MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Synechocystis sp. PCC 6803 chromosome

Total Repeats: 4345

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_000911	GTG	2	6	68	73	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_000911	GCG	2	6	88	93	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_000911	TCT	2	6	167	172	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_000911	GGT	2	6	202	207	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_000911	ATT	2	6	211	216	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_000911	ATC	2	6	393	398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_000911	GTC	2	6	759	764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_000911	ATC	2	6	1565	1570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_000911	GAA	2	6	2128	2133	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_000911	TAT	2	6	2906	2911	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_000911	GCG	2	6	2923	2928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_000911	AGC	2	6	3048	3053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_000911	GTT	2	6	4272	4277	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_000911	TTG	2	6	4423	4428	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_000911	CCA	2	6	5456	5461	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_000911	GTT	2	6	5486	5491	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_000911	ATT	2	6	6924	6929	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_000911	ATT	2	6	6934	6939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_000911	AAT	2	6	8334	8339	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_000911	TCT	2	6	8392	8397	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_000911	AGA	2	6	12681	12686	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_000911	ATT	2	6	15768	15773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_000911	GAA	2	6	15817	15822	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_000911	AAT	2	6	15898	15903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_000911	TTA	2	6	15912	15917	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_000911	TAA	2	6	15929	15934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_000911	TTG	2	6	20420	20425	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_000911	ATT	2	6	21670	21675	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_000911	TTG	2	6	21743	21748	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_000911	AAT	2	6	25147	25152	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_000911	CTC	2	6	25177	25182	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_000911	AGA	2	6	25203	25208	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_000911	TCT	2	6	27960	27965	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_000911	CTG	2	6	29932	29937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_000911	TCA	3	9	29944	29952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_000911	CTC	2	6	32460	32465	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_000911	ATA	2	6	33627	33632	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_000911	TAA	3	9	33811	33819	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_000911	ATA	2	6	33828	33833	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_000911	AAT	2	6	33863	33868	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_000911	ATT	2	6	36682	36687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_000911	CAT	2	6	36707	36712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_000911	ACT	2	6	38564	38569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_000911	CCG	2	6	39688	39693	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_000911	GTT	2	6	39739	39744	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_000911	CCT	2	6	39745	39750	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_000911	GGA	2	6	43438	43443	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_000911	TAG	2	6	43504	43509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_000911	ATG	2	6	46807	46812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_000911	CGA	2	6	46926	46931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_000911	ATT	2	6	46971	46976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_000911	TAT	2	6	48032	48037	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_000911	TTG	2	6	48046	48051	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_000911	GAG	2	6	49870	49875	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_000911	AGA	2	6	51926	51931	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_000911	GGT	2	6	51974	51979	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_000911	TAT	2	6	52229	52234	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_000911	AGT	2	6	52235	52240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_000911	TTG	2	6	53330	53335	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_000911	GGT	2	6	53339	53344	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_000911	AAT	2	6	53396	53401	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_000911	GGA	2	6	54152	54157	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_000911	CCA	2	6	54224	54229	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_000911	ATT	2	6	54342	54347	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_000911	TAC	2	6	54367	54372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_000911	GGA	2	6	54411	54416	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_000911	TAA	2	6	56527	56532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_000911	GTT	3	9	57234	57242	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_000911	ATA	2	6	57259	57264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_000911	GGA	2	6	58908	58913	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_000911	GGT	2	6	60484	60489	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_000911	TCT	2	6	61573	61578	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_000911	TCA	2	6	61598	61603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_000911	ATT	2	6	61684	61689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_000911	AAC	2	6	61778	61783	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_000911	ACC	2	6	67576	67581	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_000911	CAT	2	6	69275	69280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_000911	TGG	2	6	74337	74342	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_000911	CGT	2	6	74920	74925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_000911	ACC	2	6	74956	74961	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_000911	TGC	2	6	75811	75816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_000911	TTG	2	6	77454	77459	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_000911	GGA	2	6	77889	77894	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_000911	GAC	2	6	77931	77936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_000911	TGA	2	6	78021	78026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_000911	TCG	2	6	78134	78139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_000911	ACA	2	6	78168	78173	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_000911	AAT	2	6	78260	78265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_000911	TTC	2	6	78386	78391	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_000911	AGA	2	6	78400	78405	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_000911	CTC	2	6	78419	78424	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
92	NC_000911	ATC	2	6	80931	80936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_000911	ATT	2	6	84085	84090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_000911	TTA	2	6	84099	84104	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_000911	AGG	2	6	84762	84767	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_000911	GAA	2	6	87462	87467	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_000911	CCG	2	6	87523	87528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_000911	ACC	2	6	88697	88702	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_000911	TCA	2	6	90574	90579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_000911	CCT	2	6	90590	90595	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_000911	TTG	2	6	91464	91469	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_000911	AGC	2	6	92693	92698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_000911	TTC	2	6	92705	92710	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_000911	GAA	2	6	92745	92750	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_000911	GGC	2	6	92823	92828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_000911	ACA	2	6	93048	93053	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_000911	CAC	2	6	93084	93089	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_000911	TGG	2	6	95197	95202	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_000911	AAT	2	6	96290	96295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_000911	TCT	3	9	98513	98521	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_000911	CAG	2	6	98522	98527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_000911	CTC	2	6	99223	99228	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_000911	GAG	2	6	99328	99333	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_000911	CGC	2	6	99350	99355	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_000911	TTG	2	6	99362	99367	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_000911	GGA	2	6	101833	101838	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_000911	AGC	2	6	106615	106620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_000911	AAT	2	6	106646	106651	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_000911	TTA	2	6	106702	106707	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_000911	ACC	2	6	106708	106713	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
121	NC_000911	GTC	2	6	107023	107028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_000911	TCG	2	6	107112	107117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_000911	CCG	2	6	107376	107381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
124	NC_000911	GAA	2	6	110799	110804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_000911	CAA	2	6	111263	111268	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_000911	ATA	2	6	111392	111397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_000911	TTA	3	9	111409	111417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_000911	AAT	2	6	111488	111493	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_000911	GAT	2	6	111511	111516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_000911	ACT	2	6	111559	111564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_000911	TGA	2	6	112741	112746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_000911	GTT	2	6	112757	112762	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_000911	ATA	2	6	112826	112831	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_000911	GAA	2	6	112883	112888	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_000911	AAC	2	6	112891	112896	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_000911	CTG	2	6	112956	112961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_000911	AAT	2	6	114746	114751	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_000911	CAC	2	6	114854	114859	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
139	NC_000911	AAT	2	6	117781	117786	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_000911	TAT	2	6	117847	117852	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_000911	CTG	2	6	117856	117861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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