MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Synechocystis sp. PCC 6803 chromosome

Total Repeats: 8444

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_000911	CCGG	2	8	488	495	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_000911	AATT	2	8	567	574	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_000911	CTCC	2	8	1501	1508	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
4	NC_000911	CAGG	2	8	1643	1650	25 %	0 %	50 %	25 %	16329173
5	NC_000911	TTTG	2	8	2090	2097	0 %	75 %	25 %	0 %	16329173
6	NC_000911	TTCA	2	8	3013	3020	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_000911	ATCG	2	8	3324	3331	25 %	25 %	25 %	25 %	16329175
8	NC_000911	AGGT	2	8	3751	3758	25 %	25 %	50 %	0 %	16329175
9	NC_000911	CAAT	2	8	4303	4310	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_000911	AATT	2	8	5309	5316	50 %	50 %	0 %	0 %	16329176
11	NC_000911	TGGT	2	8	5389	5396	0 %	50 %	50 %	0 %	16329176
12	NC_000911	AGGG	2	8	5415	5422	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
13	NC_000911	ACTG	2	8	6868	6875	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14	NC_000911	GGTT	2	8	7319	7326	0 %	50 %	50 %	0 %	16329178
15	NC_000911	ATCG	2	8	8418	8425	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_000911	AAAG	2	8	8709	8716	75 %	0 %	25 %	0 %	16329179
17	NC_000911	AGCC	2	8	9370	9377	25 %	0 %	25 %	50 %	16329179
18	NC_000911	GGGC	2	8	9587	9594	0 %	0 %	75 %	25 %	16329179
19	NC_000911	ATTT	2	8	10221	10228	25 %	75 %	0 %	0 %	16329179
20	NC_000911	AATT	2	8	10775	10782	50 %	50 %	0 %	0 %	16329180
21	NC_000911	AATT	2	8	10919	10926	50 %	50 %	0 %	0 %	16329180
22	NC_000911	AATT	2	8	11147	11154	50 %	50 %	0 %	0 %	16329180
23	NC_000911	GGAA	2	8	11417	11424	50 %	0 %	50 %	0 %	16329180
24	NC_000911	ACTG	2	8	12427	12434	25 %	25 %	25 %	25 %	16329180
25	NC_000911	CCTA	2	8	13483	13490	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_000911	TCAA	2	8	14045	14052	50 %	25 %	0 %	25 %	16329182
27	NC_000911	TTGG	2	8	14076	14083	0 %	50 %	50 %	0 %	16329182
28	NC_000911	GGTT	2	8	14142	14149	0 %	50 %	50 %	0 %	16329182
29	NC_000911	TTTC	2	8	14404	14411	0 %	75 %	0 %	25 %	16329182
30	NC_000911	ATTG	2	8	14580	14587	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_000911	TGTT	2	8	14607	14614	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_000911	TTAC	2	8	14716	14723	25 %	50 %	0 %	25 %	16329183
33	NC_000911	TATT	2	8	14741	14748	25 %	75 %	0 %	0 %	16329183
34	NC_000911	TCCC	2	8	14777	14784	0 %	25 %	0 %	75 %	16329183
35	NC_000911	TCCT	2	8	15024	15031	0 %	50 %	0 %	50 %	16329183
36	NC_000911	TCAA	2	8	16832	16839	50 %	25 %	0 %	25 %	16329185
37	NC_000911	ATTT	2	8	17346	17353	25 %	75 %	0 %	0 %	16329185
38	NC_000911	GCAG	2	8	17381	17388	25 %	0 %	50 %	25 %	16329185
39	NC_000911	TTCA	2	8	17757	17764	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_000911	TGGG	2	8	17780	17787	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
41	NC_000911	CAAA	2	8	18536	18543	75 %	0 %	0 %	25 %	16329186
42	NC_000911	GTCA	2	8	19251	19258	25 %	25 %	25 %	25 %	16329186
43	NC_000911	TCAA	2	8	19672	19679	50 %	25 %	0 %	25 %	16329186
44	NC_000911	TCTT	2	8	20430	20437	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_000911	TTTG	2	8	20568	20575	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_000911	CCAA	2	8	21424	21431	50 %	0 %	0 %	50 %	16329187
47	NC_000911	CAGC	2	8	21485	21492	25 %	0 %	25 %	50 %	16329187
48	NC_000911	TAGG	2	8	21960	21967	25 %	25 %	50 %	0 %	16329188
49	NC_000911	TTGG	2	8	22191	22198	0 %	50 %	50 %	0 %	16329188
50	NC_000911	TTTC	2	8	22509	22516	0 %	75 %	0 %	25 %	16329188
51	NC_000911	TGGT	2	8	22538	22545	0 %	50 %	50 %	0 %	16329188
52	NC_000911	TACA	2	8	22881	22888	50 %	25 %	0 %	25 %	16329188
53	NC_000911	ATTT	2	8	23120	23127	25 %	75 %	0 %	0 %	16329188
54	NC_000911	ATTA	2	8	23134	23141	50 %	50 %	0 %	0 %	16329189
55	NC_000911	ATTG	2	8	24231	24238	25 %	50 %	25 %	0 %	16329190
56	NC_000911	AAAG	2	8	24387	24394	75 %	0 %	25 %	0 %	16329190
57	NC_000911	AGGT	2	8	24691	24698	25 %	25 %	50 %	0 %	16329190
58	NC_000911	GATC	2	8	25056	25063	25 %	25 %	25 %	25 %	16329190
59	NC_000911	ACTG	2	8	25335	25342	25 %	25 %	25 %	25 %	16329191
60	NC_000911	TGTT	2	8	25989	25996	0 %	75 %	25 %	0 %	16329191
61	NC_000911	AGAA	2	8	26336	26343	75 %	0 %	25 %	0 %	16329191
62	NC_000911	ATTA	2	8	26547	26554	50 %	50 %	0 %	0 %	16329191
63	NC_000911	ATTA	2	8	26889	26896	50 %	50 %	0 %	0 %	16329191
64	NC_000911	ATTG	2	8	27041	27048	25 %	50 %	25 %	0 %	16329191
65	NC_000911	AATT	2	8	27588	27595	50 %	50 %	0 %	0 %	16329191
66	NC_000911	ATTC	2	8	27698	27705	25 %	50 %	0 %	25 %	16329191
67	NC_000911	GCGA	2	8	27808	27815	25 %	0 %	50 %	25 %	16329191
68	NC_000911	TAAT	2	8	27865	27872	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_000911	GGAC	2	8	27913	27920	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
70	NC_000911	AAGG	2	8	28252	28259	50 %	0 %	50 %	0 %	16329192
71	NC_000911	TAAA	2	8	28407	28414	75 %	25 %	0 %	0 %	16329192
72	NC_000911	TTAA	2	8	28537	28544	50 %	50 %	0 %	0 %	16329192
73	NC_000911	ACTA	2	8	28605	28612	50 %	25 %	0 %	25 %	16329192
74	NC_000911	TTTA	2	8	29332	29339	25 %	75 %	0 %	0 %	16329193
75	NC_000911	GTTA	2	8	29365	29372	25 %	50 %	25 %	0 %	16329193
76	NC_000911	TAAA	2	8	29479	29486	75 %	25 %	0 %	0 %	16329193
77	NC_000911	GAGG	2	8	30583	30590	25 %	0 %	75 %	0 %	16329194
78	NC_000911	GATA	2	8	30654	30661	50 %	25 %	25 %	0 %	16329194
79	NC_000911	AAAT	2	8	30790	30797	75 %	25 %	0 %	0 %	16329194
80	NC_000911	TTGA	2	8	31580	31587	25 %	50 %	25 %	0 %	16329194
81	NC_000911	TAGC	2	8	31928	31935	25 %	25 %	25 %	25 %	16329194
82	NC_000911	ATTA	2	8	32487	32494	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_000911	CCAT	2	8	32579	32586	25 %	25 %	0 %	50 %	16329195
84	NC_000911	TTTG	2	8	32675	32682	0 %	75 %	25 %	0 %	16329195
85	NC_000911	AAAT	2	8	32745	32752	75 %	25 %	0 %	0 %	16329195
86	NC_000911	GCTT	2	8	32763	32770	0 %	50 %	25 %	25 %	16329195
87	NC_000911	CCCT	2	8	34372	34379	0 %	25 %	0 %	75 %	16329197
88	NC_000911	AACC	2	8	34607	34614	50 %	0 %	0 %	50 %	16329197
89	NC_000911	AGAA	2	8	35266	35273	75 %	0 %	25 %	0 %	16329197
90	NC_000911	ATTT	2	8	35532	35539	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_000911	TTTA	2	8	35995	36002	25 %	75 %	0 %	0 %	16329198
92	NC_000911	GGAC	2	8	36312	36319	25 %	0 %	50 %	25 %	16329198
93	NC_000911	ATTT	2	8	36408	36415	25 %	75 %	0 %	0 %	16329198
94	NC_000911	GATT	2	8	38120	38127	25 %	50 %	25 %	0 %	16329199
95	NC_000911	TTGG	2	8	38160	38167	0 %	50 %	50 %	0 %	16329199
96	NC_000911	TAGC	2	8	38810	38817	25 %	25 %	25 %	25 %	16329200
97	NC_000911	TGAA	2	8	38972	38979	50 %	25 %	25 %	0 %	16329200
98	NC_000911	ATTT	2	8	39029	39036	25 %	75 %	0 %	0 %	16329200
99	NC_000911	CAAC	2	8	39283	39290	50 %	0 %	0 %	50 %	16329200
100	NC_000911	CCTT	2	8	39361	39368	0 %	50 %	0 %	50 %	16329200
101	NC_000911	TGAA	2	8	39395	39402	50 %	25 %	25 %	0 %	16329200
102	NC_000911	GGTT	2	8	39451	39458	0 %	50 %	50 %	0 %	16329200
103	NC_000911	ACCA	2	8	40104	40111	50 %	0 %	0 %	50 %	16329201
104	NC_000911	GCAG	2	8	40806	40813	25 %	0 %	50 %	25 %	16329201
105	NC_000911	AGTA	2	8	41862	41869	50 %	25 %	25 %	0 %	16329201
106	NC_000911	GCTC	2	8	44042	44049	0 %	25 %	25 %	50 %	16329203
107	NC_000911	AGGC	2	8	44400	44407	25 %	0 %	50 %	25 %	16329203
108	NC_000911	TTTG	2	8	44593	44600	0 %	75 %	25 %	0 %	16329204
109	NC_000911	ACCT	2	8	44727	44734	25 %	25 %	0 %	50 %	16329204
110	NC_000911	CAAT	2	8	44752	44759	50 %	25 %	0 %	25 %	16329204
111	NC_000911	CTAT	2	8	44955	44962	25 %	50 %	0 %	25 %	16329205
112	NC_000911	TTGG	2	8	45004	45011	0 %	50 %	50 %	0 %	16329205
113	NC_000911	TATT	2	8	45027	45034	25 %	75 %	0 %	0 %	16329205
114	NC_000911	GGTA	2	8	46174	46181	25 %	25 %	50 %	0 %	16329205
115	NC_000911	TCGT	2	8	46521	46528	0 %	50 %	25 %	25 %	16329205
116	NC_000911	CTTG	2	8	46650	46657	0 %	50 %	25 %	25 %	16329205
117	NC_000911	TAAT	2	8	46852	46859	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_000911	ATAA	2	8	46981	46988	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_000911	TATT	2	8	47627	47634	25 %	75 %	0 %	0 %	16329206
120	NC_000911	AGCA	2	8	48085	48092	50 %	0 %	25 %	25 %	16329207
121	NC_000911	TTCG	2	8	49414	49421	0 %	50 %	25 %	25 %	16329209
122	NC_000911	CAAC	2	8	49437	49444	50 %	0 %	0 %	50 %	16329209
123	NC_000911	CTTT	2	8	50098	50105	0 %	75 %	0 %	25 %	16329210
124	NC_000911	TTTC	2	8	50744	50751	0 %	75 %	0 %	25 %	16329211
125	NC_000911	TCAG	2	8	50838	50845	25 %	25 %	25 %	25 %	16329211
126	NC_000911	GCCC	2	8	50855	50862	0 %	0 %	25 %	75 %	16329211
127	NC_000911	TGGA	2	8	50889	50896	25 %	25 %	50 %	0 %	16329211
128	NC_000911	TTCC	2	8	51618	51625	0 %	50 %	0 %	50 %	16329211
129	NC_000911	TGGT	2	8	52124	52131	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
130	NC_000911	GAGG	2	8	52482	52489	25 %	0 %	75 %	0 %	16329212
131	NC_000911	TTTC	2	8	52783	52790	0 %	75 %	0 %	25 %	16329212
132	NC_000911	GGTC	2	8	53368	53375	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
133	NC_000911	GCTA	2	8	53452	53459	25 %	25 %	25 %	25 %	16329213
134	NC_000911	AAGG	2	8	53606	53613	50 %	0 %	50 %	0 %	16329213
135	NC_000911	GGTG	2	8	53755	53762	0 %	25 %	75 %	0 %	16329213
136	NC_000911	AACT	2	8	54007	54014	50 %	25 %	0 %	25 %	16329213
137	NC_000911	AATT	2	8	54741	54748	50 %	50 %	0 %	0 %	16329214
138	NC_000911	CTAA	2	8	56552	56559	50 %	25 %	0 %	25 %	16329216
139	NC_000911	GCCT	2	8	56715	56722	0 %	25 %	25 %	50 %	16329216
140	NC_000911	GCTT	2	8	56743	56750	0 %	50 %	25 %	25 %	16329216
141	NC_000911	TCCA	2	8	57883	57890	25 %	25 %	0 %	50 %	16329217
142	NC_000911	GCTT	2	8	57956	57963	0 %	50 %	25 %	25 %	16329217
143	NC_000911	TGAA	2	8	58550	58557	50 %	25 %	25 %	0 %	16329217
144	NC_000911	CCCT	2	8	58890	58897	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
145	NC_000911	GTAT	2	8	59658	59665	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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