MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Haemophilus influenzae Rd KW20 chromosome

Total Repeats: 1042

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_000907	CAAT	2	8	1126	1133	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_000907	CTTT	2	8	3037	3044	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_000907	CTAT	2	8	5619	5626	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_000907	CAGT	2	8	5939	5946	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_000907	AAAC	2	8	6560	6567	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_000907	TTCT	2	8	7637	7644	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_000907	TATT	2	8	18500	18507	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_000907	AATT	2	8	18532	18539	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_000907	TAAA	2	8	18577	18584	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_000907	TGAA	2	8	18623	18630	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_000907	TAAA	2	8	20866	20873	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_000907	AAAT	2	8	24110	24117	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_000907	TTCC	2	8	26949	26956	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_000907	GCAA	2	8	28200	28207	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_000907	TAAA	2	8	29212	29219	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_000907	TTTC	2	8	30174	30181	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_000907	TTCT	2	8	32313	32320	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_000907	AAGA	2	8	32323	32330	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_000907	CAAA	2	8	40109	40116	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_000907	ATCA	2	8	46301	46308	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_000907	ATAA	2	8	46988	46995	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_000907	AATT	2	8	47049	47056	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_000907	ATCA	2	8	47143	47150	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_000907	AAAT	2	8	48326	48333	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_000907	TAAA	2	8	57578	57585	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_000907	TTAT	2	8	57630	57637	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_000907	GCAA	2	8	60288	60295	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_000907	TTTA	2	8	65606	65613	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_000907	AAAT	2	8	65657	65664	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_000907	ACAA	2	8	65690	65697	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_000907	CCGC	2	8	65713	65720	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
32	NC_000907	TGTA	2	8	65800	65807	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_000907	ATTT	2	8	66370	66377	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_000907	CTTA	2	8	66404	66411	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_000907	TTTG	2	8	66421	66428	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_000907	TTCA	2	8	68414	68421	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_000907	AACC	2	8	77883	77890	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_000907	AATC	2	8	80396	80403	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_000907	AAAC	2	8	85984	85991	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_000907	TGGT	2	8	88153	88160	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_000907	ATTT	2	8	91439	91446	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_000907	TAAT	2	8	92053	92060	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_000907	TAAA	2	8	92087	92094	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_000907	AATG	2	8	97069	97076	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_000907	CAAA	2	8	100424	100431	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_000907	AAAG	2	8	101623	101630	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_000907	TAAT	2	8	101733	101740	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_000907	TAAA	2	8	102362	102369	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_000907	AAAT	2	8	103279	103286	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_000907	TAAA	2	8	104201	104208	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_000907	TGCG	2	8	105284	105291	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
52	NC_000907	CACG	2	8	105308	105315	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
53	NC_000907	TGCG	2	8	105347	105354	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
54	NC_000907	TCGC	2	8	108459	108466	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
55	NC_000907	AAAG	2	8	112201	112208	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_000907	AAAG	2	8	114770	114777	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_000907	TTTA	2	8	114969	114976	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_000907	TTCT	2	8	116302	116309	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_000907	ACTA	2	8	117682	117689	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_000907	AATA	2	8	120401	120408	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_000907	CTTT	2	8	122968	122975	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_000907	TTAT	2	8	123095	123102	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_000907	ATTA	2	8	123227	123234	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_000907	TTTC	2	8	123668	123675	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_000907	CAAT	2	8	124055	124062	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_000907	TGTC	2	8	124337	124344	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
67	NC_000907	GCTT	2	8	124355	124362	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
68	NC_000907	GGCA	2	8	124860	124867	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
69	NC_000907	CAGC	2	8	124927	124934	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
70	NC_000907	CTTT	2	8	125606	125613	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_000907	GTAC	2	8	126169	126176	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
72	NC_000907	TTCA	2	8	126766	126773	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_000907	TCAA	2	8	126797	126804	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_000907	CCCT	2	8	128045	128052	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
75	NC_000907	AAGC	2	8	128626	128633	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
76	NC_000907	TAAA	2	8	128746	128753	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_000907	TCAA	2	8	128834	128841	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_000907	GTTT	2	8	129264	129271	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_000907	AATT	2	8	129643	129650	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_000907	ATTC	2	8	129909	129916	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_000907	TTAA	2	8	130598	130605	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_000907	GATT	2	8	130751	130758	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_000907	TACG	2	8	131038	131045	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
84	NC_000907	TTGG	2	8	131153	131160	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_000907	TCAA	2	8	131265	131272	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_000907	GTTG	2	8	131581	131588	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_000907	TTGT	2	8	131723	131730	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_000907	TGAA	2	8	133773	133780	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_000907	TAAA	2	8	139359	139366	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_000907	ATTT	2	8	139705	139712	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_000907	TAAT	2	8	139915	139922	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_000907	TAAA	2	8	140590	140597	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_000907	CAAA	2	8	145118	145125	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
94	NC_000907	TACT	2	8	145361	145368	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
95	NC_000907	TTTA	2	8	150266	150273	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_000907	TTTA	2	8	151921	151928	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_000907	AGCC	2	8	152064	152071	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
98	NC_000907	TTTA	2	8	152198	152205	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_000907	TTTA	2	8	152208	152215	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_000907	CAGG	2	8	152265	152272	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
101	NC_000907	CAGG	2	8	152365	152372	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
102	NC_000907	TTAC	2	8	152460	152467	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_000907	ATAG	2	8	153999	154006	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_000907	TAAT	2	8	155232	155239	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_000907	TTGT	2	8	156523	156530	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_000907	TGCT	2	8	157744	157751	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
107	NC_000907	AAAT	2	8	161318	161325	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_000907	ACAT	2	8	161465	161472	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
109	NC_000907	TTAT	2	8	165918	165925	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_000907	TGCT	2	8	166182	166189	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
111	NC_000907	ACAA	2	8	166320	166327	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
112	NC_000907	AAGG	2	8	166363	166370	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_000907	TAAA	2	8	168538	168545	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_000907	CAAG	2	8	169423	169430	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
115	NC_000907	ATTA	2	8	169657	169664	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_000907	AAGT	2	8	169760	169767	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
117	NC_000907	AAAG	2	8	170153	170160	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_000907	TAAA	2	8	170706	170713	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_000907	GTAT	2	8	171198	171205	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
120	NC_000907	TTAC	2	8	172148	172155	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
121	NC_000907	AAAG	2	8	173203	173210	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_000907	CTTT	2	8	173598	173605	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
123	NC_000907	AAAG	2	8	173616	173623	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_000907	CTAA	2	8	175658	175665	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
125	NC_000907	ATTA	2	8	178294	178301	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_000907	AATC	2	8	179450	179457	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
127	NC_000907	TATT	2	8	188126	188133	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_000907	TTAT	2	8	189910	189917	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_000907	CATA	2	8	192152	192159	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
130	NC_000907	TAAA	2	8	194535	194542	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_000907	GTTT	2	8	195564	195571	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_000907	AGTA	2	8	195623	195630	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_000907	TAAT	2	8	195783	195790	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_000907	TTGT	2	8	196905	196912	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_000907	TTTC	2	8	196914	196921	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
136	NC_000907	AGAT	2	8	201181	201188	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_000907	ATAA	2	8	201210	201217	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_000907	GAAT	2	8	213162	213169	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_000907	ATTA	2	8	214839	214846	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_000907	ATTA	2	8	216937	216944	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_000907	AACT	2	8	217404	217411	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_000907	ATTT	2	8	219188	219195	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_000907	AAAT	2	8	222030	222037	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_000907	AAAT	2	8	225659	225666	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_000907	AGTA	2	8	227400	227407	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
146	NC_000907	TTAG	2	8	227452	227459	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
147	NC_000907	AGTA	2	8	229363	229370	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
148	NC_000907	AGGA	2	8	229396	229403	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
149	NC_000907	GAAA	2	8	229431	229438	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
150	NC_000907	TATC	2	8	231822	231829	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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152	NC_000907	ATTT	2	8	232369	232376	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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