MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Haemophilus influenzae Rd KW20 chromosome

Total Repeats: 1973

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_000907	TC	3	6	1893	1898	0 %	50 %	0 %	50 %	16271978
2	NC_000907	AT	3	6	2620	2625	50 %	50 %	0 %	0 %	16271978
3	NC_000907	AT	3	6	2635	2640	50 %	50 %	0 %	0 %	16271978
4	NC_000907	CG	3	6	3493	3498	0 %	0 %	50 %	50 %	16271979
5	NC_000907	TC	3	6	4559	4564	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_000907	TA	3	6	5007	5012	50 %	50 %	0 %	0 %	16271981
7	NC_000907	TA	3	6	5265	5270	50 %	50 %	0 %	0 %	16271981
8	NC_000907	TA	3	6	5555	5560	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_000907	AG	3	6	5563	5568	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_000907	CG	3	6	5785	5790	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11	NC_000907	TA	3	6	5843	5848	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_000907	GA	3	6	8833	8838	50 %	0 %	50 %	0 %	16271982
13	NC_000907	AC	3	6	9431	9436	50 %	0 %	0 %	50 %	16271982
14	NC_000907	GC	4	8	9852	9859	0 %	0 %	50 %	50 %	16271983
15	NC_000907	AT	5	10	10201	10210	50 %	50 %	0 %	0 %	16271983
16	NC_000907	GA	3	6	10459	10464	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_000907	CT	3	6	11537	11542	0 %	50 %	0 %	50 %	16271985
18	NC_000907	TA	4	8	12852	12859	50 %	50 %	0 %	0 %	16271987
19	NC_000907	AT	3	6	13433	13438	50 %	50 %	0 %	0 %	16271988
20	NC_000907	GT	3	6	14026	14031	0 %	50 %	50 %	0 %	16271988
21	NC_000907	GC	3	6	14760	14765	0 %	0 %	50 %	50 %	16271989
22	NC_000907	CA	3	6	16013	16018	50 %	0 %	0 %	50 %	16271990
23	NC_000907	AG	3	6	17593	17598	50 %	0 %	50 %	0 %	16271991
24	NC_000907	AC	4	8	18729	18736	50 %	0 %	0 %	50 %	16271993
25	NC_000907	AT	4	8	18938	18945	50 %	50 %	0 %	0 %	16271993
26	NC_000907	CA	3	6	18954	18959	50 %	0 %	0 %	50 %	16271993
27	NC_000907	AT	3	6	19339	19344	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_000907	TC	3	6	19369	19374	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_000907	AT	3	6	21179	21184	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_000907	AT	3	6	22128	22133	50 %	50 %	0 %	0 %	16271995
31	NC_000907	CG	3	6	22239	22244	0 %	0 %	50 %	50 %	16271995
32	NC_000907	AC	3	6	23226	23231	50 %	0 %	0 %	50 %	16271996
33	NC_000907	AG	3	6	23328	23333	50 %	0 %	50 %	0 %	16271996
34	NC_000907	GA	3	6	23562	23567	50 %	0 %	50 %	0 %	16271996
35	NC_000907	AG	3	6	25237	25242	50 %	0 %	50 %	0 %	16271997
36	NC_000907	GA	3	6	25400	25405	50 %	0 %	50 %	0 %	16271997
37	NC_000907	AG	3	6	25651	25656	50 %	0 %	50 %	0 %	16271997
38	NC_000907	GC	3	6	26365	26370	0 %	0 %	50 %	50 %	30995348
39	NC_000907	GA	3	6	27944	27949	50 %	0 %	50 %	0 %	16272000
40	NC_000907	TA	3	6	28598	28603	50 %	50 %	0 %	0 %	16272001
41	NC_000907	AT	3	6	30043	30048	50 %	50 %	0 %	0 %	16272003
42	NC_000907	CG	3	6	30869	30874	0 %	0 %	50 %	50 %	16272004
43	NC_000907	GT	3	6	31412	31417	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_000907	GT	3	6	31698	31703	0 %	50 %	50 %	0 %	16272005
45	NC_000907	TA	3	6	33345	33350	50 %	50 %	0 %	0 %	16272006
46	NC_000907	CT	3	6	33468	33473	0 %	50 %	0 %	50 %	16272007
47	NC_000907	TG	3	6	40484	40489	0 %	50 %	50 %	0 %	30995349
48	NC_000907	AC	3	6	41811	41816	50 %	0 %	0 %	50 %	16272013
49	NC_000907	AT	3	6	42103	42108	50 %	50 %	0 %	0 %	16272013
50	NC_000907	GA	3	6	42828	42833	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_000907	CT	4	8	42837	42844	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_000907	TG	3	6	46919	46924	0 %	50 %	50 %	0 %	16272019
53	NC_000907	TG	3	6	47789	47794	0 %	50 %	50 %	0 %	16272020
54	NC_000907	GT	3	6	49125	49130	0 %	50 %	50 %	0 %	16272023
55	NC_000907	GA	3	6	49956	49961	50 %	0 %	50 %	0 %	16272024
56	NC_000907	AT	3	6	52286	52291	50 %	50 %	0 %	0 %	16272025
57	NC_000907	AT	3	6	52402	52407	50 %	50 %	0 %	0 %	16272025
58	NC_000907	GA	3	6	52488	52493	50 %	0 %	50 %	0 %	16272025
59	NC_000907	GA	3	6	52915	52920	50 %	0 %	50 %	0 %	16272026
60	NC_000907	AT	3	6	54078	54083	50 %	50 %	0 %	0 %	16272027
61	NC_000907	GA	3	6	55206	55211	50 %	0 %	50 %	0 %	30995351
62	NC_000907	GT	3	6	57009	57014	0 %	50 %	50 %	0 %	16272030
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64	NC_000907	GA	3	6	59448	59453	50 %	0 %	50 %	0 %	16272031
65	NC_000907	TA	3	6	59590	59595	50 %	50 %	0 %	0 %	16272032
66	NC_000907	AC	3	6	59596	59601	50 %	0 %	0 %	50 %	16272032
67	NC_000907	GC	3	6	60823	60828	0 %	0 %	50 %	50 %	16272033
68	NC_000907	GA	3	6	62361	62366	50 %	0 %	50 %	0 %	16272034
69	NC_000907	CA	3	6	63577	63582	50 %	0 %	0 %	50 %	16272035
70	NC_000907	AG	3	6	65378	65383	50 %	0 %	50 %	0 %	16272035
71	NC_000907	CT	3	6	65586	65591	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_000907	GA	3	6	65816	65821	50 %	0 %	50 %	0 %	16272036
73	NC_000907	GC	3	6	66184	66189	0 %	0 %	50 %	50 %	16272036
74	NC_000907	AT	3	6	67884	67889	50 %	50 %	0 %	0 %	16272038
75	NC_000907	AC	3	6	67910	67915	50 %	0 %	0 %	50 %	16272038
76	NC_000907	AT	3	6	68448	68453	50 %	50 %	0 %	0 %	16272039
77	NC_000907	CG	3	6	68579	68584	0 %	0 %	50 %	50 %	16272039
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80	NC_000907	AC	3	6	71382	71387	50 %	0 %	0 %	50 %	16272041
81	NC_000907	AT	3	6	71508	71513	50 %	50 %	0 %	0 %	16272041
82	NC_000907	CA	3	6	71875	71880	50 %	0 %	0 %	50 %	16272041
83	NC_000907	CT	3	6	73356	73361	0 %	50 %	0 %	50 %	16272043
84	NC_000907	AG	3	6	73471	73476	50 %	0 %	50 %	0 %	16272043
85	NC_000907	CT	3	6	75457	75462	0 %	50 %	0 %	50 %	16272043
86	NC_000907	GC	3	6	75523	75528	0 %	0 %	50 %	50 %	16272043
87	NC_000907	TG	3	6	76608	76613	0 %	50 %	50 %	0 %	16272044
88	NC_000907	AT	3	6	76992	76997	50 %	50 %	0 %	0 %	16272044
89	NC_000907	AT	3	6	78251	78256	50 %	50 %	0 %	0 %	16272045
90	NC_000907	GC	3	6	78512	78517	0 %	0 %	50 %	50 %	16272045
91	NC_000907	TG	3	6	80450	80455	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_000907	TA	4	8	80475	80482	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_000907	TA	3	6	80507	80512	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_000907	TA	3	6	82030	82035	50 %	50 %	0 %	0 %	16272049
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96	NC_000907	AC	3	6	82441	82446	50 %	0 %	0 %	50 %	16272049
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99	NC_000907	TC	3	6	85928	85933	0 %	50 %	0 %	50 %	16272052
100	NC_000907	CA	3	6	86074	86079	50 %	0 %	0 %	50 %	16272053
101	NC_000907	CG	3	6	87454	87459	0 %	0 %	50 %	50 %	16272055
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103	NC_000907	AT	3	6	88040	88045	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_000907	GC	3	6	88615	88620	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
105	NC_000907	TA	3	6	89094	89099	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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107	NC_000907	AG	3	6	89777	89782	50 %	0 %	50 %	0 %	16272059
108	NC_000907	AT	3	6	90131	90136	50 %	50 %	0 %	0 %	16272059
109	NC_000907	AT	3	6	90695	90700	50 %	50 %	0 %	0 %	16272060
110	NC_000907	GT	3	6	91152	91157	0 %	50 %	50 %	0 %	16272060
111	NC_000907	TC	3	6	92033	92038	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_000907	AT	3	6	92059	92064	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_000907	GA	3	6	94337	94342	50 %	0 %	50 %	0 %	16272062
114	NC_000907	CA	3	6	95787	95792	50 %	0 %	0 %	50 %	16272063
115	NC_000907	AG	3	6	96099	96104	50 %	0 %	50 %	0 %	16272063
116	NC_000907	CT	3	6	98703	98708	0 %	50 %	0 %	50 %	16272065
117	NC_000907	GC	3	6	99483	99488	0 %	0 %	50 %	50 %	16272066
118	NC_000907	AC	3	6	100011	100016	50 %	0 %	0 %	50 %	16272066
119	NC_000907	AC	3	6	100140	100145	50 %	0 %	0 %	50 %	16272066
120	NC_000907	TG	3	6	101444	101449	0 %	50 %	50 %	0 %	16272067
121	NC_000907	TC	3	6	103501	103506	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_000907	TA	3	6	103926	103931	50 %	50 %	0 %	0 %	16272070
123	NC_000907	TG	3	6	106798	106803	0 %	50 %	50 %	0 %	30995355
124	NC_000907	AT	3	6	108011	108016	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_000907	AT	3	6	109061	109066	50 %	50 %	0 %	0 %	16272076
126	NC_000907	TA	3	6	112321	112326	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_000907	GC	3	6	113901	113906	0 %	0 %	50 %	50 %	16272080
128	NC_000907	GC	3	6	114488	114493	0 %	0 %	50 %	50 %	16272080
129	NC_000907	CA	3	6	118976	118981	50 %	0 %	0 %	50 %	16272084
130	NC_000907	AT	3	6	119083	119088	50 %	50 %	0 %	0 %	16272084
131	NC_000907	CA	3	6	119827	119832	50 %	0 %	0 %	50 %	16272085
132	NC_000907	TA	3	6	120358	120363	50 %	50 %	0 %	0 %	16272086
133	NC_000907	TA	3	6	120436	120441	50 %	50 %	0 %	0 %	16272087
134	NC_000907	AG	3	6	120537	120542	50 %	0 %	50 %	0 %	16272087
135	NC_000907	CA	3	6	121408	121413	50 %	0 %	0 %	50 %	16272087
136	NC_000907	TA	3	6	122996	123001	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_000907	AT	3	6	123252	123257	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_000907	TC	3	6	123586	123591	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
139	NC_000907	TC	3	6	123602	123607	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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141	NC_000907	TC	3	6	125042	125047	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NC_000907	TC	3	6	125177	125182	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
143	NC_000907	GT	3	6	125749	125754	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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145	NC_000907	TC	3	6	126888	126893	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
146	NC_000907	TG	3	6	127144	127149	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
147	NC_000907	TC	3	6	127161	127166	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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