MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Methanocaldococcus jannaschii DSM 2661 chromosome

Total Repeats: 5676

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_000909	AT	3	6	2401	2406	50 %	50 %	0 %	0 %	15668173
2	NC_000909	TC	3	6	2466	2471	0 %	50 %	0 %	50 %	15668173
3	NC_000909	CT	3	6	2483	2488	0 %	50 %	0 %	50 %	15668173
4	NC_000909	AC	3	6	2502	2507	50 %	0 %	0 %	50 %	15668173
5	NC_000909	CT	3	6	3143	3148	0 %	50 %	0 %	50 %	15668173
6	NC_000909	TC	3	6	3344	3349	0 %	50 %	0 %	50 %	15668174
7	NC_000909	CT	3	6	3608	3613	0 %	50 %	0 %	50 %	15668174
8	NC_000909	AT	3	6	3647	3652	50 %	50 %	0 %	0 %	15668174
9	NC_000909	CA	3	6	3687	3692	50 %	0 %	0 %	50 %	15668174
10	NC_000909	CT	3	6	3850	3855	0 %	50 %	0 %	50 %	15668174
11	NC_000909	TA	3	6	3933	3938	50 %	50 %	0 %	0 %	15668174
12	NC_000909	CT	3	6	3958	3963	0 %	50 %	0 %	50 %	15668174
13	NC_000909	AT	3	6	4296	4301	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_000909	AT	3	6	4613	4618	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_000909	TG	3	6	4685	4690	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_000909	TA	3	6	4747	4752	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_000909	TA	3	6	4822	4827	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_000909	TG	3	6	5844	5849	0 %	50 %	50 %	0 %	15668176
19	NC_000909	AT	3	6	6272	6277	50 %	50 %	0 %	0 %	15668177
20	NC_000909	CT	4	8	6599	6606	0 %	50 %	0 %	50 %	15668177
21	NC_000909	CT	3	6	7118	7123	0 %	50 %	0 %	50 %	15668177
22	NC_000909	TA	3	6	7294	7299	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_000909	TC	3	6	7646	7651	0 %	50 %	0 %	50 %	15668178
24	NC_000909	AT	3	6	8623	8628	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_000909	AT	3	6	8649	8654	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_000909	TA	3	6	8945	8950	50 %	50 %	0 %	0 %	15668179
27	NC_000909	TG	3	6	9044	9049	0 %	50 %	50 %	0 %	15668179
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34	NC_000909	TA	3	6	10053	10058	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_000909	TA	3	6	10471	10476	50 %	50 %	0 %	0 %	15668180
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39	NC_000909	AT	3	6	10981	10986	50 %	50 %	0 %	0 %	15668181
40	NC_000909	GA	4	8	11221	11228	50 %	0 %	50 %	0 %	15668181
41	NC_000909	AG	3	6	11340	11345	50 %	0 %	50 %	0 %	15668181
42	NC_000909	GA	3	6	11575	11580	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_000909	TG	3	6	11702	11707	0 %	50 %	50 %	0 %	15668182
44	NC_000909	AG	3	6	12124	12129	50 %	0 %	50 %	0 %	15668182
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50	NC_000909	TA	3	6	13388	13393	50 %	50 %	0 %	0 %	15668183
51	NC_000909	CT	3	6	14119	14124	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_000909	CT	3	6	14496	14501	0 %	50 %	0 %	50 %	15668184
53	NC_000909	CT	3	6	14582	14587	0 %	50 %	0 %	50 %	15668184
54	NC_000909	GA	3	6	14731	14736	50 %	0 %	50 %	0 %	15668184
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58	NC_000909	AT	3	6	16526	16531	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_000909	AG	3	6	16566	16571	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_000909	TC	3	6	16576	16581	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_000909	AT	3	6	16711	16716	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_000909	TA	3	6	16731	16736	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_000909	GA	3	6	16753	16758	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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68	NC_000909	TA	3	6	17505	17510	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_000909	AT	3	6	17527	17532	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_000909	TA	3	6	17578	17583	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_000909	AT	3	6	17604	17609	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_000909	AT	3	6	17632	17637	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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108	NC_000909	TA	3	6	29777	29782	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_000909	CA	3	6	30056	30061	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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111	NC_000909	AT	3	6	30494	30499	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_000909	CA	3	6	30507	30512	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_000909	AC	4	8	30859	30866	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_000909	AT	3	6	31003	31008	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_000909	AC	3	6	31023	31028	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_000909	AT	3	6	31192	31197	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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121	NC_000909	AT	3	6	34149	34154	50 %	50 %	0 %	0 %	15668203
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126	NC_000909	TA	3	6	35103	35108	50 %	50 %	0 %	0 %	15668203
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129	NC_000909	AT	3	6	36129	36134	50 %	50 %	0 %	0 %	15668204
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131	NC_000909	TC	3	6	36389	36394	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_000909	TG	3	6	36672	36677	0 %	50 %	50 %	0 %	15668205
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134	NC_000909	TC	3	6	37221	37226	0 %	50 %	0 %	50 %	15668205
135	NC_000909	AT	3	6	37323	37328	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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142	NC_000909	TA	3	6	38103	38108	50 %	50 %	0 %	0 %	15668207
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