MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Haemophilus influenzae Rd KW20 chromosome

Total Repeats: 3583

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_000907	AAT	2	6	1114	1119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_000907	TTC	2	6	1135	1140	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_000907	AAT	2	6	4435	4440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_000907	TTA	2	6	5392	5397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_000907	ATT	2	6	5432	5437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_000907	TTG	2	6	5466	5471	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_000907	GAT	2	6	5548	5553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_000907	TAT	2	6	5569	5574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_000907	CTA	2	6	5599	5604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_000907	CAA	2	6	5634	5639	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_000907	TTG	3	9	5641	5649	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_000907	AAG	2	6	5673	5678	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_000907	TTC	2	6	5683	5688	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_000907	AGG	2	6	5700	5705	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_000907	ATT	2	6	5778	5783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_000907	TGT	2	6	5837	5842	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_000907	AGC	2	6	5875	5880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_000907	ATC	2	6	5933	5938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_000907	GTG	2	6	5948	5953	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_000907	TTG	2	6	6119	6124	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_000907	TTA	2	6	6208	6213	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_000907	CAT	2	6	6302	6307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_000907	ATC	2	6	6361	6366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_000907	GAA	2	6	6426	6431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_000907	ATC	2	6	6445	6450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_000907	CAT	2	6	6605	6610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_000907	TGA	2	6	6618	6623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_000907	GAA	2	6	6664	6669	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_000907	TGA	2	6	6708	6713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_000907	ACA	2	6	6744	6749	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_000907	CTT	2	6	6840	6845	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_000907	GAA	2	6	6856	6861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_000907	TAT	2	6	7171	7176	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_000907	ATG	2	6	7204	7209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_000907	TGA	2	6	7310	7315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_000907	ATC	2	6	7446	7451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_000907	AAT	2	6	7480	7485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_000907	ACT	2	6	7528	7533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_000907	AGA	3	9	7542	7550	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_000907	GAA	2	6	7654	7659	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_000907	TGA	2	6	7863	7868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_000907	ACA	3	9	7873	7881	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_000907	CCG	2	6	8004	8009	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_000907	CAT	2	6	8027	8032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_000907	ACC	2	6	8130	8135	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_000907	GTA	2	6	8278	8283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_000907	AGA	2	6	8310	8315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_000907	CAA	2	6	8357	8362	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_000907	ATC	2	6	8416	8421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_000907	TCG	2	6	8508	8513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_000907	TAT	2	6	10447	10452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_000907	ATT	2	6	11403	11408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_000907	TTA	2	6	12308	12313	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_000907	AAT	2	6	13381	13386	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_000907	TAT	2	6	13396	13401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_000907	CCT	2	6	18424	18429	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_000907	ATA	3	9	18443	18451	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_000907	ATT	2	6	18491	18496	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_000907	AAT	2	6	18594	18599	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_000907	TTA	2	6	18657	18662	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_000907	AAT	2	6	20856	20861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_000907	ACT	2	6	21194	21199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_000907	CTA	2	6	21204	21209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_000907	TGT	3	9	23989	23997	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_000907	TGC	2	6	24079	24084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_000907	CTT	3	9	26643	26651	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_000907	TGA	2	6	26963	26968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_000907	GAA	2	6	28004	28009	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_000907	TAG	2	6	28031	28036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_000907	TAT	2	6	28045	28050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_000907	AAT	2	6	28139	28144	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_000907	ATT	2	6	36366	36371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_000907	GTT	2	6	38078	38083	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_000907	CAA	2	6	41263	41268	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_000907	TAT	2	6	44495	44500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_000907	TCT	2	6	47000	47005	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_000907	TCA	2	6	47057	47062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_000907	ATC	3	9	47076	47084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_000907	ATC	2	6	47094	47099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_000907	TAC	2	6	47133	47138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_000907	GGA	2	6	47152	47157	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_000907	CCT	2	6	47209	47214	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_000907	TCC	2	6	47232	47237	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_000907	TAT	2	6	47926	47931	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_000907	AAG	2	6	47940	47945	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_000907	TAA	2	6	50805	50810	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_000907	ATA	2	6	52070	52075	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_000907	TTA	2	6	52621	52626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_000907	TAA	2	6	55587	55592	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_000907	ATT	2	6	56817	56822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_000907	AAC	2	6	60300	60305	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_000907	TAA	2	6	61333	61338	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_000907	CAA	3	9	66379	66387	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_000907	ATT	2	6	66398	66403	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_000907	AAG	2	6	66431	66436	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_000907	TTC	2	6	72105	72110	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_000907	TCA	2	6	76030	76035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_000907	TCT	2	6	76040	76045	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_000907	CAA	2	6	80366	80371	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_000907	TAA	2	6	80390	80395	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_000907	TCT	2	6	82750	82755	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_000907	AAT	2	6	86025	86030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_000907	ATC	3	9	87049	87057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_000907	ATT	2	6	87956	87961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_000907	ATA	3	9	87993	88001	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_000907	CGA	2	6	88106	88111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_000907	ACA	2	6	88559	88564	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_000907	ATG	2	6	88582	88587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_000907	CCA	2	6	88643	88648	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_000907	AAC	2	6	88731	88736	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_000907	CAT	2	6	91425	91430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_000907	ATA	2	6	91701	91706	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_000907	GTG	2	6	91735	91740	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_000907	ATC	2	6	91855	91860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_000907	AGC	2	6	91888	91893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_000907	CAC	2	6	91937	91942	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
117	NC_000907	TAC	2	6	91993	91998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_000907	TGC	2	6	96958	96963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_000907	ATA	2	6	96984	96989	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_000907	TCA	2	6	96994	96999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_000907	AAC	2	6	99086	99091	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_000907	ATT	2	6	100387	100392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_000907	TTA	2	6	100415	100420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_000907	ATC	2	6	100446	100451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_000907	TAA	2	6	101587	101592	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_000907	AGA	2	6	101593	101598	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_000907	CAG	2	6	102139	102144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_000907	AAT	2	6	102155	102160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_000907	CAC	2	6	102172	102177	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_000907	TCA	2	6	102227	102232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_000907	TTG	2	6	102306	102311	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_000907	TAT	2	6	103240	103245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_000907	AAT	2	6	103294	103299	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_000907	TAT	2	6	103315	103320	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_000907	TTC	2	6	103321	103326	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_000907	ACG	2	6	103353	103358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_000907	TTG	2	6	103419	103424	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_000907	CAT	2	6	103431	103436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_000907	ACT	2	6	103438	103443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_000907	TAT	2	6	103515	103520	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_000907	TTG	2	6	103534	103539	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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