MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Methanocaldococcus jannaschii DSM 2661 chromosome

Total Repeats: 22882

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_000909	GCT	2	6	2526	2531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15668173
2	NC_000909	TGA	2	6	2577	2582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15668173
3	NC_000909	TTG	2	6	2595	2600	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15668173
4	NC_000909	TCA	2	6	2625	2630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15668173
5	NC_000909	TCC	2	6	2650	2655	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15668173
6	NC_000909	CTT	2	6	2732	2737	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15668173
7	NC_000909	AAT	2	6	2774	2779	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15668173
8	NC_000909	ATT	2	6	2868	2873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15668173
9	NC_000909	ATA	2	6	3042	3047	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15668173
10	NC_000909	AAT	2	6	3083	3088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15668173
11	NC_000909	ATC	2	6	3116	3121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15668173
12	NC_000909	AGT	2	6	3175	3180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15668173
13	NC_000909	TCA	2	6	3413	3418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15668174
14	NC_000909	TCT	2	6	3486	3491	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15668174
15	NC_000909	TCA	2	6	3500	3505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15668174
16	NC_000909	ATA	2	6	3631	3636	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15668174
17	NC_000909	ATG	2	6	3724	3729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15668174
18	NC_000909	TAA	2	6	3844	3849	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15668174
19	NC_000909	CTT	3	9	3915	3923	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15668174
20	NC_000909	TAA	2	6	3948	3953	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15668174
21	NC_000909	ACG	2	6	4037	4042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15668174
22	NC_000909	GTT	2	6	4965	4970	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15668175
23	NC_000909	GTT	2	6	5007	5012	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15668175
24	NC_000909	AAT	2	6	5028	5033	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15668175
25	NC_000909	AAT	2	6	5039	5044	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15668175
26	NC_000909	AAT	2	6	5156	5161	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15668175
27	NC_000909	GAA	2	6	5265	5270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15668175
28	NC_000909	ATC	2	6	5298	5303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15668175
29	NC_000909	AGA	2	6	5365	5370	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15668175
30	NC_000909	ACA	2	6	5405	5410	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15668176
31	NC_000909	GTT	2	6	5471	5476	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15668176
32	NC_000909	TTA	2	6	5492	5497	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15668176
33	NC_000909	GTT	2	6	5708	5713	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15668176
34	NC_000909	ATA	2	6	5820	5825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15668176
35	NC_000909	ATA	2	6	5870	5875	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15668176
36	NC_000909	TAA	2	6	5934	5939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15668176
37	NC_000909	GGA	2	6	5993	5998	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15668176
38	NC_000909	CTA	2	6	6053	6058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15668176
39	NC_000909	GTG	2	6	6131	6136	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15668177
40	NC_000909	TGG	2	6	6312	6317	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15668177
41	NC_000909	TTC	2	6	6330	6335	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15668177
42	NC_000909	CTT	2	6	6468	6473	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15668177
43	NC_000909	GTT	2	6	6545	6550	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15668177
44	NC_000909	CAA	2	6	6617	6622	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15668177
45	NC_000909	ATT	2	6	6682	6687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15668177
46	NC_000909	TCC	2	6	6707	6712	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15668177
47	NC_000909	TCC	2	6	6727	6732	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15668177
48	NC_000909	TTC	2	6	6735	6740	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15668177
49	NC_000909	ATA	2	6	6778	6783	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15668177
50	NC_000909	AAC	2	6	6810	6815	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15668177
51	NC_000909	AAT	2	6	6838	6843	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15668177
52	NC_000909	ATC	2	6	6847	6852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15668177
53	NC_000909	TCC	2	6	6879	6884	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15668177
54	NC_000909	CAG	2	6	7052	7057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15668177
55	NC_000909	CAT	2	6	7100	7105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15668177
56	NC_000909	TCT	2	6	7111	7116	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15668177
57	NC_000909	CAA	2	6	7142	7147	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15668177
58	NC_000909	CAC	3	9	7187	7195	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15668177
59	NC_000909	CTC	2	6	7204	7209	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15668177
60	NC_000909	TGT	2	6	7366	7371	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15668178
61	NC_000909	TAT	2	6	7428	7433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15668178
62	NC_000909	ATC	2	6	7440	7445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15668178
63	NC_000909	AGG	2	6	7458	7463	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15668178
64	NC_000909	ACA	2	6	7549	7554	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15668178
65	NC_000909	AAT	2	6	7681	7686	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15668178
66	NC_000909	TCA	2	6	7804	7809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15668178
67	NC_000909	TAA	2	6	7973	7978	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15668178
68	NC_000909	AGA	2	6	8006	8011	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15668178
69	NC_000909	AAT	2	6	8019	8024	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15668178
70	NC_000909	ATC	2	6	8049	8054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15668178
71	NC_000909	TTG	2	6	8057	8062	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15668178
72	NC_000909	ATC	2	6	8196	8201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15668178
73	NC_000909	CAA	2	6	8261	8266	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15668178
74	NC_000909	TTC	2	6	8275	8280	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15668178
75	NC_000909	ATT	2	6	8317	8322	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15668178
76	NC_000909	CAA	2	6	8393	8398	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15668178
77	NC_000909	ATC	2	6	8403	8408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15668178
78	NC_000909	AAC	2	6	8463	8468	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15668178
79	NC_000909	ATA	2	6	8473	8478	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15668178
80	NC_000909	ATG	2	6	8884	8889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15668179
81	NC_000909	AGA	2	6	8958	8963	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15668179
82	NC_000909	AAT	2	6	9009	9014	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15668179
83	NC_000909	AGC	2	6	9018	9023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15668179
84	NC_000909	AGG	2	6	9080	9085	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15668179
85	NC_000909	TAA	2	6	9110	9115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15668179
86	NC_000909	ATC	2	6	9117	9122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15668179
87	NC_000909	AAG	2	6	9133	9138	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15668179
88	NC_000909	AGA	3	9	9203	9211	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15668179
89	NC_000909	AAG	2	6	9299	9304	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15668179
90	NC_000909	GTT	2	6	9402	9407	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15668179
91	NC_000909	GAA	2	6	9429	9434	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15668179
92	NC_000909	ATT	2	6	9471	9476	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15668179
93	NC_000909	TGA	2	6	9501	9506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15668179
94	NC_000909	GAG	2	6	9535	9540	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15668179
95	NC_000909	TAA	2	6	9590	9595	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15668179
96	NC_000909	TTG	2	6	9629	9634	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15668179
97	NC_000909	ATT	2	6	9637	9642	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15668179
98	NC_000909	GGA	2	6	9652	9657	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15668179
99	NC_000909	GTT	2	6	9661	9666	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15668179
100	NC_000909	GAA	2	6	9670	9675	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15668179
101	NC_000909	TTG	2	6	9707	9712	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15668179
102	NC_000909	GTT	2	6	9835	9840	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15668179
103	NC_000909	AGG	2	6	9893	9898	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15668179
104	NC_000909	AGG	2	6	9908	9913	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15668179
105	NC_000909	GAT	2	6	9996	10001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15668179
106	NC_000909	AGG	2	6	10115	10120	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15668180
107	NC_000909	AAC	2	6	10132	10137	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15668180
108	NC_000909	ACA	3	9	10184	10192	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15668180
109	NC_000909	ATT	3	9	10240	10248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15668180
110	NC_000909	AAT	2	6	10435	10440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15668180
111	NC_000909	ACC	2	6	10590	10595	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15668180
112	NC_000909	CAA	2	6	10605	10610	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15668180
113	NC_000909	ATT	2	6	10715	10720	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15668180
114	NC_000909	TGA	2	6	10811	10816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15668181
115	NC_000909	AAT	2	6	10826	10831	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15668181
116	NC_000909	AAT	2	6	10901	10906	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15668181
117	NC_000909	GAA	2	6	10917	10922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15668181
118	NC_000909	GTT	2	6	10944	10949	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15668181
119	NC_000909	GGT	2	6	11105	11110	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15668181
120	NC_000909	TTA	2	6	11132	11137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15668181
121	NC_000909	AAT	2	6	11171	11176	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15668181
122	NC_000909	AGG	2	6	11201	11206	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15668181
123	NC_000909	AGG	2	6	11266	11271	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15668181
124	NC_000909	GAA	2	6	11373	11378	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15668181
125	NC_000909	AAG	2	6	11518	11523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15668181
126	NC_000909	CTC	2	6	11648	11653	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15668182
127	NC_000909	AAG	2	6	11726	11731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15668182
128	NC_000909	AGA	2	6	11784	11789	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15668182
129	NC_000909	GAG	2	6	11801	11806	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15668182
130	NC_000909	AGA	2	6	11914	11919	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15668182
131	NC_000909	AGC	2	6	12492	12497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15668182
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133	NC_000909	ATA	2	6	12589	12594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15668182
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500	NC_000909	CTT	2	6	40283	40288	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15668210

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