MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Methanocaldococcus jannaschii DSM 2661 chromosome

Total Repeats: 25838

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_000909	TTA	2	6	12	17	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_000909	ATT	2	6	140	145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_000909	TAT	2	6	244	249	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_000909	TAT	2	6	281	286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_000909	AGT	2	6	289	294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_000909	TGA	2	6	343	348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_000909	TAT	2	6	353	358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_000909	GGA	2	6	425	430	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_000909	TGA	2	6	688	693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_000909	AGA	2	6	888	893	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_000909	GAA	2	6	918	923	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_000909	AGC	2	6	951	956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_000909	TCA	2	6	1056	1061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_000909	TTG	2	6	1119	1124	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_000909	AGT	2	6	1239	1244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_000909	ATA	3	9	1311	1319	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_000909	CTT	2	6	1328	1333	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_000909	CCT	2	6	1376	1381	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_000909	ACA	2	6	1453	1458	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_000909	ATA	3	9	1591	1599	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_000909	CTT	2	6	1608	1613	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_000909	ATT	2	6	1646	1651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_000909	ACC	2	6	1652	1657	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_000909	TTC	2	6	1683	1688	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_000909	AAT	2	6	1716	1721	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_000909	ATT	2	6	2083	2088	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_000909	TTA	2	6	2096	2101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_000909	TTA	2	6	2135	2140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_000909	TTA	2	6	2168	2173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_000909	AGA	2	6	2179	2184	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_000909	GCT	2	6	2526	2531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15668173
32	NC_000909	TGA	2	6	2577	2582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15668173
33	NC_000909	TTG	2	6	2595	2600	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15668173
34	NC_000909	TCA	2	6	2625	2630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15668173
35	NC_000909	TCC	2	6	2650	2655	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15668173
36	NC_000909	CTT	2	6	2732	2737	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15668173
37	NC_000909	AAT	2	6	2774	2779	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15668173
38	NC_000909	ATT	2	6	2868	2873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15668173
39	NC_000909	ATA	2	6	3042	3047	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15668173
40	NC_000909	AAT	2	6	3083	3088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15668173
41	NC_000909	ATC	2	6	3116	3121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15668173
42	NC_000909	AGT	2	6	3175	3180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15668173
43	NC_000909	TCA	2	6	3413	3418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15668174
44	NC_000909	TCT	2	6	3486	3491	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15668174
45	NC_000909	TCA	2	6	3500	3505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15668174
46	NC_000909	ATA	2	6	3631	3636	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15668174
47	NC_000909	ATG	2	6	3724	3729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15668174
48	NC_000909	TAA	2	6	3844	3849	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15668174
49	NC_000909	CTT	3	9	3915	3923	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15668174
50	NC_000909	TAA	2	6	3948	3953	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15668174
51	NC_000909	ACG	2	6	4037	4042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15668174
52	NC_000909	ATT	2	6	4098	4103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_000909	GTA	2	6	4118	4123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_000909	GGT	2	6	4193	4198	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_000909	TTG	2	6	4343	4348	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_000909	ATT	2	6	4387	4392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_000909	GTT	2	6	4420	4425	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_000909	GCT	2	6	4459	4464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_000909	GAT	2	6	4691	4696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_000909	ATT	2	6	4793	4798	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_000909	ATA	2	6	4803	4808	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_000909	TCA	2	6	4855	4860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_000909	GTT	2	6	4965	4970	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15668175
64	NC_000909	GTT	2	6	5007	5012	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15668175
65	NC_000909	AAT	2	6	5028	5033	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15668175
66	NC_000909	AAT	2	6	5039	5044	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15668175
67	NC_000909	AAT	2	6	5156	5161	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15668175
68	NC_000909	GAA	2	6	5265	5270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15668175
69	NC_000909	ATC	2	6	5298	5303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15668175
70	NC_000909	AGA	2	6	5365	5370	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15668175
71	NC_000909	ACA	2	6	5405	5410	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15668176
72	NC_000909	GTT	2	6	5471	5476	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15668176
73	NC_000909	TTA	2	6	5492	5497	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15668176
74	NC_000909	GTT	2	6	5708	5713	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15668176
75	NC_000909	ATA	2	6	5820	5825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15668176
76	NC_000909	ATA	2	6	5870	5875	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15668176
77	NC_000909	TAA	2	6	5934	5939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15668176
78	NC_000909	GGA	2	6	5993	5998	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15668176
79	NC_000909	CTA	2	6	6053	6058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15668176
80	NC_000909	GTG	2	6	6131	6136	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15668177
81	NC_000909	TGG	2	6	6312	6317	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15668177
82	NC_000909	TTC	2	6	6330	6335	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15668177
83	NC_000909	CTT	2	6	6468	6473	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15668177
84	NC_000909	GTT	2	6	6545	6550	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15668177
85	NC_000909	CAA	2	6	6617	6622	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15668177
86	NC_000909	ATT	2	6	6682	6687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15668177
87	NC_000909	TCC	2	6	6707	6712	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15668177
88	NC_000909	TCC	2	6	6727	6732	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15668177
89	NC_000909	TTC	2	6	6735	6740	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15668177
90	NC_000909	ATA	2	6	6778	6783	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15668177
91	NC_000909	AAC	2	6	6810	6815	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15668177
92	NC_000909	AAT	2	6	6838	6843	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15668177
93	NC_000909	ATC	2	6	6847	6852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15668177
94	NC_000909	TCC	2	6	6879	6884	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15668177
95	NC_000909	CAG	2	6	7052	7057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15668177
96	NC_000909	CAT	2	6	7100	7105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15668177
97	NC_000909	TCT	2	6	7111	7116	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15668177
98	NC_000909	CAA	2	6	7142	7147	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15668177
99	NC_000909	CAC	3	9	7187	7195	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15668177
100	NC_000909	CTC	2	6	7204	7209	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15668177
101	NC_000909	TGT	2	6	7366	7371	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15668178
102	NC_000909	TAT	2	6	7428	7433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15668178
103	NC_000909	ATC	2	6	7440	7445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15668178
104	NC_000909	AGG	2	6	7458	7463	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15668178
105	NC_000909	ACA	2	6	7549	7554	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15668178
106	NC_000909	AAT	2	6	7681	7686	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15668178
107	NC_000909	TCA	2	6	7804	7809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15668178
108	NC_000909	TAA	2	6	7973	7978	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15668178
109	NC_000909	AGA	2	6	8006	8011	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15668178
110	NC_000909	AAT	2	6	8019	8024	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15668178
111	NC_000909	ATC	2	6	8049	8054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15668178
112	NC_000909	TTG	2	6	8057	8062	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15668178
113	NC_000909	ATC	2	6	8196	8201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15668178
114	NC_000909	CAA	2	6	8261	8266	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15668178
115	NC_000909	TTC	2	6	8275	8280	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15668178
116	NC_000909	ATT	2	6	8317	8322	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15668178
117	NC_000909	CAA	2	6	8393	8398	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15668178
118	NC_000909	ATC	2	6	8403	8408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15668178
119	NC_000909	AAC	2	6	8463	8468	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15668178
120	NC_000909	ATA	2	6	8473	8478	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15668178
121	NC_000909	TAT	2	6	8601	8606	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_000909	TAC	2	6	8661	8666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_000909	ATT	3	9	8676	8684	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_000909	TAC	2	6	8716	8721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_000909	TAT	2	6	8722	8727	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_000909	TTA	2	6	8840	8845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_000909	TAA	2	6	8853	8858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_000909	ATG	2	6	8884	8889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15668179
129	NC_000909	AGA	2	6	8958	8963	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15668179
130	NC_000909	AAT	2	6	9009	9014	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15668179
131	NC_000909	AGC	2	6	9018	9023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15668179
132	NC_000909	AGG	2	6	9080	9085	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15668179
133	NC_000909	TAA	2	6	9110	9115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15668179
134	NC_000909	ATC	2	6	9117	9122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15668179
135	NC_000909	AAG	2	6	9133	9138	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15668179
136	NC_000909	AGA	3	9	9203	9211	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15668179
137	NC_000909	AAG	2	6	9299	9304	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15668179
138	NC_000909	GTT	2	6	9402	9407	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15668179
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