MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Haemophilus influenzae Rd KW20 chromosome

Total Repeats: 1413

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_000907	CGTAT	2	10	44	53	20 %	40 %	20 %	20 %	16271977
2	NC_000907	AATTT	2	10	1073	1082	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_000907	CGCAC	2	10	3258	3267	20 %	0 %	20 %	60 %	16271979
4	NC_000907	ATTCT	2	10	4317	4326	20 %	60 %	0 %	20 %	16271980
5	NC_000907	TAAAA	2	10	4768	4777	80 %	20 %	0 %	0 %	16271981
6	NC_000907	TGCAC	2	10	9069	9078	20 %	20 %	20 %	40 %	16271982
7	NC_000907	TATTG	2	10	9179	9188	20 %	60 %	20 %	0 %	16271982
8	NC_000907	ATTTG	2	10	13131	13140	20 %	60 %	20 %	0 %	16271987
9	NC_000907	TTATT	2	10	15013	15022	20 %	80 %	0 %	0 %	16271990
10	NC_000907	AATCA	2	10	16776	16785	60 %	20 %	0 %	20 %	16271991
11	NC_000907	CAACC	2	10	17093	17102	40 %	0 %	0 %	60 %	16271991
12	NC_000907	AAAAC	2	10	17984	17993	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_000907	ACCAA	2	10	18870	18879	60 %	0 %	0 %	40 %	16271993
14	NC_000907	GGCTT	2	10	18886	18895	0 %	40 %	40 %	20 %	16271993
15	NC_000907	CACAA	2	10	20332	20341	60 %	0 %	0 %	40 %	16271994
16	NC_000907	TTAAA	2	10	21139	21148	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_000907	AATAC	2	10	21756	21765	60 %	20 %	0 %	20 %	16271995
18	NC_000907	CAATT	2	10	25973	25982	40 %	40 %	0 %	20 %	30995348
19	NC_000907	CGATT	2	10	26270	26279	20 %	40 %	20 %	20 %	30995348
20	NC_000907	AACAT	2	10	28010	28019	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
21	NC_000907	CTTTT	2	10	30015	30024	0 %	80 %	0 %	20 %	16272003
22	NC_000907	ATAAA	2	10	30188	30197	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_000907	AAAAT	2	10	32660	32669	80 %	20 %	0 %	0 %	16272006
24	NC_000907	TAAAC	2	10	33719	33728	60 %	20 %	0 %	20 %	16272007
25	NC_000907	CAATC	2	10	36026	36035	40 %	20 %	0 %	40 %	16272009
26	NC_000907	AATTA	2	10	36093	36102	60 %	40 %	0 %	0 %	16272009
27	NC_000907	TTACC	2	10	39471	39480	20 %	40 %	0 %	40 %	16272011
28	NC_000907	TGGTA	2	10	41020	41029	20 %	40 %	40 %	0 %	30995349
29	NC_000907	CCCCT	2	10	41302	41311	0 %	20 %	0 %	80 %	16272013
30	NC_000907	AATGC	2	10	43721	43730	40 %	20 %	20 %	20 %	16272016
31	NC_000907	ATTTT	2	10	45207	45216	20 %	80 %	0 %	0 %	16272018
32	NC_000907	GCCAA	2	10	46047	46056	40 %	0 %	20 %	40 %	16272018
33	NC_000907	TTCCA	2	10	46663	46672	20 %	40 %	0 %	40 %	16272019
34	NC_000907	TTATG	2	10	48465	48474	20 %	60 %	20 %	0 %	16272022
35	NC_000907	ACAAA	2	10	52408	52417	80 %	0 %	0 %	20 %	16272025
36	NC_000907	ATTTC	2	10	52752	52761	20 %	60 %	0 %	20 %	16272026
37	NC_000907	TAATT	2	10	53198	53207	40 %	60 %	0 %	0 %	16272026
38	NC_000907	TATGA	2	10	54723	54732	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_000907	AATCA	2	10	57288	57297	60 %	20 %	0 %	20 %	16272030
40	NC_000907	AATGC	2	10	57906	57915	40 %	20 %	20 %	20 %	16272031
41	NC_000907	TCCTG	2	10	57971	57980	0 %	40 %	20 %	40 %	16272031
42	NC_000907	GATTG	2	10	61579	61588	20 %	40 %	40 %	0 %	16272034
43	NC_000907	TCTGT	2	10	62516	62525	0 %	60 %	20 %	20 %	16272034
44	NC_000907	TAAAT	2	10	64195	64204	60 %	40 %	0 %	0 %	16272035
45	NC_000907	ATTTT	2	10	68927	68936	20 %	80 %	0 %	0 %	16272040
46	NC_000907	GCCTT	2	10	72663	72672	0 %	40 %	20 %	40 %	16272042
47	NC_000907	TGAAA	2	10	74008	74017	60 %	20 %	20 %	0 %	16272043
48	NC_000907	AGGTA	2	10	77992	78001	40 %	20 %	40 %	0 %	16272045
49	NC_000907	CAACG	2	10	80911	80920	40 %	0 %	20 %	40 %	16272049
50	NC_000907	AGAAA	2	10	82271	82280	80 %	0 %	20 %	0 %	16272049
51	NC_000907	GAAGA	2	10	82625	82634	60 %	0 %	40 %	0 %	16272049
52	NC_000907	TTGGA	2	10	84451	84460	20 %	40 %	40 %	0 %	16272051
53	NC_000907	CGTTG	2	10	84693	84702	0 %	40 %	40 %	20 %	16272052
54	NC_000907	TTACA	2	10	86066	86075	40 %	40 %	0 %	20 %	16272053
55	NC_000907	TGATT	2	10	87378	87387	20 %	60 %	20 %	0 %	16272055
56	NC_000907	AATTT	2	10	87536	87545	40 %	60 %	0 %	0 %	16272055
57	NC_000907	CACAT	2	10	90826	90835	40 %	20 %	0 %	40 %	16272060
58	NC_000907	AGTTA	2	10	92670	92679	40 %	40 %	20 %	0 %	16272061
59	NC_000907	ATGCC	2	10	95876	95885	20 %	20 %	20 %	40 %	16272063
60	NC_000907	AAATT	2	10	97996	98005	60 %	40 %	0 %	0 %	16272065
61	NC_000907	CTTGC	2	10	98909	98918	0 %	40 %	20 %	40 %	16272065
62	NC_000907	GCAAT	2	10	99603	99612	40 %	20 %	20 %	20 %	16272066
63	NC_000907	CCAAT	2	10	103040	103049	40 %	20 %	0 %	40 %	16272069
64	NC_000907	GTTTT	2	10	104152	104161	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_000907	CTGAA	2	10	104237	104246	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
66	NC_000907	TACGC	2	10	107527	107536	20 %	20 %	20 %	40 %	16272073
67	NC_000907	GCAAA	2	10	108198	108207	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
68	NC_000907	TGTAA	2	10	110839	110848	40 %	40 %	20 %	0 %	16272078
69	NC_000907	GGTTG	2	10	114370	114379	0 %	40 %	60 %	0 %	16272080
70	NC_000907	TTCGC	2	10	114397	114406	0 %	40 %	20 %	40 %	16272080
71	NC_000907	AGGCA	2	10	114528	114537	40 %	0 %	40 %	20 %	16272080
72	NC_000907	AGAAA	2	10	116324	116333	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_000907	GCTTT	2	10	116824	116833	0 %	60 %	20 %	20 %	16272082
74	NC_000907	CGTGA	2	10	118559	118568	20 %	20 %	40 %	20 %	16272084
75	NC_000907	CAAAA	2	10	120511	120520	80 %	0 %	0 %	20 %	16272087
76	NC_000907	AATGG	2	10	120722	120731	40 %	20 %	40 %	0 %	16272087
77	NC_000907	AAAGT	2	10	121605	121614	60 %	20 %	20 %	0 %	16272087
78	NC_000907	GTTAT	2	10	122208	122217	20 %	60 %	20 %	0 %	16272087
79	NC_000907	AAACT	2	10	122887	122896	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
80	NC_000907	TAACC	2	10	125254	125263	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
81	NC_000907	CGACT	2	10	125582	125591	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
82	NC_000907	TCGGT	2	10	125957	125966	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
83	NC_000907	GTTTT	2	10	126823	126832	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_000907	GCTTC	2	10	127453	127462	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
85	NC_000907	TTCAA	2	10	128707	128716	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
86	NC_000907	AAGAT	2	10	128980	128989	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
87	NC_000907	ATCAA	2	10	129590	129599	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
88	NC_000907	AAATC	2	10	130772	130781	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
89	NC_000907	CAAAG	2	10	131304	131313	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
90	NC_000907	AAAAG	2	10	131538	131547	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_000907	AATTG	2	10	131688	131697	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_000907	TCCAA	2	10	135250	135259	40 %	20 %	0 %	40 %	16272090
93	NC_000907	AAAAG	2	10	137010	137019	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_000907	AAATA	2	10	139416	139425	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_000907	CGCCA	2	10	142391	142400	20 %	0 %	20 %	60 %	16272096
96	NC_000907	GCAAA	2	10	144804	144813	60 %	0 %	20 %	20 %	16272097
97	NC_000907	AGCCC	2	10	145077	145086	20 %	0 %	20 %	60 %	16272097
98	NC_000907	AGCCA	2	10	146373	146382	40 %	0 %	20 %	40 %	16272098
99	NC_000907	GCAGT	2	10	146851	146860	20 %	20 %	40 %	20 %	16272099
100	NC_000907	TCTTT	2	10	147880	147889	0 %	80 %	0 %	20 %	16272101
101	NC_000907	ACAAA	2	10	148703	148712	80 %	0 %	0 %	20 %	16272101
102	NC_000907	GAATG	2	10	148843	148852	40 %	20 %	40 %	0 %	16272101
103	NC_000907	CACGA	2	10	151071	151080	40 %	0 %	20 %	40 %	16272103
104	NC_000907	TTTTG	2	10	151457	151466	0 %	80 %	20 %	0 %	16272103
105	NC_000907	AAAGA	2	10	151871	151880	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
106	NC_000907	ATCAC	2	10	155955	155964	40 %	20 %	0 %	40 %	16272107
107	NC_000907	TTTCA	2	10	155984	155993	20 %	60 %	0 %	20 %	16272107
108	NC_000907	CTGTT	2	10	157758	157767	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
109	NC_000907	TAAAT	2	10	158796	158805	60 %	40 %	0 %	0 %	16272110
110	NC_000907	TTTTG	2	10	158949	158958	0 %	80 %	20 %	0 %	16272110
111	NC_000907	CATTA	2	10	159233	159242	40 %	40 %	0 %	20 %	16272110
112	NC_000907	AATTA	2	10	159795	159804	60 %	40 %	0 %	0 %	16272111
113	NC_000907	TACAA	2	10	160773	160782	60 %	20 %	0 %	20 %	16272112
114	NC_000907	GATAA	2	10	161181	161190	60 %	20 %	20 %	0 %	16272112
115	NC_000907	TTAAT	2	10	161240	161249	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_000907	CCTTA	2	10	161862	161871	20 %	40 %	0 %	40 %	16272113
117	NC_000907	ACTTT	2	10	161966	161975	20 %	60 %	0 %	20 %	16272113
118	NC_000907	CTAAT	2	10	162814	162823	40 %	40 %	0 %	20 %	16272114
119	NC_000907	ATTTT	2	10	163104	163113	20 %	80 %	0 %	0 %	16272114
120	NC_000907	CTACT	2	10	163249	163258	20 %	40 %	0 %	40 %	16272114
121	NC_000907	TACAA	2	10	164527	164536	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
122	NC_000907	TTTAC	2	10	166908	166917	20 %	60 %	0 %	20 %	16272118
123	NC_000907	ACGAT	2	10	167597	167606	40 %	20 %	20 %	20 %	16272119
124	NC_000907	ATAAC	2	10	167903	167912	60 %	20 %	0 %	20 %	16272119
125	NC_000907	AAATG	2	10	168260	168269	60 %	20 %	20 %	0 %	16272119
126	NC_000907	ATAAA	2	10	169326	169335	80 %	20 %	0 %	0 %	16272120
127	NC_000907	TGATG	2	10	170287	170296	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
128	NC_000907	TGGTC	2	10	171231	171240	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
129	NC_000907	AAGTT	2	10	171805	171814	40 %	40 %	20 %	0 %	16272122
130	NC_000907	AATTC	2	10	173308	173317	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
131	NC_000907	CAAAG	2	10	173552	173561	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
132	NC_000907	ATCAA	2	10	173708	173717	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
133	NC_000907	ATAAG	2	10	174674	174683	60 %	20 %	20 %	0 %	16272124
134	NC_000907	ATTTA	2	10	175040	175049	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_000907	GCTAC	2	10	176199	176208	20 %	20 %	20 %	40 %	16272127
136	NC_000907	ATTTA	2	10	178664	178673	40 %	60 %	0 %	0 %	16272129
137	NC_000907	AAAAC	2	10	179943	179952	80 %	0 %	0 %	20 %	16272131
138	NC_000907	GGTAT	2	10	181941	181950	20 %	40 %	40 %	0 %	16272132
139	NC_000907	AGTTT	2	10	182221	182230	20 %	60 %	20 %	0 %	16272133
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