MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Haemophilus influenzae Rd KW20 chromosome

Total Repeats: 24142

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_000907	GCA	2	6	59	64	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16271977
2	NC_000907	TGA	2	6	73	78	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16271977
3	NC_000907	TGA	2	6	307	312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16271977
4	NC_000907	GTG	2	6	396	401	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16271977
5	NC_000907	ACA	2	6	452	457	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16271977
6	NC_000907	GTT	2	6	482	487	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16271977
7	NC_000907	GCG	2	6	585	590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16271977
8	NC_000907	CAT	2	6	610	615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16271977
9	NC_000907	TGT	2	6	718	723	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16271977
10	NC_000907	CTT	2	6	753	758	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16271977
11	NC_000907	ATG	2	6	759	764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16271977
12	NC_000907	TGT	2	6	850	855	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16271977
13	NC_000907	TAG	2	6	990	995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16271977
14	NC_000907	AAT	2	6	1114	1119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_000907	TTC	2	6	1135	1140	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_000907	CAA	3	9	1247	1255	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16271978
17	NC_000907	ATA	2	6	1413	1418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16271978
18	NC_000907	TCG	2	6	1545	1550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16271978
19	NC_000907	TCA	2	6	1588	1593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16271978
20	NC_000907	CCA	2	6	1629	1634	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16271978
21	NC_000907	ACA	2	6	1642	1647	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16271978
22	NC_000907	TTA	2	6	1677	1682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16271978
23	NC_000907	CAA	2	6	1700	1705	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16271978
24	NC_000907	ATT	2	6	1757	1762	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16271978
25	NC_000907	GGC	2	6	1918	1923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16271978
26	NC_000907	TTC	2	6	1929	1934	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16271978
27	NC_000907	AGA	2	6	1960	1965	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16271978
28	NC_000907	TGC	2	6	2047	2052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16271978
29	NC_000907	GAA	2	6	2173	2178	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16271978
30	NC_000907	ATT	2	6	2224	2229	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16271978
31	NC_000907	ATG	2	6	2246	2251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16271978
32	NC_000907	GGA	2	6	2258	2263	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16271978
33	NC_000907	AAC	2	6	2341	2346	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16271978
34	NC_000907	AAT	2	6	2435	2440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16271978
35	NC_000907	TGA	2	6	2466	2471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16271978
36	NC_000907	AAG	2	6	2483	2488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16271978
37	NC_000907	AGA	2	6	2491	2496	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16271978
38	NC_000907	CAC	2	6	2628	2633	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16271978
39	NC_000907	ATC	2	6	2684	2689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16271978
40	NC_000907	GAA	2	6	2744	2749	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16271978
41	NC_000907	ACT	2	6	2791	2796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16271978
42	NC_000907	AAG	2	6	3003	3008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16271978
43	NC_000907	ATT	2	6	3049	3054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16271979
44	NC_000907	TCT	2	6	3066	3071	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16271979
45	NC_000907	ATT	2	6	3095	3100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16271979
46	NC_000907	AAT	2	6	3241	3246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16271979
47	NC_000907	TCT	2	6	3375	3380	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16271979
48	NC_000907	AAT	2	6	3389	3394	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16271979
49	NC_000907	TCA	2	6	3426	3431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16271979
50	NC_000907	ATT	2	6	3509	3514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16271979
51	NC_000907	TAA	2	6	3519	3524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16271979
52	NC_000907	CAC	2	6	3634	3639	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16271979
53	NC_000907	CAA	2	6	3646	3651	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16271979
54	NC_000907	ATT	2	6	3656	3661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16271979
55	NC_000907	TAA	2	6	3794	3799	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16271979
56	NC_000907	CAT	2	6	3833	3838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16271979
57	NC_000907	ATT	2	6	3853	3858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16271980
58	NC_000907	ATC	2	6	3875	3880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16271980
59	NC_000907	TTC	2	6	3923	3928	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16271980
60	NC_000907	GAC	2	6	4048	4053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16271980
61	NC_000907	AAT	2	6	4435	4440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_000907	ACG	2	6	5068	5073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16271981
63	NC_000907	ACA	2	6	5144	5149	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16271981
64	NC_000907	TCT	2	6	5165	5170	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16271981
65	NC_000907	CAT	2	6	5239	5244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16271981
66	NC_000907	TTG	2	6	5311	5316	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16271981
67	NC_000907	TTA	2	6	5392	5397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_000907	ATT	2	6	5432	5437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_000907	TTG	2	6	5466	5471	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_000907	GAT	2	6	5548	5553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_000907	TAT	2	6	5569	5574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_000907	CTA	2	6	5599	5604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_000907	CAA	2	6	5634	5639	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_000907	TTG	3	9	5641	5649	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_000907	AAG	2	6	5673	5678	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_000907	TTC	2	6	5683	5688	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_000907	AGG	2	6	5700	5705	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_000907	ATT	2	6	5778	5783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_000907	TGT	2	6	5837	5842	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_000907	AGC	2	6	5875	5880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_000907	ATC	2	6	5933	5938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_000907	GTG	2	6	5948	5953	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_000907	TTG	2	6	6119	6124	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_000907	TTA	2	6	6208	6213	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_000907	CAT	2	6	6302	6307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_000907	ATC	2	6	6361	6366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_000907	GAA	2	6	6426	6431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_000907	ATC	2	6	6445	6450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_000907	CAT	2	6	6605	6610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_000907	TGA	2	6	6618	6623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_000907	GAA	2	6	6664	6669	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_000907	TGA	2	6	6708	6713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_000907	ACA	2	6	6744	6749	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_000907	CTT	2	6	6840	6845	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_000907	GAA	2	6	6856	6861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_000907	TAT	2	6	7171	7176	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_000907	ATG	2	6	7204	7209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_000907	TGA	2	6	7310	7315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_000907	ATC	2	6	7446	7451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_000907	AAT	2	6	7480	7485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_000907	ACT	2	6	7528	7533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_000907	AGA	3	9	7542	7550	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_000907	GAA	2	6	7654	7659	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_000907	TGA	2	6	7863	7868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_000907	ACA	3	9	7873	7881	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_000907	CCG	2	6	8004	8009	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_000907	CAT	2	6	8027	8032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_000907	ACC	2	6	8130	8135	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_000907	GTA	2	6	8278	8283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_000907	AGA	2	6	8310	8315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_000907	CAA	2	6	8357	8362	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_000907	ATC	2	6	8416	8421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_000907	TCG	2	6	8508	8513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_000907	ATA	2	6	8745	8750	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16271982
115	NC_000907	TTA	2	6	8787	8792	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16271982
116	NC_000907	CAC	2	6	8823	8828	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16271982
117	NC_000907	GTT	2	6	8907	8912	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16271982
118	NC_000907	GAA	2	6	9023	9028	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16271982
119	NC_000907	GTT	2	6	9087	9092	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16271982
120	NC_000907	AGA	2	6	9334	9339	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16271982
121	NC_000907	AAC	2	6	9357	9362	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16271982
122	NC_000907	TCC	2	6	9412	9417	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16271982
123	NC_000907	ACT	2	6	9591	9596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16271982
124	NC_000907	AGA	3	9	9616	9624	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16271982
125	NC_000907	ATC	3	9	9633	9641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16271982
126	NC_000907	GAA	2	6	9650	9655	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16271982
127	NC_000907	AAT	2	6	9677	9682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16271982
128	NC_000907	TTC	2	6	9801	9806	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16271983
129	NC_000907	TTC	2	6	9888	9893	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16271983
130	NC_000907	TTA	2	6	10074	10079	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16271983
131	NC_000907	CAT	2	6	10088	10093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16271983
132	NC_000907	TTG	2	6	10243	10248	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16271983
133	NC_000907	CAC	2	6	10281	10286	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16271983
134	NC_000907	GAA	2	6	10302	10307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16271983
135	NC_000907	TAT	2	6	10447	10452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_000907	ATC	2	6	10600	10605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16271984
137	NC_000907	ATT	2	6	10615	10620	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16271984
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265	NC_000907	CAT	2	6	20193	20198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16271994
266	NC_000907	CAT	2	6	20289	20294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16271994
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