGAAA	2	10	360091	360100	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_000912	GAATT	2	10	360738	360747	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_000912	GTGAT	2	10	361242	361251	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
69	NC_000912	CAAAA	2	10	372660	372669	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
70	NC_000912	TTAAC	2	10	373072	373081	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
71	NC_000912	AAAGA	2	10	413107	413116	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_000912	GAAAA	2	10	415164	415173	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_000912	TTGTA	2	10	415697	415706	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
74	NC_000912	AGCAA	2	10	415957	415966	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
75	NC_000912	TAAAT	2	10	416020	416029	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_000912	AATTA	2	10	429405	429414	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_000912	TATGA	2	10	438430	438439	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_000912	ACCGT	2	10	444214	444223	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
79	NC_000912	TGCAG	2	10	447391	447400	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
80	NC_000912	TGAGT	2	10	447404	447413	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
81	NC_000912	GGTAA	2	10	447495	447504	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
82	NC_000912	TAAAA	2	10	453214	453223	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_000912	AATTA	2	10	463127	463136	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_000912	TTAAA	2	10	483270	483279	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_000912	CTTTA	2	10	516593	516602	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
86	NC_000912	GGGTT	2	10	529222	529231	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
87	NC_000912	TTACT	2	10	529993	530002	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
88	NC_000912	ATTAC	2	10	530247	530256	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
89	NC_000912	ATCAA	2	10	530783	530792	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
90	NC_000912	GCTTT	2	10	559879	559888	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
91	NC_000912	GTGAT	2	10	560667	560676	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
92	NC_000912	TTTGG	2	10	560807	560816	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
93	NC_000912	TCAAA	2	10	569748	569757	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
94	NC_000912	ATCTT	2	10	588663	588672	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
95	NC_000912	CCCGC	2	10	603962	603971	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
96	NC_000912	TATGA	2	10	611961	611970	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
97	NC_000912	TTTTG	2	10	620358	620367	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
98	NC_000912	AAAAC	2	10	627381	627390	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
99	NC_000912	TTAAT	2	10	637113	637122	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_000912	TTCTA	2	10	637574	637583	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
101	NC_000912	ATCTC	2	10	637819	637828	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
102	NC_000912	AAGAA	2	10	637981	637990	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
103	NC_000912	TTCTT	2	10	638066	638075	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
104	NC_000912	TATTT	2	10	645274	645283	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_000912	TCTCC	2	10	648977	648986	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
106	NC_000912	TTTTA	2	10	651316	651325	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_000912	GTTAT	2	10	659674	659683	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
108	NC_000912	AATTT	2	10	698459	698468	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_000912	AGTGA	2	10	698635	698644	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
110	NC_000912	AAGAT	2	10	700041	700050	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
111	NC_000912	AATTT	2	10	703704	703713	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_000912	TTGCT	2	10	705231	705240	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
113	NC_000912	TTAAA	2	10	751435	751444	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_000912	AATTG	2	10	759700	759709	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
115	NC_000912	TTTTC	2	10	760954	760963	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
116	NC_000912	AACTG	2	10	761470	761479	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
117	NC_000912	TGTTC	2	10	774093	774102	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
118	NC_000912	ATATT	2	10	791456	791465	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_000912	AACAA	2	10	798802	798811	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
120	NC_000912	TTGTT	2	10	798840	798849	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
121	NC_000912	ATCTT	2	10	799517	799526	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.