MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Methanocaldococcus jannaschii DSM 2661 chromosome

Total Repeats: 1714

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_000909	AATTT	2	10	84	93	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_000909	AATAG	2	10	698	707	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_000909	TTAAA	2	10	1334	1343	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_000909	TTAAA	2	10	1614	1623	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_000909	TAAAA	2	10	2196	2205	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_000909	TTTAC	2	10	3518	3527	20 %	60 %	0 %	20 %	15668174
7	NC_000909	ATTAT	2	10	4448	4457	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_000909	AAACA	2	10	4470	4479	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_000909	TTTAA	2	10	4571	4580	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_000909	AGATA	2	10	5581	5590	60 %	20 %	20 %	0 %	15668176
11	NC_000909	AATCA	2	10	8415	8424	60 %	20 %	0 %	20 %	15668178
12	NC_000909	AAGAT	2	10	8766	8775	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_000909	AAATA	2	10	9342	9351	80 %	20 %	0 %	0 %	15668179
14	NC_000909	AAGGA	2	10	10410	10419	60 %	0 %	40 %	0 %	15668180
15	NC_000909	ATTGA	2	10	10663	10672	40 %	40 %	20 %	0 %	15668180
16	NC_000909	TAGCG	2	10	10889	10898	20 %	20 %	40 %	20 %	15668181
17	NC_000909	AGAGA	2	10	11935	11944	60 %	0 %	40 %	0 %	15668182
18	NC_000909	GCTTC	2	10	13558	13567	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
19	NC_000909	GGTAT	2	10	14103	14112	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
20	NC_000909	TCCGT	2	10	14995	15004	0 %	40 %	20 %	40 %	15668185
21	NC_000909	AGCGA	2	10	16429	16438	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
22	NC_000909	AAGTT	2	10	16764	16773	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_000909	ATTTA	2	10	17837	17846	40 %	60 %	0 %	0 %	15668189
24	NC_000909	ATATC	2	10	19566	19575	40 %	40 %	0 %	20 %	15668190
25	NC_000909	GAATT	2	10	21645	21654	40 %	40 %	20 %	0 %	15668191
26	NC_000909	AGAGA	2	10	23403	23412	60 %	0 %	40 %	0 %	15668192
27	NC_000909	ATTAT	2	10	24080	24089	40 %	60 %	0 %	0 %	15668193
28	NC_000909	GTGAG	2	10	25272	25281	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
29	NC_000909	AGCGA	2	10	25316	25325	40 %	0 %	40 %	20 %	15668194
30	NC_000909	TATTT	2	10	25660	25669	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_000909	TAAAA	2	10	28441	28450	80 %	20 %	0 %	0 %	15668198
32	NC_000909	ATATA	2	10	28464	28473	60 %	40 %	0 %	0 %	15668198
33	NC_000909	TTAAA	2	10	28702	28711	60 %	40 %	0 %	0 %	15668199
34	NC_000909	TTTCC	2	10	28795	28804	0 %	60 %	0 %	40 %	15668199
35	NC_000909	ATATA	2	10	28962	28971	60 %	40 %	0 %	0 %	15668199
36	NC_000909	TGGCT	2	10	29231	29240	0 %	40 %	40 %	20 %	15668199
37	NC_000909	AATAG	2	10	29859	29868	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_000909	ACTAT	2	10	30371	30380	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
39	NC_000909	TTAAA	2	10	31228	31237	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_000909	TAGAT	2	10	31608	31617	40 %	40 %	20 %	0 %	15668200
41	NC_000909	ATATA	2	10	31665	31674	60 %	40 %	0 %	0 %	15668200
42	NC_000909	GATGT	2	10	32292	32301	20 %	40 %	40 %	0 %	15668201
43	NC_000909	AATAA	2	10	32487	32496	80 %	20 %	0 %	0 %	15668201
44	NC_000909	TATAA	2	10	32497	32506	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_000909	ATTAA	2	10	33063	33072	60 %	40 %	0 %	0 %	15668202
46	NC_000909	ATCCA	2	10	34219	34228	40 %	20 %	0 %	40 %	15668203
47	NC_000909	TAATT	2	10	34897	34906	40 %	60 %	0 %	0 %	15668203
48	NC_000909	TTGAA	2	10	35052	35061	40 %	40 %	20 %	0 %	15668203
49	NC_000909	ATAAA	2	10	37366	37375	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_000909	GTTAA	2	10	37737	37746	40 %	40 %	20 %	0 %	15668206
51	NC_000909	GTTTA	2	10	38122	38131	20 %	60 %	20 %	0 %	15668207
52	NC_000909	CTCTA	2	10	40894	40903	20 %	40 %	0 %	40 %	15668211
53	NC_000909	CTAAC	2	10	41304	41313	40 %	20 %	0 %	40 %	15668211
54	NC_000909	CTTAT	2	10	42977	42986	20 %	60 %	0 %	20 %	15668213
55	NC_000909	TTAAA	2	10	46494	46503	60 %	40 %	0 %	0 %	15668215
56	NC_000909	CAAAT	2	10	47199	47208	60 %	20 %	0 %	20 %	15668216
57	NC_000909	AACTC	2	10	48029	48038	40 %	20 %	0 %	40 %	15668217
58	NC_000909	TAATT	2	10	49349	49358	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_000909	TACCC	2	10	50490	50499	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
60	NC_000909	CTCTT	2	10	50678	50687	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
61	NC_000909	TTAAA	2	10	53385	53394	60 %	40 %	0 %	0 %	15668224
62	NC_000909	TATTT	2	10	54910	54919	20 %	80 %	0 %	0 %	15668225
63	NC_000909	TCTCC	2	10	55118	55127	0 %	40 %	0 %	60 %	15668226
64	NC_000909	TAAAT	2	10	55807	55816	60 %	40 %	0 %	0 %	15668227
65	NC_000909	GTAAG	2	10	58413	58422	40 %	20 %	40 %	0 %	15668229
66	NC_000909	ATAAA	2	10	59627	59636	80 %	20 %	0 %	0 %	15668231
67	NC_000909	AAAAT	2	10	60125	60134	80 %	20 %	0 %	0 %	15668231
68	NC_000909	TTTTA	2	10	60344	60353	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_000909	AAATA	2	10	60419	60428	80 %	20 %	0 %	0 %	15668232
70	NC_000909	TATAA	2	10	60792	60801	60 %	40 %	0 %	0 %	15668233
71	NC_000909	ATCTC	2	10	62650	62659	20 %	40 %	0 %	40 %	15668236
72	NC_000909	GGCTG	2	10	65229	65238	0 %	20 %	60 %	20 %	15668238
73	NC_000909	ATTTA	3	15	65481	65495	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_000909	TGAAT	2	10	67004	67013	40 %	40 %	20 %	0 %	15668241
75	NC_000909	AAAAT	2	10	68084	68093	80 %	20 %	0 %	0 %	15668245
76	NC_000909	ATAAA	2	10	69010	69019	80 %	20 %	0 %	0 %	15668245
77	NC_000909	TTAAC	2	10	72230	72239	40 %	40 %	0 %	20 %	15668249
78	NC_000909	AGTGT	2	10	72483	72492	20 %	40 %	40 %	0 %	15668249
79	NC_000909	TTATG	2	10	74275	74284	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_000909	ATAGA	2	10	74686	74695	60 %	20 %	20 %	0 %	15668252
81	NC_000909	TGAGA	2	10	76403	76412	40 %	20 %	40 %	0 %	15668253
82	NC_000909	AAAAG	2	10	76861	76870	80 %	0 %	20 %	0 %	15668254
83	NC_000909	AGAGA	2	10	77182	77191	60 %	0 %	40 %	0 %	15668254
84	NC_000909	AATCT	2	10	78858	78867	40 %	40 %	0 %	20 %	15668255
85	NC_000909	TCATA	2	10	79600	79609	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
86	NC_000909	AAACC	2	10	79978	79987	60 %	0 %	0 %	40 %	15668256
87	NC_000909	TGATT	2	10	80958	80967	20 %	60 %	20 %	0 %	15668257
88	NC_000909	ATGGA	2	10	81649	81658	40 %	20 %	40 %	0 %	15668257
89	NC_000909	AGGAG	2	10	83402	83411	40 %	0 %	60 %	0 %	15668259
90	NC_000909	AGAGG	2	10	83628	83637	40 %	0 %	60 %	0 %	15668260
91	NC_000909	TGAGT	2	10	83951	83960	20 %	40 %	40 %	0 %	15668260
92	NC_000909	ATTTT	2	10	86560	86569	20 %	80 %	0 %	0 %	15668262
93	NC_000909	TTACA	2	10	88409	88418	40 %	40 %	0 %	20 %	15668264
94	NC_000909	TAACT	2	10	88723	88732	40 %	40 %	0 %	20 %	15668265
95	NC_000909	TAAGT	2	10	90487	90496	40 %	40 %	20 %	0 %	15668267
96	NC_000909	CGCTC	2	10	90857	90866	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
97	NC_000909	TTTTG	2	10	93479	93488	0 %	80 %	20 %	0 %	15668271
98	NC_000909	TTCCT	2	10	94461	94470	0 %	60 %	0 %	40 %	15668271
99	NC_000909	TCCCC	2	10	95574	95583	0 %	20 %	0 %	80 %	15668272
100	NC_000909	CTCTC	2	10	96231	96240	0 %	40 %	0 %	60 %	15668272
101	NC_000909	ATATT	2	10	96442	96451	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_000909	GTTAA	2	10	97073	97082	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
103	NC_000909	TAAAA	2	10	97150	97159	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_000909	GAAAG	2	10	100815	100824	60 %	0 %	40 %	0 %	15668275
105	NC_000909	AATGA	2	10	101169	101178	60 %	20 %	20 %	0 %	15668275
106	NC_000909	AAAAT	2	10	101212	101221	80 %	20 %	0 %	0 %	15668275
107	NC_000909	GGTCT	2	10	102010	102019	0 %	40 %	40 %	20 %	15668277
108	NC_000909	AAAAT	2	10	102307	102316	80 %	20 %	0 %	0 %	15668277
109	NC_000909	TAATT	2	10	102579	102588	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_000909	GAAAG	2	10	102766	102775	60 %	0 %	40 %	0 %	15668278
111	NC_000909	GATAA	2	10	103042	103051	60 %	20 %	20 %	0 %	15668278
112	NC_000909	TTAAA	2	10	104519	104528	60 %	40 %	0 %	0 %	15668279
113	NC_000909	AAATA	2	10	104529	104538	80 %	20 %	0 %	0 %	15668279
114	NC_000909	ATTTT	2	10	104615	104624	20 %	80 %	0 %	0 %	15668279
115	NC_000909	CATTT	2	10	106412	106421	20 %	60 %	0 %	20 %	15668280
116	NC_000909	TCTCA	2	10	106620	106629	20 %	40 %	0 %	40 %	15668281
117	NC_000909	AGTTG	2	10	107452	107461	20 %	40 %	40 %	0 %	15668282
118	NC_000909	AAATT	2	10	108536	108545	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_000909	CAAAC	2	10	109941	109950	60 %	0 %	0 %	40 %	15668283
120	NC_000909	GTTTA	2	10	110361	110370	20 %	60 %	20 %	0 %	15668284
121	NC_000909	CTATT	2	10	110696	110705	20 %	60 %	0 %	20 %	15668284
122	NC_000909	TATTT	2	10	111634	111643	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_000909	CTAAG	2	10	112154	112163	40 %	20 %	20 %	20 %	15668285
124	NC_000909	AAACT	2	10	113039	113048	60 %	20 %	0 %	20 %	15668286
125	NC_000909	TTCTC	2	10	114942	114951	0 %	60 %	0 %	40 %	15668289
126	NC_000909	AGTGA	2	10	115218	115227	40 %	20 %	40 %	0 %	15668290
127	NC_000909	GATAT	2	10	115546	115555	40 %	40 %	20 %	0 %	15668290
128	NC_000909	CCCTG	2	10	116556	116565	0 %	20 %	20 %	60 %	15668292
129	NC_000909	CTTCT	2	10	117181	117190	0 %	60 %	0 %	40 %	15668293
130	NC_000909	TATTT	2	10	118528	118537	20 %	80 %	0 %	0 %	15668294
131	NC_000909	ATTTT	2	10	118991	119000	20 %	80 %	0 %	0 %	15668294
132	NC_000909	ATTTT	2	10	119293	119302	20 %	80 %	0 %	0 %	15668295
133	NC_000909	AAAAT	2	10	120001	120010	80 %	20 %	0 %	0 %	298575366
134	NC_000909	TTTAA	2	10	120499	120508	40 %	60 %	0 %	0 %	298575366
135	NC_000909	CTTTT	2	10	120963	120972	0 %	80 %	0 %	20 %	298575366
136	NC_000909	CTTTT	2	10	121800	121809	0 %	80 %	0 %	20 %	298575366
137	NC_000909	TTTTG	2	10	122226	122235	0 %	80 %	20 %	0 %	298575366
138	NC_000909	TAAAT	2	10	123395	123404	60 %	40 %	0 %	0 %	15668297
139	NC_000909	TAAAT	2	10	124051	124060	60 %	40 %	0 %	0 %	15668299
140	NC_000909	ATTTT	2	10	124370	124379	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_000909	TATTT	2	10	126134	126143	20 %	80 %	0 %	0 %	298575369
142	NC_000909	TCCTC	2	10	127146	127155	0 %	40 %	0 %	60 %	15668302
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