MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Methanocaldococcus jannaschii DSM 2661 chromosome

Total Repeats: 5354

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_000909	TTTA	2	8	67	74	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_000909	ATTA	2	8	165	172	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_000909	GTAA	2	8	174	181	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_000909	GAAA	2	8	251	258	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_000909	ATTA	2	8	444	451	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_000909	TCAA	2	8	2346	2353	50 %	25 %	0 %	25 %	15668173
7	NC_000909	TTAA	2	8	2688	2695	50 %	50 %	0 %	0 %	15668173
8	NC_000909	TCAA	2	8	3030	3037	50 %	25 %	0 %	25 %	15668173
9	NC_000909	CTTT	2	8	3677	3684	0 %	75 %	0 %	25 %	15668174
10	NC_000909	TTAA	2	8	4252	4259	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_000909	TTGT	2	8	4273	4280	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_000909	ATTG	2	8	4287	4294	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_000909	CTAT	2	8	4488	4495	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_000909	TTTA	2	8	4816	4823	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_000909	ATTT	2	8	4874	4881	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_000909	ATTT	2	8	5067	5074	25 %	75 %	0 %	0 %	15668175
17	NC_000909	ATAA	2	8	5801	5808	75 %	25 %	0 %	0 %	15668176
18	NC_000909	AAGG	2	8	5900	5907	50 %	0 %	50 %	0 %	15668176
19	NC_000909	GCAT	2	8	6231	6238	25 %	25 %	25 %	25 %	15668177
20	NC_000909	CAAC	2	8	7061	7068	50 %	0 %	0 %	50 %	15668177
21	NC_000909	TTTA	2	8	7473	7480	25 %	75 %	0 %	0 %	15668178
22	NC_000909	ATTA	2	8	7824	7831	50 %	50 %	0 %	0 %	15668178
23	NC_000909	CAAC	2	8	8132	8139	50 %	0 %	0 %	50 %	15668178
24	NC_000909	TAAA	2	8	9386	9393	75 %	25 %	0 %	0 %	15668179
25	NC_000909	TATT	2	8	9487	9494	25 %	75 %	0 %	0 %	15668179
26	NC_000909	TTCT	2	8	10007	10014	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_000909	ATGC	2	8	10101	10108	25 %	25 %	25 %	25 %	15668180
28	NC_000909	AAAT	2	8	10737	10744	75 %	25 %	0 %	0 %	15668180
29	NC_000909	GACT	2	8	10961	10968	25 %	25 %	25 %	25 %	15668181
30	NC_000909	GAAA	2	8	11347	11354	75 %	0 %	25 %	0 %	15668181
31	NC_000909	AAGG	2	8	11457	11464	50 %	0 %	50 %	0 %	15668181
32	NC_000909	TAGA	2	8	11678	11685	50 %	25 %	25 %	0 %	15668182
33	NC_000909	GTTG	2	8	11952	11959	0 %	50 %	50 %	0 %	15668182
34	NC_000909	TCCC	2	8	11962	11969	0 %	25 %	0 %	75 %	15668182
35	NC_000909	AAAG	2	8	12037	12044	75 %	0 %	25 %	0 %	15668182
36	NC_000909	ATGG	2	8	12047	12054	25 %	25 %	50 %	0 %	15668182
37	NC_000909	TAAA	2	8	12182	12189	75 %	25 %	0 %	0 %	15668182
38	NC_000909	GAAG	2	8	12242	12249	50 %	0 %	50 %	0 %	15668182
39	NC_000909	GAAT	2	8	12332	12339	50 %	25 %	25 %	0 %	15668182
40	NC_000909	CATC	2	8	12462	12469	25 %	25 %	0 %	50 %	15668182
41	NC_000909	ATTA	2	8	12952	12959	50 %	50 %	0 %	0 %	15668183
42	NC_000909	AGGA	2	8	13321	13328	50 %	0 %	50 %	0 %	15668183
43	NC_000909	TCAT	2	8	13420	13427	25 %	50 %	0 %	25 %	15668183
44	NC_000909	AGTT	2	8	13879	13886	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_000909	ATAG	2	8	14081	14088	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_000909	TTCT	2	8	14391	14398	0 %	75 %	0 %	25 %	15668184
47	NC_000909	TTTC	2	8	14459	14466	0 %	75 %	0 %	25 %	15668184
48	NC_000909	TTCC	2	8	14687	14694	0 %	50 %	0 %	50 %	15668184
49	NC_000909	TTTA	2	8	14976	14983	25 %	75 %	0 %	0 %	15668185
50	NC_000909	ATCT	2	8	15050	15057	25 %	50 %	0 %	25 %	15668185
51	NC_000909	TCTA	2	8	15471	15478	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_000909	AGTT	2	8	15575	15582	25 %	50 %	25 %	0 %	15668186
53	NC_000909	TGGA	2	8	15583	15590	25 %	25 %	50 %	0 %	15668186
54	NC_000909	GTTT	2	8	15986	15993	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_000909	AAGG	2	8	16928	16935	50 %	0 %	50 %	0 %	15668188
56	NC_000909	AGAA	2	8	17024	17031	75 %	0 %	25 %	0 %	15668188
57	NC_000909	GAAA	2	8	17034	17041	75 %	0 %	25 %	0 %	15668188
58	NC_000909	GAAA	2	8	17591	17598	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_000909	TAAA	2	8	18130	18137	75 %	25 %	0 %	0 %	15668189
60	NC_000909	ATAA	2	8	18546	18553	75 %	25 %	0 %	0 %	15668189
61	NC_000909	TAAC	2	8	19264	19271	50 %	25 %	0 %	25 %	15668190
62	NC_000909	AAAT	2	8	19664	19671	75 %	25 %	0 %	0 %	15668190
63	NC_000909	TTCT	2	8	19724	19731	0 %	75 %	0 %	25 %	15668190
64	NC_000909	TTTC	2	8	20304	20311	0 %	75 %	0 %	25 %	15668190
65	NC_000909	TCTT	2	8	20626	20633	0 %	75 %	0 %	25 %	15668190
66	NC_000909	CCAA	2	8	21185	21192	50 %	0 %	0 %	50 %	15668191
67	NC_000909	ATTG	2	8	21352	21359	25 %	50 %	25 %	0 %	15668191
68	NC_000909	CCAT	2	8	21503	21510	25 %	25 %	0 %	50 %	15668191
69	NC_000909	CCAA	2	8	21851	21858	50 %	0 %	0 %	50 %	15668191
70	NC_000909	CCTT	2	8	22039	22046	0 %	50 %	0 %	50 %	15668191
71	NC_000909	TGTC	2	8	22365	22372	0 %	50 %	25 %	25 %	15668191
72	NC_000909	ATCA	2	8	22542	22549	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_000909	AGAA	2	8	22912	22919	75 %	0 %	25 %	0 %	15668192
74	NC_000909	AAAT	2	8	23036	23043	75 %	25 %	0 %	0 %	15668192
75	NC_000909	GTAA	2	8	23434	23441	50 %	25 %	25 %	0 %	15668192
76	NC_000909	ATTA	2	8	24146	24153	50 %	50 %	0 %	0 %	15668193
77	NC_000909	AAAG	2	8	24344	24351	75 %	0 %	25 %	0 %	15668193
78	NC_000909	TATT	2	8	24865	24872	25 %	75 %	0 %	0 %	15668193
79	NC_000909	TTAG	2	8	25548	25555	25 %	50 %	25 %	0 %	15668194
80	NC_000909	TATG	2	8	25595	25602	25 %	50 %	25 %	0 %	15668194
81	NC_000909	TAGA	2	8	25634	25641	50 %	25 %	25 %	0 %	15668194
82	NC_000909	TCCA	2	8	25712	25719	25 %	25 %	0 %	50 %	15668195
83	NC_000909	TGTT	2	8	26198	26205	0 %	75 %	25 %	0 %	15668196
84	NC_000909	TCCC	2	8	26756	26763	0 %	25 %	0 %	75 %	15668196
85	NC_000909	TTCT	2	8	26995	27002	0 %	75 %	0 %	25 %	15668196
86	NC_000909	AACT	2	8	27335	27342	50 %	25 %	0 %	25 %	15668197
87	NC_000909	TATC	2	8	27373	27380	25 %	50 %	0 %	25 %	15668197
88	NC_000909	ATTG	2	8	27750	27757	25 %	50 %	25 %	0 %	15668197
89	NC_000909	CAAA	2	8	27772	27779	75 %	0 %	0 %	25 %	15668197
90	NC_000909	ATTT	2	8	28029	28036	25 %	75 %	0 %	0 %	15668198
91	NC_000909	CCTA	2	8	28991	28998	25 %	25 %	0 %	50 %	15668199
92	NC_000909	ACCA	2	8	29114	29121	50 %	0 %	0 %	50 %	15668199
93	NC_000909	TAAA	2	8	29354	29361	75 %	25 %	0 %	0 %	15668199
94	NC_000909	ATAA	2	8	29531	29538	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_000909	AAAT	2	8	29611	29618	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_000909	ATTT	2	8	29633	29640	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_000909	AATT	2	8	29905	29912	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_000909	TAAA	2	8	29938	29945	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_000909	CCCA	2	8	30166	30173	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
100	NC_000909	CCAC	2	8	30308	30315	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
101	NC_000909	AACA	2	8	30341	30348	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
102	NC_000909	AATT	2	8	30433	30440	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_000909	AAAC	2	8	30594	30601	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NC_000909	AATA	2	8	31139	31146	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_000909	ATGA	2	8	31255	31262	50 %	25 %	25 %	0 %	15668200
106	NC_000909	ATTG	2	8	31537	31544	25 %	50 %	25 %	0 %	15668200
107	NC_000909	CTGT	2	8	31980	31987	0 %	50 %	25 %	25 %	15668201
108	NC_000909	AGAA	2	8	32027	32034	75 %	0 %	25 %	0 %	15668201
109	NC_000909	TTTA	2	8	32625	32632	25 %	75 %	0 %	0 %	15668202
110	NC_000909	AAAG	2	8	33308	33315	75 %	0 %	25 %	0 %	15668202
111	NC_000909	GAAA	2	8	33326	33333	75 %	0 %	25 %	0 %	15668202
112	NC_000909	TTTG	2	8	33916	33923	0 %	75 %	25 %	0 %	15668203
113	NC_000909	TCCA	2	8	34305	34312	25 %	25 %	0 %	50 %	15668203
114	NC_000909	AATA	2	8	34379	34386	75 %	25 %	0 %	0 %	15668203
115	NC_000909	TTTA	2	8	34503	34510	25 %	75 %	0 %	0 %	15668203
116	NC_000909	GGAT	2	8	34957	34964	25 %	25 %	50 %	0 %	15668203
117	NC_000909	GAAG	2	8	35273	35280	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_000909	CCTT	2	8	35291	35298	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_000909	GATT	2	8	35593	35600	25 %	50 %	25 %	0 %	15668204
120	NC_000909	CAAT	2	8	35633	35640	50 %	25 %	0 %	25 %	15668204
121	NC_000909	TCCA	2	8	35956	35963	25 %	25 %	0 %	50 %	15668204
122	NC_000909	CTTC	2	8	36225	36232	0 %	50 %	0 %	50 %	15668204
123	NC_000909	ATCT	2	8	36861	36868	25 %	50 %	0 %	25 %	15668205
124	NC_000909	TCTT	2	8	36938	36945	0 %	75 %	0 %	25 %	15668205
125	NC_000909	TCAT	2	8	36953	36960	25 %	50 %	0 %	25 %	15668205
126	NC_000909	AGGA	2	8	37605	37612	50 %	0 %	50 %	0 %	15668206
127	NC_000909	TTAA	2	8	38379	38386	50 %	50 %	0 %	0 %	15668207
128	NC_000909	ATAG	2	8	38487	38494	50 %	25 %	25 %	0 %	15668207
129	NC_000909	CCTA	2	8	38583	38590	25 %	25 %	0 %	50 %	15668207
130	NC_000909	TAGA	2	8	38799	38806	50 %	25 %	25 %	0 %	15668208
131	NC_000909	CATT	2	8	39064	39071	25 %	50 %	0 %	25 %	15668208
132	NC_000909	AGTT	2	8	39150	39157	25 %	50 %	25 %	0 %	15668208
133	NC_000909	TAAT	2	8	40066	40073	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_000909	TTTG	2	8	40139	40146	0 %	75 %	25 %	0 %	15668210
135	NC_000909	TTTA	2	8	40540	40547	25 %	75 %	0 %	0 %	15668211
136	NC_000909	GATA	2	8	40737	40744	50 %	25 %	25 %	0 %	15668211
137	NC_000909	TCCT	2	8	40862	40869	0 %	50 %	0 %	50 %	15668211
138	NC_000909	TTTA	2	8	40930	40937	25 %	75 %	0 %	0 %	15668211
139	NC_000909	TTGT	2	8	41169	41176	0 %	75 %	25 %	0 %	15668211
140	NC_000909	CTAA	2	8	41186	41193	50 %	25 %	0 %	25 %	15668211
141	NC_000909	ATTT	2	8	41224	41231	25 %	75 %	0 %	0 %	15668211
142	NC_000909	TAGA	2	8	41233	41240	50 %	25 %	25 %	0 %	15668211
143	NC_000909	TTTA	2	8	41467	41474	25 %	75 %	0 %	0 %	15668211
144	NC_000909	TTAT	2	8	41819	41826	25 %	75 %	0 %	0 %	15668211
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146	NC_000909	TTCT	2	8	42050	42057	0 %	75 %	0 %	25 %	15668212
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