MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Haemophilus influenzae Rd KW20 chromosome

Total Repeats: 470

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_000907	TC	3	6	4559	4564	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_000907	TA	3	6	5555	5560	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_000907	AG	3	6	5563	5568	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_000907	CG	3	6	5785	5790	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5	NC_000907	TA	3	6	5843	5848	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_000907	GA	3	6	10459	10464	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_000907	AT	3	6	19339	19344	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_000907	TC	3	6	19369	19374	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_000907	AT	3	6	21179	21184	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_000907	GT	3	6	31412	31417	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_000907	GA	3	6	42828	42833	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_000907	CT	4	8	42837	42844	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_000907	CT	3	6	65586	65591	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_000907	TG	3	6	80450	80455	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_000907	TA	4	8	80475	80482	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_000907	TA	3	6	80507	80512	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_000907	AC	3	6	88027	88032	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_000907	AT	3	6	88040	88045	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_000907	GC	3	6	88615	88620	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_000907	TA	3	6	89094	89099	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_000907	TC	3	6	92033	92038	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_000907	AT	3	6	92059	92064	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_000907	TC	3	6	103501	103506	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_000907	AT	3	6	108011	108016	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_000907	TA	3	6	112321	112326	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_000907	TA	3	6	122996	123001	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_000907	AT	3	6	123252	123257	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_000907	TC	3	6	123586	123591	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_000907	TC	3	6	123602	123607	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_000907	AC	3	6	123852	123857	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_000907	TC	3	6	125042	125047	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_000907	TC	3	6	125177	125182	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_000907	GT	3	6	125749	125754	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_000907	TC	3	6	126851	126856	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_000907	TC	3	6	126888	126893	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_000907	TG	3	6	127144	127149	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_000907	TC	3	6	127161	127166	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_000907	GT	3	6	127318	127323	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_000907	GT	3	6	127487	127492	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_000907	CA	3	6	128850	128855	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_000907	AT	3	6	128865	128870	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_000907	GC	3	6	129093	129098	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43	NC_000907	TA	3	6	129317	129322	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_000907	CT	3	6	129542	129547	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_000907	CA	3	6	130336	130341	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_000907	CA	3	6	130857	130862	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_000907	TA	3	6	133840	133845	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_000907	AT	3	6	135516	135521	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_000907	AT	3	6	139452	139457	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_000907	AT	4	8	155252	155259	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_000907	CA	3	6	161251	161256	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_000907	CA	3	6	161534	161539	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_000907	TA	3	6	168601	168606	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_000907	TG	3	6	169377	169382	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_000907	AC	4	8	171264	171271	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_000907	AT	3	6	179327	179332	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_000907	CT	3	6	190760	190765	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_000907	CA	3	6	203249	203254	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_000907	AG	3	6	206668	206673	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_000907	TA	4	8	219088	219095	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_000907	TA	3	6	219292	219297	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_000907	TA	3	6	224801	224806	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_000907	AC	3	6	225766	225771	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_000907	CG	3	6	226553	226558	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
65	NC_000907	CG	3	6	232900	232905	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
66	NC_000907	AT	3	6	234747	234752	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_000907	TC	3	6	236003	236008	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_000907	AT	3	6	236014	236019	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_000907	GT	3	6	236781	236786	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_000907	AG	3	6	238171	238176	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_000907	AT	3	6	242025	242030	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_000907	TC	3	6	242413	242418	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_000907	TC	3	6	242429	242434	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_000907	AC	3	6	242678	242683	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_000907	TC	3	6	243868	243873	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_000907	TC	3	6	244003	244008	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_000907	GT	3	6	244575	244580	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_000907	TC	3	6	245677	245682	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_000907	TC	3	6	245714	245719	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_000907	TG	3	6	245970	245975	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_000907	TC	3	6	245987	245992	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_000907	GT	3	6	246144	246149	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_000907	GT	3	6	246313	246318	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_000907	CA	3	6	247676	247681	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_000907	AT	3	6	247691	247696	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_000907	TG	3	6	247760	247765	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_000907	AT	3	6	255552	255557	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_000907	CT	3	6	257615	257620	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_000907	AG	3	6	257657	257662	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_000907	AG	3	6	257914	257919	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_000907	AG	3	6	258029	258034	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_000907	AT	3	6	265223	265228	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_000907	TA	3	6	267407	267412	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_000907	CA	3	6	277130	277135	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_000907	TC	3	6	278592	278597	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_000907	TC	3	6	278707	278712	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_000907	TA	3	6	279251	279256	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_000907	AT	3	6	282341	282346	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_000907	AG	3	6	282969	282974	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_000907	AT	3	6	286556	286561	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_000907	AC	3	6	287978	287983	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_000907	AT	3	6	288424	288429	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_000907	TC	3	6	292094	292099	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_000907	TA	3	6	309593	309598	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_000907	AT	3	6	321062	321067	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_000907	AG	3	6	349580	349585	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_000907	TC	3	6	350284	350289	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_000907	TA	3	6	351082	351087	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_000907	TA	3	6	351105	351110	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_000907	AT	3	6	355593	355598	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_000907	GA	3	6	356221	356226	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_000907	TG	3	6	371548	371553	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_000907	AC	3	6	371785	371790	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_000907	TG	3	6	379094	379099	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_000907	TG	3	6	379200	379205	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_000907	TA	3	6	380284	380289	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_000907	GA	3	6	401793	401798	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_000907	AG	3	6	401875	401880	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_000907	AG	3	6	414460	414465	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_000907	TC	3	6	429715	429720	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_000907	GT	3	6	432749	432754	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_000907	TA	3	6	441366	441371	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_000907	GA	3	6	443363	443368	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_000907	AC	3	6	443778	443783	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_000907	AT	3	6	449557	449562	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_000907	GA	3	6	456199	456204	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_000907	GT	3	6	463242	463247	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_000907	AT	3	6	463295	463300	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_000907	AT	3	6	463306	463311	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_000907	TC	3	6	464675	464680	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NC_000907	AG	3	6	467373	467378	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_000907	AT	3	6	476330	476335	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_000907	TC	3	6	481581	481586	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_000907	AG	3	6	482664	482669	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_000907	TA	3	6	506742	506747	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_000907	GC	5	10	514856	514865	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
137	NC_000907	AG	3	6	516398	516403	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_000907	TA	3	6	524560	524565	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_000907	TA	3	6	528064	528069	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_000907	TA	3	6	528150	528155	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_000907	TG	3	6	539235	539240	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_000907	TA	3	6	539376	539381	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_000907	TA	3	6	540691	540696	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_000907	CT	3	6	550499	550504	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
145	NC_000907	AC	3	6	553956	553961	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
146	NC_000907	TA	3	6	561591	561596	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_000907	TA	3	6	565574	565579	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_000907	TA	3	6	567688	567693	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_000907	AT	3	6	574905	574910	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_000907	AT	3	6	575070	575075	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_000907	AG	4	8	576361	576368	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
152	NC_000907	TA	3	6	599862	599867	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_000907	TA	3	6	600977	600982	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_000907	TA	4	8	603118	603125	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.