MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Haemophilus influenzae Rd KW20 chromosome

Total Repeats: 5229

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_000907	GTTC	2	8	388	395	0 %	50 %	25 %	25 %	16271977
2	NC_000907	CAAA	2	8	972	979	75 %	0 %	0 %	25 %	16271977
3	NC_000907	CAAT	2	8	1126	1133	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_000907	TCAA	2	8	1344	1351	50 %	25 %	0 %	25 %	16271978
5	NC_000907	TTGC	2	8	1364	1371	0 %	50 %	25 %	25 %	16271978
6	NC_000907	AGCA	2	8	1500	1507	50 %	0 %	25 %	25 %	16271978
7	NC_000907	ATTT	2	8	1746	1753	25 %	75 %	0 %	0 %	16271978
8	NC_000907	CTTT	2	8	1877	1884	0 %	75 %	0 %	25 %	16271978
9	NC_000907	ATTT	2	8	2568	2575	25 %	75 %	0 %	0 %	16271978
10	NC_000907	GCAA	2	8	2973	2980	50 %	0 %	25 %	25 %	16271978
11	NC_000907	CTTT	2	8	3037	3044	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_000907	ATTT	2	8	3478	3485	25 %	75 %	0 %	0 %	16271979
13	NC_000907	CTCG	2	8	4751	4758	0 %	25 %	25 %	50 %	16271981
14	NC_000907	CCAA	2	8	4804	4811	50 %	0 %	0 %	50 %	16271981
15	NC_000907	CTAT	2	8	5619	5626	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_000907	CAGT	2	8	5939	5946	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_000907	AAAC	2	8	6560	6567	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_000907	TTCT	2	8	7637	7644	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_000907	AATT	2	8	8859	8866	50 %	50 %	0 %	0 %	16271982
20	NC_000907	GAAT	2	8	9213	9220	50 %	25 %	25 %	0 %	16271982
21	NC_000907	ATGT	2	8	9440	9447	25 %	50 %	25 %	0 %	16271982
22	NC_000907	CGTT	2	8	10262	10269	0 %	50 %	25 %	25 %	16271983
23	NC_000907	ATTT	2	8	11348	11355	25 %	75 %	0 %	0 %	16271984
24	NC_000907	GCGA	2	8	11928	11935	25 %	0 %	50 %	25 %	16271986
25	NC_000907	ACAA	2	8	12599	12606	75 %	0 %	0 %	25 %	16271987
26	NC_000907	ATTA	2	8	12663	12670	50 %	50 %	0 %	0 %	16271987
27	NC_000907	GCGT	2	8	12689	12696	0 %	25 %	50 %	25 %	16271987
28	NC_000907	TCAA	2	8	13226	13233	50 %	25 %	0 %	25 %	16271987
29	NC_000907	CCGC	2	8	13574	13581	0 %	0 %	25 %	75 %	16271988
30	NC_000907	ATTT	2	8	13630	13637	25 %	75 %	0 %	0 %	16271988
31	NC_000907	AGCA	2	8	13960	13967	50 %	0 %	25 %	25 %	16271988
32	NC_000907	GTTT	2	8	13992	13999	0 %	75 %	25 %	0 %	16271988
33	NC_000907	TTTA	2	8	14245	14252	25 %	75 %	0 %	0 %	16271988
34	NC_000907	CATT	2	8	15059	15066	25 %	50 %	0 %	25 %	16271990
35	NC_000907	CAAT	2	8	15374	15381	50 %	25 %	0 %	25 %	16271990
36	NC_000907	CAAA	2	8	15744	15751	75 %	0 %	0 %	25 %	16271990
37	NC_000907	GAAC	2	8	15755	15762	50 %	0 %	25 %	25 %	16271990
38	NC_000907	TTAT	2	8	16071	16078	25 %	75 %	0 %	0 %	16271991
39	NC_000907	TTTA	2	8	17472	17479	25 %	75 %	0 %	0 %	16271991
40	NC_000907	GAAT	2	8	18362	18369	50 %	25 %	25 %	0 %	16271992
41	NC_000907	TATT	2	8	18500	18507	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_000907	AATT	2	8	18532	18539	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_000907	TAAA	2	8	18577	18584	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_000907	TGAA	2	8	18623	18630	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_000907	TCTT	2	8	19643	19650	0 %	75 %	0 %	25 %	16271994
46	NC_000907	TATT	2	8	20351	20358	25 %	75 %	0 %	0 %	16271994
47	NC_000907	ATTC	2	8	20781	20788	25 %	50 %	0 %	25 %	16271994
48	NC_000907	TAAA	2	8	20866	20873	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_000907	AGCA	2	8	21452	21459	50 %	0 %	25 %	25 %	16271995
50	NC_000907	AATA	2	8	21540	21547	75 %	25 %	0 %	0 %	16271995
51	NC_000907	CAAG	2	8	21661	21668	50 %	0 %	25 %	25 %	16271995
52	NC_000907	AAAG	2	8	22599	22606	75 %	0 %	25 %	0 %	16271995
53	NC_000907	ATTA	2	8	22688	22695	50 %	50 %	0 %	0 %	16271996
54	NC_000907	CGGA	2	8	23823	23830	25 %	0 %	50 %	25 %	16271996
55	NC_000907	CCAC	2	8	23932	23939	25 %	0 %	0 %	75 %	16271996
56	NC_000907	AAAT	2	8	24110	24117	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_000907	ATCA	2	8	24291	24298	50 %	25 %	0 %	25 %	16271997
58	NC_000907	TCAA	2	8	24436	24443	50 %	25 %	0 %	25 %	16271997
59	NC_000907	AGAA	2	8	24690	24697	75 %	0 %	25 %	0 %	16271997
60	NC_000907	GAAT	2	8	25366	25373	50 %	25 %	25 %	0 %	16271997
61	NC_000907	TTCA	2	8	25383	25390	25 %	50 %	0 %	25 %	16271997
62	NC_000907	TTAA	2	8	26025	26032	50 %	50 %	0 %	0 %	30995348
63	NC_000907	TACG	2	8	26182	26189	25 %	25 %	25 %	25 %	30995348
64	NC_000907	TTGG	2	8	26243	26250	0 %	50 %	50 %	0 %	30995348
65	NC_000907	CGCA	2	8	26405	26412	25 %	0 %	25 %	50 %	30995348
66	NC_000907	TAAA	2	8	26589	26596	75 %	25 %	0 %	0 %	30995348
67	NC_000907	GAGT	2	8	26863	26870	25 %	25 %	50 %	0 %	16271999
68	NC_000907	TTCC	2	8	26949	26956	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_000907	TTGC	2	8	27099	27106	0 %	50 %	25 %	25 %	16272000
70	NC_000907	ATTT	2	8	27131	27138	25 %	75 %	0 %	0 %	16272000
71	NC_000907	CATT	2	8	27145	27152	25 %	50 %	0 %	25 %	16272000
72	NC_000907	TAAT	2	8	27307	27314	50 %	50 %	0 %	0 %	16272000
73	NC_000907	AATA	2	8	27464	27471	75 %	25 %	0 %	0 %	16272000
74	NC_000907	TGCT	2	8	27497	27504	0 %	50 %	25 %	25 %	16272000
75	NC_000907	TAAA	2	8	27714	27721	75 %	25 %	0 %	0 %	16272000
76	NC_000907	TAAT	2	8	27766	27773	50 %	50 %	0 %	0 %	16272000
77	NC_000907	GCAA	2	8	28200	28207	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
78	NC_000907	TTGG	2	8	28513	28520	0 %	50 %	50 %	0 %	16272001
79	NC_000907	TAAA	2	8	29212	29219	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_000907	TAAT	2	8	29299	29306	50 %	50 %	0 %	0 %	16272002
81	NC_000907	ACGA	2	8	29870	29877	50 %	0 %	25 %	25 %	16272002
82	NC_000907	TTTC	2	8	30174	30181	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_000907	ATAC	2	8	31284	31291	50 %	25 %	0 %	25 %	16272004
84	NC_000907	AATT	2	8	31424	31431	50 %	50 %	0 %	0 %	16272005
85	NC_000907	ATTT	2	8	31539	31546	25 %	75 %	0 %	0 %	16272005
86	NC_000907	TAAT	2	8	31593	31600	50 %	50 %	0 %	0 %	16272005
87	NC_000907	TACG	2	8	31917	31924	25 %	25 %	25 %	25 %	16272005
88	NC_000907	TTCT	2	8	32313	32320	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_000907	AAGA	2	8	32323	32330	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_000907	TAAA	2	8	32436	32443	75 %	25 %	0 %	0 %	16272006
91	NC_000907	TAAA	2	8	33214	33221	75 %	25 %	0 %	0 %	16272006
92	NC_000907	ATTT	2	8	33455	33462	25 %	75 %	0 %	0 %	16272006
93	NC_000907	GCGG	2	8	34392	34399	0 %	0 %	75 %	25 %	16272007
94	NC_000907	TCGT	2	8	34767	34774	0 %	50 %	25 %	25 %	16272007
95	NC_000907	TCAT	2	8	34827	34834	25 %	50 %	0 %	25 %	16272007
96	NC_000907	ATAA	2	8	34876	34883	75 %	25 %	0 %	0 %	16272007
97	NC_000907	CACG	2	8	35459	35466	25 %	0 %	25 %	50 %	16272008
98	NC_000907	CAAT	2	8	35583	35590	50 %	25 %	0 %	25 %	16272008
99	NC_000907	AAAC	2	8	35591	35598	75 %	0 %	0 %	25 %	16272008
100	NC_000907	AGCT	2	8	35635	35642	25 %	25 %	25 %	25 %	16272008
101	NC_000907	CCAT	2	8	36633	36640	25 %	25 %	0 %	50 %	16272010
102	NC_000907	AACT	2	8	37045	37052	50 %	25 %	0 %	25 %	16272010
103	NC_000907	CTTT	2	8	37427	37434	0 %	75 %	0 %	25 %	16272010
104	NC_000907	GCAA	2	8	37514	37521	50 %	0 %	25 %	25 %	16272010
105	NC_000907	AATA	2	8	37653	37660	75 %	25 %	0 %	0 %	16272010
106	NC_000907	TTCT	2	8	38417	38424	0 %	75 %	0 %	25 %	16272011
107	NC_000907	CGTA	2	8	38452	38459	25 %	25 %	25 %	25 %	16272011
108	NC_000907	ATGG	2	8	38659	38666	25 %	25 %	50 %	0 %	16272011
109	NC_000907	CTTT	2	8	38765	38772	0 %	75 %	0 %	25 %	16272011
110	NC_000907	AAAT	2	8	39576	39583	75 %	25 %	0 %	0 %	16272011
111	NC_000907	TAAA	2	8	39708	39715	75 %	25 %	0 %	0 %	16272011
112	NC_000907	TTCT	2	8	39771	39778	0 %	75 %	0 %	25 %	16272011
113	NC_000907	CAAA	2	8	40109	40116	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
114	NC_000907	ATTT	2	8	42346	42353	25 %	75 %	0 %	0 %	16272014
115	NC_000907	AGTA	2	8	42493	42500	50 %	25 %	25 %	0 %	16272014
116	NC_000907	TTAA	2	8	43460	43467	50 %	50 %	0 %	0 %	16272015
117	NC_000907	GGCA	2	8	43597	43604	25 %	0 %	50 %	25 %	16272015
118	NC_000907	AAGA	2	8	43925	43932	75 %	0 %	25 %	0 %	16272016
119	NC_000907	GAAA	2	8	44446	44453	75 %	0 %	25 %	0 %	16272016
120	NC_000907	ATAA	2	8	44773	44780	75 %	25 %	0 %	0 %	16272017
121	NC_000907	TTTG	2	8	44836	44843	0 %	75 %	25 %	0 %	16272017
122	NC_000907	AACC	2	8	45042	45049	50 %	0 %	0 %	50 %	16272017
123	NC_000907	CTTG	2	8	46186	46193	0 %	50 %	25 %	25 %	16272018
124	NC_000907	ATCA	2	8	46301	46308	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
125	NC_000907	AATA	2	8	46543	46550	75 %	25 %	0 %	0 %	16272019
126	NC_000907	CATA	2	8	46680	46687	50 %	25 %	0 %	25 %	16272019
127	NC_000907	ATAA	2	8	46988	46995	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_000907	AATT	2	8	47049	47056	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_000907	ATCA	2	8	47143	47150	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
130	NC_000907	ATCA	2	8	47607	47614	50 %	25 %	0 %	25 %	16272020
131	NC_000907	ACTC	2	8	47744	47751	25 %	25 %	0 %	50 %	16272020
132	NC_000907	AATT	2	8	48011	48018	50 %	50 %	0 %	0 %	30995350
133	NC_000907	AATG	2	8	48039	48046	50 %	25 %	25 %	0 %	30995350
134	NC_000907	TTGC	2	8	48111	48118	0 %	50 %	25 %	25 %	30995350
135	NC_000907	AAAT	2	8	48326	48333	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_000907	ATCA	2	8	48346	48353	50 %	25 %	0 %	25 %	16272022
137	NC_000907	ACTA	2	8	49201	49208	50 %	25 %	0 %	25 %	16272023
138	NC_000907	ATTA	2	8	49555	49562	50 %	50 %	0 %	0 %	16272023
139	NC_000907	ATTA	2	8	49847	49854	50 %	50 %	0 %	0 %	16272023
140	NC_000907	TAAA	2	8	50394	50401	75 %	25 %	0 %	0 %	16272024
141	NC_000907	GATT	2	8	50473	50480	25 %	50 %	25 %	0 %	16272024
142	NC_000907	TGGT	2	8	50538	50545	0 %	50 %	50 %	0 %	16272024
143	NC_000907	TTTG	2	8	50569	50576	0 %	75 %	25 %	0 %	16272024
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